biomolo kolo 2moje

Pierwotne transkrypty eukariontów są rozcinane przez specyficzną nukleazę kompleksu rozpoznającego sekwencję AAUAAA.

mRNA pozbawiony ogona poli(A) może nie ulegać wydajnej translacji.

Inhibitorem reakcji poliadenylacji jest 2’,5’-dideoksyadenozyna.

Ogon poli(A) jest produktem reakcji katalizowanej przez polimerazę RNA II

Poliadenylacja zwiększa stabilność cząsteczki mRNA.

Długość życia mRNA zależy od szybkości syntezy ogona poli(A).

Za syntezę ogona poli(A) odpowiedzialna jest polimeraza poli(A

Inhibitorem reakcji poliadenylacji jest koordynacja

Za syntezę ogona poli(A) odpowiedzialna jest polimeraza poli(A), która czerpie instrukcję z nici matrycowej DNA.

Długość życia mRNA zależy w pewnym stopniu od szybkości degradacji ogona poli(A)

mRNA pozbawiony ogona poli(A) może nie ulegać wydajnej transkrypcji.

Większość eukariotycznych mRNA ma na końcu 3’ ogon zbudowany z 5'-monofosforanów deoksyryboadenozyny.

Inhibitorem reakcji poliadenylacji jest 3’-deoksyadenozyna.

Donorem reszt A jest 5’-trifosforan deoksyryboadenozyny

Pierwotne transkrypty eukariontów są rozcinane przez specyficzną nukleazę kompleksu rozpoznającego sekwencję AAUAAA.

mRNA pozbawiony ogona poli(A) może nie ulegać wydajnej translacji.

Poliadenylacja zwiększa stabilność cząsteczki mRNA.

Za syntezę ogona poli(A) odpowiedzialna jest polimeraza poli(A

Długość życia mRNA zależy w pewnym stopniu od szybkości degradacji ogona poli(A)

Inhibitorem reakcji poliadenylacji jest 3’-deoksyadenozyna.

produkt przejściowy którego gr karboksylowa tworzy wiazanie bezwodnikowe z ortofosforanem

reakcja katalizowana I etepowa

wszystkie syntetazy rozpoznaja tRNA oddzialywujac z petla antykodonu

większość syntetazy ma walsciwosci korekcyjne

estry aminokwasow syntetyzowane na koncu 3 tRNA

potrzebne ATP

większość syntetazy ma walsciwosci korekcyjne

potrzebne ATP

IF2 oddzialywuje z podjednostka duza

aminoacylo-tRNA wiaze się do miejsca P

IF2 zdolny do hydrolizy GTP dzieki czemu dostarcza energii do translacji

tRNA komplementarny do dużego segmentu

IF1 i IF3 dostarczaja aminoacylo-tRNA do rybosomu

aminoacylo-tRNA wiaze się do miejsca P

IF2 zdolny do hydrolizy GTP dzieki czemu dostarcza energii do translacji

aminokwasy dodawane do N-konca

rozpoczęcie na kodonie przez specyficzne pre tRNA i kodonu

wiązanie peptydowe aminoacylo-tRNA miejsce A a reszta peptydylowa miejsca P

aminokwasy aktywowane przez przyłączenia do tRNA

rozpoczęcie na kodonie przez specyficzne pre tRNA i kodonu

wiązanie peptydowe aminoacylo-tRNA miejsce A a reszta peptydylowa miejsca P

aminokwasy aktywowane przez przyłączenia do tRNA

antykodon i miejsce wiazania aminokwasu na przeciwległym koncu

zbudowany z heliakalnych końców tworzących litre U

wiele zmodyfikowanych nukleotydow

zawiera od 70-90 nukleotydow

duza czesc jest sparowana

zawiara ACC gdzie przyłączone aminokwasy

CCA na koncu 3’

antykodon i miejsce wiazania aminokwasu na przeciwległym koncu

wiele zmodyfikowanych nukleotydow

zawiera od 70-90 nukleotydow

duza czesc jest sparowana

CCA na koncu 3’

powoduje wypetlenie gdy zwiaze się z araO2 i araI

w obecności cAMP-CAP aktywuje transkrypcję genów struktury przez przyłączenie arabinozy i związanie do araO1 i araI

wiaze z araO1 hamujac transkrypcje genu

wiaze się specyficznie z DNA w obecności arabinozy

wiaze araO2 aktywuje geny struktury

powoduje wypetlenie gdy zwiaze się z araO2 i araI

wiaze z araO1 hamujac transkrypcje genu

wiaze się specyficznie z DNA w obecności arabinozy

nergia potrzebna do utworzenia wiązań peptydowych ……. peptydylotransferazę

hydroliza GTP przez czynnik elongacyjny EF-Tu umożliwia… uwolnienie

Puromycyna powoduje przedwczesną terminację łańcucha działając jako analog aminoacyloTrna

hydroliza GTP przez czynnik elongacyjny EF-Tu umożliwia… uwolnienie

Puromycyna powoduje przedwczesną terminację łańcucha działając jako analog aminoacyloTrna

Element wchodzący w sklad chromosomow

DNA jest otoczony przez histony

rdzen ma 4 rodzaje histonow

rdzen 140 pz

nulkeosomy scisle upakowane

upakowane DNA

Element wchodzący w sklad chromosomow

rdzen ma 4 rodzaje histonow

upakowane DNA

dla każdego aminokwasu istnieje inny enzym katalizujący tworzenie odpowiedniego

wszystkie syntetazy aminoacylotRNA rozpoznaja właściwy tRNa rozpoznając

wiazanie estrowe w aminoacylotRNA tworzone jest miedzy grupa karboksylowa aminokwasu a gr fosforanowa tRNA

rodzaj aminokwasu przylaczanego do tRNA zalezy od rodzaju syntetazy……….. jest substratem

aminokwas polaczony z tRNA odgrywa istotna role w rozpoznaniu

niektóre syntetay aminoacylo-tRNA posiadają aktywność korekcyjna……….. niewłaściwym tRNA

dla każdego aminokwasu istnieje inny enzym katalizujący tworzenie odpowiedniego

rodzaj aminokwasu przylaczanego do tRNA zalezy od rodzaju syntetazy……….. jest substratem

niektóre syntetay aminoacylo-tRNA posiadają aktywność korekcyjna……….. niewłaściwym tRNA

aktywacja aminokwasu zachodzi poprzez przyłączenie do tRNA

zawiera antykodon

zawiera kodon

czy przy tworzeniu aminoacylo-tRNA, powstaje produkt pośredni aminoacyloAMP

sluzy jako polaczenie miedzy mRNA a pojedynczym aminokwasem

czy na końcu 3` jest sekwencja ACC

oddzialywuje z mRNA na drodze translacji,

może być polaczony z aminokwasem wiazaniem estrowym,

może posiadac rozna ilość licznych roznych sekwencji

aktywacja aminokwasu zachodzi poprzez przyłączenie do tRNA

zawiera antykodon

czy przy tworzeniu aminoacylo-tRNA, powstaje produkt pośredni aminoacyloAMP

sluzy jako polaczenie miedzy mRNA a pojedynczym aminokwasem

oddzialywuje z mRNA na drodze translacji,

może być polaczony z aminokwasem wiazaniem estrowym,

może posiadac rozna ilość licznych roznych sekwencji

u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki

typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA

promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA zależy jak interpretowac zasadniczy

sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka sigma polimerazy RNA

heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy (...) niektórych genów E.coli (

u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki

typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA

promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA zależy jak interpretowac zasadniczy

sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka sigma polimerazy RNA

heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy (...) niektórych genów E.coli (

te które maja sekwencje prawie zgodne z sekwencjami zgodnymi i sa separowane przez 17 par zasad sa bardzo wydajne

dla wkiekszosci genow zawiera rozne zgodne sekwencje

okresla strone startu dla transkrypcji na matrycy DNA

maja identyczne i określone sekwencje

mogą wykazywac rozna wydajność transkrypcji

sa aktywne kiedy G lub C sa zamienione w ich -10 rejon w czasie mutacji

te które maja sekwencje prawie zgodne z sekwencjami zgodnymi i sa separowane przez 17 par zasad sa bardzo wydajne

dla wkiekszosci genow zawiera rozne zgodne sekwencje

okresla strone startu dla transkrypcji na matrycy DNA

mogą wykazywac rozna wydajność transkrypcji

czasteczka elongacyjna Tu oddzialuje ze wszystkimi czasteczkami aminiacetyl-tRNA oprocz fMet-RNAf

peptydylo-tRNA może zajmowac miejsce P lub A zalezne od tego, w którym cyklu komorkowym się znajduje

1 kodon AUG od konca 5’ transkryptu hydrolizującego ATP

fMet-tRNA zajmuje miejsce P(jako jedyne)

czasteczka elongacyjna Ts wiaze GTP,podlega hydrolizacji EF-Ts do GDP

czasteczka elongacyjna Tu oddzialuje ze wszystkimi czasteczkami aminiacetyl-tRNA oprocz fMet-RNAf

peptydylo-tRNA może zajmowac miejsce P lub A zalezne od tego, w którym cyklu komorkowym się znajduje

fMet-tRNA zajmuje miejsce P(jako jedyne)

aza elongacji podczas transkrypcji jest przeprowadzana przez rdzen polimerazy

polimeraza RNA wykazuje aktywność egzonukleazowa, która umozliwia jej korekcję błędów

Pre-mRNA podlega procesowi składania(slipingu) jeszcze zanim zajdzie translacja

produktem może być policistronowy mRNA

rRNA(tzw.odwrotny RNA, ) jest syntetyzowany w kierunku odwrotnym do typowego 5’---3’ stąd jego nazwa

aza elongacji podczas transkrypcji jest przeprowadzana przez rdzen polimerazy

produktem może być policistronowy mRNA

alternatywny splicing pre-mRNA dzięki któremu powstają różne cząsteczki transkryptu

selektywne skladanie aktywnych kompleksów transkrypcyjnych na ….

selektywna degradacja cząsteczek mRNA

glikozylacja i fosforylacja polipeptydów, aby mogły się stać funkcjonalnymi białkami

ozluźnienie struktury spakowanego DNA poprzez modyfikacje białek histonowych

regulacja tworzenia się kompleksu inicjującego translację

alternatywny splicing pre-mRNA dzięki któremu powstają różne cząsteczki transkryptu

selektywne skladanie aktywnych kompleksów transkrypcyjnych na ….

selektywna degradacja cząsteczek mRNA

ozluźnienie struktury spakowanego DNA poprzez modyfikacje białek histonowych

regulacja tworzenia się kompleksu inicjującego translację

większość genów eukaryota znajduje się pod kontrolą jednego aktywatora i jednego represora

zaktywowane związanym hormonem receptory wiążą się ze specyficznymi sekwencjami…….”… elementami odpowiedzi na hormon”

aktywatory i represory działają poprzez zmiane szybkości tworzenia się kompleksu transkrypcyjnego

rejony chromosomów, w których aktywnie zachodzi transkrypcja nazywamy „pufami” …szczególnie zwarta strukturą DNA

geny w obrębie upakowanej chromatyny sa aktywne

w wielu białkach kontrolujących ekspresję genów, wiążących się specyficznie do….. „palca cynkowego”

aktywatory i represory działają poprzez zmiane szybkości tworzenia się kompleksu transkrypcyjnego

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązanie fosfodiestrowe z końcem 5’ intronu

Do splicingu tego pre-rRNA wymagany jest kofaktor – albo nukleotyd guaninowy: GTP, GDP lub GMP albo guanozyna.

Do splicingu tego pre-rRNA wymagany jest kofaktor - albo nukleotyd guaninowy: GTP, GDP lub GMP, albo guanina

Kofaktor tworzy wiązania kowalencyjne ze specyficzną sekwencją eksonu 2 w pre-rRNA

Do splicingu tego pre-rRNA wymagany jest kofaktor albo nukleotyd adeniniwy: ATP, ADP lub AMP, albo adenina.

Grupa 3’-OH eksonu 1 atakuje miejsce splicingowe 3’

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązanie fosfodiestrowe z końcem 3’ intronu.

Miejsce splicingowe 3’ jest ustawione w odpowiedniej pozycji dzięki parowaniu się zasad rejonu bogatego w puryny, występującego w eksonie poprzedzającym intron i sekwencji przewodnika bogatej w pirymidyny, która występuje w intronie

Pre-rRNA zawiera specjalną „kieszeń” wiążącą kofaktor

Miejsce splicingowe 5’ jest ustawione w odpowiedniej pozycji dzięki parowaniu się zasad rejonu bogatego w pirymidyny, występującego w eksonie poprzedzającym intron i sekwencji przewodnika bogatej w puryny, która występuje w intronie

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązanie fosfodiestrowe z koncem 5’ intronu.

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązania fosfodiestrowe z końcem 3’ egzonu.

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązanie fosfodiestrowe z końcem 3’ eksonu.

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązanie fosfodiestrowe z końcem 5’ intronu

Grupa 3’-OH eksonu 1 atakuje miejsce splicingowe 3’

Pre-rRNA zawiera specjalną „kieszeń” wiążącą kofaktor

Miejsce splicingowe 5’ jest ustawione w odpowiedniej pozycji dzięki parowaniu się zasad rejonu bogatego w pirymidyny, występującego w eksonie poprzedzającym intron i sekwencji przewodnika bogatej w puryny, która występuje w intronie

Związanie TBP wywołuje w DNA duże zmiany konformacyjne prowadzące m.in. do poszerzania małego rowka DNA

Białko TBP jest składnikiem czynnika transkrypcyjnego TFIID, który rozpoczyna proces inicjacji transkrypcji

Związanie TBP wywołuje w DNA duże zmiany konformacyjne prowadzące m.in. do poszerzania małego rowka DNA

Białko TBP jest składnikiem czynnika transkrypcyjnego TFIID, który rozpoczyna proces inicjacji transkrypcji

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza σ32

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza białka σ32

Dodatnie superskręcenie kolistego DNA wspomaga transkrypcję wielu genów

Podjednostka σ nadaje rdzeniowi enzymu zdolność inicjacji transkrypcji w miejscach promotorowych

Podjednostka σ oddysocjowuje od holoenzymu na wczesnym etapie elongacji transkryptu

Podjednostka σ oddysocjowuje od holoenzymu pod koniec elongacji transkryptu

Przejście od kompleksu promotorowego zamkniętego do kompleksu promotorowego otwartego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji.

Po oddysocjowaniu od holoenzymu zmieniona strukturalnie podjednostka σ nie może ponownie uczestniczyć w inicjacji transkrypcji.

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza białka σ70

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza białka σ54

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza σ54

Przejście od kompleksu promotorowego otwartego do kompleksu promotorowego zamkniętego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji

Rdzeń polimerazy RNA silnie wiąże się z matrycą DNA bez względu na jej sekwencję

Rdzeń polimerazy RNA słabo wiąże się do matrycy DNA

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza σ32

Podjednostka σ nadaje rdzeniowi enzymu zdolność inicjacji transkrypcji w miejscach promotorowych

Podjednostka σ oddysocjowuje od holoenzymu na wczesnym etapie elongacji transkryptu

Przejście od kompleksu promotorowego zamkniętego do kompleksu promotorowego otwartego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji.

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza σ54

Rdzeń polimerazy RNA silnie wiąże się z matrycą DNA bez względu na jej sekwencję

podjednostka σ

w przybliżeniu 17 nukleozydow nici kodującej DNA w formie pojedynczej

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza białka σ70

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza białka σ54

Dodatnie superskręcenie kolistego DNA wspomaga transkrypcję wielu genów

w przybliżeniu 12 bp helisy DNA-RNA

dpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza σ32

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza σ54

w przybliżeniu 12 nukleozydow konce 5 lini wydłużającej się RNA

Przejście od kompleksu promotorowego zamkniętego do kompleksu promotorowego otwartego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji.

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza białka σ32

w przybliżeniu 17 nukleozydow nici kodującej DNA w formie pojedynczej

dpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza σ32

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza σ54

Przejście od kompleksu promotorowego zamkniętego do kompleksu promotorowego otwartego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji.