Fiszki
inżynieria genetyczna
Test w formie fiszek Jedziemy z tym
Ilość pytań: 119
Rozwiązywany: 945 razy
41. Komórki większości szczepów bakteryjnych, używanych w laboratorium inżynierii genetycznej,
mogą być hodowane w pożywce płynnej. Dostarcza ona różnych składników potrzebnych dla
wzrostu kultury bakteryjnej. Jedną ze znanych pożywek jest minimalna pożywka M9. Które z
podanych poniżej charakterystyk/opisów są prawdziwe w odniesieniu do pożywki M9:
d) pozwala ona na prowadzenie hodowli komórek bakteryjnych w ściśle zdefiniowanych warunkach
e) po dodaniu do niej glukozy otrzymamy pożywkę LB
c) zawiera wyłącznie związki nieorganiczne
a)jednym ze standardowych jej składników, koniecznym dla prawidłowego wzrostu kultury, jest antybiotyk ampicylina
b)pożywka zawiera wyłącznie związki organiczne
d) pozwala ona na prowadzenie hodowli komórek bakteryjnych w ściśle zdefiniowanych warunkach
42. Profilowane genetyczne wymaga identyfikacji
wariantów sekwencji typu STR (short tandem
repeats) w allelach. W tym celu wykonywany jest PCR a następnie analiza produktów amplifikacji.
Typowa analiza polega na określeniu:
c) Mapy restrykcyjnej produktów
a) Polarności produktów
b) Sekwencji produktów
e) masy (..)
d) Polimorfizmu pojedynczych nukleotydow
c) Mapy restrykcyjnej produktów
b) Sekwencji produktów
e) masy (..)
d) Polimorfizmu pojedynczych nukleotydow
43. W celu otrzymania preparatu DNA plazmidowego z kom. Bakteryjnej dodano NaOH w takiej
ilości, iż wartość pH wynosila ok. 12,35. Które z opisow sa prawdziwe :
d) po zakwaszeniu (do pH ok. 7,00) ekstraktu łatwo można oddzielić zdenaturowany DNA plazmidowy od DNA chromosomowego bakterii
c) w takich warunkach do formy jednoniciowej nie ulegnie denaturacji tylko superzwinięty DNA (supercoiled)
e) po zakwaszeniu ekstraktu do pH ok. 7.00 tak przygotowany zdenaturowany DNA chromosomowy bakterii moze byc latwo oddzielony od plazmidowego
b) w takich warunkach do formy jednoniciowej ulegnie denaturacji tylko superzwinięty DNA (supercoiled)
a) w tych warunkach caly dsDNA jaki znajdowal sie w komórce ulegl denaturacji do formy jednoniciowej
e) po zakwaszeniu ekstraktu do pH ok. 7.00 tak przygotowany zdenaturowany DNA chromosomowy bakterii moze byc latwo oddzielony od plazmidowego
44. Kolisty DNA poddano linearyzacji enzymem dającym końce lepkie (5’wystające) a następnie
potraktowano go nukleaza S1 i po zahamowaniu aktywności tejże nukleazy użyto terminalnej
transferazy przy obecnościdNTP. Najprawdopodobniej końce powstałego fragmentu DNA będą
miały charakter taki jak te pokazane w punkcie:
a) 5’AGCAATGGC3’ 3’CTAGTCGT5’
b) 5’AGCAATGG3’ 3’ACC5’
c) 5’AGCAATGG3’ 3’TCGTTACC5’
d) 5’ACTAGCAA3’ 3’TCGTTACC5’
e) żadne z powyższych – nie wiadomo jaka była sekwencja kodonów powstałych po trawieniu wektora
a) 5’AGCAATGGC3’ 3’CTAGTCGT5’
45. Spośród podanych poniżej temperatur hybrydyzacji proszę wybrać tę, która pozwoli z
najwyższym prawdopodobieństwem na wydajne otrzymanie specyficznego produktu w PCR
przeprowadzonym przy udziale następującej pary starterów
5’GGTAATCGGTTAGGCTCC3’oraz 5’GGAGCCTAACCGATTACC3’
a)56 st. C
c)59 st. C
b)72 st. C
e)żadna z powyższych temperatur
d)55 st. C
a)56 st. C
46. Anemia sierpowata jest wynikiem mutacji występującej w recesywnym allelu genu (jakimś
tam). Mutacja powoduje, iż w genomie brak jest charakterystycznego dla sekwencji dzikiej miejsca
restrykcyjnego Mst II. W konsekwencji analiza Southerna( Southern Blotting) identyfikuje tylko
jeden fragment DNA (1.3 kb) dla allelu zmutowanego i dwa fragmenty (1,1 kb i 0,2 kb) dla allelu
dzikiego gdy przed analizą DNA jest trawiony enzymem Mst II. Poniżej podano opisy różnych
wyników analizy Southerna. Który z nich odpowiada parze rodziców, których dziecko z 25 %
prawdopodobieństwem będzie chore na anemię sierpowatą:
d) analiza wykazała obecność fragmentu 1,3 u jednego z rodziców i fragmentów 1,1 kb i 0,2 kb u drugiego
c) analiza wykazała obecność 1,3 kb u jednego z rodziców i 0,2 kb u drugiego
b) analiza wykazała obecność fragmentów 1,3 kb i 0,2 kb u obojga z rodziców
e) analiza wykazała obecność fragmentów 1,3 kb, 1,1 kb i 0,2 kb u obojga rodziców
a)analiza wykazała obecność fragmentów 1,1 kb i 0,2 kb u obojga z rodziców
e) analiza wykazała obecność fragmentów 1,3 kb, 1,1 kb i 0,2 kb u obojga rodziców
47. Poniżej przedstawiono wynik analizy elektroforetycznej produktów PCR otrzymanych w wyniku
eksperymentu, którego celem było oznaczenie płci na podstawie analizy DNA wyizolowanego z
próbek archeologicznych. Ślad 1 standard wagowy (marker), ślady 2,3,4 analiza 3 produktów PCR.
Podczas eksperymentu zastosowano typowe dla tego typu analizy startery, które eliminują
możliwość otrzymania niejednoznacznego wyniku, gdy PCR nie będzie miało miejsca- na przykład z
powodu słabej jakości matrycy. Które z poniższych stwierdzeń są prawdziwe:
c) startery użyte w trakcie PCR były skierowane do charakterystycznych sekwencji obecnych w chromosomie Y
b) startery użyte w trakcie PCR były skierowane do genu, którego warianty obecne są na chromosomie X jak i chromosomie Y
e) obraz otrzymany po analizie elektroforetycznej wskazuje, że próbka 2 pochodzi od osoby płci męskiej (jeden chromosom Y)
a)startery użyte w trakcie PCR były skierowane do charakterystycznych sekwencji obecnych w chromosomie X
d)obraz otrzymany po analizie elektroforetycznej wskazuje, że próbka 2 pochodzi od osoby płci żeńskiej (dwa chromosomy X)
b) startery użyte w trakcie PCR były skierowane do genu, którego warianty obecne są na chromosomie X jak i chromosomie Y
48. Wektor plazmidowy posiada gen markerowy Amp odpowiadający za odporność
transformowanych bakterii na ampicylinę. Jedno z miejsc restrykcyjnych zlokalizowanych w
obrębie sekwencji wielokrotnego klonowania (MCS) tego wektora zostało strawione enzymem
restrykcyjnym a powstały w ten sposób zlinearyzowany plazmid ligowano z biblioteką fragmentów
DNA o komplementarnych do wektora końcach. Biblioteka zastała otrzymana z plazmidu
odpowiedzialnego za oporność niektórych szczepów bakteryjnych na działanie ampicyliny,
chloramfenikolu, erytromycyny i innych antybiotyków. Poniżej podano zawartość antybiotyków w
kilku różnych podłożach stałych. Które z tych podłoży mogą być użyte do wyselekcjonowania klonu
zawierającego gen kodujący acetylotransferazę chloramfenikolu, enzym który modyfikując
chloramfenikol zmienia go w związek nietoksyczny dla komórek bakteryjnych?
d. Ampicylina, erytromycyna
c. Chloramfenikol
e. Erytromycyna i chloramfenikol
b. Ampicylina i chloramfenikol
a. Ampicylina
c. Chloramfenikol
b. Ampicylina i chloramfenikol
49. Wektor plazmidowy poddany linearyzacji enzymem EcoRI został, bezpośrednio po inaktywacji
enzymu, użyty do ligacji z ds. DNA powstałym w wyniku hybrydyzacji dwóch syntetycznych
oligonukleotydów (insert); syntetyczny ds. DNA został tak zaprojektowany, iż posiada końce
identyczne z końcami wektora (EcoRI). Mieszaniną koligacyjną poddano transformacji komórki
bakteryjne i wysiano je na podłoże zawierające odpowiedni dla wektora antybiotyk. Które z
podanych poniżej twierdzeń są prawdziwe ( zakładamy, że analizie poddano odpowiednio dużą
ilość klonów):
a. Pośród powstałych klonów można było zaobserwować klony zawierające wektor pozbawiony insertu
d. Ligacji insertu i cząsteczki wektora towarzyszyło powstanie 4 wiązań fosfodiestrowych
c. pośród powstałych klonów można było zaobserwowac wektor zawierajacy wiecej niż jeden fragment / wśród powstałych klonów można było zaobserwować klony zawierające wektor z wbudowanymi kilkoma fragmentami
b. Pośród powstałych klonów można było zaobserwować klony zawierające rekombinowany wektor z wbudowanym jednym insertem
e. Ligacji insertu i cząsteczki wektora towarzyszyło powstanie 2 wiązań fosfodiestrowych
a. Pośród powstałych klonów można było zaobserwować klony zawierające wektor pozbawiony insertu
d. Ligacji insertu i cząsteczki wektora towarzyszyło powstanie 4 wiązań fosfodiestrowych
b. Pośród powstałych klonów można było zaobserwować klony zawierające rekombinowany wektor z wbudowanym jednym insertem
50. Przy pomocy techniki primer extension można mapować (określić, zlokalizować) 5’ koniec
transkryptu. W tym samym celu można też posłużyć się techniką wykorzystującą nukleazę S1 (S1
mapping). Która z podanych poniżej czynności/informacji nie ma miejsca ( nie jest prawdziwa) w
przypadku pierwszej z wymienionych technik? GC 190
d. Wariant tej techniki może być użyty do mapowania 3’ końca transkryptu
e. Reakcja przy udziale rekombinowanego enzymu posiadającego aktywność enzymu używanego przez retrowirusy do syntezy DNA na matrycy RNA
c. Hybrydyzacja
a. Znakowanie DNA
b. Denaturacja DNA i elektroforeza
d. Wariant tej techniki może być użyty do mapowania 3’ końca transkryptu
e. Reakcja przy udziale rekombinowanego enzymu posiadającego aktywność enzymu używanego przez retrowirusy do syntezy DNA na matrycy RNA
b. Denaturacja DNA i elektroforeza
51. Które z twierdzeń dotyczących reakcji łańcuchowej polimeryzacji (PCR) są prawdziwe?
b. Mieszanina reakcyjna PCR zawiera m. in. trifosforany czterech rybonukleotydów i polimerazę DNA.
a. Cykl PCR obejmuje trzy etapy: denaturację w temperaturze 95 st. C, hybrydyzację w temperaturze zależnej od długości startera oraz elongację, którą zwykle prowadzi się w temperaturze 72 st. C.
c. Może być wykorzystana do wykrywania rearanżacji chromosomalnych powodujących niektóre formy białaczek.
d. PCR może być wykorzystywany podczas mutagenezy ukierunkowanej sterowanej przez oligonukleotydy.
e. W przeciwieństwie do reakcji sekwencjonowania DNA metodą dideoksy, PCR wymaga dwóch starterów, które są do siebie komplementarne.
a. Cykl PCR obejmuje trzy etapy: denaturację w temperaturze 95 st. C, hybrydyzację w temperaturze zależnej od długości startera oraz elongację, którą zwykle prowadzi się w temperaturze 72 st. C.
c. Może być wykorzystana do wykrywania rearanżacji chromosomalnych powodujących niektóre formy białaczek.
d. PCR może być wykorzystywany podczas mutagenezy ukierunkowanej sterowanej przez oligonukleotydy.
52. Wektor kosmidowy został poddany ligacji z fragmentami DNA o przypadkowej (różnej) długości
w celu przygotowania biblioteki genomowej człowieka. Maksymalna długość insertów
składających się na bibliotekę będzie najprawdopodobniej wynosić:
b. 40 kb
a. 15 kb
c. 150 kb
d. 23 kb
e. 8 kb
b. 40 kb
53. W pewnym laboratorium postanowiono zidentyfikować w bibliotece cDNA pochodzącej z
komórek człowieka klon odpowiadający genowi XYZ. W tym celu postanowiono posłużyć się
techniką hybrydyzacji z użyciem sondy, będącej fragmentem cDNA genu homologicznego,
zidentyfikowanego uprzednio podczas analizy klonów, pochodzących z biblioteki otrzymanej z
komórek Drosophila melanogaster. Jaka, Twoim zdaniem, powinna być temperatura hybrydyzacji
sondy z repliką biblioteki, zawierającej klon poszukiwanego genu, wykonaną na krążku
nitrocelulozowym?
e. Nie można tego powiedzieć dysponując tylko informacjami podanymi w zadaniu.
d. Podczas hybrydyzacji temperatura powinna wynosić 98 st. C.
a. Taka sama jak temperatura hybrydyzacji sondy z klonem Drosophila.
b. Niższa od temperatury hybrydyzacji sondy z klonem Drosophila.
c. Wyższa od temperatury hybrydyzacji sondy z klonem Drosophila.
b. Niższa od temperatury hybrydyzacji sondy z klonem Drosophila.
54. Które z podanych poniżej enzymów będą dawały produkty, które można poddać, bez
dodatkowych zabiegów, radioaktywnemu znakowaniu przy pomocy [α32P]-dATP i fragmentu
Klenowa? W nawiasach podano sekwencje, dla uproszczenia tylko jednej z nici, rozpoznawanej
przez odpowiednie enzymy, gwiazdka oznacza położenie trawionego wiązania fosfodiestrowego.
a. EcoRI(GA*ATTC)
b. PstI(CTGCA*G)
d. HpaII(C*CGG)
e. BglII(A*GATCT)
c. SmaI(CCC*GGG)
a. EcoRI(GA*ATTC)
b. PstI(CTGCA*G)
d. HpaII(C*CGG)
e. BglII(A*GATCT)
55. Poniżej podany jest schemat wektora. Korzystając z przedstawionych na wykresie informacji
proszę wybrać tę z cech/charakterystyk, która jest prawdziwa: NIE MA TU ODPOWIEDZI DOBREJ ZAZNACZONEJ POPATRZEĆ NA BAZĘ I PRZECZYTAĆ WYJAŚNIENIA
56. (otwarte) W pewnym laboratorium posiadano tylko dwa enzymy restrykcyjne EcoRI
EcoRI(GA*ATTC) oraz HpaII (C*GGG). Który z nich powinien być użyty do optymalnego
przygotowania fragmentów DNA składających się na reprezentatywną bibliotekę
genomową (w wektorze będącym pochodną geny faga lambda). Odpowiedź proszę
uzasadnić. TO TEŻ ZOBACZYĆ W BAZIE
57. (otwarte) Co byłoby skutkiem całkowitego zastąpienia jednego z dNTP mieszaniny
reakcyjnej używanej do sekwencjonowania DNA metodą Sangera przez jego 2’,3’-
dideoksyanalog? Odpowiedź proszę uzasadnić ZOBACZYĆ W BAZIE
58. Spośród podanych poniżej zestawów proszę wybrać zawerający najwłaściwsze
uzupełnienia dla następującego twierdzenia: “ddNTP, używany do sekwencjonowania
DNA metodą Sangera charakteryzuje się tym, że nie posiada on …....... przy węglach ….....
i ….... .”
b) metyl, 2’, 3’
e) żaden z powyższych
a) OH, 2’, 3’
d) OH, 2’, 5’
c) karboksyl, 2’, 3’
a) OH, 2’, 3’
59. Które z poniżych twierdzeń jest prawdziwe w odniesieniu do real- time PCR?
c) ilość produktu powstającego podczas real- time PCR może być precyzyjnie określona przez pomiar fluorescencji związku specyficznie wiążącego (niekowalencyjnie) dsDNA
a) metoda ta pozwala na określenie ilości DNA w analizowanej próbce
h) może służyć do oznaczenia stężenia RNA, jeśli na początku eksperymentu użyje się odwrotnej transkryptazy
e) metoda ta jest tożsama z tzw. ilościową PCR (quantitative PCR)
g) stosuje się sondę reporterową hybrydyzującą z produktem
f) stosuje się związek wiążący się niekowalencyjnie do dwuniciowego DNA- barwnik wiąże się do dwuniciowego DNA, tyle jest w książce, ale nie wiem jakie jest to wiązanie, czy kowalencyjne czy też nie? Zaznaczam na czerwono dlatego.
b) metoda ta pozwala na określenie ilości transkryptów analizowanego genu
d) ilość produktu powstającego podczas real- time PCR może być precyzyjnie określona przez pomiar fluorescencji związku kowalencyjnie przyłączonego do jednego z końców oligonukleotydu pełniącego funkcję specyficznej sondy wiążącej się z produktem amplifikacji
a) metoda ta pozwala na określenie ilości DNA w analizowanej próbce
h) może służyć do oznaczenia stężenia RNA, jeśli na początku eksperymentu użyje się odwrotnej transkryptazy
g) stosuje się sondę reporterową hybrydyzującą z produktem
b) metoda ta pozwala na określenie ilości transkryptów analizowanego genu
d) ilość produktu powstającego podczas real- time PCR może być precyzyjnie określona przez pomiar fluorescencji związku kowalencyjnie przyłączonego do jednego z końców oligonukleotydu pełniącego funkcję specyficznej sondy wiążącej się z produktem amplifikacji
60. Które z podanych poniżej informacji są prawdziwe w odniesieniu do ligacji fragmentów
DNA o koncach tępych przy pomocy topoizomerazy DNA?
b) wektor przygotowany do ligacji przy pomocy topoizomerazy, może też być, bez żadnych dodatkowych zabiegów, użyty do ligacji z syntetycznym ds. oligonukleotydem, przy pomocy ligazy T4
c) fragmenty DNA poddawane ligacji z wektorem, przy pomocy topoizomerazy, muszą posiadać końce tępe, pozbawione reszt kwasu fosforowego
d) reakcja ligacji przy pomocy topoizomerazy skutkuje powstaniem rekombinowanego DNA, w którym brakuje dwóch wiązań fosfodiestrowych,( wiązania te są formowane, po transformacji, przez geny komórki bakteryjnej
a) ligacja tego typu wymaga wektora, który musi byc poddany linearyzacji przy pomocy enzymu restrykcyjnego dającego produkty o końcach tępych
f) tworzy 4 wiązania fosfodiestrowe (tworzy 2 wiązania)Ligacja tępych końców za pomocą topoizomerazy DNA.
e) produkty nie posiadają 4 wiązań fosfodiestrowych
e) produkty nie posiadają 4 wiązań fosfodiestrowych