biomolo kolo 2moje

Inhibitorem reakcji poliadenylacji jest 2’,5’-dideoksyadenozyna.

Inhibitorem reakcji poliadenylacji jest 3’-deoksyadenozyna.

Donorem reszt A jest 5’-trifosforan deoksyryboadenozyny

Pierwotne transkrypty eukariontów są rozcinane przez specyficzną nukleazę kompleksu rozpoznającego sekwencję AAUAAA.

Długość życia mRNA zależy od szybkości syntezy ogona poli(A).

mRNA pozbawiony ogona poli(A) może nie ulegać wydajnej transkrypcji.

Inhibitorem reakcji poliadenylacji jest koordynacja

mRNA pozbawiony ogona poli(A) może nie ulegać wydajnej translacji.

Długość życia mRNA zależy w pewnym stopniu od szybkości degradacji ogona poli(A)

Za syntezę ogona poli(A) odpowiedzialna jest polimeraza poli(A

Za syntezę ogona poli(A) odpowiedzialna jest polimeraza poli(A), która czerpie instrukcję z nici matrycowej DNA.

Poliadenylacja zwiększa stabilność cząsteczki mRNA.

Ogon poli(A) jest produktem reakcji katalizowanej przez polimerazę RNA II

Większość eukariotycznych mRNA ma na końcu 3’ ogon zbudowany z 5'-monofosforanów deoksyryboadenozyny.

Inhibitorem reakcji poliadenylacji jest 3’-deoksyadenozyna.

Pierwotne transkrypty eukariontów są rozcinane przez specyficzną nukleazę kompleksu rozpoznającego sekwencję AAUAAA.

mRNA pozbawiony ogona poli(A) może nie ulegać wydajnej translacji.

Długość życia mRNA zależy w pewnym stopniu od szybkości degradacji ogona poli(A)

Za syntezę ogona poli(A) odpowiedzialna jest polimeraza poli(A

Poliadenylacja zwiększa stabilność cząsteczki mRNA.

potrzebne ATP

wszystkie syntetazy rozpoznaja tRNA oddzialywujac z petla antykodonu

reakcja katalizowana I etepowa

produkt przejściowy którego gr karboksylowa tworzy wiazanie bezwodnikowe z ortofosforanem

estry aminokwasow syntetyzowane na koncu 3 tRNA

większość syntetazy ma walsciwosci korekcyjne

potrzebne ATP

większość syntetazy ma walsciwosci korekcyjne

IF1 i IF3 dostarczaja aminoacylo-tRNA do rybosomu

tRNA komplementarny do dużego segmentu

aminoacylo-tRNA wiaze się do miejsca P

IF2 oddzialywuje z podjednostka duza

IF2 zdolny do hydrolizy GTP dzieki czemu dostarcza energii do translacji

aminoacylo-tRNA wiaze się do miejsca P

IF2 zdolny do hydrolizy GTP dzieki czemu dostarcza energii do translacji

aminokwasy dodawane do N-konca

aminokwasy aktywowane przez przyłączenia do tRNA

wiązanie peptydowe aminoacylo-tRNA miejsce A a reszta peptydylowa miejsca P

rozpoczęcie na kodonie przez specyficzne pre tRNA i kodonu

aminokwasy aktywowane przez przyłączenia do tRNA

wiązanie peptydowe aminoacylo-tRNA miejsce A a reszta peptydylowa miejsca P

rozpoczęcie na kodonie przez specyficzne pre tRNA i kodonu

CCA na koncu 3’

antykodon i miejsce wiazania aminokwasu na przeciwległym koncu

zawiara ACC gdzie przyłączone aminokwasy

duza czesc jest sparowana

wiele zmodyfikowanych nukleotydow

zbudowany z heliakalnych końców tworzących litre U

zawiera od 70-90 nukleotydow

CCA na koncu 3’

antykodon i miejsce wiazania aminokwasu na przeciwległym koncu

duza czesc jest sparowana

wiele zmodyfikowanych nukleotydow

zawiera od 70-90 nukleotydow

wiaze się specyficznie z DNA w obecności arabinozy

wiaze araO2 aktywuje geny struktury

w obecności cAMP-CAP aktywuje transkrypcję genów struktury przez przyłączenie arabinozy i związanie do araO1 i araI

powoduje wypetlenie gdy zwiaze się z araO2 i araI

wiaze z araO1 hamujac transkrypcje genu

wiaze się specyficznie z DNA w obecności arabinozy

powoduje wypetlenie gdy zwiaze się z araO2 i araI

wiaze z araO1 hamujac transkrypcje genu

Puromycyna powoduje przedwczesną terminację łańcucha działając jako analog aminoacyloTrna

nergia potrzebna do utworzenia wiązań peptydowych ……. peptydylotransferazę

hydroliza GTP przez czynnik elongacyjny EF-Tu umożliwia… uwolnienie

Puromycyna powoduje przedwczesną terminację łańcucha działając jako analog aminoacyloTrna

hydroliza GTP przez czynnik elongacyjny EF-Tu umożliwia… uwolnienie

DNA jest otoczony przez histony

Element wchodzący w sklad chromosomow

nulkeosomy scisle upakowane

upakowane DNA

rdzen 140 pz

rdzen ma 4 rodzaje histonow

Element wchodzący w sklad chromosomow

upakowane DNA

rdzen ma 4 rodzaje histonow

wiazanie estrowe w aminoacylotRNA tworzone jest miedzy grupa karboksylowa aminokwasu a gr fosforanowa tRNA

aminokwas polaczony z tRNA odgrywa istotna role w rozpoznaniu

wszystkie syntetazy aminoacylotRNA rozpoznaja właściwy tRNa rozpoznając

dla każdego aminokwasu istnieje inny enzym katalizujący tworzenie odpowiedniego

niektóre syntetay aminoacylo-tRNA posiadają aktywność korekcyjna……….. niewłaściwym tRNA

rodzaj aminokwasu przylaczanego do tRNA zalezy od rodzaju syntetazy……….. jest substratem

dla każdego aminokwasu istnieje inny enzym katalizujący tworzenie odpowiedniego

niektóre syntetay aminoacylo-tRNA posiadają aktywność korekcyjna……….. niewłaściwym tRNA

rodzaj aminokwasu przylaczanego do tRNA zalezy od rodzaju syntetazy……….. jest substratem

zawiera kodon

może posiadac rozna ilość licznych roznych sekwencji

może być polaczony z aminokwasem wiazaniem estrowym,

czy przy tworzeniu aminoacylo-tRNA, powstaje produkt pośredni aminoacyloAMP

czy na końcu 3` jest sekwencja ACC

zawiera antykodon

sluzy jako polaczenie miedzy mRNA a pojedynczym aminokwasem

aktywacja aminokwasu zachodzi poprzez przyłączenie do tRNA

oddzialywuje z mRNA na drodze translacji,

może posiadac rozna ilość licznych roznych sekwencji

może być polaczony z aminokwasem wiazaniem estrowym,

czy przy tworzeniu aminoacylo-tRNA, powstaje produkt pośredni aminoacyloAMP

zawiera antykodon

sluzy jako polaczenie miedzy mRNA a pojedynczym aminokwasem

aktywacja aminokwasu zachodzi poprzez przyłączenie do tRNA

oddzialywuje z mRNA na drodze translacji,

u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki

typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA

heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy (...) niektórych genów E.coli (

sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA zależy jak interpretowac zasadniczy

za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka sigma polimerazy RNA

u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki

typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA

heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy (...) niektórych genów E.coli (

sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA zależy jak interpretowac zasadniczy

za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka sigma polimerazy RNA

dla wkiekszosci genow zawiera rozne zgodne sekwencje

sa aktywne kiedy G lub C sa zamienione w ich -10 rejon w czasie mutacji

te które maja sekwencje prawie zgodne z sekwencjami zgodnymi i sa separowane przez 17 par zasad sa bardzo wydajne

maja identyczne i określone sekwencje

mogą wykazywac rozna wydajność transkrypcji

okresla strone startu dla transkrypcji na matrycy DNA

dla wkiekszosci genow zawiera rozne zgodne sekwencje

te które maja sekwencje prawie zgodne z sekwencjami zgodnymi i sa separowane przez 17 par zasad sa bardzo wydajne

mogą wykazywac rozna wydajność transkrypcji

okresla strone startu dla transkrypcji na matrycy DNA

czasteczka elongacyjna Ts wiaze GTP,podlega hydrolizacji EF-Ts do GDP

peptydylo-tRNA może zajmowac miejsce P lub A zalezne od tego, w którym cyklu komorkowym się znajduje

1 kodon AUG od konca 5’ transkryptu hydrolizującego ATP

fMet-tRNA zajmuje miejsce P(jako jedyne)

czasteczka elongacyjna Tu oddzialuje ze wszystkimi czasteczkami aminiacetyl-tRNA oprocz fMet-RNAf

peptydylo-tRNA może zajmowac miejsce P lub A zalezne od tego, w którym cyklu komorkowym się znajduje

fMet-tRNA zajmuje miejsce P(jako jedyne)

czasteczka elongacyjna Tu oddzialuje ze wszystkimi czasteczkami aminiacetyl-tRNA oprocz fMet-RNAf

aza elongacji podczas transkrypcji jest przeprowadzana przez rdzen polimerazy

rRNA(tzw.odwrotny RNA, ) jest syntetyzowany w kierunku odwrotnym do typowego 5’---3’ stąd jego nazwa

produktem może być policistronowy mRNA

polimeraza RNA wykazuje aktywność egzonukleazowa, która umozliwia jej korekcję błędów

Pre-mRNA podlega procesowi składania(slipingu) jeszcze zanim zajdzie translacja

aza elongacji podczas transkrypcji jest przeprowadzana przez rdzen polimerazy

produktem może być policistronowy mRNA

regulacja tworzenia się kompleksu inicjującego translację

selektywne skladanie aktywnych kompleksów transkrypcyjnych na ….

alternatywny splicing pre-mRNA dzięki któremu powstają różne cząsteczki transkryptu

glikozylacja i fosforylacja polipeptydów, aby mogły się stać funkcjonalnymi białkami

selektywna degradacja cząsteczek mRNA

ozluźnienie struktury spakowanego DNA poprzez modyfikacje białek histonowych

regulacja tworzenia się kompleksu inicjującego translację

selektywne skladanie aktywnych kompleksów transkrypcyjnych na ….

alternatywny splicing pre-mRNA dzięki któremu powstają różne cząsteczki transkryptu

selektywna degradacja cząsteczek mRNA

ozluźnienie struktury spakowanego DNA poprzez modyfikacje białek histonowych

większość genów eukaryota znajduje się pod kontrolą jednego aktywatora i jednego represora

aktywatory i represory działają poprzez zmiane szybkości tworzenia się kompleksu transkrypcyjnego

w wielu białkach kontrolujących ekspresję genów, wiążących się specyficznie do….. „palca cynkowego”

zaktywowane związanym hormonem receptory wiążą się ze specyficznymi sekwencjami…….”… elementami odpowiedzi na hormon”

rejony chromosomów, w których aktywnie zachodzi transkrypcja nazywamy „pufami” …szczególnie zwarta strukturą DNA

geny w obrębie upakowanej chromatyny sa aktywne

aktywatory i represory działają poprzez zmiane szybkości tworzenia się kompleksu transkrypcyjnego

Miejsce splicingowe 5’ jest ustawione w odpowiedniej pozycji dzięki parowaniu się zasad rejonu bogatego w pirymidyny, występującego w eksonie poprzedzającym intron i sekwencji przewodnika bogatej w puryny, która występuje w intronie

Do splicingu tego pre-rRNA wymagany jest kofaktor albo nukleotyd adeniniwy: ATP, ADP lub AMP, albo adenina.

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązanie fosfodiestrowe z końcem 3’ eksonu.

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązania fosfodiestrowe z końcem 3’ egzonu.

Pre-rRNA zawiera specjalną „kieszeń” wiążącą kofaktor

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązanie fosfodiestrowe z końcem 3’ intronu.

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązanie fosfodiestrowe z końcem 5’ intronu

Do splicingu tego pre-rRNA wymagany jest kofaktor - albo nukleotyd guaninowy: GTP, GDP lub GMP, albo guanina

Grupa 3’-OH eksonu 1 atakuje miejsce splicingowe 3’

Miejsce splicingowe 3’ jest ustawione w odpowiedniej pozycji dzięki parowaniu się zasad rejonu bogatego w puryny, występującego w eksonie poprzedzającym intron i sekwencji przewodnika bogatej w pirymidyny, która występuje w intronie

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązanie fosfodiestrowe z koncem 5’ intronu.

Do splicingu tego pre-rRNA wymagany jest kofaktor – albo nukleotyd guaninowy: GTP, GDP lub GMP albo guanozyna.

Kofaktor tworzy wiązania kowalencyjne ze specyficzną sekwencją eksonu 2 w pre-rRNA

Miejsce splicingowe 5’ jest ustawione w odpowiedniej pozycji dzięki parowaniu się zasad rejonu bogatego w pirymidyny, występującego w eksonie poprzedzającym intron i sekwencji przewodnika bogatej w puryny, która występuje w intronie

Pre-rRNA zawiera specjalną „kieszeń” wiążącą kofaktor

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązanie fosfodiestrowe z końcem 5’ intronu

Grupa 3’-OH eksonu 1 atakuje miejsce splicingowe 3’

Związanie TBP wywołuje w DNA duże zmiany konformacyjne prowadzące m.in. do poszerzania małego rowka DNA

Białko TBP jest składnikiem czynnika transkrypcyjnego TFIID, który rozpoczyna proces inicjacji transkrypcji

Związanie TBP wywołuje w DNA duże zmiany konformacyjne prowadzące m.in. do poszerzania małego rowka DNA

Białko TBP jest składnikiem czynnika transkrypcyjnego TFIID, który rozpoczyna proces inicjacji transkrypcji

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza białka σ32

Przejście od kompleksu promotorowego zamkniętego do kompleksu promotorowego otwartego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji.

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza białka σ54

Rdzeń polimerazy RNA silnie wiąże się z matrycą DNA bez względu na jej sekwencję

Rdzeń polimerazy RNA słabo wiąże się do matrycy DNA

Podjednostka σ oddysocjowuje od holoenzymu na wczesnym etapie elongacji transkryptu

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza białka σ70

Przejście od kompleksu promotorowego otwartego do kompleksu promotorowego zamkniętego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji

Dodatnie superskręcenie kolistego DNA wspomaga transkrypcję wielu genów

Podjednostka σ nadaje rdzeniowi enzymu zdolność inicjacji transkrypcji w miejscach promotorowych

Podjednostka σ oddysocjowuje od holoenzymu pod koniec elongacji transkryptu

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza σ54

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza σ32

Po oddysocjowaniu od holoenzymu zmieniona strukturalnie podjednostka σ nie może ponownie uczestniczyć w inicjacji transkrypcji.

Przejście od kompleksu promotorowego zamkniętego do kompleksu promotorowego otwartego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji.

Rdzeń polimerazy RNA silnie wiąże się z matrycą DNA bez względu na jej sekwencję

Podjednostka σ oddysocjowuje od holoenzymu na wczesnym etapie elongacji transkryptu

Podjednostka σ nadaje rdzeniowi enzymu zdolność inicjacji transkrypcji w miejscach promotorowych

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza σ54

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza σ32

podjednostka σ

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza białka σ70

w przybliżeniu 12 bp helisy DNA-RNA

dpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza σ32

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza białka σ32

Dodatnie superskręcenie kolistego DNA wspomaga transkrypcję wielu genów

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza σ54

Przejście od kompleksu promotorowego zamkniętego do kompleksu promotorowego otwartego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji.

w przybliżeniu 17 nukleozydow nici kodującej DNA w formie pojedynczej

w przybliżeniu 12 nukleozydow konce 5 lini wydłużającej się RNA

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza białka σ54

dpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza σ32

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza σ54

Przejście od kompleksu promotorowego zamkniętego do kompleksu promotorowego otwartego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji.

w przybliżeniu 17 nukleozydow nici kodującej DNA w formie pojedynczej