Fiszki
Biologia molekularna - egzamin
Test w formie fiszek
Ilość pytań: 66
Rozwiązywany: 684 razy
Polimeraza DNA I
Wymagana w replikacji
Potrzebuje primera i matrycy
Wymagana w naprawie DNA
Usuwa primer i wypełnia szczeliny podczas replikacji
Wymagana w replikacji
Potrzebuje primera i matrycy
Wymagana w naprawie DNA
Usuwa primer i wypełnia szczeliny podczas replikacji
Polimeraza DNA II
Wymagana w naprawie DNA
Posiada aktywność nukleazową 3-5
Potrzebuje primera z 3OH wolna i matrycy
Wymagana w naprawie DNA
Posiada aktywność nukleazową 3-5
Potrzebuje primera z 3OH wolna i matrycy
Polimeraza DNA III
Potrzebuje primera i matrycy
Posiada aktywność nukleazową 3-5
Wymagana w replikacji
Tworzy najwięcej DNA podczas replikacji
Potrzebuje primera i matrycy
Posiada aktywność nukleazową 3-5
Wymagana w replikacji
Tworzy najwięcej DNA podczas replikacji
Podjednostki polimerazy RNA :
σ odszukuje miejsca promotorowe, pomaga zainicjować syntezę i oddysocjowuje od enzymu
α wiąże bialko regulatorowe
β wiąże matrycę DNA
β wiąże trifosforanów rybonukleotydów
σ odszukuje miejsca promotorowe, pomaga zainicjować syntezę i oddysocjowuje od enzymu
α wiąże bialko regulatorowe
β wiąże matrycę DNA
β wiąże trifosforanów rybonukleotydów
Miejsca promotorowe E.coli
określa stronę startu dla transkrypcji na matrycy DNA
dla większości genów zawierają rożne zgodne sekwencje
mają identyczne i określone sekwencje
te które mają sekwencje prawie zgodne z sekwencjami zgodnymi i są separowane przez 17 par zasad są bardzo wydajne
mogą wykazywać różną wydajność transkrypcji
są aktywne kiedy G lub C są zamienione w ich -10 rejon w czasie mutacji
określa stronę startu dla transkrypcji na matrycy DNA
dla większości genów zawierają rożne zgodne sekwencje
te które mają sekwencje prawie zgodne z sekwencjami zgodnymi i są separowane przez 17 par zasad są bardzo wydajne
mogą wykazywać różną wydajność transkrypcji
Bąbel transkrypcyjny
część polimeryzacji enzymu
w przybliżeniu 12 bp helisy DNA-RNA
podjednostka σ
w przybliżeniu 17 nukleozydów nici kodującej DNA w formie pojedynczej
w przybliżeniu 12 nukleozydów końce 5’ linii wydłużającej się RNA
część polimeryzacji enzymu
w przybliżeniu 12 bp helisy DNA-RNA
w przybliżeniu 17 nukleozydów nici kodującej DNA w formie pojedynczej
Polimeraza RNA I
Syntezuje RNA w kierunku 5’→3’
Jest zbudowana z kilku podjednostek
Jest zlokalizowana w jąderku
Tworzy prekursory 18s, 5,8s, 28s rRNA
Syntezuje RNA w kierunku 5’→3’
Jest zbudowana z kilku podjednostek
Jest zlokalizowana w jąderku
Tworzy prekursory 18s, 5,8s, 28s rRNA
Polimeraza RNA II
Syntezuje RNA w kierunku 5’→3’
Silnie inhibitowany przez amanitynę
Tworzy prekursorowy mRNA
Jest zbudowana z kilku podjednostek
Ma podjednostkę z powtarzalną sekwencją aminokwasów regulowaną w fosforylacji
Jest zlokalizowana w nukleoplazmie
Syntezuje RNA w kierunku 5’→3’
Silnie inhibitowany przez amanitynę
Tworzy prekursorowy mRNA
Jest zbudowana z kilku podjednostek
Ma podjednostkę z powtarzalną sekwencją aminokwasów regulowaną w fosforylacji
Jest zlokalizowana w nukleoplazmie
Polimeraza RNA III
Tworzy prekursorowy tRNA
Syntezuje RNA w kierunku 5’→3’
Jest zlokalizowana w nukleoplazmie
Tworzy 5s rRNA
Jest zbudowana z kilku podjednostek
Tworzy prekursorowy tRNA
Syntezuje RNA w kierunku 5’→3’
Jest zlokalizowana w nukleoplazmie
Tworzy 5s rRNA
Jest zbudowana z kilku podjednostek
I grupa splicingowa
Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań
Wymaga nukleozyd guanozowy albo nukleotyd
Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań
Wymaga nukleozyd guanozowy albo nukleotyd
II grupa splicingowa
Spliceosom jest wymagany
Wymagane wiązanie 2’-5’ fosfodiestrowe
Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań
Produkt pośredni o kształcie lassa
Spliceosom jest wymagany
Wymagane wiązanie 2’-5’ fosfodiestrowe
Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań
Produkt pośredni o kształcie lassa
Splicing mRNA
Produkt pośredni o kształcie lassa
Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań
Wymagane wiązanie 2’-5’ fosfodiestrowe
snRNPs są wymagane
Spliceosom jest wymagany
Produkt pośredni o kształcie lassa
Reakcje transestryfikacji zrywania i tworzenia wiązań
Wymagane wiązanie 2’-5’ fosfodiestrowe
snRNPs są wymagane
Spliceosom jest wymagany
Splicing eukariotyczny tRNA
Aktywności ligazy i nukleazy są potrzebne
Aktywności ligazy i nukleazy są potrzebne
Splicing Tetrahymena thermophila
potrzebny kofaktor GTP, GDP
kofaktor atakuje miejsce 5’ i traci PPi z konca 5’
nie potrzeba ATP
kofaktor atakuje miejsce 3’
kieszeń (zawiera cząsteczki prekursorowego RNA)
potrzebny kofaktor GTP, GDP
kofaktor atakuje miejsce 5’ i traci PPi z konca 5’
nie potrzeba ATP
kieszeń (zawiera cząsteczki prekursorowego RNA)
Kompleks cAMP-CAP
represor transkrypcji
w operonie ora wpływa na geny struktury
w obecności arabinozy wpływa na geny struktury
chroni miejsca -48 do -5
po jego związaniu do atenuatora trp może być transkrypcja genów struktury
chroni przez DNAza -87 do -47
w operonie ora wpływa na geny struktury
w obecności arabinozy wpływa na geny struktury
chroni przez DNAza -87 do -47
Bialko C operonu ara
w obecności cAMP-CAP geny struktury operonu i związanie arabinozowego do araO1 i araI
wiąże z araO1 hamując transkrypcję genu
powoduje wypętlenie, gdy zwiąże się z araO2 i araI
wiąże się specyficznie z DNA w obecności arabinozy
wiąże araO2 aktywując geny struktury
w obecności cAMP-CAP geny struktury operonu i związanie arabinozowego do araO1 i araI
wiąże z araO1 hamując transkrypcję genu
powoduje wypętlenie, gdy zwiąże się z araO2 i araI
Bakteriofag λ
gdy nic nie atakuje, zmienia to w fazie lizogenicznej jest on obecny z uwagi na represor, który ulega autoregulacji
białko cro wiąże się do or3 i wtedy hamuje represor (gen c1)
zostaje uwolnione z chromosomu bakteryjnego z kompleksu rexDNA
syntetyzuje tylko represor λ w bakterii lizogenicznych
białko cro związane z or1 to hamuje syntezę represora
profag (DNA) jest także lizogenicznej, gdy nie aktywuje zmiany bo represor λ …
ssDNA = recA oddziałuje z nim także represor λ
gdy nic nie atakuje, zmienia to w fazie lizogenicznej jest on obecny z uwagi na represor, który ulega autoregulacji
białko cro wiąże się do or3 i wtedy hamuje represor (gen c1)
zostaje uwolnione z chromosomu bakteryjnego z kompleksu rexDNA
syntetyzuje tylko represor λ w bakterii lizogenicznych
profag (DNA) jest także lizogenicznej, gdy nie aktywuje zmiany bo represor λ …
ssDNA = recA oddziałuje z nim także represor λ
Operon arabinozowy
w obecności cAMP-CAP i arabinozy nie da się zapętlić
może syntezować arabinozę przy wykorzystaniu białek powstałych z białek struktury
cAMP-CAP i arabiznoza może przeprowadzać transkrypcje genów struktury, nieznacznie obniżają szybkość
konstutywna synteza białka C
w obecności cAMP-CAP i arabinozy nie da się zapętlić
konstutywna synteza białka C
może syntezować arabinozę przy wykorzystaniu białek powstałych z białek struktury
krótki transkrypt liderowy kończy sekwencja poli(U)
transkrypcja operonu trp kontrolowana atenuatorem
rybosom zatrzymuje tak, że transkrypcja poniżej atenuatora
koduje krotki peptyd testowy z 2 resztami trp
reszty trp obecne obok siebie
w obrębie genu trpD
niedobór trp bo brak tryptofanylo-tRNA rybosom zatrzymuje na kodujących trp
krótki transkrypt liderowy kończy sekwencja poli(U)
transkrypcja operonu trp kontrolowana atenuatorem
rybosom zatrzymuje tak, że transkrypcja poniżej atenuatora
koduje krotki peptyd testowy z 2 resztami trp
reszty trp obecne obok siebie
niedobór trp bo brak tryptofanylo-tRNA rybosom zatrzymuje na kodujących trp
tRNA
zawiera od 70-90 nukleotydów
zbudowany z helikalnych końców tworzących literę U
wiele zmodyfikowanych nukleotydów
duża cześć jest sparowana
antykodon i miejsce wiązania aminokwasu na przeciwległym końcu
zawiera ACC, gdzie przyłączone aminokwasy
CCA na końcu 3’
zawiera od 70-90 nukleotydów
wiele zmodyfikowanych nukleotydów
duża cześć jest sparowana
antykodon i miejsce wiązania aminokwasu na przeciwległym końcu
CCA na końcu 3’