b. polega na cyklicznym dodaniu przez polimerazę DNA tylko 1 nukleotydu wyznakowanego fluorescencyjnyjnie, terminacji syntezy, wymyciu niedodanych nukleotydów, obrazowaniu, usunięciu grupy terminującej i powtórzeniu na nowo syntezy 1 nukleotydu
a. sekwencjonowaniu w czasie rzeczywistym SMART (single molekule real time)
d. wykorzystuje ligazę DNA zamiast polimerazy DNA, dochodzi do łączenia krótkich fragmentów wyznakowanych fluorescencyjnie
c. wykorzystanie nukleotydy wyznakowane radioaktywnie
b. polega na cyklicznym dodaniu przez polimerazę DNA tylko 1 nukleotydu wyznakowanego fluorescencyjnyjnie, terminacji syntezy, wymyciu niedodanych nukleotydów, obrazowaniu, usunięciu grupy terminującej i powtórzeniu na nowo syntezy 1 nukleotydu
W której z metod do wizualizacji nie używa się autoradiografii?
b. Southern Blotting
c. pirosekwencjonowanie
a. sekwencjonowanie metodą Sangera
d. metoda chemicznej degradacji Maxima-Gilberta
c. pirosekwencjonowanie
W sekwencjonowaniu cyklicznym materiałem wyjściowym jest zwykle:
d. dwuniciowy DNA
a. jednoniciowy cDNA
c. jednoniciowy DNA
b. dwuniciowy RNA
d. dwuniciowy DNA
Do metod sekwencjonowania należy:
d. Metoda Sangera
b. Northern-blot
a. Southern-blot
c. hybrydyzacja FISH
d. Metoda Sangera
Wskaż nieprawidłowe stwierdzenie dotyczące sekwencjonowania cyklicznego:
d. materiałem wyjściowym jest dwuniciowy DNA
c. produkt reakcji przyrasta wykładniczo
a. ze względu na obecność dideoksynuklotydów dochodzi do terminacji łańcucha
b. do reakcji amplifikacji używany jest jeden starter
c. produkt reakcji przyrasta wykładniczo
Dideoksynukleotydy to:
a. zdenaturowane nukleotydy powstające w trakcie oczyszczania produktu PCR przed sekwencjonowaniem
b. trifosforany dideoksynukleozydów, które są analogami nukleotydów uniemożliwiającymi przyłączenie do syntetyzowanego łańcucha DNA następnego nukleotydu
d. nukleotydy podlegające modyfikacji w trakcie reakcji sekwencjonowania
c. trifisforany dideoksynukleozydów, które są znakowanymi starterami pozwalającymi na specyficzne namnażanie fragmentów PCR do sekwencjonowania
b. trifosforany dideoksynukleozydów, które są analogami nukleotydów uniemożliwiającymi przyłączenie do syntetyzowanego łańcucha DNA następnego nukleotydu
Sekwencjonowanie metodą chemicznej degradacji to inna nazwa:
c. metody Sangera
a. sekwencjonowania cyklicznego
d. metody Maxama-Gilberta
b. pirosekwencjonowania
d. metody Maxama-Gilberta
“Jest najstarszą metodą sekwencjonowania klasycznego opartą na chemicznej degradacji łańcucha DNA. Składa się z
3 etapów : chemicznej modyfikacji zasady azotowej, usunięciu tej zasady i przecięciu nici DNA w miejscu AP. Matrycę
do sekwencjonowania w tej metodzie może stanowić jedno- lub dwuniciowy DNA, wyznakowany radioaktywnie na
końcu 5’”. Jaka to metoda:
d. pirosekwencjonowanie
b. metoda Sangera
a. sekwencjonowanie masowe
c. metoda Maxama-Gilberta
c. metoda Maxama-Gilberta
Jak nazywa się metoda sekwencjonowania peptydów polegająca na kolejnym odrywaniu oznakowanych
aminokwasów z N-końca cząsteczki peptydu?
c. degradacja Edmana
a. sekwencjonowanie równoległe
b. sekwencjonowanie Sangera
d. degradacja równoległa
c. degradacja Edmana
Jaką metodę przedstawia poniższa rycina?
a. Pirosekwencjowanie, które należy do NGS
d. Metoda Sangera, które jest sekwencjonowaniem klasycznym
c. Sekwencjonowanie nanoporowe, które jest sekwencjonowaniem klasycznym
b. Metoda Solexa, które należy do NGS
a. Pirosekwencjowanie, które należy do NGS
W przypadku sekwencjonowania DNA metodą Sanger’a, kolejność nukleotydów w badanym DNA ustalimy poprzez
a. analizę prążków reakcji PCR sekwencyjnego
d. analizę produktów cięcia enzymami restrykcyjnymi
c. analizę intensywności fluorescencji hybrydyzowanej sondy
b. analizę widma absorpcyjnego
a. analizę prążków reakcji PCR sekwencyjnego
Poniższe zdjęcie przedstawia wynik otrzymany po:
d. Hybrydyzacji FISH
c. Elektroforezie
b. Real Time PCR
a. sekwencjonowaniu Sangera
c. Elektroforezie
Na rycinie przedstawiono schemat diagnozowania molekularnego niedokrwistości sierpowatej metodą:
c. hybrydyzacji DNA
b. Sekwencjonowania
a. RT-qPCR
d. PCR-RFLP
c. hybrydyzacji DNA
Fragment Klenowa polimerazy I DNA to enzym używany podczas:
d. sekwencjonowania cyklicznego
a. Pirosekwencjonowania
c. sekwencjonowania metodą Maxama Gilberta
b. sekwencjonowania metodą Sangera
a. Pirosekwencjonowania
Pirosekwencjonowanie polega na:
b. Dodaniu znakowanego fluorochromem nukleotydu, które poprzez lucyferazę powoduje emisję sygnału świetlnego
a. Dodaniu znakowanego fluorochromem nukleotydu i odczyt pików świetlnych
d. Odłączaniu nukleotydów przez apirazę i ich degradacja powoduje sygnał świetlny
c. Dodanie niewyznakowanego nukleotydu
b. Dodaniu znakowanego fluorochromem nukleotydu, które poprzez lucyferazę powoduje emisję sygnału świetlnego
Techniką genotypowania, która wykorzystuje endonukleazy restrykcyjne jest technika:
d. RFLP
c. Sekwencjonowanie metodą Sangera
b. Western Blot
a. PCR
d. RFLP
Na rycinie przedstawiono:
c. Zasadę techniki PCR w czasie rzeczywistym (qRT-PCR)
d. Zasadę sekwencjonowania DNA z użyciem znaczników fluorescencyjnych
a. Zasadę sekwencjonowania metodą Sangera
b. Schemat łańcuchowej syntezy fragmentów DNA
b. Schemat łańcuchowej syntezy fragmentów DNA
Najbardziej precyzyjną metodą poznania struktury DNA jest:
c. RT-PCR
d. Hybrydyzacja
a. Analiza cytometryczna
b. Sekwencjonowanie
b. Sekwencjonowanie
W jakim celu w jednej z metod sekwencjonowania stosowana jest piperydyna?
a. Piperydyna nie jest stosowana w żadnej metodzie sekwencjonowania
d. Do przekształcenia pirofosforanu do ATP
c. . Do degradacji ATP i niezwiązanych nukleotydów
b. Do degradacji wiązań N-glikozydowych i fosfodiestrowych
b. Do degradacji wiązań N-glikozydowych i fosfodiestrowych
Jak nazywamy sekwencjonowanie, w którym stosuje się odczynniki przecinające cząsteczki (…) określonych pozycjach
nukleotydowych?
