Inżynieria genetyczna

W analizie Southern (ang. Southern hybridization) fragment sekwencji genu aktyny z drożdży został użyty jako sonda do analizy fragmentów powstałych w wyniku trawienia EcoRI DNA genomowego z D. stramonium. Na autoradiogramie zaobserwowano jedno pasmo odpowiadające cząsteczkom DNA o długości 4 kb. Oznacza to, że:

Rysunek wektora (chyba Shuttle Vector). Co jest charakterystyczne tylko dla drożdży?

Poniżej podany jest schemat wektora. Korzystając z zawartych w schemacie informacji proszę wybrać te z cech/ charakterystyk, które są prawdziwe:

Charakterystyka wektora pBluescript II KS

Które ze zdań dotyczących Nukleazy SI są poprawne?

Który ze zwiazków może być użyty jako substrat do enzymatycznego znakowania izotopem P32 fragmentu DNA o końcach tępych?

Dla elektroforezy NIE jest prawdą

Enzym restrykcyjny ClaI rozpoznaje sekwencje ATˇCGAT i trawi wiązanie fosfodiestrowe pomiędzy resztami T i C. Enzym restrykcyjny TaqI rozpoznaje sekwencje TˇCGA

Może być użyty jako substrat do radioaktywnego znakowania fragmentu DNA przy wykorzystaniu fragmentu Klenowa polimerazy I DNA: NIE MA ECORI

Zakładajac ze polimeraza Taq nie traci aktywności, a substraty PCR nie ulegają rozkładowi, można powiedzieć, że docelowa sekwencja DNA jest powielona po n-cyklach:

Spośród podanych temperatur wybrać która z największym powodzeniem da wydajne otrzymanie produktów PCR przeprowadzając dla startera 5’ GGTAATCGGTTAGGCTCC3’:

Wektor plazmidowy zawiera gen markerowy odpowiadający za odporność na erytromycynę (EryR) i gen markerowy odpowiedzialny za oporność na ampicylinę. Gen AmpR został przecięty enzymem restrykcyjnym a powstały w ten sposób plazmid połączono z fragmentem 1000pz o końcach komplementarnych do wektora. Które z poniższych fenotypów maja komórki transformowane:

Kolista cząsteczka DNA posiada n-miejsc restrykcyjnych EcoRI. Ile fragmentów DNA powstanie po całkowitym jej strawieniu?:

Pewien student zamierzał otrzymać bibliotekę z mutacjami kasetowymi w obrębie centrum aktywnego enzymu XYZ. Gen XYZ dał do wektora pUC18, wstawił go tak, że nie zaburzał ramki odczytu LacZ', czyli gdy dało sie do odpowiedniej komórki (takiej, w której daje sie prowadzić selekcję biało-niebieską) powstaje aktywna B-galaktozydaza. wyciął kasetę, którą chciał zmienić, oddzielił przez elektroforezę od reszty wektora, wziął wektor bez kasety i fosfatazą usunął reszty fosforanowe z 5' końców - żeby nie doszło do samoligacji wektora, po czym dodał syntetyczne oligonukleotydy.

Rysunek z wektorem YAC

Fragmenty / ramiona (o łącznej długości 30kb) WEKTORA ZASTĘPCZEGO z faga . poddawano ligacji z fragmentami DNA majacymi prawidlowe konce lepkie odpowiednie do ramion wektora. Jaki maksymalny rozmiar mogl mieć wsczepiany w ten wektor odcinek (insert):

Nokaut genu mysiego spowoduje, że komórki macierzyste będą / Jednym z etapów doświadczenia, którego celem jest nokaut mysiego genu jest selekcja komórek macierzystych, które są:

Załóżmy, ze w plazmidzie, który jest kolistą cząsteczką , na którą składa się 3200 pz występują sekwencja rozpoznawane prze EcoRI położone w odległości : 400, 700, 1400 i 2600 pz od arbitralnie położonego punktu zerowego . Po całkowitym trawieniu wymienionym enzymem – powstaną produkty:

Pewien haploidalny szczep grzyba Neurospora jest transgeniczny pod wzgledem genu lucyferazy (gen LUX). Gen ten nie wystepuje w szczepie dzikim. Szczep transgeniczny zostal skrzyzowany ze szczepem dzikim a powstale aksospory poddano analizie PCR wykorzystujac startery specyficzne dla genu lucyferazy. Zakladajac, ze PCR przeprowadzono w sposob optymalny mozna przypuszczac ze udzial aksospor dla ktorych zidentyfikowano specyficzny produkt wynosil:

Obserwowane pasma obrazują wszystkie produkty jakie powstały w wyniku trawienia długiego fragmentu, które z poniższych twierdzeń są prawdziwe: