1.Ktore z podanych niżej związków mogą być wykorzystane do znakowania fragmentu DNA przy
wykorzystaniu kinazy polinukleotydowej:
C) dGTP , znakowany w pozycji α lub γ (alfa lub gama- obojętnie)
B) ATP , znakowany w pozycji α (alfa)
D) [γ(gama)-32P]-ATP
A) dATP, znakowany 32P w pozycji γ (gama)
D) [γ(gama)-32P]-ATP
2.Pytanie na temat pożywki M9 :(jej charakterystyka)
C) zawiera tylko zwiazki nieorganiczne
D) ma ściśle zdefiniowany skład
A) zawiera ampicylinę
B) zawiera tylko zwiazki organiczne
E) po dodaniu glukozy otrzymamy pozywke LB
D) ma ściśle zdefiniowany skład
3. W celu otrzymania preparatu DNA plazmidowego z kom. bakteryjnej dodano NaOH w takiej
ilosci iz wartosc pH wynosila 12.5 Ktory z opisow / charakterystyk jest prawdziwe:
B) w tych warunkach dysocjacji do pojedynczych nici ulegly fragmenty DNA ktore sa w formie superzwinietej (supercoiled)
C) w tych warunkach wszystkie koliste czasteczki ulegaja dysocjacji
D) po zakwaszeniu do pH ok 7.00 tak przygotowany zdenaturowany DNA plazmidowy moze byc latwo oddzielony od chromosowego
A) w tych warunkach caly dsDNA jaki znajdowal sie w komorce ulegl dysocjacji do pojedynczych nici
E) po zakwaszeniu do ok pH=7.00 tak przygotowany zdenaturowany DNA chromosomu bakteryjnego moze byc latwo oddzielony od plazmidowego
E) po zakwaszeniu do ok pH=7.00 tak przygotowany zdenaturowany DNA chromosomu bakteryjnego moze byc latwo oddzielony od plazmidowego
4.Przy pomocy nukleazy S1 mozna znakowac koniec 5' trankskryptu. Przy pomocy tego samego
enzymu mozna zmapowac tez 3' koniec po wprowadzeniu odpowiednmich zmian do naszych
działan. Ktore z ponizszych czynnosci ma miejsce TYLKO podczas mapowania 3' konca :
C) denaturacja DNA i elektroforeza
A) znakowanie DNA przy wykorzystaniu gama -32P -ATP
E) reakcja przy udziale polimerazy DNA I
D) reakcja przy udziale rekombinowanego enzymu uzywanego przez retrowirusy do syntezy DNA na bazie RNA
B) znakowanie DNA przy wykorzystaniu alfa -32P -dATP
E) reakcja przy udziale polimerazy DNA I
B) znakowanie DNA przy wykorzystaniu alfa -32P -dATP
5. Pewien student zamierzał otrzymac bibliotekę z mutacjami kasetowymi w obrebie centrum
aktywnego enzymu XYZ. No i madrala zrobił jakoś tak:
gen XYZ dał do wektora pUC18, wstawił go tak, że nie zaburzał ramki odczytu LacZ', czyli gdy dało
sie do odpowiedniej komórki (takiej, w której daje sie prowadzić selekcję biało-niebieską) powstaje
aktywna B-galaktozydaza. wyciął kasetę, którą chciał zmienić, oddzielił przez elektroforezę od
reszty wektora, wziął wektor bez kasety i kinazą polinukleotydową usunął reszty fosforanowe z 5'
końców - żeby nie doszło do samoligacji wektora, po czym dodał syntetyczne oligonukleotydy.
D) te co sie same zligowaly stanowia jedynie 1,2 % w porownaniu do eksperymentu kontrolnego gdzie nie było defosforylacji
A) rekombinanty beda niebieskie
C) te co sie same zligowaly (nierembionanty) nie beda niebieskie
E) w komorkach nie bedzie aktywnosci enzymu XYZ
B) rekombinanty nie beda niebieskie
D) te co sie same zligowaly stanowia jedynie 1,2 % w porownaniu do eksperymentu kontrolnego gdzie nie było defosforylacji
6.Mamy gen w pojedynczej kopii. Chcąc go wykryć użyto sondy o odpowiednio do niego (tego
genu) komplementarnej sekwencji. Była to metoda fluorescencyjna FISH a eksperyment
przeprowadzono na chromosomach w trakcie profazy. Co zaobserwowano:
A) 2 sygnały fluorescencyjne blisko siebie
E) 4 pary sygnałów
B) 2 sygnały fluorescencyjne
D) 4 sygnały blisko siebie
C) 2 pary sygnałów fluorescencyjne
C) 2 pary sygnałów fluorescencyjne
7.Cztery klony BAC fragmentów ludzkiego genomowego DNA (A, B, C, D) zbadano na obecność
sekwencji STS (5 sekwencji oznaczonych 1-5). Ich obecność w poszczególnych genach przedstawia
tabelka poniżej, przy czym + oznacza obecność STS w danym klonie:
STS
DNA 1 2 3 4 5
A + + +
B + +
C + +
D + +
D) D-A-C-B
E) D-A-B-C
C) A-B-D-E
A) A-B-C-D
B) D-C-B-A
E) D-A-B-C
8.Byl rysunek wektoru (umieszczam jego dolny fragment ☺ niestety wiecej nie mam):
A) wektor posiada gen markerowy
E) wieksza ilosc preparatu wektora potrzebna do analiz mozna uzyskac hodujac bakterie transformowane tym wektorem
D) wektor pozwala na badanie aktywnosci promotorow eukariotycznych
B) wektor jest kosmidem
C) korzystajac z wektora mozna prowadzic transkypcje in-vitro przy wykorzystaniu polimeraz fagowych
A) wektor posiada gen markerowy
E) wieksza ilosc preparatu wektora potrzebna do analiz mozna uzyskac hodujac bakterie transformowane tym wektorem
9.Po przeprowadzeniu sekwencjonowania DNA wedlug
metody dideoksy Sangera (korzysta sie z
analogow 2',3'-dideoksy trifosforanow nukleotydów) otrzymano przedstawiony nizej
autoradiogram :
ddATP ddCTP ddGTP ddTTP
3’
5’
Która sekwencja będzie odpowiadała sekwencji nici matrycowej (czyli badanej):
D) 5’ATGCA3’
C) 3’ACGTT5’
A) 3’TACGT5’
B) 5’TGCAT3’
D) 5’ATGCA3’
10. Każdy rodzic ma dwa allele genu X. może on mieć postać dziką - dominującą(A) -ZDROWA...albo
zmutowaną - recesywną(a)- wywołuje hemofilie albo cos równie paskudnego – o już wiem :
anemie sierpowatą. W przypadku zmutowanej wersji gen nie jest przecinany przez enzym
restrykcyjny np. EcoRI bo nie ma miejsca rozpoznawanego przez ten enzym i otrzymujemy jeden
tylko fragment o dł. 1,3 kb. Jeśli tniemy gen dziki to otrzymujemy 2 fragmenty : 1,1kb i 0,2 kb.
Znaczy gdzieś tam w środku ma jedno miejsce które jest rozpoznawane przez ten enzym
restrykcyjny.
Pytanie: Jakie fragmenty będziemy widzieć u rodziców których PRZYSZLE DZIECKO MA 25%
PRAWDOPODOBIENSTWO NA ZACHOROWANIE NA TĄ CHOROBE
C) mozna zaobserwowac obecnosc fragmentow 1.3kb u jednego z rodzicow i 1,1kb oraz 0.2 kb u drugiego z rodzicow
B) można zaobserwować obecność fragmentów 1.3 kb i 0.2 kb u obojga rodzicow
D) (cos w stylu C)
A) można zaobserwować obecność fragmentów 1.1 kb i 0.2 kb u obojga rodzicow
E) u obojga rodzicow wszystkie trzy fragmenty :1,3kb .. 1,1kb... 0.2kb
A) można zaobserwować obecność fragmentów 1.1 kb i 0.2 kb u obojga rodzicow
Plazmid X ma gen markerowy AmpR czyli na ampicyline opornosc. Bierzemy jakiś inny plazmid
co ma geny oporności na ampicylinę, chloramfenikol, erytromycynę, itp, itd. Tniemy go i kolekcję
otrzymanych fragmentów wklonowujemy w nasz plazmid X, ten przenosimy do komórek i szukamy
rekombinantów które dostały gen ooprności na chloramfenikol - jakich podłóż możemy użyć:
A) z ampicyliną
B) z chloramfenikolem i ampicyliną
C) z chloramfenikolem
E) erytromycyna i chloramfenikol
D) erytromycyna i ampicylina
B) z chloramfenikolem i ampicyliną
C) z chloramfenikolem
12.Wyobraź sobie ze dysponujesz klonem (tzn. sekwencją) jakiegoś genu, który, możesz
przypuszczać na podstawie analiz genetycznych, jest zlokalizowany w odległości nie większej niż
200kb od genu odpowiedzialnego za powstawanie jakieś choroby. Spośród podanych poniżej
czynności proszę wybrać TYLKO NIEKTORE składające się w odpowiedniej sekwencji na
eksperyment (technikę) który pozwoli na odczytanie sekwencji w tym obszarze 200kb. A) częściowe trawienie DNA enzymem BamHI w celu otrzymania zachodzących na siebie
(względem sekwencji) fragmentów o dl ok. 20 kb
B) całkowite (wyczerpujące) trawienie DNA enzymem EcoRI
C) izolacja ludzkiego genomowego DNA
D) izolacja genomowego DNA z E.coli
E) Northern-blotting sondą otrzymana przy wykorzystaniu genu A
F) powtarzanie czynności opisanych w poprzednich dwóch etapach do momentu otrzymania
odpowiedniej ilości klonów
G) otrzymanie biblioteki w fagu lambda
H) przeszukiwanie biblioteki przy pomocy sondy przygotowanej w oparciu o sekwencje genu
A w etapie pierwszym, potem izolacja klonu hybrydowanego z sonda
I) subklonowanie fragmentu z końca nowoizolowanego klonu w celu otrzymania nowej
sondy do ponownego przeszukiwania biblioteki i identyfikacji nowego klonu
hybrydyzowanego z sond Proszę wybrać, który z poniższych zapisów, następujących po sobie czynności składających się na
scharakteryzowany powyżej eksperyment, jest prawidłowy :
B) C-A-G-H-I-F
E) żadna
D) A-C-G-H-I-F
C) C-H-I-F-A
A) A-B-C-D-E-G
B) C-A-G-H-I-F
13. Podane niżej enzymy restrykcyjne trawią DNA w specyficznych miejscach (jak poniżej) :
BamHI NheI Xbal EcoRI 5’-GGATCC-3’ 5’-GCTAGC-3’ 5’-TCTAGA-3’ 5’-GAATTC-3’
3’-CCTAGG-5’ 3’-CGATCG-5’ 3’-AGATCT-5’ 3’-CTTAAG-5’
Wszystkie one hydrolizują wiązanie fosfodiestrowe pomiędzy pierwszym a drugim nukleotydem
(licząc od 5' końca każdej linii – czyli lepkie końce robią), przy czym produkty ....(tu niestety brak
tresci ale to raczej malo istotne)
Spośród podanych poniżej zdań proszę wybrać prawdziwe:
E) NheI i Xbal są kaudomerami
D)....np fragmenty poddane restrykcji przez EcoRi i BamHI mogą byc smialo ze soba zligowane (to samo co C )
B) fragmenty poddane restrykcji przez NheI i Xbal mogą byc smialo ze soba zligowane
A) EcoRI i BamHI to izoschizomery
C)....np.NheI i Xbal są izoschizomerami (jakos w tym stylu było)
E) NheI i Xbal są kaudomerami
B) fragmenty poddane restrykcji przez NheI i Xbal mogą byc smialo ze soba zligowane
14.Mamy opisany eksperyment restrykcji jakiegoś faga. Najpierw 16 µl DNA w probówce. Do tego
dodajemy kolejno: 1. 2µl buforu
2. 2 µl roztworu z enzymem
Pytanie: Skoro optymalne stężenie NaCl dla enzymu to 50mM to jakie było wyjściowe stężenie tej
soli w dodawanym buforze (po obliczeniach rozcieńczenie buforu wyszło R=10)
B) 50mM
B) 500mM
E) trudno powiedzieć
B) 10mM
A) 200mM
B) 500mM
15. W trakcie elektroforezy w żelu agarozowym, w nieobecności bromku etydyny:
D) superzwiniete czasteczki dsDNA poruszaja sie wolniej niz odpowiednie im zlinearyzowane
E) fragmenty dsDNA o dlugosci 1006bp i 1007bp moga byc rozdzielone w celu preparatywnym
B) czasteczkki dsDNA sa obdarzone ladunkiem dodatnim
A) czasteczka dsDNA porusza sie w kierunku elektrody ujemnej
C) liniowe czasteczki dsDNA poruszaja sie tym szybciej im sa krotsze
D) superzwiniete czasteczki dsDNA poruszaja sie wolniej niz odpowiednie im zlinearyzowane
C) liniowe czasteczki dsDNA poruszaja sie tym szybciej im sa krotsze
y)16.Dwie próbki kompetentnych
komórek E.coli poddano transformacji wektorem zawierającym
gen AmpR (opornosc na ampicyline). I potem mamy dwie różne sytuacje:
1. dodano do nich niewielka ilosc pozywki plynnej i po ok. 2 min umieszczono na pożywce
zawierająca ampicylinę.
2. dodano ta sama ilosci pozywki plynnej i po 30 min inkubacji umieszczono na pożywce z
ampicylina.
Jakie zanotowano obserwacje:
B) szalka pierwsza 300 kolonii i szalka druga 30 kolonii
E) szalka pierwsza 300 kolonii i szalka druga 0 kolonii
C) szalka pierwsza 30 kolonii i szalka druga 400 kolonii
A) szalka pierwsza 300 kolonii i szalka druga 300 kolonii
D) szalka pierwsza 0 kolonii i szalka druga 300 kolonii
C) szalka pierwsza 30 kolonii i szalka druga 400 kolonii
17.Fragmenty (ramiona - w sumie 30kb) WEKTORA ZASTĘPCZEGO poddawano ligacji z fragmentami
DNA majacymi prawidlowe konce lepkie odpowiednie do ramion wektora. Jaki maksymalny
rozmiar mogl mieć wsczepiany w ten wektor odcinek:
E)22kb
A)8kb
D)20kb
C)100kb
B)40kb
E)22kb
18.Doświadczenie ktorego celem jest nokaut genu mysiego XYZ. Komórki macierzyste, do których
wprowadzany jest gen rekombinowany:
D) sa oporne na dzialanie neomycyny
B) zawierają oba allele typu dzikiego
E) zawieraja gen Tk
A) zawierają 1 allel zmutowany i 1 typ dzikiego genu XYZ
C) poddawane są selekcji, ktorej celem jest wybrac te w ktorych zaszla rekombinacja niehomologiczna
B) zawierają oba allele typu dzikiego
19.Kulisty DNA poddano linearyzacji enzymem dajacym konce lepkie. Nastepnie potraktowano go
nukleza S1 i po zahamowaniu aktywnosci tejze nukleazy uzyto terminalej transferazy przy
obecnosci dNTP. Najprawdopodobniej końce powstalego fragmentu DNA beda mialy charakter
taki jak te pokazane w punkcie :
E)zadne z powyzszych - nie wiadomo jaka poczatkowa sekwencja byla
B) 5’AGCAATGG3’ 3’ACC5’
A) 5’AGCAATGGC3’ 3’AGCTTCGT5’
D) 5’ACTAGCAA3’ 3’TCGTTACC5’
C) 5’AGCAATGG3’ 3’TCGTTACC5’
A) 5’AGCAATGGC3’ 3’AGCTTCGT5’
20. Pewien haploidalny szczep grzybaa Neurospora jest transgeniczny pod wzgledem genu
lucyferazy. Gen ten nie wystepuje w szczepie dzikim. Szczep transgeniczny zostal skrzyzowany ze
szczepem dzikim a powstale askospory poddano analizie PCR wykorzystujac startery specyficzne
dla genu lucyferazy. Zakladajac, ze PCR przeprowadzono w sposob optymalny mozna przypuszczac
ze udzial askospor dla ktorych zidentyfikowano specyficzny produkt wynosil :