Pytania i odpowiedzi (2 / 2)
Biochemia I egzamin Dobryszycki
51.
1 Które z poniższych stwierdzeń dotyczących błon biologicznych są prawdziwe?
a. Błony biologiczne są warstwowymi strukturami zbudowanymi głównie z lipidów i białek, b. Obecność nienasyconych kwasów tłuszczowych z wiązaniami podwójnymi w konfiguracji cis w lipidach błonowych obniża tzw. temperaturę przejścia („topnienia”) błony., g. Są dużymi strukturami warstwowymi, ściśle odgraniczającymi różne przedziały., i. Mogą być traktowane jak dwuwymiarowy roztwór zorientowanych przestrzennie lipidów i białek., j. Zawierają specyficzne białka, które pośredniczą w charakterystycznych funkcjach błon., n. Obecność cholesterolu powoduje zmniejszenie płynności błony.
52.
2 Które z poniższych stwierdzeń dotyczących lipidów błon biologicznych są prawdziwe?
a. Zarówno gangliozydy, jak i cerebrozydy są sfingolipidami., b. Glikolipidy są sfingolipidami i zawierają fragmenty cukrowe., Fosfoglicerydy są fosfolipidami błonowymi zbudowanymi na bazie kwasu fosfatydowego.
53.
12.4 Które z poniższych stwierdzeń dotyczących białek błonowych są prawdziwe?
Obecność helis transbłonowych w białku można przewidzieć na podstawie jego sekwencji aminokwasowej. , Białka błonowe mają ściśle określoną orientację ponieważ są dostarczane od strony cytozolowej komórki. , Aspiryna blokuje aktywność syntazy-1 prostaglandyny H2 poprzez zablokowanie kanału hydrofobowego umożliwiającego dotarcie kwasu arachidonowego do miejsca aktywnego enzymu., i. Białka transbłonowe przechodzą przez całą szerokość dwuwarstwy lipidowej., Rodopsyna bakteryjna jest białkiem integralnym, k. Do oddzielenia białka integralnego od błony konieczne jest użycie detergentu.
54.
1 Karbamoilotransferaza asparaginianowa (ATCaza):
c. CTP hamuje ją na drodze sprzężenia zwrotnego.
55.
3 Zaznacz poprawną odpowiedź na temat strategii regulacji enzymów:
a. Cytydynotrifosforan (CTP) hamuje ACTazę., c. W oddziaływaniach allosterycznych w ACTazie pośredniczą duże zmiany w strukturze czwartorzędowej.
56.
4 Które z poniższych stwierdzeń dotyczących fosforylacji białek są prawdziwe?
a. Reakcje fosforylacji białek są katalizowane przez tzw. kinazy białkowe. , b. Wprowadzenie silnie naładowanej grupy fosforanowej do enzymu może znacznie zmienić jego właściwości, a w tym np. jego powinowactwo do substratu, d. Donorem grupy fosforanowej w reakcji fosforylacji białka może być ATP, ale nie ADP ani AMP. , e. Podczas fosforylacji dochodzi do transferu najbardziej zewnętrznej reszty fosforanowej z odpowiedniego nukleotydu na substrat pełniący rolę akceptora. , j. Fosforylacja białek indukuje zmiany konformacyjne.
57.
5 Które stwierdzenia o cAMP są prawdziwe?
a. Większość efektów cAMP w komórkach eukariotycznych jest używanych do aktywacji kinaz białkowych A., c. cAMP wiąże się z regulatorową podjednostką PKA i aktywuje enzym przez uwolnienie katalitycznych podjednostek
58.
6 Które z poniższych stwierdzeń dotyczących kinazy białkowej A (PKA) są prawdziwe?
a. W komórkach eukariotycznych większość efektów zależnych od cyklicznego adenozynomonofosforanu (cAMP) jest skutkiem aktywacji PKA. , c. cAMP wiąże się do dimeru R2 podjednostek regulatorowych PKA, co prowadzi do oddysocjowania podjednostek katalitycznych., e. cAMP aktywuje PKA zmieniając jej strukturę czwartorzędową, f. PKA i większość innych kinaz występują w postaci izoenzymów, co umożliwia precyzyjne dostosowanie regulacji do typu komórki, czy stadium rozwojowego. , h. Podjednostki katalityczne zawierają specjalną sekwencję nazywaną pseudosubstratową która jest zbliżona do optymalnej sekwencji substratowej, lecz pozbawiona reszty akceptującej fosforan.
59.
7 Które z poniższych stwierdzeń na temat chymotrypsynogenu (ChTg) oraz procesu jego aktywacji są prawdziwe?
b. Kluczowym zjawiskiem dla nabycia aktywności katalitycznej przez ChTg jest proteolityczne utworzenie nowego końca aminowego, który przemieszcza się do wnętrza białka i tworzy dodatkowe wiązanie jonowe z obecną tam ujemnie naładowaną grupą karboksylową, d. ChTg jest pojedynczym łańcuchem polipeptydowym.
60.
8 Które zdania dotyczące proteaz serynowych: trypsyny, chymotrypsyny i elastazy są prawdziwe?
a. Pochodzą od wspólnego pragenu., b. Wykazują podobieństwa w sekwencji aminokwasowej i strukturze trójwymiarowej., c. Katalizują tą samą reakcję: cięcia wiązania peptydowego., d. Katalizują reakcje, które przebiegają przez kowalencyjny związek pośredni., e. Wykazują różnice strukturalnie w centrach aktywnych.
61.
9 Aktywacja zymogenów trzustkowych rozpoczyna się od:
c. Przekształcenia trypsynogenu w trypsynę przez enteropeptydazę w dwunastnicy
62.
10 Które z poniższych stwierdzeń dotyczących kaskady krzepnięcia krwi są prawdziwe?
a. Aktywne czynniki kaskady krzepnięcia krwi działają krótko, m.in. dlatego, że mogą być zatrzymywane w wątrobie oraz degradowane proteolitycznie przez serpiny. , b. Do syntezy funkcjonalnej protrombiny wymagana jest obecność witaminy K. , d. Antytrombina III hamuje trombinę i niektóre z pozostałych czynników kaskady krzepnięcia krwi., g. Białko C jest aktywowaną przez trombinę proteazą, która degraduje czynniki krzepliwości Va i VIIIa.
63.
14 Które z poniższych białek syntetyzowane są w postaci nieaktywnej i podlegają aktywacji na drodze proteolitycznej?
b. Lipaza trzustkowa , c. Kolagen, d. Chymotrypsyna , e. Czynnik X krzepliwości krwi
64.
11 Które z poniższych stwierdzeń na temat kinaz NMP są prawdziwe?
b. Do tej grupy enzymów należą np. kinaza adenylanowa i guanylanowa., c. Zmiany konformacyjne, którymi podlega m.in. domena wiążąca nukleotydy i pętla P są podstawą wykluczenia transferu reszty fosforanowej na cząsteczkę wody. , e. Zawierają w swej strukturze silnie konserwatywną domenę wiążącą nukleotydy.
65.
12 Które z podanych reakcji mogą być katalizowane przez kinazy NMP?
a. AMP+ ATP 2ADP, b. AMP+ GTP ADP + GDP
66.
10 Które z poniższych stwierdzeń dotyczących enzymów wykorzystujących jedną z reszt aminokwasowych jako silny nukleofil do hydrolizy wiązania peptydowego są prawdziwe?
b. Jedną z istotnych strategii generowania silnego nukleofilu jest tzw. triada katalityczna. , c. Mimo, iż karboksypeptydaza II z ziaren pszenicy wykorzystuje triadę katalityczną złożoną z takich samych reszt co chymotrypsyna, enzymy te nie wykazują ogólnego podobieństwa strukturalnego., f. Chymotrypsyna, trypsyna i elastaza są białkami homologicznymi, ale wykazują odmienną specyficzność substratową z powodu różnic w budowie kieszeni S1 wiążącej substrat
67.
9 Na schemacie przedstawiono wyniki mutagenezy ukierunkowanej pewnej proteazy serynowej. Zaznaczone reszty tworzące triadę katalityczną zastępowano alaniną i mierzono aktywność zmutowanego punktowo enzymu (zielone słupki) wyznaczając wartość log10(kkat). Podobnie zbadano enzym zawierający alaninę we wszystkich trzech pozycjach triady (niebieski słupek). Dla porównania na schemacie przedstawiono wynik pomiaru aktywności dla enzymu niezmutowanego (czerwony słupek) oraz szybkość reakcji niekatalizowanej (czarny słupek). Które z poniższych stwierdzeń dotyczących roli poszczególnych reszt w katalizie uważasz za najbardziej prawdopodobne na podstawie danych uzyskanych w tym eksperymencie? Załóż, że każda z wprowadzonych mutacji zmienia wyłącznie strukturę pierwszorzędową enzymu
c. Mutacja reszty histydylowej na alaninę praktycznie uniemożliwia atak reszty serylowej na wiązanie peptydowe substratu., f. Pewien wkład w katalizę mają także inne mechanizmy niż te związane bezpośrednio z triadą katalityczną.
68.
8 Które z poniższych stwierdzeń dotyczących katalizy enzymatycznej są prawdziwe?
b. Enzymy katalizują reakcje chemiczne poprzez preferencyjne wiązanie stanu przejściowego reakcji w porównaniu z jej substratami i produktami., e. Istotny wkład w katalizę enzymatyczną ma przybliżanie oraz odpowiednie wzajemne orientowanie substratów reakcji wielosubstratowych., . Kataliza elektrostatyczna polega na ułatwieniu powstania lub stabilizacji stanu przejściowego za pomocą naładowanych grup enzymu lub za pomocą kofaktorów.
69.
7 Które z poniższych stwierdzeń dotyczących mechanizmu reakcji katalizowanej przez enzym restrykcyjny EcoRV są prawdziwe?
d. Eksperymentalnie wykazano, że reakcja hydrolizy wiązania fosfodiestrowego zachodzi z odwróceniem konfiguracji stereochemicznej na atomie fosforu., e. Prawdziwość udziału w tej reakcji nukleofila (Nu) można zweryfikować za pomocą analizy stereochemicznej produktów hydrolizy chiralnych, tiofosforanowych pochodnych DNA, które zamiast jednego atomu tlenu w wiązaniu fosfodiestrowym zawierają atom siarki.
70.
6 Które z poniższych stwierdzeń dotyczących anhydraz węglanowych są prawdziwe?
a. Wszystkie znane anhydrazy węglanowe wykorzystują jon Zn2+ jako … , c. Anhydrazy węglanowe są metaloenzymami, których …., d. Niektóre anhydrazy węglanowe mają bardzo wysoką liczbę obrotów rzędu 10^6., e. Jon metalu ludzkiej anhydrazy węglanowej z … histydylowe oraz w zależności od pH jedną cząsteczkę wody …
71.
5 Które z poniższych stwierdzeń dotyczących mechanizmu reakcji katalizowanej przez ludzką anhydrazę węglanową II są prawdziwe?
b. Rola jonu cynku polega na obniżeniu pKa z wartości >15 dla samej wody do wartości rzędu 7 dla kompleksu [His3Zn2+]H2O., d. Rola jonu cynku polega m.in. na zwiększeniu kwasowego charakteru aktywnej reszty aminokwasowej, obecnej w centrum katalitycznym enzymu., h. Kataliza wymaga aktywacji cząsteczki wody przez jon Zn2+.