molekularna egzamin

Posiada aktywność nukleazową 3-5 (egzonukleazowa 3-5)

Potrzebuje primera z 3OH wolna i matrycy

Wymagana w naprawie DNA

Posiada aktywność nukleazową 3-5 (egzonukleazowa 3-5)

Potrzebuje primera z 3OH wolna i matrycy

Wymagana w naprawie DNA

Wymagana w replikacji

Usuwa primer i wypełnia szczeliny podczas replikacji

Wymagana w naprawie DNA

Potrzebuje primera i matrycy

Wymagana w replikacji

Usuwa primer i wypełnia szczeliny podczas replikacji

Wymagana w naprawie DNA

Potrzebuje primera i matrycy

mechanizm katalizowanej reakcji wymaga utworzenia związania kowalencyjnie enzymadenylan

wymagana w replikacji DNA naprawy i rekombinacji

katalizuje reakcje przez mechanizm który wymaga aktywacji fosforanem DNA przez formowanie wiązania fosfobezwodnikowego z AMP

katalizuje tworzenie się wiązania 3’-OH i 5’P

katalizuje tworzenie się wiązania 3’-OH i 5’P

mechanizm katalizowanej reakcji wymaga utworzenia związania kowalencyjnie enzymadenylan

wymagana w replikacji DNA naprawy i rekombinacji

katalizuje tworzenie się wiązania 3’-OH i 5’P

katalizuje tworzenie się wiązania 3’-OH i 5’P

może być wydzielana z chromosomów sztucznych drożdży

może być analizowany przez wędrówkę wzdłuż chromosomu

musi posiadać końce kohezyjne do klonowania

mogą być odseparowane przez elektroforezę w żelu poliakryloamidowym

może być pakowany w fag

może być wydzielana z chromosomów sztucznych drożdży

może być analizowany przez wędrówkę wzdłuż chromosomu

musi posiadać końce kohezyjne do klonowania

jest metodą niszczenia patogenicznych bakterii

powoduje czułość komórki na antybiotyk

prowadzi do przeniesienia odporności na leki

jest nazywane inaktywacją insercyjną

może być używany do identyfikacji bakterii zawierających wektor z fragmentem DNA

może być używany do identyfikacji bakterii zawierających wektor z fragmentem DNA

tworzy pary A-C i G-T (nie, A-T i G-C

dwa polinukleotydowe łańcuchy są zwinięte wokół wspólnej osi

można zmieniać sekwencje w jednej nici niezależnie od drugiej nici

helisa ma pełny obrót o 34 st., bo każda para obraca się o 36 st. względem sąsiedniej pary zasady i oddalonego 3,4 A(helisa ma pełny obrót o 360 stopni)

puryny i pirymidyny znajdują się w wewnętrznej stronie helisy, a szkielet fosfodiestrowy na zewnątrz

puryny i pirymidyny znajdują się w wewnętrznej stronie helisy, a szkielet fosfodiestrowy na zewnątrz

dwa polinukleotydowe łańcuchy są zwinięte wokół wspólnej osi

puryny i pirymidyny znajdują się w wewnętrznej stronie helisy, a szkielet fosfodiestrowy na zewnątrz

puryny i pirymidyny znajdują się w wewnętrznej stronie helisy, a szkielet fosfodiestrowy na zewnątrz

dotyczy to euchromatyny (czyli tej rozwiniętej chromatyny), tzn. że te przeciwciała zwiążą się z euchromatyną.

ukazane rejony są aktywne transkrypcyjnie

mają więcej etylowanych reszt

przeciwciało łączy się do Lys na N’ końcu.

ukazane rejony są aktywne transkrypcyjnie

np. deacylacja N-końców histonów (wpływają na genom za pomocą deacetylacji histonów lub metylacji DNA, więc wydaje mi się, że ok)

przyłączają się do rejonów cis a same są trans (represory to elementy trans oddziałujące z elementami cis np, represor wiążący się do operatora)

mają 2 rejony wiążące

mają budowę modułową

np. deacylacja N-końców histonów (wpływają na genom za pomocą deacetylacji histonów lub metylacji DNA, więc wydaje mi się, że ok)

przyłączają się do rejonów cis a same są trans (represory to elementy trans oddziałujące z elementami cis np, represor wiążący się do operatora)

mają budowę modułową

jest zdegenerowany, bo w różnych organizmach kodują inny aminokwas (nie z tego powodu chodzi) b)ogólnie cechy kodu genetycznego

3 kodony kodujące 1 aminokwas to synonimy tak, ale potem była dalsza część pytania: „np. CAC i CGC to synonimy metioniny”.

ma 64 kodony kodujące 20 aminokwasów ( 61 i 3 kodony stop)

nie ma znaków przecinkowych

jest uniwersalny jego uniwersalność jest prawie absolutna

nie ma znaków przecinkowych

jest uniwersalny jego uniwersalność jest prawie absolutna

czy da to mutację CG – AT w niciach potomnych

mutacje w DNA są widoczne we wszystkich następnych pokoleniach

jeżeli jest w mRNA to w znaczący sposób wpływa na ekspresję (nieprawda bo mRNA nie ma tak dużego wpływu na ekspresję)

enzymy usuwające tą mutacje – proces naprawy –glikozydaza uracylowa, potem endonukleaza AP, polimeraza DNA i ligaza na końcu

coś z tyminą , że jest obecna w RNA, mimo że koszt energetyczny syntezy jest wiekszy niż w uracylu , występującym w RNA

est to spontaniczna modyfikacja prowadzi do powstania nowych kodonów

czy da to mutację CG – AT w niciach potomnych

enzymy usuwające tą mutacje – proces naprawy –glikozydaza uracylowa, potem endonukleaza AP, polimeraza DNA i ligaza na końcu

est to spontaniczna modyfikacja prowadzi do powstania nowych kodonów

SEKWENCJE WZMACNIAJĄCE - działają w układzie cis wiąząc się z czynnikami transkrypcji działającymi w trans

związanie TBP do kasety TATA zapoczątkowuje transkrypcję

kaseta CG i CAAT leżą tylko na nici antysensowna

przyłącza się do sekwencji TATA która u Procaryota jest bliżej niż u eukariota początku transkrypcji( tu było tak że TATA znajduje się bliżej poczatku transkrypcji niz homologiczna sekw.u Prokariota i to była nieprawda)

SEKWENCJE WZMACNIAJĄCE - działają w układzie cis wiąząc się z czynnikami transkrypcji działającymi w trans

związanie TBP do kasety TATA zapoczątkowuje transkrypcję

wszystkie 4 NTP

starter z 3’-OH ( z wolną grupą 3’-OH)

wszystkie 4 dNTP

matryca komplementarna do startera (nie xd)

polimeraza DNA

matryca 1 lub 2 niciowa

aktywność egzonukleazowa 3’--5’ (ogólnie nie jest to mega niezbędne, po prostu będa błędy)

jon magnezu

starter z 3’-OH ( z wolną grupą 3’-OH)

wszystkie 4 dNTP

polimeraza DNA

matryca 1 lub 2 niciowa

jon magnezu

matryca

polimeraza DNA (I)

ά-P32-ATP czy γP32-ATP - (bo nie dodajemy ddNTP na początek, więc nie może być gamma)

2’,5’-di detoksy analog jednego z 4 dNTP - (2,3-dideoksy analog dNTP)

jeden z 4 dNTP (wszystkie cztery)

matryca

polimeraza DNA (I)

ά-P32-ATP czy γP32-ATP - (bo nie dodajemy ddNTP na początek, więc nie może być gamma)

) W żelu znajduje się bromek etydyny

Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o dług. 2220pz (najwolniej

Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o dług. 210pz

Długość cząsteczki Dna wynosi 2220

Metoda ta może być stosowania do produktów ekspresji metody Sangeranie,bo wmetodzie dideoksy sangera nie stosuje się elektroforezy tylko robi się autoradiogram a elektroforeze stosuje się do metody Southern

Na tym odcinku DNA znajduje się 5 unikalnych mc restrykcyjnych rozpoznawanych przez enzym – tak, bo to był liniowy DNA i powstalo 6 kawałków czyli 5 miejsc restrykcyjnych

) W żelu znajduje się bromek etydyny

Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o dług. 210pz

Na tym odcinku DNA znajduje się 5 unikalnych mc restrykcyjnych rozpoznawanych przez enzym – tak, bo to był liniowy DNA i powstalo 6 kawałków czyli 5 miejsc restrykcyjnych

regulacje dotyczące histonów noszą nazwę kodu histonoweg.

coś tam było z acylacją reszt Lys w ogonach hisonowych- to jest chyba zla odpowiedz, bo było napisane, że tylko Lys a to Lys i Arg ma być?

ulegają acetylacji , fosforylacji , ATp-zowane , ubikwitynacji -wystawienie ogonów na działanie acetylaz

modyfikacje potranslacyjne na końcu N’

w heterochromatynie acetylacja N-końców

kod histonowy zbiór informacji o modyfikacjach histonów

ulegają acetylacji , fosforylacji , ATp-zowane , ubikwitynacji -wystawienie ogonów na działanie acetylaz

modyfikacje potranslacyjne na końcu N’

kod histonowy zbiór informacji o modyfikacjach histonów

Zapewnia, ze wlasciwe aminoacylo-tRNA wchodzi do rybosomu.(łączy do miejsca A, jest to podobne do EF-Tu u prokariota) czyli GPTazy, a EF1B to wymienia GDP na GPT jak EF-Ts.

Hydrolizuje GTP, co jest potrzebne w procesie translokacji rybosomu wzdluz mRNA.

Uniemozliwia czasteczkom tRNA opuszczenie rybosomy przed utworzeniem wiazania peptydowego.

Katalizuje tworzenie wiazania peptydowego

Zapewnia, ze wlasciwe aminoacylo-tRNA wchodzi do rybosomu.(łączy do miejsca A, jest to podobne do EF-Tu u prokariota) czyli GPTazy, a EF1B to wymienia GDP na GPT jak EF-Ts.

Uwalnia czynniki inicjacyjne po zlozeniu rybosomy w rejonie kodonu inicjacyjnego.

Wiaze inicjatorowy tRNAMet i GTP w czasie skladania kompleksu inicjacyjnego

Laczy czapeczke na koncu 5' mRNA z kompleksem preinicjacyjnym.

Zapobiega polaczeniu duzej podjednostki rybosomu z mala podjednostka w cytoplazmie

Zapobiega polaczeniu duzej podjednostki rybosomu z mala podjednostka w cytoplazmie

Wszystkie syntetazy aminoacylo-tRNA katalizują dodanie jednego lub więcej rodzajów aminokwasów do jednego rodzaju tRNA.

Wszystkie syntetazy aminoacylo-tRNA katalizują dodanie jednego rodzaju aminokwasu do jednego lub więcej rodzajów tRNA.

Wszystkie syntetazy aminoacylo-tRNA katalizują dodanie jednego lub więcej rodzajów aminokwasów do jednego lub więcej rodzajów tRNA.

Wszystkie syntetazy aminoacylo-tRNA katalizują dodanie jednego rodzaju aminokwasu do jednego rodzaju tRNA.

Wszystkie syntetazy aminoacylo-tRNA katalizują dodanie jednego rodzaju aminokwasu do jednego lub więcej rodzajów tRNA.

pojedyncza cząsteczka tRNA oddziałująca z różnymi kodonami dla tego samego aminokwasu

cząsteczka tRNA, do której mogą być przyłączane różne aminokwasy.

różne cząsteczki tRNA rozpoznające ten sam kodon.

różne cząsteczki tRNA specyficzne dla tego samego aminokwasu

różne cząsteczki tRNA specyficzne dla tego samego aminokwasu

przez pory w błonach w procesie zależnym od energii (str 375)

przez pory w błonach w procesie zależnym od energii (str 375)