JUMPJET 1.1

Ryboza nie zawiera grupy hydroksylowej 3’

Jednoniciowy RNA może tworzyć helisę z komplementarnym jednoniciowym DNA

Temperatura topnienia DNA zależy od długości cząsteczki DNA w sposób odwrotnie proporcjonalny

W DNA obok standardowych wiązań fosfodiestrowych 3’-5’ występują także przejściowo 2’-5’. fosfodiestrowe

Podczas rozplatania dwuniciowej helisy DNA pod wpływem wzrostu temperatury następuje spadek absorbancji przy długości fali 260 nm

Deoksyryboza nie zawiera grupy hydroksylowej 2’

Puste miejsca powstałe w wyniku wycięcia uszkodzonego DNA wypełnia polimeraza DNA III

Hipoksantyna tworzy parę z cytozyną

Spontaniczne pojawienie się uracylu w DNA podlega naprawie polegającej na jego metylacji w odpowiedniej pozycji z utworzeniem tyminy

Transwersja jest jednym z rodzajów delecji

Głównym efektem działania światła ultrafioletowego jest powstanie wiązań kowalencyjnych łączących komplementarne zasady pirymidynowe w jednej nici DNA

Guanina ulega deaminacji oksydacyjnej do ksantyny

Wprowadzenie do DNA 5-bromouracylu zwiększa częstość pojawiania się insercji

Za usuwanie dimerów pirymidynowych w komórkach jest odpowiedzialne białko FGIR będące fotoligazą

Głównym efektem działania światła ultrafioletowego jest powstanie wiązań kowalencyjnych łączących komplementarne zasady pirymidynowe w jednej nici DNA TAK

Metylacja cytozyny w pozycji C5 może skutkować zwiększonym poziomem mutacji z powodu zachodzącej spontanicznie jej deaminacji

Psoralen i jego chemiczne pochodne mogą połączyć kowalencyjnie dwie nici DNA

Insercja polega na wstawieniu jednej lub większej liczby zasad do danej cząsteczki DNA

Produkt utlenienia guaniny, 8 - oksyguanina, tworzy wiązania wodorowe z adeniną

Zamiana zasady purynowej na purynę jest przykładem transwersji

Wszystkie 4 aktywowane prekursory 5’-trifosforany deoksyrybonukleozydów

Wszystkie 4 aktywowane prekursory ATP, CTP, GTP, TTP

Odcinek starterowy posiadający wolną grupę hydroksylową 5’

NAD+, który dostarcza energii do syntezy

Jony Mg2+

Jednoniciowa lub dwuniciowa matryca DNA

Wszystkie 4 aktywowane prekursory dATP, dCTP, dGTP, dTTP

Ligaza T4 bierze udział w przyłączeniu białka regulatorowego do sekwencji promotorowej

Wymaga kofaktora NAD+ albo ATP zależnie od źródła enzymu, dostarcza energii do tworzenia wiązań fosfodiestrowych

Mogą łączyć końce jednoniciowego DNA w formę kolistą

Katalizują tworzenie wiązań fosfatydylowych w miejscach zerwania łańcucha DNA

Wymagają końców DNA z wolną grupą 3’-OH oraz ufosforylowaną grupą hydroksylową 5’

Mechanizm katalizowanej reakcji wymaga utworzenia związania kowalencyjnie enzym-adenylan

Jednym z etapów reakcji jest przeniesienie reszty AMP na ufosforylowany koniec 5’ DNA z utworzeniem wiązania bezwodnikowego

Wymagana w replikacji DNA do naprawy i rekombinacji

Katalizuje reakcje przez mechanizm, który wymaga aktywacji fosforanem DNA przez formowanie wiązania fosfobezwodnikowego z AMP

Katalizuje tworzenie się wiązania 3OH i 5P

Źródłem energii dla danej ligazy może być ATP jak i NAD+

liczba opleceń mówi ile razy jedna nić DNA oplata prawoskrętnie drugą nić DNA i dlatego jest zawsze dodatnią helisą typu B

Lk naturalnie występujących cząsteczek DNA nie jest cechą dotyczącą wyłącznie kolistego DNA

Do zmiany konformacji cząsteczki DNA wystarczy jej rozplecenie i ponowne splecenie do nowej postaci bez przecinania którejkolwiek z nici, podczas gdy do zmiany topologii konieczne jej rozcięcie przynajmniej jednej z nici

Liczba opleceń (Lk) naturalnie występująca u cząsteczek DNA, jest cechą dotyczącą wyłącznie DNA kolistego

Lk=Tw+Wr

Wr-Liczba zwojów-liczba zwrotów, które oś dupleksu DNA wykonuje wokół osi superhelisy

Lk-liczba opleceń- jest topologiczną właściwością DNA

Lk-liczba opleceń mówi, ile razy jedna nić DNA oplata prawoskrętnie drugą nić DNA i dlatego jest zawsze dodatnia dla DNA- B

DNA chromosomów człowieka jest superskręcone negatywnie/ujemnie, dzięki toroidalnemu nawinięciu DNA na szkielet

Liczba zwojów (Wr) jest cechą topologiczną

Tw-liczba skrętów- móri nam ile razy jedna nić oplata się wokół osi dupleksu w DNA

Prokariotyczne izomerazy typu II katalizują

Wr-Liczba zwojów- mówi nam ile razy oś helisy DNA oplata prawoskrętnie samą siebie

Jest jednokierunkowa

Deoksyryboza ma przy 3’ wolna grupę OH

Komplementarne pary tworzą się między pirymidyna a pirymidyna, puryna a puryną

Połączenie puryny z rybozą i pirymidyny z deoksyrybozą nosi nazwę nukleozydu

Guanina paruje z cytozyną poprzez 3 wiązania wodorowe

Zasady w superhelisie znajdują się wewnątrz helisy prostopadle do osi helisy

Pi

Kinaza polinukleotydowa

ATP

Endonukleaza EcoRI

Ligaza z faga T-4

Hiperchromizm jest to efekt podczas topnienia DNA, który powoduje obniżenie absorbancji przy promieniu 260 nm

Jeżeli na jednej nici A+G wynosi 30%, to możliwe jest by na drugiej T stanowiło 20%

Ze wzrostem ilości nukleotydów temperatura topnienia wzrasta

Paruje 5 zasad

Zawsze jest dwuniciowa