Fiszki
inżynieria genetyczna
Test w formie fiszek Jedziemy z tym
Ilość pytań: 119
Rozwiązywany: 950 razy
81.Zakładajac ze polimeraza Taq nie traci aktywności, a substraty PCR nie ulegają
rozkładowi, można powiedzieć, że docelowa sekwencja DNA jest powielona po n-cyklach:
e) 2(n-2) razy
c) n razy
d) n2n razy
b) 2n razy
a) n2 razy
b) 2n razy
83. Spośród podanych
temperatur wybrać która z największym powodzeniem da wydajne
otrzymanie produktów PCR przeprowadzając dla startera 5’
GGTAATCGGTTAGGCTCC3’:
e) żadna
d) 55°C
b) 72°C
c) 59°C
a) 56°C
a) 56°C
84.Który z podanych czynników istotny dla jednej z metod pozwalających na otrzymanie
cDNA jest głównym winowajcą odpowiedzialnym za brak w cDNA informacji reprezentującej 5’
koniec transkryptu:
e) nie wiadomo
c) 5’AGCAATGG3’ 3’TCGTTACC5’
a) 5’AGCAATGG3’ 3’TCGT5’
d) 5’AGGAA3’ 3’TCGTTACC5’
b) 5’AGCAATGG3’ 3’ACC5’
b) 5’AGCAATGG3’ 3’ACC5’
85.Wektor plazmidowy zawiera gen markerowy odpowiadający za odporność na erytromycynę
(EryR) i gen markerowy odpowiedzialny za oporność na ampicylinę. Gen AmpR został przecięty
enzymem restrykcyjnym a powstały w ten sposób plazmid połączono z fragmentem 1000pz o
końcach komplementarnych do wektora. Które z poniższych fenotypów maja komórki
transformowane:
b) niewrażliwe na ampicylinę i wrażliwe na erytromycynę
c) wrażliwe na ampicylinę i wrażliwe na erytromycynę
e) nie wiadomo
d) wrażliwe na ampicylinę i niewrażliwe na erytromycynę
a) niewrażliwe na ampicylinę i niewrażliwe na erytromycynę
d) wrażliwe na ampicylinę i niewrażliwe na erytromycynę
86.Kolista cząsteczka DNA posiada n-miejsc restrykcyjnych EcoRI. Ile fragmentów DNA
powstanie po całkowitym jej strawieniu?
NIE MA TU ODPOWIEDZI DOBREJ ZAZNACZONEJ
87. Pożywka płynna M9: tutaj też nie czaję co ma być jako dobra odpowiedź
88. W celu otrzymania preparatu DNA plazmidowego z kom. bakteryjnej dodano NaOH w
takiej ilości, iż wartość pH wynosila ok. 12,35. Które z opisow sa prawdziwe: /
Przygotowano ekstrakt z DNA, do którego dodano NaOH przez co pH zwiększyło się do
12,35. Jakie cechy tego eksrtaktu:
A) w tych warunkach caly dsDNA jaki znajdowal sie w komorce ulegl denaturacji do formy jednoniciowej
B) w takich warunkach do formy jednoniciowej nie ulegnie denaturacji tylko superzwinięty DNA (supercoiled)
F) w tych warunkach denaturacji nie ulegnie cDNA może ulec, ponieważ jest liniowe
H) po zkwaszeniu do ph 7.0 DNA chromosomalny bakteryjny asocjuje z DNA plazmidowym
C) w tych warunkach wszystkie koliste czasteczki ulegaja dysocjacji plazmidowe DNA
D) po zakwaszeniu (do pH ok. 7,00) ekstraktu łatwo można oddzielić zdenaturowany DNA plazmidowy od DNA chromosomowego bakterii denaturacji ulega DNA chromosomowy,
G) po zakwaszeniu do ph 7.0 DNA plazmidowy asocjuje z DNA bakteryjnym wytłumaczenie poniżej
E) po zakwaszeniu ekstraktu do pH ok. 7.00 tak przygotowany zdenaturowany DNA chromosomowy bakterii moze byc latwo oddzielony od plazmidowego
A) w tych warunkach caly dsDNA jaki znajdowal sie w komorce ulegl denaturacji do formy jednoniciowej
89. Pewien student zamierzał otrzymać bibliotekę z mutacjami kasetowymi w obrębie
centrum aktywnego enzymu XYZ. Gen XYZ dał do wektora pUC18, wstawił go tak, że nie
zaburzał ramki odczytu LacZ', czyli gdy dało sie do odpowiedniej komórki (takiej, w której
daje sie prowadzić selekcję biało-niebieską) powstaje aktywna B-galaktozydaza. wyciął
kasetę, którą chciał zmienić, oddzielił przez elektroforezę od reszty wektora, wziął wektor
bez kasety i fosfatazą usunął reszty fosforanowe z 5' końców - żeby nie doszło do
samoligacji wektora, po czym dodał syntetyczne oligonukleotydy.
f) to jest popierdolone zadanie, układane przez idiotę, gdzie treść jest wzięta z kosmosu, a student który wykonywał ten eksperyment łamie wszelkie prawa inżynierii genetycznej Nie wiadomo o co chodzi w tym zadaniu, treść jest mało jasna i nieprecyzyjna, czegoś brakuje, gdzie ta kaseta – równie dobrze mógł wyciąć kawałek LacZ’ . Ktoś niedokładnie przepisał treść zadania generalnie jest tak ! nietransformowane – nie rosną na ampi transformowane nierekombinowane – z X-Gal produkt niebieski transformowane rekombinowane – z X-Gal produkt biały
f) to jest popierdolone zadanie, układane przez idiotę, gdzie treść jest wzięta z kosmosu, a student który wykonywał ten eksperyment łamie wszelkie prawa inżynierii genetycznej Nie wiadomo o co chodzi w tym zadaniu, treść jest mało jasna i nieprecyzyjna, czegoś brakuje, gdzie ta kaseta – równie dobrze mógł wyciąć kawałek LacZ’ . Ktoś niedokładnie przepisał treść zadania generalnie jest tak ! nietransformowane – nie rosną na ampi transformowane nierekombinowane – z X-Gal produkt niebieski transformowane rekombinowane – z X-Gal produkt biały
90. Mamy gen w pojedynczej kopii. Chcac go wykryc uzyto sondy o odpowiednio do niego
(tego genu) komplementarnej sekwencji. Byla to metoda fluorescecyjna FISH
(Fluorescence in situ hybridization), a eksperyment przeprowadzono na chromosomach w
trakcie profazy (mitozy?). Co zaobserwowano:
NIE MA ODPOWIEDZI
NIE MA ODPOWIEDZI
.91. Cztery klony BAC
fragmentow ludzkiego genomowego DNA (A, B, C, D) zbadano na
obecnosc sekwencji STS (5 sekwencji oznaczonych 1-5). Ich obecnosc w poszczegolnych
genach przedstawia tabelka poniżej, przy czym + oznacza obecnosc STS w danym klonie:
zobaczyć w bazie bo jest tabela i wytłumaczenie zadania, a nie ma zaznaczonej dobrej odpowiedzi
zobaczyć w bazie bo jest tabela i wytłumaczenie zadania, a nie ma zaznaczonej dobrej odpowiedzi
92. Rysunek wektora pGEM3Z i wskazać cechy prawdziwe:
d) może tworzyć dsRNA służy do transkrypcji in vitro i otrzymywania dsRNA do wyciszania genowego sond do hybrydyzacji
c) może być użyty do otrzymywania ssDNA
a) jest kosmidem
b) ma gen markerowy do ekspresji genu w organizmie drożdżowym
d) może tworzyć dsRNA służy do transkrypcji in vitro i otrzymywania dsRNA do wyciszania genowego sond do hybrydyzacji
93. Rysunek z wektorem YAC
d) od razu po trawieniu enzymami restrykcyjnymi można przystąpić do ligacji YAC z insertem
a) na podłożu minimalnym z TRP można wyselekcjonować sztuczny chromosom
b) po wklonowaniu insertu inaktywacja SUP4
c) stosowane drożdże to mutanty podwójnie auksotroficzne
b) po wklonowaniu insertu inaktywacja SUP4
c) stosowane drożdże to mutanty podwójnie auksotroficzne
94. Po przeprowadzeniu sekwencjonowania DNA wedlug metody dideoksy
Sangera
(korzysta sie z analogow 2',3'-dideoksytrifosforanow nukleotydów) otrzymano
przedstawiony nizej autoradiogram:
Odczytujemy wynik sekwencjonowania od od 5’ końca do 3’ (5’TGCAT3’)
Tworzymy nić komplementarną ( ta będzie matrycową) (3’ACGTA5’)
Zapisujemy nić w ogólnie przyjętej konwencji (5’-->3’) (5’ATGCA3’)
1
Odczytujemy wynik sekwencjonowania od od 5’ końca do 3’ (5’TGCAT3’)
2
Tworzymy nić komplementarną ( ta będzie matrycową) (3’ACGTA5’)
3
Zapisujemy nić w ogólnie przyjętej konwencji (5’-->3’) (5’ATGCA3’)
95. Plazmid X ma gen markerowy AmpR czyli na ampicyline opornosc. Bierzemy jakiś inny
plazmid co ma geny oporności na ampicylinę, chloramfenikol, erytromycynę, itp, itd.
Tniemy go i kolekcję otrzymanych fragmentów wklonowujemy w nasz plazmid X, ten
przenosimy do komórek i szukamy rekombinantów które dostały gen ooprności na
chloramfenikol - jakich podłóż możemy użyć:
E) erytromycyna i chloramfenikol
C) z chloramfenikolem
A) z ampicyliną
D) erytromycyna i ampicylina
B) z chloramfenikolem i ampicyliną
E) erytromycyna i chloramfenikol
C) z chloramfenikolem
B) z chloramfenikolem i ampicyliną
96. Chromosome walking. Które czynności wybierzesz (niektóre) i w jakiej kolejności je
ułożysz żeby otrzymac klony reprezentujące odcinek dna o długości 200kb. Na 1 koncu ma
być gen A do którego już masz klon i możesz z niego zrobic sonde, na drugim koncu ma
być gen odp za nowotwor piersi / Wyobraź sobie ze dysponujesz klonem (tzn. sekwencją)
jakiegos genu, który, mozesz przypuszczac na podstawie analiz genetycznych, jest
zlokalizowany w odleglosci nie wiekszej niz 200kb od genu odpowiedzialnego za
powstawanie jakies choroby (nowotworu). Sposrod podanych ponizej czynności prosze
wybrac TYLKO NIEKTORE skladajace sie w odpowiedniej sekwencji na eksperyment
(technike) ktory pozwoli na odczytanie sekwencji w tym obszarze 200kb.
A) czesciowe trawienie DNA enzymem BamHI w celu otrzymania zachodzących na siebie (względem sekwencji) fragmentow o dl ok. 20 kb
H) przeszukiwanie biblioteki przy pomocy sondy przygotowanej w oparciu o sekwencje genu A w etapie pierwszym, potem izolacja klonu hybrydowanego z sonda
C) izolacja ludzkiego genomowego DNA
G) otrzymanie biblioteki w fagu lambda
F) powtarzanie czynności opisanych w poprzednich dwóch etapach do momentu otrzymania odpowiedniej ilości klonow
I) subklonowanie fragmentu z konca nowoizolowanego klonu w celu otrzymania nowej sondy do ponownego przeszukiwania biblioteki i identyfikacji nowego klonu hybrydyzowanego z sond
1
C) izolacja ludzkiego genomowego DNA
2
A) czesciowe trawienie DNA enzymem BamHI w celu otrzymania zachodzących na siebie (względem sekwencji) fragmentow o dl ok. 20 kb
3
G) otrzymanie biblioteki w fagu lambda
4
H) przeszukiwanie biblioteki przy pomocy sondy przygotowanej w oparciu o sekwencje genu A w etapie pierwszym, potem izolacja klonu hybrydowanego z sonda
5
I) subklonowanie fragmentu z konca nowoizolowanego klonu w celu otrzymania nowej sondy do ponownego przeszukiwania biblioteki i identyfikacji nowego klonu hybrydyzowanego z sond
6
F) powtarzanie czynności opisanych w poprzednich dwóch etapach do momentu otrzymania odpowiedniej ilości klonow
97. Podane nizej enzymy restrykcyjne trawia DNA w specyficznych miejscach (jak
ponizej):
BamHI NheI Xbal EcoRI
5’-GˇGATCC-3’ 5’-GˇCTAGC-3’ 5’-TˇCTAGA-3’ 5’-GˇAATTC-3’
3’-CCTAG^G-5’ 3’-CGATC^G-5’ 3’-AGATC^T-5’ 3’-CTTAA^G-3’
Wszystkie one hydrolizuja wiazanie fosfodiestrowe pomiedzy pierwszym a drugim
nukleotydem (liczac od 5' konca każdej linii), przy czym produkty ....(tu niestety brak
tresci ale to raczej malo istotne)
Sposrod podanych ponizej zdan prosze wybrac prawdziwe:
C)NheI i Xbal są izoschizomerami
A) EcoRI i BamHI to izoschizomerami
B) fragmenty poddane restrykcji przez NheI i Xbal mogą byc smialo ze soba zligowane
D) NheI i Xbal są izokaudomerami
B) fragmenty poddane restrykcji przez NheI i Xbal mogą byc smialo ze soba zligowane
D) NheI i Xbal są izokaudomerami
98. były różne wartości/ W celu przeprowadzenia trawienia enzymem restrykcyjnym XYZ
do 14ml próbki zawierającej DNA dodano 2 ml odpowiedniego dla tego enzymu buforu, 2
ml roztworu zawierającego enzym i 2 ml wody destylowanej, tak przygotowana mieszanina
reakcyjna pracowała na optymalnych parametrach i z dużą wydajnością substratową.
Wiedząc, że optymalne dla enzymu XYZ stężenie NaCl wynosi 100mM można
wywnioskować iż w buforze wyjściowym wartość stężenia tej soli wynosi:
a) 200mM
e) trudno powiedzieć bo za mało informacji
b) 1000mM
c) 50mM
d) 500mM
b) 1000mM
99. Mamy16 µl DNA w probowce. Do tego dodajemy kolejno 2 µl buforu oraz 2 µl
roztworu z enzymem. Skoro optymalne stężenie NaCl dla enzymu to 50mM to jakie bylo
wyjsciowe stezenie tej soli dodawanym buforze
B) 10mM
D) 500mM
E) trudno powiedziec bo za malo informacji
C) 50mM
A) 200mM
D) 500mM
100. Mamy opisany eksperyment restrykcji jakiegoś faga. Najpierw 14ul DNA w
probówce. Do tego dodajemy kolejno: 2ul buforu i 2 ul roztworu z enzymem. Skoro
optymalne stężenie NaCl dla enzymu to 100mM to jakie było wyjściowe stężenie tej soli
dodawanym buforze?
d) 500mM
b) 1000mM
c) 50mM
a) 200mM
e) trudno powiedzieć bo za mało informacji
b) 1000mM
101. W trakcie elektroforezy w żelu agarozowym, w nieobecności bromku etydyny:
D) superzwiniete czasteczki dsDNA poruszaja sie wolniej niz odpowiednie im zlinearyzowane
F) liniowe ds. DNA porusza się szybciej niż odpowiadające mu koliste sdDNA im wyższy stopień skręcenia tym większa ruchliwość cząsteczki
B) czasteczkki dsDNA sa obdarzone ladunkiem dodatnim
C) liniowe czasteczki dsDNA poruszaja sie tym szybciej im sa krotsze
A) czasteczka dsDNA porusza sie w kierunku elektrody ujemnej
E) fragmenty dsDNA o dlugosci 1006bp i 1007bp moga byc rozdzielone w celu preparatywnym.
C) liniowe czasteczki dsDNA poruszaja sie tym szybciej im sa krotsze