molekularna egzamin

SSB to białka wiążące jednoniciowy DNA, chronią jednoniciowe DNA przed powrotną reasocjacją do dwuniciowego DNA oraz przed degradacją

gyrazawymaga ATP, odpowiada za superskręty dodaje ujemne zwoje

Jest semikonserwatywna

Fragment S1 HMM - jest ATPazą, ale nie jest zbudowana z mikrotubul aktynowych

LMM tworzy filamenty, brak aktywności ATPazy - i nie łączy się z aktyną

HMM nie tworzy filamentów

Miozyna może być podzielona przez trypsynę na dwa częściowo funkcjonalne fragmenty: meromiozynę lekką (LMM) i meromiozynę ciężką (HMM). LMM, podobnie jak miozyna, tworzy filamenty, lecz nie ma aktywności ATP-azowej i nie łączy się z aktyną. Natomiast meromiozyna ciężka - HMM - przeciwnie - katalizuje hydrolizę ATP i wiąże się z aktyną lecz nie tworzy filamentów. HMM: S1 lub jeden sufragment o kształcie pałeczki nazwany S2. W rzeczywistości subfragmenty S1 są jednostkami miozyny generującymi siłę mechaniczną. S'2' → szyjka, zawias S'1' → główka z łańcuchami lekkimi (miejsce wiążące aktynę i ATP [aktywność ATPazy]

ramiona podwłókien A są zbudowane z dyneiny wykazującej aktywność ATPazową- Na każdej podjednostce A występują dwa ramiona dyneiny - wewnętrzne i zewnętrzne, a dyneina zawiera ATPazę, więc chyba prawda.

obecna w różnych stężeniach zależnie od źródła węgla używanego do wzrostu

jest produkowana z jednostki genu zwanej operonem

hydrolizuje wiązanie 1,4-β oligosacharydy laktozy i tworzy galaktozę i glukozę

jest allosterycznie aktywowana przez niemetaboliczny składnik IPTG (izopropylotiogalaktozyd)

jej poziom wzrasta w koordynacji z permeazą galaktozydową i acetylofransferazą tiogalaktozydową

syntetyzuje 3 rożne klasy mRNA, które są wyznaczane poprzez czas po infekcji ich pojawienia

niosą programowaną syntezę białek potrzebnych do replikacji genów i produkcji ich strukturalnych komponentów

tworzą produkty genów N i Q, które działają jako białka regulacji pozytywnej, prowadzące sekwencyjną λ- kodującego białka

N i Q zapobiegają końcu transkrypcji

Q potrzebne, gdy są transkrybowane geny białka główki i ogonka wirusa oraz białka konieczne do lizy komórki gospodarza

Southern - wykrywanie DNA

RLFP

Klonowanie DNA -- dogodnymi wektorami do klonowania są bakteriofagi i plazmidy

Yac-i - jeśli chodzi o sztuczne chromosomy drożdży (YAC) - są to wektory, w które wprowadza się duże fragmenty DNA. Głównymi składnikami są ARS, centromer i telomery S.cerevisiae.

Kosmidy

kaseta Pribnowa (5'-TATAAT-3', inaczej sekwencja pribnowa)

rejon –35

Wewnetrzny fragment bialka usuwany po translacji z jednoczesnym polaczeniem fragmentów go otaczajacych.

Wycinanie intein jest odpowiednikiem wycinania intronów z pre-mRNA. (ale warto dodać że jest białkowym odpowiednikiem)

Niektóre z intein są specyficznymi endonukleazami zdolnymi do usuwania specyficznej sekwencji DNA w allelu który nie zawiera sekwencji kodującej inteinę. (JAK BĘDZIE PRZECINANIA TO TEŻ DOBRZE )

Metylacja DNA de novo, to przyłączenie grup metylowych do DNA w nowym miejscu, prowadzące do zmiany wzoru metylacji genomu.

Metylacja DNA de novo to u myszy proces metylacji zależny od metylotransferaz DNA kodowanych przez geny Dnmt3a i Dnmt3b. (Dntm3a i Dntm3b są homologiczne do Dntm1)

Przywracanie fluorescencji po fotowygaszaniu (FRAP)

jest miejscem syntezy i obróbki cząsteczek rRNA

złożona sieć włókien zbudowanych z białek i RNA, tworząca substrukturę jądra

Telomerazy:

odwrotna transkryptaza 5’🡪3’

odwrotna transkryptaza 5’🡪3’

syntezuje nic w kierunku 5’🡪3’

+ wymaga matrycy

syntezuje nić bogatą w G

replikacja eukariotycznego chromosomu to kilka widełek

białka kodowane przez pojedyncze kopie genów

białka kodowane przez pojedyncze kopie genów

silnie zasadowe białka, ładunek ‘+’

białka histonowe H1, H2A, H2B, H3, H4(z czego H1 oddziałuje częściowo z DNA łącznikowym)

geny kodujące histony wielokrotnie powtórzone

histony wiążą się z nicią wiodącą

konstutywna synteza białka C

w obecności cAMP-CAP i arabinozy nie da się zapętlić

syntetyzuje tylko represor λ w bakterii lizogenicznych

ssDNA = recA oddziałuje z nim także represor λ

zostaje uwolnione z chromosomu bakteryjnego z kompleksu rexDNA

gdy nic nie atakuje, zmienia tow fazie lizogenicznej jest on obecny z uwagi na represor, który ulega autoregulacji

profag (DNA) jest także lizogenicznej, gdy nie aktywuje zmiany bo represor λ …

białko cro wiąże się do or3 i wtedy hamuje represor (gen cL)

wiąże z araO1 hamując transkrypcję genu

w obecności cAMP-CAP geny struktury operonu i związanie arabinozowego do araO1 i araI

powoduje wypętlenie, gdy zwiąże się z araO2 i araI

chroni przez DNAza -87 do -47

w operonie ora wpływa na geny struktury

w obecności arabinozy wpływa na geny struktury

Wymagana w replikacji

Potrzebuje primera i matrycy

Tworzy najwięcej DNA podczas replikacji ( no ogólnie ona jest głównym enzymem replikacyjnym więc pewnie tworzy najwięcej, ale nie jestem pewna)

Posiada aktywność nukleazową 3-5