Pytania i odpowiedzi

inżynieria genetyczna

Zebrane pytania i odpowiedzi do zestawu. Jedziemy z tym
Ilość pytań: 119 Rozwiązywany: 946 razy
Pytanie 41
41. Komórki większości szczepów bakteryjnych, używanych w laboratorium inżynierii genetycznej, mogą być hodowane w pożywce płynnej. Dostarcza ona różnych składników potrzebnych dla wzrostu kultury bakteryjnej. Jedną ze znanych pożywek jest minimalna pożywka M9. Które z podanych poniżej charakterystyk/opisów są prawdziwe w odniesieniu do pożywki M9:
d) pozwala ona na prowadzenie hodowli komórek bakteryjnych w ściśle zdefiniowanych warunkach
Pytanie 42
42. Profilowane genetyczne wymaga identyfikacji wariantów sekwencji typu STR (short tandem repeats) w allelach. W tym celu wykonywany jest PCR a następnie analiza produktów amplifikacji. Typowa analiza polega na określeniu:
b) Sekwencji produktów
c) Mapy restrykcyjnej produktów
d) Polimorfizmu pojedynczych nukleotydow
e) masy (..)
Pytanie 43
43. W celu otrzymania preparatu DNA plazmidowego z kom. Bakteryjnej dodano NaOH w takiej ilości, iż wartość pH wynosila ok. 12,35. Które z opisow sa prawdziwe :
e) po zakwaszeniu ekstraktu do pH ok. 7.00 tak przygotowany zdenaturowany DNA chromosomowy bakterii moze byc latwo oddzielony od plazmidowego
Pytanie 44
44. Kolisty DNA poddano linearyzacji enzymem dającym końce lepkie (5’wystające) a następnie potraktowano go nukleaza S1 i po zahamowaniu aktywności tejże nukleazy użyto terminalnej transferazy przy obecnościdNTP. Najprawdopodobniej końce powstałego fragmentu DNA będą miały charakter taki jak te pokazane w punkcie:
a) 5’AGCAATGGC3’ 3’CTAGTCGT5’
Pytanie 45
45. Spośród podanych poniżej temperatur hybrydyzacji proszę wybrać tę, która pozwoli z najwyższym prawdopodobieństwem na wydajne otrzymanie specyficznego produktu w PCR przeprowadzonym przy udziale następującej pary starterów 5’GGTAATCGGTTAGGCTCC3’oraz 5’GGAGCCTAACCGATTACC3’
a)56 st. C
Pytanie 46
46. Anemia sierpowata jest wynikiem mutacji występującej w recesywnym allelu genu (jakimś tam). Mutacja powoduje, iż w genomie brak jest charakterystycznego dla sekwencji dzikiej miejsca restrykcyjnego Mst II. W konsekwencji analiza Southerna( Southern Blotting) identyfikuje tylko jeden fragment DNA (1.3 kb) dla allelu zmutowanego i dwa fragmenty (1,1 kb i 0,2 kb) dla allelu dzikiego gdy przed analizą DNA jest trawiony enzymem Mst II. Poniżej podano opisy różnych wyników analizy Southerna. Który z nich odpowiada parze rodziców, których dziecko z 25 % prawdopodobieństwem będzie chore na anemię sierpowatą:
e) analiza wykazała obecność fragmentów 1,3 kb, 1,1 kb i 0,2 kb u obojga rodziców
Pytanie 47
47. Poniżej przedstawiono wynik analizy elektroforetycznej produktów PCR otrzymanych w wyniku eksperymentu, którego celem było oznaczenie płci na podstawie analizy DNA wyizolowanego z próbek archeologicznych. Ślad 1 standard wagowy (marker), ślady 2,3,4 analiza 3 produktów PCR. Podczas eksperymentu zastosowano typowe dla tego typu analizy startery, które eliminują możliwość otrzymania niejednoznacznego wyniku, gdy PCR nie będzie miało miejsca- na przykład z powodu słabej jakości matrycy. Które z poniższych stwierdzeń są prawdziwe:
b) startery użyte w trakcie PCR były skierowane do genu, którego warianty obecne są na chromosomie X jak i chromosomie Y
Pytanie 48
48. Wektor plazmidowy posiada gen markerowy Amp odpowiadający za odporność transformowanych bakterii na ampicylinę. Jedno z miejsc restrykcyjnych zlokalizowanych w obrębie sekwencji wielokrotnego klonowania (MCS) tego wektora zostało strawione enzymem restrykcyjnym a powstały w ten sposób zlinearyzowany plazmid ligowano z biblioteką fragmentów DNA o komplementarnych do wektora końcach. Biblioteka zastała otrzymana z plazmidu odpowiedzialnego za oporność niektórych szczepów bakteryjnych na działanie ampicyliny, chloramfenikolu, erytromycyny i innych antybiotyków. Poniżej podano zawartość antybiotyków w kilku różnych podłożach stałych. Które z tych podłoży mogą być użyte do wyselekcjonowania klonu zawierającego gen kodujący acetylotransferazę chloramfenikolu, enzym który modyfikując chloramfenikol zmienia go w związek nietoksyczny dla komórek bakteryjnych?
b. Ampicylina i chloramfenikol
c. Chloramfenikol
Pytanie 49
49. Wektor plazmidowy poddany linearyzacji enzymem EcoRI został, bezpośrednio po inaktywacji enzymu, użyty do ligacji z ds. DNA powstałym w wyniku hybrydyzacji dwóch syntetycznych oligonukleotydów (insert); syntetyczny ds. DNA został tak zaprojektowany, iż posiada końce identyczne z końcami wektora (EcoRI). Mieszaniną koligacyjną poddano transformacji komórki bakteryjne i wysiano je na podłoże zawierające odpowiedni dla wektora antybiotyk. Które z podanych poniżej twierdzeń są prawdziwe ( zakładamy, że analizie poddano odpowiednio dużą ilość klonów):
a. Pośród powstałych klonów można było zaobserwować klony zawierające wektor pozbawiony insertu
b. Pośród powstałych klonów można było zaobserwować klony zawierające rekombinowany wektor z wbudowanym jednym insertem
d. Ligacji insertu i cząsteczki wektora towarzyszyło powstanie 4 wiązań fosfodiestrowych
Pytanie 50
50. Przy pomocy techniki primer extension można mapować (określić, zlokalizować) 5’ koniec transkryptu. W tym samym celu można też posłużyć się techniką wykorzystującą nukleazę S1 (S1 mapping). Która z podanych poniżej czynności/informacji nie ma miejsca ( nie jest prawdziwa) w przypadku pierwszej z wymienionych technik? GC 190
b. Denaturacja DNA i elektroforeza
d. Wariant tej techniki może być użyty do mapowania 3’ końca transkryptu
e. Reakcja przy udziale rekombinowanego enzymu posiadającego aktywność enzymu używanego przez retrowirusy do syntezy DNA na matrycy RNA
Pytanie 51
51. Które z twierdzeń dotyczących reakcji łańcuchowej polimeryzacji (PCR) są prawdziwe?
a. Cykl PCR obejmuje trzy etapy: denaturację w temperaturze 95 st. C, hybrydyzację w temperaturze zależnej od długości startera oraz elongację, którą zwykle prowadzi się w temperaturze 72 st. C.
c. Może być wykorzystana do wykrywania rearanżacji chromosomalnych powodujących niektóre formy białaczek.
d. PCR może być wykorzystywany podczas mutagenezy ukierunkowanej sterowanej przez oligonukleotydy.
Pytanie 52
52. Wektor kosmidowy został poddany ligacji z fragmentami DNA o przypadkowej (różnej) długości w celu przygotowania biblioteki genomowej człowieka. Maksymalna długość insertów składających się na bibliotekę będzie najprawdopodobniej wynosić:
b. 40 kb
Pytanie 53
53. W pewnym laboratorium postanowiono zidentyfikować w bibliotece cDNA pochodzącej z komórek człowieka klon odpowiadający genowi XYZ. W tym celu postanowiono posłużyć się techniką hybrydyzacji z użyciem sondy, będącej fragmentem cDNA genu homologicznego, zidentyfikowanego uprzednio podczas analizy klonów, pochodzących z biblioteki otrzymanej z komórek Drosophila melanogaster. Jaka, Twoim zdaniem, powinna być temperatura hybrydyzacji sondy z repliką biblioteki, zawierającej klon poszukiwanego genu, wykonaną na krążku nitrocelulozowym?
b. Niższa od temperatury hybrydyzacji sondy z klonem Drosophila.
Pytanie 54
54. Które z podanych poniżej enzymów będą dawały produkty, które można poddać, bez dodatkowych zabiegów, radioaktywnemu znakowaniu przy pomocy [α32P]-dATP i fragmentu Klenowa? W nawiasach podano sekwencje, dla uproszczenia tylko jednej z nici, rozpoznawanej przez odpowiednie enzymy, gwiazdka oznacza położenie trawionego wiązania fosfodiestrowego.
a. EcoRI(GA*ATTC)
b. PstI(CTGCA*G)
d. HpaII(C*CGG)
e. BglII(A*GATCT)
Pytanie 55
55. Poniżej podany jest schemat wektora. Korzystając z przedstawionych na wykresie informacji proszę wybrać tę z cech/charakterystyk, która jest prawdziwa: NIE MA TU ODPOWIEDZI DOBREJ ZAZNACZONEJ POPATRZEĆ NA BAZĘ I PRZECZYTAĆ WYJAŚNIENIA
Pytanie 56
56. (otwarte) W pewnym laboratorium posiadano tylko dwa enzymy restrykcyjne EcoRI EcoRI(GA*ATTC) oraz HpaII (C*GGG). Który z nich powinien być użyty do optymalnego przygotowania fragmentów DNA składających się na reprezentatywną bibliotekę genomową (w wektorze będącym pochodną geny faga lambda). Odpowiedź proszę uzasadnić. TO TEŻ ZOBACZYĆ W BAZIE
Pytanie 57
57. (otwarte) Co byłoby skutkiem całkowitego zastąpienia jednego z dNTP mieszaniny reakcyjnej używanej do sekwencjonowania DNA metodą Sangera przez jego 2’,3’- dideoksyanalog? Odpowiedź proszę uzasadnić ZOBACZYĆ W BAZIE
Pytanie 58
58. Spośród podanych poniżej zestawów proszę wybrać zawerający najwłaściwsze uzupełnienia dla następującego twierdzenia: “ddNTP, używany do sekwencjonowania DNA metodą Sangera charakteryzuje się tym, że nie posiada on …....... przy węglach …..... i ….... .”
a) OH, 2’, 3’
Pytanie 59
59. Które z poniżych twierdzeń jest prawdziwe w odniesieniu do real- time PCR?
a) metoda ta pozwala na określenie ilości DNA w analizowanej próbce
b) metoda ta pozwala na określenie ilości transkryptów analizowanego genu
d) ilość produktu powstającego podczas real- time PCR może być precyzyjnie określona przez pomiar fluorescencji związku kowalencyjnie przyłączonego do jednego z końców oligonukleotydu pełniącego funkcję specyficznej sondy wiążącej się z produktem amplifikacji
g) stosuje się sondę reporterową hybrydyzującą z produktem
h) może służyć do oznaczenia stężenia RNA, jeśli na początku eksperymentu użyje się odwrotnej transkryptazy
Pytanie 60
60. Które z podanych poniżej informacji są prawdziwe w odniesieniu do ligacji fragmentów DNA o koncach tępych przy pomocy topoizomerazy DNA?
e) produkty nie posiadają 4 wiązań fosfodiestrowych