Fiszki
JUMPJET 1.1
Test w formie fiszek Biolomolo 1.1
Ilość pytań: 58
Rozwiązywany: 1589 razy
Kwasy nukleinowe
Temperatura topnienia DNA zależy od długości cząsteczki DNA w sposób odwrotnie proporcjonalny
Podczas rozplatania dwuniciowej helisy DNA pod wpływem wzrostu temperatury następuje spadek absorbancji przy długości fali 260 nm
W DNA obok standardowych wiązań fosfodiestrowych 3’-5’ występują także przejściowo 2’-5’. fosfodiestrowe
Deoksyryboza nie zawiera grupy hydroksylowej 2’
Jednoniciowy RNA może tworzyć helisę z komplementarnym jednoniciowym DNA
Ryboza nie zawiera grupy hydroksylowej 3’
Deoksyryboza nie zawiera grupy hydroksylowej 2’
Jednoniciowy RNA może tworzyć helisę z komplementarnym jednoniciowym DNA
Mutacja genów
Insercja polega na wstawieniu jednej lub większej liczby zasad do danej cząsteczki DNA
Spontaniczne pojawienie się uracylu w DNA podlega naprawie polegającej na jego metylacji w odpowiedniej pozycji z utworzeniem tyminy
Wprowadzenie do DNA 5-bromouracylu zwiększa częstość pojawiania się insercji
Hipoksantyna tworzy parę z cytozyną
Transwersja jest jednym z rodzajów delecji
Puste miejsca powstałe w wyniku wycięcia uszkodzonego DNA wypełnia polimeraza DNA III
Metylacja cytozyny w pozycji C5 może skutkować zwiększonym poziomem mutacji z powodu zachodzącej spontanicznie jej deaminacji
Głównym efektem działania światła ultrafioletowego jest powstanie wiązań kowalencyjnych łączących komplementarne zasady pirymidynowe w jednej nici DNA
Głównym efektem działania światła ultrafioletowego jest powstanie wiązań kowalencyjnych łączących komplementarne zasady pirymidynowe w jednej nici DNA TAK
Guanina ulega deaminacji oksydacyjnej do ksantyny
Za usuwanie dimerów pirymidynowych w komórkach jest odpowiedzialne białko FGIR będące fotoligazą
Psoralen i jego chemiczne pochodne mogą połączyć kowalencyjnie dwie nici DNA
Zamiana zasady purynowej na purynę jest przykładem transwersji
Produkt utlenienia guaniny, 8 - oksyguanina, tworzy wiązania wodorowe z adeniną
Insercja polega na wstawieniu jednej lub większej liczby zasad do danej cząsteczki DNA
Hipoksantyna tworzy parę z cytozyną
Metylacja cytozyny w pozycji C5 może skutkować zwiększonym poziomem mutacji z powodu zachodzącej spontanicznie jej deaminacji
Głównym efektem działania światła ultrafioletowego jest powstanie wiązań kowalencyjnych łączących komplementarne zasady pirymidynowe w jednej nici DNA
Głównym efektem działania światła ultrafioletowego jest powstanie wiązań kowalencyjnych łączących komplementarne zasady pirymidynowe w jednej nici DNA TAK
Guanina ulega deaminacji oksydacyjnej do ksantyny
Psoralen i jego chemiczne pochodne mogą połączyć kowalencyjnie dwie nici DNA
Produkt utlenienia guaniny, 8 - oksyguanina, tworzy wiązania wodorowe z adeniną
Spośród poniższych składników wybierz te, które są wymagane dla aktywności polimerazy DNA zależnej od DNA do przeprowadzenia reakcji syntezy nowego łańcucha (DNA):
Wszystkie 4 aktywowane prekursory 5’-trifosforany deoksyrybonukleozydów
Jony Mg2+
NAD+, który dostarcza energii do syntezy
Wszystkie 4 aktywowane prekursory dATP, dCTP, dGTP, dTTP
Jednoniciowa lub dwuniciowa matryca DNA
Odcinek starterowy posiadający wolną grupę hydroksylową 5’
Wszystkie 4 aktywowane prekursory ATP, CTP, GTP, TTP
Wszystkie 4 aktywowane prekursory 5’-trifosforany deoksyrybonukleozydów
Jony Mg2+
Wszystkie 4 aktywowane prekursory dATP, dCTP, dGTP, dTTP
Jednoniciowa lub dwuniciowa matryca DNA
Ligazy DNA
Mechanizm katalizowanej reakcji wymaga utworzenia związania kowalencyjnie enzym-adenylan
Wymagana w replikacji DNA do naprawy i rekombinacji
Mogą łączyć końce jednoniciowego DNA w formę kolistą
Katalizują tworzenie wiązań fosfatydylowych w miejscach zerwania łańcucha DNA
Ligaza T4 bierze udział w przyłączeniu białka regulatorowego do sekwencji promotorowej
Katalizuje tworzenie się wiązania 3OH i 5P
Wymaga kofaktora NAD+ albo ATP zależnie od źródła enzymu, dostarcza energii do tworzenia wiązań fosfodiestrowych
Katalizuje reakcje przez mechanizm, który wymaga aktywacji fosforanem DNA przez formowanie wiązania fosfobezwodnikowego z AMP
Źródłem energii dla danej ligazy może być ATP jak i NAD+
Wymagają końców DNA z wolną grupą 3’-OH oraz ufosforylowaną grupą hydroksylową 5’
Jednym z etapów reakcji jest przeniesienie reszty AMP na ufosforylowany koniec 5’ DNA z utworzeniem wiązania bezwodnikowego
Mechanizm katalizowanej reakcji wymaga utworzenia związania kowalencyjnie enzym-adenylan
Wymagana w replikacji DNA do naprawy i rekombinacji
Katalizuje tworzenie się wiązania 3OH i 5P
Wymaga kofaktora NAD+ albo ATP zależnie od źródła enzymu, dostarcza energii do tworzenia wiązań fosfodiestrowych
Katalizuje reakcje przez mechanizm, który wymaga aktywacji fosforanem DNA przez formowanie wiązania fosfobezwodnikowego z AMP
Źródłem energii dla danej ligazy może być ATP jak i NAD+
Wymagają końców DNA z wolną grupą 3’-OH oraz ufosforylowaną grupą hydroksylową 5’
Topologia DNA:
Lk naturalnie występujących cząsteczek DNA nie jest cechą dotyczącą wyłącznie kolistego DNA
DNA chromosomów człowieka jest superskręcone negatywnie/ujemnie, dzięki toroidalnemu nawinięciu DNA na szkielet
Liczba opleceń (Lk) naturalnie występująca u cząsteczek DNA, jest cechą dotyczącą wyłącznie DNA kolistego
Liczba zwojów (Wr) jest cechą topologiczną
Prokariotyczne izomerazy typu II katalizują
Lk-liczba opleceń mówi, ile razy jedna nić DNA oplata prawoskrętnie drugą nić DNA i dlatego jest zawsze dodatnia dla DNA- B
Wr-Liczba zwojów- mówi nam ile razy oś helisy DNA oplata prawoskrętnie samą siebie
Tw-liczba skrętów- móri nam ile razy jedna nić oplata się wokół osi dupleksu w DNA
Lk=Tw+Wr
Wr-Liczba zwojów-liczba zwrotów, które oś dupleksu DNA wykonuje wokół osi superhelisy
Do zmiany konformacji cząsteczki DNA wystarczy jej rozplecenie i ponowne splecenie do nowej postaci bez przecinania którejkolwiek z nici, podczas gdy do zmiany topologii konieczne jej rozcięcie przynajmniej jednej z nici
liczba opleceń mówi ile razy jedna nić DNA oplata prawoskrętnie drugą nić DNA i dlatego jest zawsze dodatnią helisą typu B
Lk-liczba opleceń- jest topologiczną właściwością DNA
Lk naturalnie występujących cząsteczek DNA nie jest cechą dotyczącą wyłącznie kolistego DNA
DNA chromosomów człowieka jest superskręcone negatywnie/ujemnie, dzięki toroidalnemu nawinięciu DNA na szkielet
Lk-liczba opleceń mówi, ile razy jedna nić DNA oplata prawoskrętnie drugą nić DNA i dlatego jest zawsze dodatnia dla DNA- B
Wr-Liczba zwojów- mówi nam ile razy oś helisy DNA oplata prawoskrętnie samą siebie
Tw-liczba skrętów- móri nam ile razy jedna nić oplata się wokół osi dupleksu w DNA
Lk=Tw+Wr
Wr-Liczba zwojów-liczba zwrotów, które oś dupleksu DNA wykonuje wokół osi superhelisy
Do zmiany konformacji cząsteczki DNA wystarczy jej rozplecenie i ponowne splecenie do nowej postaci bez przecinania którejkolwiek z nici, podczas gdy do zmiany topologii konieczne jej rozcięcie przynajmniej jednej z nici
Lk-liczba opleceń- jest topologiczną właściwością DNA
Wskaż zdania dotyczące dwuniciowej DNA, które są prawdziwe
Jest jednokierunkowa
Zasady w superhelisie znajdują się wewnątrz helisy prostopadle do osi helisy
Połączenie puryny z rybozą i pirymidyny z deoksyrybozą nosi nazwę nukleozydu
Guanina paruje z cytozyną poprzez 3 wiązania wodorowe
Komplementarne pary tworzą się między pirymidyna a pirymidyna, puryna a puryną
Deoksyryboza ma przy 3’ wolna grupę OH
Zasady w superhelisie znajdują się wewnątrz helisy prostopadle do osi helisy
Guanina paruje z cytozyną poprzez 3 wiązania wodorowe
Mamy oligonukleotyd, który ma tępe końce. Jakich odczynników musimy dodać, aby powstał peptyd o końcach lepkich:
Kinaza polinukleotydowa
Ligaza z faga T-4
Pi
ATP
Endonukleaza EcoRI
Kinaza polinukleotydowa
Ligaza z faga T-4
ATP
Endonukleaza EcoRI
Które zdania są prawdziwe o DNA
Jeżeli na jednej nici A+G wynosi 30%, to możliwe jest by na drugiej T stanowiło 20%
Ze wzrostem ilości nukleotydów temperatura topnienia wzrasta
Zawsze jest dwuniciowa
Paruje 5 zasad
Hiperchromizm jest to efekt podczas topnienia DNA, który powoduje obniżenie absorbancji przy promieniu 260 nm
Jeżeli na jednej nici A+G wynosi 30%, to możliwe jest by na drugiej T stanowiło 20%
Ze wzrostem ilości nukleotydów temperatura topnienia wzrasta
Które z poniższych zdań są cechami kodu genetycznego?
Kodony, które określają ten sam aminokwas są nazywane akronimami.
61 trojek koduje aminokwasy
Znakami przestankowymi w kodzie genetycznym są zwykle cytozyny metylowane przy C-5
Jest całkowicie zdegradowany
Mutacja w pętli antykodonu cząsteczki tRNA może sprawić, że dany kodon STOP w mRNA będzie rozpoznawany jako kodon kodujący aminokwas
Jest zdegenerowany
W różnych organizmach ten sam kodon może kodować inny aminokwas, co jest nazywane degeneracją kodu genetycznego
Kod genetyczny jest w pełni uniwersalny, co oznacza, że wszystkie systemy translacyjne organizmów żywych używają tego samego kodonu, lub tej samej grupy kodonów, dla tych samych aminokwasów.
Mutacja w sekwencji końca 5' cząsteczki tRNA może sprawić, że dany kodon STOP w mRNA będzie rozpoznawany jako kodon kodujący aminokwas.
Sekwencja jest odczytywana kolejno, od określonego miejsca startowego
Każdy aminokwas może być kodowany przez więcej niż jeden kodon, przy czym skład pierwszej i drugiej zasady dla danego aminokwasu jest taki sam
61 trojek koduje aminokwasy
Mutacja w pętli antykodonu cząsteczki tRNA może sprawić, że dany kodon STOP w mRNA będzie rozpoznawany jako kodon kodujący aminokwas
Jest zdegenerowany
Sekwencja jest odczytywana kolejno, od określonego miejsca startowego
Gen
Eukariota mają introny, a większość prokariota nie ma
Egzony mogą kodować całe domeny białek
Introny kodują łączniki pomiędzy białkami
W genie prokariota występuje współliniowa zależność pomiędzy genem i kodowanym przez niego białkiem.
Splicing autokatalityczny jest jedną z metod do otrzymania białka o innnych właściwościach
Eukariota mają introny, a większość prokariota nie ma
Egzony mogą kodować całe domeny białek
Czym się różni polimeraza RNA od polimerazy DNA
Katalizuje tworzenie wiązań fosfodiestrowych tylko wtedy, gdy zasada przyłączonego nukleotydu jest komplementarna do zasady w łańcuchu stanowiącym matrycę
Wydłuża rosnący łańcuch w kierunku 5’->3’
Nie ma właściwości nukleazowej
Jako matryce wykorzystuje RNA zamiast DNA
Wymaga dUTP zamiast dTTP
Umożliwia syntezę łańcucha DNA poprzez ułatwienie ataku nukleofilowego grupy hydroksylowej 3’ rosnącego łańcucha na atom fosforu w pozycji alfa odpowiedniego bifosforanu deoksyrybonukleotydu
Wymaga jonu 2-wartościowego
Umożliwia syntezę łańcucha DNA poprzez atak nukleofilowy grupy hydroksylowej 3’ rosnącego łańcucha na atom fosforu w pozycji α odpowiedniego dNTP
Syntezę RNA ułatwia nukleofilowy atak na gr 2’
Jako startera wymaga RNA zamiast DNA
Nie ma właściwości nukleazowej
PCR
Metodą tą możemy skutecznie poddać amplifikacji także ten fragment cząsteczki DNA, którego sekwencji nie znamy, pod warunkiem, że znamy sekwencje go oskrzydlające (otaczające)
Wymaga polimerazy DNA
Typowym enzymem wykorzystywanym w tej metodzie jest termostabilna polimeraza DNA z Thermus aquaticus, nazywana polimerazą Taq
Wymaga użycia dwóch komplementarnych do siebie oligonukleotydów jako starterów
DNA jest syntezowany w sposób geometryczny
Ma ważne zastosowanie w mutagenezie ukierunkowanej sterowanej oligonukleotydem
Składają się na niego 3 etapy: denaturacja w 90℃, hybrydyzacja w 72℃, elongacja, dla której temp jest zależna od długości startera
Wykorzystywana do wykrywania białaczki (spowodowane rearanżacją chromosomów)
Służy do wykrywania śladowych ilości wirusów i bakterii
Klasyczny PCR może być wykorzystany do amplifikacji dwuniciowych matryc DNA
Metodą tą możemy skutecznie poddać amplifikacji także ten fragment cząsteczki DNA, którego sekwencji nie znamy, pod warunkiem, że znamy sekwencje go oskrzydlające (otaczające)
Wymaga polimerazy DNA
Typowym enzymem wykorzystywanym w tej metodzie jest termostabilna polimeraza DNA z Thermus aquaticus, nazywana polimerazą Taq
DNA jest syntezowany w sposób geometryczny
Ma ważne zastosowanie w mutagenezie ukierunkowanej sterowanej oligonukleotydem
Wykorzystywana do wykrywania białaczki (spowodowane rearanżacją chromosomów)
Służy do wykrywania śladowych ilości wirusów i bakterii
Klasyczny PCR może być wykorzystany do amplifikacji dwuniciowych matryc DNA
Która z odpowiedzi dotyczącej łańcuchowej polimeryzacji jest nieprawdziwa:
Służy do wykrywania rzadkich rodzajów białek
Potrzebne są: 2 odcinki startera, trifosforany 4 nukleozydów, polimeraza RNA
W PCR: 3 etapy: denaturacja w 90℃, hybrydyzacja w 72℃, elongacja , dla której temp jest zależna od długości startera
Można wykrywać śladowe ilości białek i cukrów
W reakcji PCR DNA jest wydłużane w sposób geometryczny
Produkty PCR są wykrywane przy pomocy western blotting
Potrzebne są: 2 odcinki startera, trifosforany 4 nukleozydów, polimeraza RNA
W PCR: 3 etapy: denaturacja w 90℃, hybrydyzacja w 72℃, elongacja , dla której temp jest zależna od długości startera
Można wykrywać śladowe ilości białek i cukrów
Produkty PCR są wykrywane przy pomocy western blotting
Jakie wiązanie występuje między nukleozydami?
Beta-laktamowe
Kowalencyjne
Glikozydowe
Fosfodiestrowe
Fosfodiestrowe
Cechy charakterystyczne mRNA eukariota
Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG lub pppG
Posiadają na końcu 3’ ogon poliA, niekodowany przez matryce
Translacja jest sprzężona z transkrypcją i zachodzi w tym samym czasie
Zazwyczaj powstają z pre-mRNA
Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG
Posiadają na końcu 3’ ogon poliA, niekodowany przez matryce
Zazwyczaj powstają z pre-mRNA
Odwrotna transkryptaza
Dwuniciowy RNA wbudowuje się do genomu
Organizmy eukariotyczne mogą korzystać z retrowirusa zmieniać metabolizm
Wirusowa czy komórki gospodarza
Odwrotna transkryptaza RNA zależna od DNA
Replikaza RNA-polimeraza RNA zależna od RNA
Polimeraza DNA zależna od DNA
Powstaje hybryda DNA-RNA
Polimeraza DNA zależna od RNA
Organizmy eukariotyczne mogą korzystać z retrowirusa zmieniać metabolizm
Polimeraza DNA zależna od DNA
Powstaje hybryda DNA-RNA
Polimeraza DNA zależna od RNA
Enzymy restrykcyjne: pocięto jakiś liniowy odcinek DNA enzymem EcoRV, obraz po elektroforezie uwidoczniono na żelu. Co możesz powiedzieć na podstawie rysunku poniżej; żel wybarwiono bromkiem etydyny; zwróć uwagę na słabo rozdzielone elementy o długościach 433 i 415 par zasad.
Długość cząsteczki DNA wynosi 2220
W żelu znajduje się bromek etydyny
Na tym odcinku DNA znajduje się 5 unikalnych miejsc restrykcyjnych rozpoznawanych przez enzym
Metoda ta może być stosowania do produktów ekspresji metody Sangera
Żadna z powyższych nie jest prawdziwa
Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o długości 210 pz
Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o długości 2220 pz
W żelu znajduje się bromek etydyny
Na tym odcinku DNA znajduje się 5 unikalnych miejsc restrykcyjnych rozpoznawanych przez enzym
Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o długości 210 pz
Co jest wymagane do przeprowadzenia reakcji Sangera, ale chodziło o to, że jest obecny zawsze w jednym z odczynników?
γ-P32-ATP
Matryca
Jeden z 4 dNTP
Wszystkie 4 dNTP
α-P32-ATP
2’,5’-dideoksy analog jednego z 4 dNTP
Polimeraza DNA
Matryca
α-P32-ATP
Polimeraza DNA
Chcesz syntezować nić DNA - co jest do tego niezbędne?
Matryca 1 lub 2 niciowa
Polimeraza DNA
Wszystkie 4 NTP
Matryca komplementarna do startera
Magnez
Wszystkie 4 dNTP
Aktywność egzonukleazowa 3---5’
Starter z 3’-OH
Matryca 1 lub 2 niciowa
Polimeraza DNA
Matryca komplementarna do startera
Wszystkie 4 dNTP
Starter z 3’-OH
Pytanie dotyczące usuwania deaminowanej cytozny do uracylu w DNA
Enzymy usuwające tę mutację – proces naprawy – glikozydaza uracylowa, potem endonukleaza AP, polimeraza DNA i ligaza na końcu
Czy da to mutację CG – AT w niciach potomnych
Jeżeli jest w mRNA to w znaczący sposób wpływa na ekspresję
Jest to spontaniczna modyfikacja, prowadzi do powstania nowych kodonów
Coś z tyminą, że jest obecna w RNA, mimo że koszt energetyczny syntezy jest większy niż w uracylu, występującym w RNA
Mutacje w DNA są widoczne we wszystkich następnych pokoleniach
Jeżeli jest w mRNA to w znaczący sposób wpływa na ekspresję
Jest to spontaniczna modyfikacja, prowadzi do powstania nowych kodonów