molekularna egzamin

Acetylacja(ułatwia rozluźnieniu chromatyny, co sprzyja transkrypcji)

Metylacja

Ubikiwitynacja(sygnał np. degradacji białka)

sumoilacja (dołączenie białka SUMO)

dodatkowa zmienność genetyczna

Zachodzi już po transkrypcji

Zachodzi przy udziale enzymów, np. polimerazy poli(A) (inny przykład to deaminaza przy Apolipoproteinie B 100 i 48)

zmieniają liczbę opleceń

przekształcają topoizomery, rozcinają DNA

10^8

V,D,J,C

jeden

w splicosomie uczestniczą katalityczne cząsteczki snRna - to było poprawne

polimeraza DNA zalezna od RNA

powstaje hybryda DNA – RNA(retrowirusy

stępuje etap gdzie o.t. tworzy DNA wirusowego RNA i potem integracja z chromosomem gospodarza

organizmy eukariotyczne mogą korzystać z retrowirusa zmieniać metabolizm.

Zazwyczaj powstają z premRNA

Posiadają na końcu 3’ ogon poliA , nie kodowany przez matryce

który wiąże się z intensywnymi modyfikacjami chemicznymi histonów - (zmiany struktury nukleosomu, poślizg lub przemieszczenie cis, transfer lub przemieszczenie trans)

który jest indukowany przez zależny od energii proces osłabiający oddziaływania pomiędzy nukleosomem i związanym z nim DNA - (str. 284)

które może skutkować tzw. przemieszczeniem cis, skutkujący transportem(?) nukleosomu na inną cząsteczkę DNA - przemieszczenie cis jest fizycznym przesunięciem nukleosomu wzdłuż nici DNA, a transprzeniesienie nukleosomu na inną cząsteczkę DNA lub dalszy fragment tej samej cząsteczki (str.285)

może uczestniczyć w procesie, w którym uczestniczy wielobiałkowy składnik zwany egzosomem, który degraduje mRNA przy udziale spokrewnionych z enzymami bakteryjnego degradosomu.

może przebiegac wg mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA (RNA surveillance), który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych

w prawidłowej, niezmienionej komórce (tzn. niezainfekowanej wirusami i nietransformowanej egzogennym DNA) może być skutkiem wyciszania RNA (interferencji RNA) dwuniciowe genomy wirusowe są wyciszane

może zależeć od obecności tzw. elementów niestabilności, znajdujących się w obrębie transkryptu

Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji, przesuwa o jeden nukleotyd do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.

Odbywa się pomiędzy eksonami zawartymi w obrębie różnych cząsteczek RNA.

eksony z różnych transkryptów RNA są łączone ze sobą

jest miejscem syntezy i obróbki cząsteczek rRNA

jest miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNA I - polimeraza RNA I jest umieszczona w jąderku no i tworzy transkrypty komórkowe dla rRNA.

może przebiegać według mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA, który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych.

może zależeć od szlaku, którego jednym z elementów są cząsteczki RNA o strukturze spinki do włosów, powstające z prekursorowego RNA, syntezowanego przez polimerazę RNA II. chodzi o mikroRNA

może zależeć od sekwencji znajdujących się w obrębie transkryptu – np. dzięki granicom egzon-intron

czynnik elongacyjny Tu(EF-Tu) oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacetylo-tRNA oprócz fMet-tRNAf

peptydylotRNA może znajdować się zarówno w miejscu P lub A rybosomu, w zależności od fazy cyklu translacyjnego

fMet-tRNAf zajmuje miejsce P jako jedyn h1-IF1 skierowuje fMet-tRNA od razu do miejsca P podczas inicjacji

mRNA policistronowe

promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA

sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w terminacji transkrypcji niektórych genów E.coli (jest dobrze, ponieważ białko RHO ma aktywność ATPazową oraz działa również jak helikaza)

u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki np. operon tryptofanowy - jest tryptofan nie trzeba nic robić, koniec transkrypcji

mRNA policistronowe

połączenie zasady z cukrem nosi nazwę nukteozydu, bo nukleotyd to nukleozyd plus gr.fosforanowa.

guanina paruje się z cytozyna poprzez 3 wiązania wodorowe

zasady w superhelisie są wewnątrz helisy

adenozyna i guanina wiąże się przez N9 z C1 deoksyrybozy wiązaniem N- -glikozydowym , a cytozyna i tymina przez N-1 z C1

efekt hiperchromowy - efekt podczas topnienia DNA, który powoduje podwyższenie absorbancji przy długości fali 260 nm może być pytanie o efekt hipochromowy - obniżenie absorbancji!!

eżeli A+G =30% to T może być więcej niż 20%(reguła Chargaffa)

wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie są odcinane po przejściu przez błonę ER

uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu

Rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błonę

białaczka

pozwala na wykrycie niewielkich wirusów

wymaga polimerazy DNA i czterech deoksynukleotydów (wymaga termostabilnej DNA i wszystkich 4 dNTP)

kodowane przez HLA

są polimorficzne i odrzucają przeszczepy

układ zawiera 3 grupy MHC I, MHC II, MHC III