Fiszki
ozi <3
Test w formie fiszek
Ilość pytań: 71
Rozwiązywany: 226 razy
Kierowanie białek które ze stwierdzeń na temat sekwencji sygnałowych są poprawne:
wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie są odcinane po przejściu przez błonę ER
cząsteczka rozpoznająca sygnał (SRP) jest białkiem składającym się z 7 a helis/ łańcuchów polipeptydowych
Cykl ATPADP... sekwencję sygnałową z SRP i odłącza ją od …
Rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błonę
SRP zapobiega przedwczesnej elongacji, a przez to fałdowaniu się białka
uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu
wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie są odcinane po przejściu przez błonę ER
Rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błonę
SRP zapobiega przedwczesnej elongacji, a przez to fałdowaniu się białka
Które zdania na temat struktury DNA są prawdziwe:
adenozyna i guanina wiąże się przez N9 z C1 deoksyrybozy wiązaniem N--glikozydowym , a cytozyna i tymina przez N-1 z C1
jeżeli A+G =30% to T może być więcej niż 20%
efekt hiperchromowy - efekt podczas topnienia DNA, który powoduje podwyższenie absorbancji przy długości fali 260 nm
komplementarne pary tworzą się pomiędzy puryna i puryną oraz pirymidyną i pirymidyną
deoksyryboza ma przy węglu 2’ wolną grupę OH
dwuniciowe RNA może przyjmować strukturę A DNA
zasady w superhelisie są wewnątrz helisy
temp topnienia jest odwrotnie proporcjonalna do długości łańcucha
guanina paruje się z cytozyna poprzez 3 wiązania wodorowe
połączenie zasady z cukrem nosi nazwę nukteozydu
adenozyna i guanina wiąże się przez N9 z C1 deoksyrybozy wiązaniem N--glikozydowym , a cytozyna i tymina przez N-1 z C1
jeżeli A+G =30% to T może być więcej niż 20%
efekt hiperchromowy - efekt podczas topnienia DNA, który powoduje podwyższenie absorbancji przy długości fali 260 nm
dwuniciowe RNA może przyjmować strukturę A DNA
zasady w superhelisie są wewnątrz helisy
guanina paruje się z cytozyna poprzez 3 wiązania wodorowe
połączenie zasady z cukrem nosi nazwę nukteozydu
Sygnały rozpoczynające i kończące sygnał:
typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA
za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka alfa polimerazy RNA
sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU
promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA
u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki
heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w terminacji transkrypcji niektórych genów E.coli
mRNA policistronowe
sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU
promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA
u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki
heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w terminacji transkrypcji niektórych genów E.coli
mRNA policistronowe
Translacja u procaryota
peptydylotRNA może znajdować się zarówno w miejscu P lub A rybosomu, w zależności od fazy cyklu translacyjnego
fMet-tRNAf inicjatorowy wiąże się w przeciwieństwie do...
fMet-tRNAf zajmuje miejsce P jako jedyne
formylometionylo-tRNAf powstaje w reakcj
czynnik elongacyjny Ts (EFTs) wiąże nukleotyd GTP, przez co w wyniku hydrolizy uwalnia się GDP
poszukiwanie pierwszego kodonu AUG od 5’ końca transkryptu hydrolizującego ATP
mRNA policistronowe
czynnik elongacyjny Tu(EFTu) oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacetylotRNA oprócz fMet-tRNAf
peptydylotRNA może znajdować się zarówno w miejscu P lub A rybosomu, w zależności od fazy cyklu translacyjnego
fMet-tRNAf zajmuje miejsce P jako jedyne
mRNA policistronowe
czynnik elongacyjny Tu(EFTu) oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacetylotRNA oprócz fMet-tRNAf
Degradacja eukariotycznych RNA:
w prawidłowej, niezmienionej komórce skutkuje powstaniem krótkich interferujących RNA o długości 21--28 nukleotydów
może zależeć od szlaku, którego jednym z elementów są cząsteczki RNA o strukturze spinki do włosów, powstające z prekursorowego RNA, syntezowanego przez polimerazę RNA II.
może przebiegać według mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA, który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych.
powoduje, że eukariotyczne mRNA są cząsteczkami żyjącymi dłużej niż ich odpowiedniki bakteryjne, jednak z typowym okresem półtrwania rzędu 10--20 minut
może zależeć od sekwencji znajdujących się w obrębie transkryptu
może przebiegać, w procesie, w którym następuje usuwanie czapeczki mRNA skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcucha Poli(A), co z kolei prowadzi do braku translacji i szybkiego trawienia eksonukleolitycznego.
może przebiegać według mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA, który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych.
może zależeć od sekwencji znajdujących się w obrębie transkryptu
Jeden/jednym z typowych promotorów E. Coli poddano, wraz z kontrolowanym przez ten
promotor genem gruntownym badaniom, korzystając z odpowiednich metod biologii molekularnej.
Poniżej przedstawione są wybrane wnioski jakie sformułowano po ich przeprowadzeniu. Wybrać
te które są zgodne z AKTUALNYM stanem wiedzy:
rdzeń polimerazy RNA rozpoznaje sekwencję promotora i łączy się z nim
w trakcie eksperymentów prowadzonych in vitro nie zaobserwowano powstawania krótszych niż spodziewany, transkryptów.
Rozpoczęcie elongacji towarzyszy zmiana konformacyjna holoenzymu polimerazy RNA skutkiem czego pokrywa ona mniejszy odcinek DNA (30--40bp).
zmiana sekwencji bloku/kasety -35 promotora ma bezpośredni wpływ na przekształcenie zamkniętego kompleksu promotorowego w kompleks otwarty
wzbogacenie sekwencji -10 w pary GC wpływa na proces rozpoznania promotora przez podjednostkę polimerazy RNA
w zamkniętym kompleksie promotorowym polimeraza pokrywa ok. 80 pz, rozpoczynając powyżej bloku 35 i kończąc poniżej bloku 10
w trakcie eksperymentów prowadzonych in vitro nie zaobserwowano powstawania krótszych niż spodziewany, transkryptów.
w zamkniętym kompleksie promotorowym polimeraza pokrywa ok. 80 pz, rozpoczynając powyżej bloku 35 i kończąc poniżej bloku 10
Bardzo często polipeptyd uwalniany z rybosomu jest nieaktywny i zanim będzie mógł spełniać
swoją funkcję w komórce musi być poddany obróbce potranslacyjnej. Z podanych poniżej wybrać
te, które są PRAWDZIWE w odniesieniu do obróbki potranslacyjnej.
gdyby w komórce proces fałdowania polipeptydu przebiegał, gdy dostępna jest tylko jego część, to mogłoby zmniejszyć prawdopodobieństwo występowania nieprawidłowych odgałęzień ścieżki fałdowania
białka opiekuńcze decydują o trzeciorzędowej strukturze białek
niektóre białka syntezowane są jako poliproteiny, długie polipeptydy zawierające kilka białek połączonych ze sobą jedno za drugim, sposobem głowa-ogon; zdarza się, że sekwencje kodujące poszczególne produkty (białka) zachodzą na siebie
niektóre z intein posiadają aktywność endonukleazy, która może specyficznie przeciąć gen nie zawierający inteiny, co jest wymagane do ukierunkowanego przemieszczania się sekwencji intronu inteiny
inteina, to wewnętrzny fragment białka usuwany po translacji z jednoczesnym połączeniem fragmentów go otaczających
nie jest możliwe, aby niewłaściwie sfałdowane białko przyjęło właściwą dla siebie konformację
niektóre białka syntezowane są jako poliproteiny, długie polipeptydy zawierające kilka białek połączonych ze sobą jedno za drugim, sposobem głowa-ogon; zdarza się, że sekwencje kodujące poszczególne produkty (białka) zachodzą na siebie
inteina, to wewnętrzny fragment białka usuwany po translacji z jednoczesnym połączeniem fragmentów go otaczających
Które z poniższych twierdzeń dotyczących telomerazy ssaków jest PRAWDZIWE?
Telomeraza jest aktywna w wybranych typach komórek np. w komórkach hemopoetyczych szpiku kostnego
Terapia powodująca inaktywację telomerazy powinna być stosowana w walce z rakiem tylko wtedy, gdy aktywacja telomerazy jest przyczyną powstawania raka, a nie skutkiem
Telomeraza jest polimerazą DNA zależną od RNA
Żadna z powyższych odpowiedzi nie jest prawdziwa
Telomeraza syntezuje tylko jeden z łańcuchów polinukleotydowych telomeru korzystając z matrycy bogatej w reszty G
Aktywność telomerazy jest kontrolowana przez białko TRF1 promujące tworzenie struktury telomerów typu pętli t.
Telomeraza jest aktywna w wybranych typach komórek,- enzym jest aktywny w komórkach embrionalnych, natomiast po urodzeniu jego aktywność przejawia się w komórkach rozrodczych i macierzystych.
Telomeraza jest aktywna w wybranych typach komórek np. w komórkach hemopoetyczych szpiku kostnego
Telomeraza jest polimerazą DNA zależną od RNA
Telomeraza jest aktywna w wybranych typach komórek,- enzym jest aktywny w komórkach embrionalnych, natomiast po urodzeniu jego aktywność przejawia się w komórkach rozrodczych i macierzystych.
Problem topologiczny dotyczy którego z następujących zagadnień?
Rozwijanie dsDNA i rotacja cząsteczki DNA
Zablokowanie miejsc replikacji DNA przez nukleosomy
Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów DNA opisuje grupa toponemiczna
Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów dsDNA opisuje grupa plektonemiczna
Synchronizacja replikacji DNA z podziałem komórkowym
Trudności związane z syntezą DNA na nici opóźnionej
Rozwijanie dsDNA i rotacja cząsteczki DNA
Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów dsDNA opisuje grupa plektonemiczna
Standardowy mechanizm syntezy białka polega na przesuwaniu się rybosomu względem
mRNA dokładnie kodon za kodonem. Są znane jednak nietypowe zjawiska zachodzące podczas
elongacji. Poniżej podane zostały informacje na ich temat – zaznaczyć prawdziwe
pominięcie translacyjne zaczyna się i kończy zawsze na dwóch identycznych kodonach.
poślizg rybosomu umożliwia jednemu rybosomowi translację wybranych fragmentów mRNA policistronowego, np. mRNA operonu laktozowego.
w przypadku kilku mRNA obserwuje się zaprogramowaną zmianę fazy odczytu, zmieniającą fazę odczytu w specyficznym miejscu transkryptu
zmiana fazy odczytu polega na tym, iż w czasie translacji mRNA rybosom zatrzymuje się, przesuwa o jeden kodon do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację
wskutek pominięcia translacyjnego z jednego mRNA mogą być syntezowane dwa różne białka
zaprogramowana zamian fazy odczytu występuje wyłącznie w bakteriach
poślizg rybosomu umożliwia jednemu rybosomowi translację wybranych fragmentów mRNA policistronowego, np. mRNA operonu laktozowego.
w przypadku kilku mRNA obserwuje się zaprogramowaną zmianę fazy odczytu, zmieniającą fazę odczytu w specyficznym miejscu transkryptu
wskutek pominięcia translacyjnego z jednego mRNA mogą być syntezowane dwa różne białka
Które z podanych poniżej informacji są PRAWDZIWE w odniesieniu do domeny C końcowej
(CTD) największej podjednostki polimerazy RNA II
Kompleks białkowy zwany mediatorem bezpośrednio aktywuje inicjację transkrypcji przez fosforylację CTD
CTD jest zaangażowane w oddziaływanie z czynnikami białkowymi biorącymi udział w procesach molekularnych towarzyszących terminacji transkrypcji
Status jej fosforylacji jest stały podczas trwania procesu transkrypcji – zmienia się na etapie inicjacji, podczas trwania transkrypcji jest taki sam
Wieloskładnikowy kompleks białkowy, tzw. Czynnik specyficzności cięcia i poliadenylacji (CPSF), pozyskiwany do kompleksu polimerazy jest już na etapie inicjacji transkrypcji i wchodzi w kontakt z CTD. CPSF pozostaje związany z CTD do czasu pojawienia się sekwencji poliA w transkrypcie.
U ssaków CTD zawiera 52 powtórzenia siedmioaminokwasowej sekwencji Tyr--Ser--Pro--Thr--Ser--Pro--Ser. Dwie z reszt Pro w każdym powtórzeniu mogą być modyfikowane przez dodanie grup fosforanowych –
Jej fosforylacja warunkuje przyłączenie się polimerazy do kompleksu preinicjacyjnego
Wieloskładnikowy kompleks białkowy, tzw. Czynnik specyficzności cięcia i poliadenylacji (CPSF), pozyskiwany do kompleksu polimerazy jest już na etapie inicjacji transkrypcji i wchodzi w kontakt z CTD. CPSF pozostaje związany z CTD do czasu pojawienia się sekwencji poliA w transkrypcie.
Zakończenie transkrypcji bakteryjnej:
Może być skutkiem specjalnego rodzaju kontroli zależnego od sprzężonych ze sobą procesów syntezy transkryptu i biłaka – bakteriofag lambda – syntezowane białka są antyterminatorami dzięki czemu bakteriofag może przejść w kolejną fazę
Może być zależne od białka Rho, które posiada aktywność helikazy, dzięki czemu może ono aktywnie „rozbijać” pary zasad, w tym przypadku pomiędzy matrycą a ciągiem reszt U struktury spinki do włosów transkryptu
Poprzedzone jest nieciągłym procesem transkrypcji
Mniej więcej w połowie przypadków następuje w obrębie sekwencji nici matrycowej DNA, która zawiera sekwencję odwróconego palindromu
Żadne z powyższych stwierdzeń nie jest prawdziwe
Może być kontrolowane przez tzw. Białko antyterminacyjne, którego obecność zapobiega, na przykład, zatrzymaniu się polimerazy przy terminatorze zależnym od białka Rho.
Może być skutkiem specjalnego rodzaju kontroli zależnego od sprzężonych ze sobą procesów syntezy transkryptu i biłaka – bakteriofag lambda – syntezowane białka są antyterminatorami dzięki czemu bakteriofag może przejść w kolejną fazę
Poprzedzone jest nieciągłym procesem transkrypcji
Może być kontrolowane przez tzw. Białko antyterminacyjne, którego obecność zapobiega, na przykład, zatrzymaniu się polimerazy przy terminatorze zależnym od białka Rho.
Które z podanych poniżej twierdzeń są PRAWDZIWE dla zjawiska replikacji DNA w komórkach
eukariotycznych ?
Zakończenie syntezy fragmentu Okazaki wymaga usunięcia sekwencji startera odpowiednią polimerazą posiadającą aktywność egzonukleazy
Enzymy i pozostałe białka biorące udział w replikacji tworzą duże struktury wewnątrzjądrowe tzw. fabryki replikacyjne, z których każda zawiera odpowiednik bakteryjnego replisomu
Koniec 5’startera używanego przez polimerazę DNA zawiera resztę 5’ fosforanową , blokuje aktywność enzymatyczną nukleazy oznaczanej skrótem FEN1
Chromatydy siostrzane są aż do stadium anafazy dzięki kohezynom, które dołączane są do nowych nici DNA natychmiast po przejściu przez widełki replikacyjne.
Polimeraza DNA kopiująca nić opóźnioną tworzy kompleksy dimeryczne
Żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe
Chromatydy siostrzane są aż do stadium anafazy dzięki kohezynom, które dołączane są do nowych nici DNA natychmiast po przejściu przez widełki replikacyjne.
Jaki stan metylacji wysp CpG charakteryzuje geny metabolizmu podstawowego
(housekeeping genes)?
Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów są metylowane w niektórych tkankach, ale nie we wszystkich.
Wyspy CpG nie są metylowane tylko w tych tkankach, w których specyficznej ekspresji ulega sąsiadujący z nią gen metabolizmu
Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów charakteryzuje wysoki poziom metylacji.
Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów nie są metylowane.
Żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe.
Te geny z reguły nie są położone w sąsiedztwie wysp CpG
Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów nie są metylowane.
Które z poniższych twierdzeń są prawdziwe w odniesieniu do piętnowania genomowego
Skutkiem piętnowania jeden gen z pary alleli ulega ekspresji, drugi jest metylowany i wyciszany.
funkcją piętnowania jest to, że DNA pary alleli (obu jednocześnie) homologicznych podlega metylacji, co skutkuje brakiem ich ekspresji
jest to bardzo często występująca cecha genomów ssaków
piętnowaniu podlegają tylko geny kodujące białka.
żadna z odpowiedzi nie jest prawdziwa.
jeden z pary alleli ulega metylacji w procesie zależnym od tzw. elementów kontrolujących piętnowanie
Skutkiem piętnowania jeden gen z pary alleli ulega ekspresji, drugi jest metylowany i wyciszany.
jeden z pary alleli ulega metylacji w procesie zależnym od tzw. elementów kontrolujących piętnowanie
Jeśli komórka diploidalna ma 4 chromosomy X to ile chromosomów X będzie
transkrybowanych?
dwa
To się zmienia mogą być dwa lub jeden
jeden
trzy
cztery
To się zmienia mogą być trzy albo dwa
jeden
Które z poniższych twierdzeń opisują funkcje jąderka
est miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNAII
jest rusztowaniem chromosomowym zmieniającym swoją strukturę w czasie podziału komórki co prowadzi do kondensacja chromosomów
jest miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNA
jest miejscem syntezy i obróbki cząsteczek rRNA
jest miejscem ekspresji genów kodujących białka
jest miejscem obróbki cząsteczek mRNA
jest miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNA
jest miejscem syntezy i obróbki cząsteczek rRNA
Które zdanie prawidłowo opisuje składanie RNA w układzie trans ?
Składanie w układzie trans jest powszechnym zjawiskiem w odniesieniu do transkryptów genów człowieka.
Niektóre RNA uczestniczące w tym procesie zawierają informację z dwóch genów, co skutkuje jednoczesną translacją, prowadzącą do dwóch produktów białkowych
Sekwencje intronowe nie są usuwane z transkryptów RNA i podlegają translacji do białek.
Odbywa się pomiędzy eksonami zawartymi w obrębie różnych cząsteczek RNA.
Następuje zastąpienie wybranych eksonów w niektórych transkryptach przez ekson liderowy
Składanie w układzie trans zachodzi w sposób podobny do składania przebiegającego z wycinaniem intronów GUAG, z tym że zamiast lassa tworzona jest struktura widełek.
Odbywa się pomiędzy eksonami zawartymi w obrębie różnych cząsteczek RNA.
Składanie w układzie trans zachodzi w sposób podobny do składania przebiegającego z wycinaniem intronów GUAG, z tym że zamiast lassa tworzona jest struktura widełek.
W jaki sposób zachodzi zmiana fazy odczytu w czasie translacji?
Rybosom kończy translację na kodonie, który koduje aminokwas.
Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji, przesuwa o jeden nukleotyd do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.
Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji przesuwa o jeden kodon do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.
Rybosom dochodzi do końca sekwencji kodującej, uwalnia właściwie zsyntezowane białko i rozpoczyna syntezę nowego białka począwszy od następnego kodonu inicjacyjnego.
Rybosom przeprowadza translację cząsteczki tRNA, która zawiera jeden dodatkowy nukleotyd lub brakuje w niej nukleotydu
W czasie translacji cząsteczek RNA rybosomu pomija kodon.
Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji, przesuwa o jeden nukleotyd do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.
Zakończenie (terminacja) transkrypcji bakteryjnej:
może być zależne od białka Rho, które posiada aktywność helikazy, dzięki czemu może ono aktywnie ‘rozbijać’ pary zasad pomiędzy matrycą a ciągiem reszt Ustruktury spinki do włosów transkryptu
Poprzedzone jest nieciągłym procesem transkrypcji , podczas którego polimeraza dokonuje wyboru pomiędzy kontynuowaniem elongacji a terminacją
Może być kontrolowane przez tzw. białko antyterminacyjne, którego obecność zapobiega, np. zatrzymaniu się polimerazy przy terminatorze zaleznym od białka Rho
może być skutkiem specjalnego rodzaju kontroli, zależnego od sprzężonych ze sobą procesów syntezy transkryptu i białka
następuje mniej więcej w połowie przypadków w obrębie sekwencji nici matrycowej DNA, która zawiera sekwencje odwróconego palindromu.
Poprzedzone jest nieciągłym procesem transkrypcji , podczas którego polimeraza dokonuje wyboru pomiędzy kontynuowaniem elongacji a terminacją
Może być kontrolowane przez tzw. białko antyterminacyjne, którego obecność zapobiega, np. zatrzymaniu się polimerazy przy terminatorze zaleznym od białka Rho
może być skutkiem specjalnego rodzaju kontroli, zależnego od sprzężonych ze sobą procesów syntezy transkryptu i białka
następuje mniej więcej w połowie przypadków w obrębie sekwencji nici matrycowej DNA, która zawiera sekwencje odwróconego palindromu.