Biochemia I - 1

jest płaskie

ma charakter wiązania podwójnego

miedzy atomem alfa i karoksykowym jest swoboda rotacji

są wiązaniami kowalencyjnymi, które mogą zostać zniesione przez działanie takich substancji jak: beta-merkaptoetanol, dinitrotroitol, mocznik

podczas renaturacji rybonukleazy następuje spontaniczne odtworzenie mostków dwusiarczowych,

powstają przez redukcję grup sulfhydrylowych

test ELISA może być wykorzystany do wykrycia danego antygenu w mieszaninach złożonych (np. we krwi

Test ELISA umożliwia zarówno wykrycie antygenu, jak i jego ilościowe oznaczenie

W środowisku lekko kwaśnym uwalniana jest cykliczna fenylotiohydantoinowa pochodna aminokwasu, po czym koniec peptydowy jest gotowy do kolejnego cyklu reakcji

Metoda ta pozwala na oznaczenie wyłącznie aminokwasu z końca N polipeptydu, ponieważ uwolnienie znakowanego aminokwasu wymaga hydrolizy wszystkich wiązań peptydowych

Hemoglobina płodu ma wyższe powinowactwo do tlenu niż hemoglobina matki w nieobecności BPG.

Hemoglobina F przeważa w ciągu ostatnich sześciu miesięcy życia płodowego człowieka i ma budowę podjednostkową α2g2

Hemoglobina o budowie podjednostkowej α2g2 ma wyższe powinowactwo do tlenu niż hemoglobina A

Hemoglobina A prze 3waża u dorosłego człowieka i ma budowę podjednostkową

jej substratami do reakcji jest asparagina i karbamoliofosforan

CTP hamuje ja na drodze sprzężenia zwrotnego

pełni rolę pośrednika w przepływie informacji genetycznej.

może być składnikiem rybosomu

często zachodzi wewnątrzłańcuchowe parowanie zasad.

jest liniowym polimerem.

jego rdzeń jest zbudowany z powtarzających się jednostek cukrowo-fosforanowych

Pompy jonowe zawierają w swojej strukturze fragment transbłonowy

Zadaniem fizjologicznym pomp błonowych jest wyrównywanie stężeń określonej substancji na zewnątrz i wewnątrz komórki.

W układach biologicznych kanały błonowe występują w postaci otwartej i są zamykane jedynie na krótką chwilę.

Rodopsyna bakteryjna jest białkiem peryferyjnym

Białka błonowe mają ściśle określoną orientację ponieważ są dostarczane od strony cytozolowej komorki.

Coś o ich specyficzności, że objawia się ona tym, że przeprowadzają jakąś określoną reakcję lub reakcję blisko spokrewnioną i tym, że mogę WYBIERAĆ (?!) substrat

Zwiekszają szybkość reakcji od 10 do 10^6 w stosunku do reakcji niekatalizowanej.

nie zmieniają czy też nie wpływają na delta G

wpływają na szybkośc reakcji, obniżają energię aktywacji

Podczas fosforylacji dochodzi do transferu najbardziej zewnętrznej ϒ reszty fosforanowej z odpowiedniego nukleotydu na substrat pełniący rolę akceptora

Powyższy zapis oznacza że enzym E łączy się z substratem S i powstaje kompleks ES, a szybkość tej reakcji w [mol/s] wynosi k1 /k-1

Model ten spełniony jest tylko dla prędkości początkowych reakcji katalizowanej enzymatycznie, gdy reakcje powstawania produktu P z kompleksu ES jest nie odwracalna

Model ten spełniony jest tylko w warunkach osiągniecia stanu równowagi dynamicznejP

Energia uwolniona podczas tworzenia wiązań chemicznych musi być wykorzystana do rozerwania innych wiązań lub uwolnienia w postaci ciepła lub też zmagazynowana w jakiejś innej formie.

Energia całkowita układu i jego otoczenia jest stała.

Reakcja może zająć spontanicznie jeśli …. Gibbsa jest ujemna

delta G’ jest różnicą między entalpią swobodną produktów I substratów reakcji, dlatego niezależy od drogi reakcji, ani jej molekularnego mechanizmu

Ujemna wartość entalpii swobodnej reakcji, oznacza że reakcja zachodzi spontanicznie z dużą szybkościąP

Jeżeli delta G’ reakcji wynosi zero, to w układzie niezachodzi przekształcanie reagentów w żadną stronę

Warunkiem stabilizowania struktury białka przez wiązania van der Waalsa jest ciasne upakowanie aminokwasów

W środowisku wodnym łańcuch polipeptydowy zwija się chowając boczne łańcuchy hydrofobowe do wnętrza cząsteczki

Białko może składać się z kilku podjednostek globularnych zwanych domenami

Model jednoprzejściowy zakłada możliwość istnienia tetramerów hemoglobiny składających się tylko z podjednostek o takiej samej konformacji.

Model sekwencyjny zakłada możliwość istnienia tetramerów hemoglobiny składających się z podjednostek o różnej konformacji.

ujemna wartość enztalpi swobodnej reakcji oznacza że reakcja zachodzi spontanicznie z dużą szybkością

dodatnia wartość entalpi reakcji (delta H>0) utrudnia a dodatnia wartośc entropii (deltaS>0) ułatwia spontaniczność reakcji

enzym wpływa na szybkość reakcji, a nie na stałą

Kofaktory(koenzymy ) będące małymi cząsteczkami organicznymi są często pochodnymi witamin

koenzym to kofaktor

enzym bez kofaktora to apoenzym

koenzym silnie związany z enzymem nazywamy grupą prostetyczną

wyróżniamy dwa rodzaje ko faktorów, jony metali oraz koenzymy

specyficzność enzymu oznacza zarówno zdolnośc enzymu do katalizy tylko reakcji specyficznego typu reakcji ściśle pokrewnych oraz wyboru substratów przekształcanego w produkt .

Białka pełnią rolę enzymów w układach biologicznych

enzymy przyśpieszają reakcję zwykle 10-10^6 razy w stosunku do odpowiedniej reakcji nie katalizowanej.