BCHM 2015/2016 - 2018/2019 (I T)

harper: tiolaza -> syntaza HMG-CoA -> reduktaza HMG-CoA -> kinaza mewalonianowa (3 kinazy) -> epoksydaza skwalenowa -> lanosterocyklaza oksydoskwalenowa -> izomeraza -> reduktaza delta 24

herper: zaburzenia metabolizmu tryptofanu i metioniny ; wzrost wrażliwości na działanie hormonów steroidowych ; znaczenie w rozwoju hormonozależnych nowotworów (piersi, macicy, prostaty)

Cechą wyróżniającą tRNA od innych RNA jest występowanie, oprócz A, U, G i C, innych zasad, takich jak:hipoksantyna (nukleozyd inozyna) ?? Efekt wooble?

reakcja zachodzi samorzutnie od lewej do prawej ????

Km nie zmieni się,Vmax zmaleje

syntaza glikogenowa,dehydrogenaza pirogronianiowa

tRNA [nietypowe kodony - Nietypowe parowanie zasad pomiędzy nukleotydami innymi niż A-U i G-C może tworzyć się w trzeciej pozycji kodonu, to zjawisko znane jako wobble] ???

Spektrometria mas wykorzystywana jest także do badań strukturalnych białek, a szczególnie do ich identyfikacji. W tym celu oczyszczone białko początkowo poddaje się trawieniu na mniejsze fragmenty przy pomocy enzymu (zastosowanie znajdują tu proteazy, jak: chymotrypsyna, trypsyna oraz kolagenoza). Uzyskane peptydy wymywa się z żelu, a następnie poddaje analizie. Na spektrometrze MALDI-TOF otrzymuje się widmo, które ukazuje masy poszczególnych poptydów. Jest to mapa peptydowa, typowa dla każdego białka, co jest skutkiem specyfiki substratowej enzymu. Jako przykład można podać trypsynę, która zrywa wiązania w białku zawsze po resztach aminokwasowych lizyny i argininy, natomiast masy uzyskanych fragmentów zależne są od pozycji tych dwóch aminokwasów w sekwencji białkowej. W wyniku trawienia otrzymane masy peptydów są porównywane z masami peptydów wyni­kającymi z trawienia in silico sekwencji aminokwasowych, które są obecne w białkowych bazach danych. Metoda ta umożliwia jedynie identyfikację poznanych wcześniej białek

przez podjednostkę Gq

Acetylo-CoA, który powstaje w mitochondrium, zostaje przeniesiony do cytozolu w postaci cytrynianu, po kondensacji ze szczawiooctanem. W cytozolu liaza cytrynianowa zależna od ATP rozszczepia cytrynian do acetylo-CoA i szczawiooctanu. Następnie szczawiooctan przekształcany jest do jabłczanu, a ten następnie zostaje przekształcony do pirogronianu, który wraca do mitochondrium. Potem biosynteza kw tłuszczowych w cytozolu

https://pl.wikipedia.org/wiki/Choroba_syropu_klonowego XD

Dehydrataza ALA jest specyficznie hamowana przez jony ołowiu [haper: dehydrataza ALA jest metaloproteiną zawierającą cynk, hamowaną przez ołów..]

niektóre leki powodują wzmożoną ekspresję genu ALAS

streptomycyna,puromycyna,tetracykliny

kolagen I i II-postać klasyczna ?? (kości i chrząstki stawowe)

wzrost cGMP

Można się spodziewać, że w komórkach będzie istnieć 64 - 3 (STOP) = 61 rodzajów cząsteczek tRNA. Jest ich jednak mniej (ok. 30). Dzieje się tak dlatego, że jeden antykodon tRNA może parować z więcej niż jednym kodonem. Zapewniają to nietypowe oddziaływania G-U lub sporadyczne występowanie nietypowej zasady azotowej o specyficznych właściwościach - inozyny (I). Zjawisko to nosi nazwę wobble base pairing (wahające się oddziaływanie zasad) i dotyczy trzeciej zasady w kodonie w kierunku 5’ → 3’ Funkcje wobble- Pozwala rozpoznawać wiele kodonów dla tego samego aminokwasu, który niesie + zapewnienie, że tRNA nie dołączy złego kodonu

AAUCGG