Fiszki
ozi <3
Test w formie fiszek
Ilość pytań: 71
Rozwiązywany: 229 razy
Degradacja drożdżowych mRNA:
może zależeć od obecności tzw. elementów niestabilności, znajdujących się w obrębie transkryptu
w prawidłowej, niezmienionej komórce (tzn. niezainfekowanej wirusami i nietransformowanej egzogennym DNA) może być skutkiem wyciszania RNA (interferencji RNA)
może zachodzić w kierunku od 5’ do 3’ lub 3’ do 5’ w odróżeniniu od degradacji w komórkach bakteryjnych, która zawsze zachodzi w kierunku od 3’ do 5
może uczestniczyć w procesie, w którym uczestniczy wielobiałkowy składnik zwany egzosomem, który degraduje mRNA przy udziale spokrewnionych z enzymami bakteryjnego degradosomu.
może przebiegać w procesie w którym następuje usuwanie czapeczek skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcuchów poliA, co z kolei prowadzi do braku translacji mRNA i szybkiego i szybkiego trawienia eksonukleotydów
może przebiegac wg mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA (RNA surveillance), który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych
może zależeć od obecności tzw. elementów niestabilności, znajdujących się w obrębie transkryptu
może uczestniczyć w procesie, w którym uczestniczy wielobiałkowy składnik zwany egzosomem, który degraduje mRNA przy udziale spokrewnionych z enzymami bakteryjnego degradosomu.
może przebiegac wg mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA (RNA surveillance), który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych
Remodelowanie nukleosomu to jeden ze sposobów/typów modyfikacji struktury chromatyny:
który jest bezwzględnie konieczny dla rozpoczęcia transkrypcji genu
który jest indukowany przez zależny od energii proces osłabiający oddziaływania pomiędzy nukleosomem i związanym z nim DNA
który zachodzi przy udziale złożonych kompleksów białkowych np. Swi/Snfi i wpływa na ekspresję całego genomu
który wiąże się z intensywnymi modyfikacjami chemicznymi histonów
które może skutkować tzw. przemieszczeniem cis, skutkujący transportem(?) nukleosomu na inną cząsteczkę DNA
Żadne nie jest prawdziwe
który jest indukowany przez zależny od energii proces osłabiający oddziaływania pomiędzy nukleosomem i związanym z nim DNA
Cechy charakterystyczne mRNA eukariota
Zazwyczaj powstają z premRNA
Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG lub pppG
Posiadają na końcu 3’ ogon poliA , nie kodowany przez matryce
Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG
Translacja jest sprzężona z transkrypcja i zachodzi w tym samym czasie
Zazwyczaj powstają z premRNA
Posiadają na końcu 3’ ogon poliA , nie kodowany przez matryce
Odwrotna transkryptaza
organizmy eukariotyczne mogą korzystać z retrowirusa zmieniać metabolizm
2-niciowy RNA wbudowuje się do genomu
powstaje hybryda DNA – RNA
Replikaza RNA- - polimeraza RNA zależna od RNA
wirusowa czy komórki gospodarza
polimeraza DNA zależna od RNA
odwrotna transkryptaza RNA zależna od DNA
polimeraza DNA zależna od DNA
organizmy eukariotyczne mogą korzystać z retrowirusa zmieniać metabolizm
powstaje hybryda DNA – RNA
polimeraza DNA zależna od RNA
SPLAJSING
splajsing autokatalityczny grupy 1 wymaga guaznozyny lub guanylanu i wiąże się do miejsca splajsingowego 3
w splicuinu gr 1 następuje atak guaniny lub guanozyny ma na 2’ OH
gr 1 jest u Procaryota gr 2 u Eucaryota – u prokariota nie ma splicingu bo nie ma intronów
w splicosomie u wszystkich Eukariotów uczestniczą katalityczne cząsteczki snRna
w splicosomie u wszystkich Eukariotów uczestniczą katalityczne cząsteczki snRna
Histony – modyfikacje potranslacyjne na końcu N’
regulacje dotyczące histonów noszą nazwę kodu histonowego
wystawienie ogonów na działanie acetylaz
w heterochromatynie acetylacja N-końców
tylko Lys ulega acetylacji w ogonach hisonowych
w euchromatynie acetylacja N-końców
kod histonowy – było coś o tym, że kod histonowy jest informacją czy zbiorem informacji o modyfikacjach czy coś takiego
wystawienie ogonów na działanie acetylaz
tylko Lys ulega acetylacji w ogonach hisonowych
w euchromatynie acetylacja N-końców
kod histonowy – było coś o tym, że kod histonowy jest informacją czy zbiorem informacji o modyfikacjach czy coś takiego
Operon laktozowy
przyłącza się cAMP
tworzy wiązanie 1,6 βglikozydowe w allolaktozie
katalizuje tworzenie glukozy i czegoś tam jeszcze
katalizuje syntezę laktozy z glukozy i galaktozy
IPTG jest induktorem metabolizowanym przez B-galaktozydazę
tworzy się jeszcze permeaza i transacetylaza
coś tam że jak się łączy z kompleksem CAP-cAMP w miejscu operatorowym
gen Y koduje βgalaktozydaze
tworzy wiązanie 1,6 βglikozydowe w allolaktozie
Enzymy restrykcyjne pocięto jakiś liniowy odcinek DNA enzymem EcoRV , obraz po
elektroforezie uwidoczniono na żelu , Co możesz powiedzieć na podstawie rysunku
17
poniżej , żel wybarwiono bromkiem etydyny , zwróć uwagę na słabo rozdzielone
elementy o długościach 433 i 415 pz
Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o dług. 2220pz
Żadna z powyższych nie jest prawdziwa
Na tym odcinku DNA znajduje się 5 unikalnych mc restrykcyjnych rozpoznawanych przez enzym
Metoda ta może być stosowania do produktów ekspresji metody Sangera
Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o dług. 210pz
W żelu znajduje się bromek etydyny
Na tym odcinku DNA znajduje się 5 unikalnych mc restrykcyjnych rozpoznawanych przez enzym
Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o dług. 210pz
W żelu znajduje się bromek etydyny
Co jest wymagane do przeprowadzenie reakcji Sangera ale chodziło o to że jest obecny
zawsze w jednym z odczynników?
polimeraza DNA (I)
ά-P32-ATP
matryca
jeden z 4 dNTP
polimeraza DNA (I)
ά-P32-ATP
Chcesz syntezować nić DNA co jest do tego NIEZBĘDNE?
polimeraza DNA
starter z 3’-OH
aktywność egzonukleazowa 3’--5
wszystkie 4 NTP
wszystkie 4 dNTP
matryca komplementarna do startera
matryca 1 lub 2 niciowa
jon magnezu
polimeraza DNA
starter z 3’-OH
wszystkie 4 dNTP
matryca 1 lub 2 niciowa
jon magnezu
represora λ
łączy się z OR3
rożne powinowactwo przez białko lex A
wiąże specyficznie do sekwencji DNA rozpoznawanych przez białko cro
rożne powinowactwo do miejsc OR
wiąże jako monomer
przyłącza się do ssDNA –
koduje represor lambda i cro
cro przyłącza się do OR 1 i hamuje represor lambda
ma miejsce wiązania ara
w swoim cyklu lizogennym ma taki okres ze powstaje hybryd DNA-RNA faza lizogenna jest utrzymywana dzięki działaniu represora lambda
koduje represor lambda tylko w fazie lizogennej
łączy się z OR3
wiąże specyficznie do sekwencji DNA rozpoznawanych przez białko cro
rożne powinowactwo do miejsc OR
w swoim cyklu lizogennym ma taki okres ze powstaje hybryd DNA-RNA faza lizogenna jest utrzymywana dzięki działaniu represora lambda
Pytanie dotyczące usuwanie deaminowanej Cytozny do uracylu w DNA
jeżeli jest w mRNA to w znaczący sposób wpływa na ekspresję
czy da to mutację CG – AT w niciach potomnych
mutacje w DNA są widoczne we wszystkich następnych pokoleniach
tymina jest obecna w RNA, mimo że koszt energetyczny syntezy jest większy niż w uracylu, występującym w RNA
enzymy usuwające tą mutacje – proces naprawy – glikozydaza uracylowa, potem endonukleaza AP, polimeraza DNA i ligaza na końcu
jest to spontaniczna modyfikacja prowadzi do powstania nowych kodonów
jeżeli jest w mRNA to w znaczący sposób wpływa na ekspresję
jest to spontaniczna modyfikacja prowadzi do powstania nowych kodonów
Pytanie o kod genetyczny
3 kodony kodujące 1 aminokwas to synonimy
jest uniwersalny jego uniwersalność jest prawie absolutna
jest zdegenerowany, bo w różnych organizmach kodują inny aminokwas
nie ma znaków przecinkowych
ma 64 kodony kodujące 20 aminokwasów
3 kodony kodujące 1 aminokwas to synonimy
jest uniwersalny jego uniwersalność jest prawie absolutna
nie ma znaków przecinkowych
Holoenzym polimerazy RNA
wiąże się specyficznie z matrycą
łączy się z miejscem promotorowym dopiero po oddysocjowaniu jednej z podjednostek-
ma po 1 podj. Alfa, beta, gamma i delta 2alfa, 1beta, 1 beta’, 1sigma
bierze udział w inicjacji elongacji i terminacji
wiąże się specyficznie z matrycą
Redagowanie RNA
zachodzi autokatalitycznie
dodatkowa zmiennosc genetyczna
Zachodzi już po transkrypcji
Zachodzi przy udziale enzymów, np. polimerazy poli(A)
zwiększa różnorodność genomu
dodatkowa zmiennosc genetyczna
Zachodzi już po transkrypcji
Zachodzi przy udziale enzymów, np. polimerazy poli(A)
Represory transkrypcji u Eucaryota
przyłączają się do rejonów cis a same są trans
mają budowę modułową
np. deacylacja N-końców histonów
mają 2 rejony wiążące
przyłączają się do rejonów cis a same są trans
np. deacylacja N-końców histonów
TOPOIZOMERAZY
topoizomerazy 1 rozcina 2 nici, a topoizomerazy 2 jedną nić
5’ P laczy się z ε Lys
5’-P łaczy się z -OH Ty
wymagają ATP
przekształcają topoizomery, rozcinają DNA
żadna poprawna
zmieniają liczbę opleceń
przekształcają topoizomery, rozcinają DNA
zmieniają liczbę opleceń
Immunoprecypitacja
ukazane rejony są aktywne transkrypcyjnie
przeciwciało łączy się do Lys na N’ końcu
mają więcej etylowanych reszt
dotyczy to euchromatyny
ukazane rejony są aktywne transkrypcyjnie
dotyczy to euchromatyny
Bakteriofag λ w fazie litycznej
syntetyzuje 3 rożne klasy mRNA, które są wyznaczane poprzez czas po infekcji ich pojawienia
początkowo produkuje dwie cząsteczki jądra, pełni rolę inhibitora syntezy λ represora, a inną gra rolę końca transkrypcji
tworzą produkty genów N i Q, które działają jako białka regulacji pozytywnej, prowadzące sekwencyjną λ- kodującego białka
Q potrzebne, gdy są transkrybowane geny białka główki i ogonka wirusa oraz białka konieczne do lizy komórki gospodarza
niosą programowaną syntezę białek potrzebnych do replikacji genów i produkcji ich strukturalnych komponentów
N i Q zapobiegają końcu transkrypcji
N powoduje produkcję białka niezbędnego do replikacji DNA faga i rekombinacji
syntetyzuje 3 rożne klasy mRNA, które są wyznaczane poprzez czas po infekcji ich pojawienia
tworzą produkty genów N i Q, które działają jako białka regulacji pozytywnej, prowadzące sekwencyjną λ- kodującego białka
Q potrzebne, gdy są transkrybowane geny białka główki i ogonka wirusa oraz białka konieczne do lizy komórki gospodarza
niosą programowaną syntezę białek potrzebnych do replikacji genów i produkcji ich strukturalnych komponentów
N i Q zapobiegają końcu transkrypcji
N powoduje produkcję białka niezbędnego do replikacji DNA faga i rekombinacji
β-galaktozydaza
tworzy wiązanie 1,6-β oligosacharydu allolaktozy
jest produkowana z jednostki genu zwanej operonem
jej poziom wzrasta w koordynacji z permeazą galaktozydową i acetylofransferazą tiogalaktozydową
hydrolizuje wiązanie 1,4-β oligosacharydy laktozy i tworzy galaktozę i glukozę
obecna w różnych stężeniach zależnie od źródła węgla używanego do wzrostu
est allosterycznie aktywowana przez niemetaboliczny składnik IPTG
tworzy wiązanie 1,6-β oligosacharydu allolaktozy
jest produkowana z jednostki genu zwanej operonem
jej poziom wzrasta w koordynacji z permeazą galaktozydową i acetylofransferazą tiogalaktozydową
hydrolizuje wiązanie 1,4-β oligosacharydy laktozy i tworzy galaktozę i glukozę
obecna w różnych stężeniach zależnie od źródła węgla używanego do wzrostu