Fiszki
Biologia molekularna
Test w formie fiszek Przykładowe pytania.
Ilość pytań: 34
Rozwiązywany: 8102 razy
Które z podanych poniżej informacji są prawdziwe w odniesieniu do wycinania intein?
e) Niektóre z intein są specyficznymi endonukleazami zdolnymi do usuwania specyficznej sekwencji DNA w allelu który nie zawiera sekwencji kodującej inteinę
c) Inteina jest usuwana bezpośrednio po zakończeniu transkrypcji, czemu towarzyszy łączenie zewnętrznych segmentów, t.j ekstein.
f) po wycięciu inteiny, eksteiny łączone są przez specyficzną ligazę białkową
d) Większość intein zidentyfikowano w białkach wyższych eukariotnów.
a) Wycinanie intein jest odpowiednikiem wycinania intronów z premRNA
b) Inteina to zewnętrzny lub wewnętrzny fragment białka usuwany przez cięcie proteolityczne prowadzące do powstania aktywnego białka.
e) Niektóre z intein są specyficznymi endonukleazami zdolnymi do usuwania specyficznej sekwencji DNA w allelu który nie zawiera sekwencji kodującej inteinę
a) Wycinanie intein jest odpowiednikiem wycinania intronów z premRNA
Której z wymienionych niżej modyfikacji mogą podlegać histony?
d) Ubikiwitynacja
b) Przemieszczenie trans
f) sumoilacja (dołączenie białka SUMO)
e) remodelowanie
a) Acetylacja
c) Metylacja
d) Ubikiwitynacja
f) sumoilacja (dołączenie białka SUMO)
a) Acetylacja
c) Metylacja
Co wchodzi w skład promotora u Procaryota?
c) kaseta Hognessa
b) kaseta CAAT
a) kaseta Pribnowa
d) rejon –35
e) sekwencja zawierająca wiele reszt purynowych
a) kaseta Pribnowa
d) rejon –35
Replikacja DNA u procaryota:
b) topoizomeraza I tnie dwie nici, topoizomeraza II tnie jedną nić
d) Jest semikonserwatywna
a) nie potrzebuja ATP
c) gyrazawymaga ATP, odpowiada za superskręty
d) Jest semikonserwatywna
c) gyrazawymaga ATP, odpowiada za superskręty
Kierowanie białek które ze stwierdzen na temat sekwencji sygnałowych są poprawne:
d) SRP zapobiega przedwczesnej elongacji, a przez to fałdowaniu się białka
b) cząsteczka rozpoznająca sygnał (SRP) jest białkiem składającym się z 7 ahelis
c) uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu
a) wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie sa odcinane po przejściu przez błonę ER
e) Rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błone
d) SRP zapobiega przedwczesnej elongacji, a przez to fałdowaniu się białka
a) wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie sa odcinane po przejściu przez błonę ER
e) Rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błone
Sygnały rozpoczynające i kończące sygnał:
f) u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki
c) promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA
e) heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w terminacji transkrypcji niektórych genów E.coli
h) mRNA policistronowe
a) za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka alfa polimerazy RNA
d) sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU
b) typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA
f) u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki
c) promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA
e) heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w terminacji transkrypcji niektórych genów E.coli
h) mRNA policistronowe
d) sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU
Translacja u procaryota
a) poszukiwanie pierwszego kodonu AUG od 5’ końca transkryptu hudrolizującego ATP
e) fMettRNA f zajmuje miejsce P jako jedyne
d) peptydylotRNA może znajdować się zarówno w miejscu P lub A rybosomu, w zależności od fazy cyklu translacyjnego
c) czynnik elongacyjny Tu(EFTu) oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacetylotRNA oprócz fMettRNA f
b) czynnik elongacyjny Ts (EFTs) wiąże nukleotyd GTP, przez co w wyniku hydrolizy uwalnia się GDP
d) peptydylotRNA może znajdować się zarówno w miejscu P lub A rybosomu, w zależności od fazy cyklu translacyjnego
c) czynnik elongacyjny Tu(EFTu) oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacetylotRNA oprócz fMettRNA f
b) czynnik elongacyjny Ts (EFTs) wiąże nukleotyd GTP, przez co w wyniku hydrolizy uwalnia się GDP
Degradacja eukariotycznych RNA:
c) może przebiegać według mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA, który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych
d) może zależeć od szlaku, którego jednym z elementów są cząsteczki RNA o strukturze spinki do włosów, powstające z prekursorowego RNA, syntezowanego przez polimerazę RNA II.
f) może zależeć od sekwencji znajdujących się w obrębie transkryptu
e) w prawidłowej, niezmienionej komórce skutkuje powstaniem krótkich interferujących RNA o długości 2128 nukleotydów
b) może przebiegać, w procesie, w którym następuje usuwanie czapeczki mRNA skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcucha Poli(A), co z kolei prowadzi do braku translacji i szybkiego trawienia eksonukleolitycznego.
a) powoduje, że eukariotyczne mRNA są cząsteczkami żyjącymi dłużej niż ich odpowiedniki bakteryjne, jednak z typowym okresem półtrwania rzędu 10-20 minut
c) może przebiegać według mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA, który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych
f) może zależeć od sekwencji znajdujących się w obrębie transkryptu
Jeden z typowych promotorów E.Coli poddano, wraz z kontrolowanym przez ten promotor genem
gruntownym badaniom, korzystając z odpowiednich metod biologii molekularnej. Poniżej
przedstawione są wybrane wnioski jakie sformułowano po ich przeprowadzeniu. Wybrać te które są
zgodne z AKTUALNYM stanem wiedzy:
d) wzbogacenie sekwencji 10 w pary GC wpływa na proces rozpoznania promotora przez podjednostkę polimerazy RNA
c) w zamkniętym kompleksie promotorowym polimeraza pokrywa ok. 80pz, rozpoczynając powyżej bloku 35 i kończąc poniżej bloku 10
a) rdzeń polimerazy RNA rozpoznaje sekwencję promotora i łączy się z nim
e) w trakcie eksperymentów prowadzonych in vitro nie zaobserwowano powstawania krótszych niż spodziewany, transkryptów
b) zmiana sekwencji bloku/kasety 35 promotora ma bezpośredni wpływ na przekształcenie zamkniętego kompleksu promotorowego w kompleks otwarty.
f) Rozpoczęcie elongacji towarzyszy zmiana konformacyjna holoenzymu polimerazy RNA skutkiem czego pokrywa ona mniejszy odcinek DNA (3040bp).
c) w zamkniętym kompleksie promotorowym polimeraza pokrywa ok. 80pz, rozpoczynając powyżej bloku 35 i kończąc poniżej bloku 10
e) w trakcie eksperymentów prowadzonych in vitro nie zaobserwowano powstawania krótszych niż spodziewany, transkryptów
Bardzo często polipeptyd uwalniany z rybosomu jest nieaktywny i zanim będzie mógł spełniać
swoją funkcję w komórce musi być poddany obróbce postranslacyjnej. Z podanych poniżej wybrać
te, które są PRAWDZIWE w odniesieniu do obróbki potranslacyjnej.
d) niektóre z intein posiadają aktywność endonukleazy, która może specyficznie przeciąć gen nie zawierający inteiny, co jest wymagane do ukierunkowanego przemieszczania się sekwencji intronu inteiny
f) białka opiekuńcze decydują o trzeciorzędowej strukturze białek
e) niektóre białka syntezowane są jako poliproteiny, długie polipeptydy zawierające kilka białek połączonych ze sobą jedno za drugim, sposobem głowaogon; zdarza się, że sekwencje kodujące poszczególne produkty (białka) zachodzą na siebie.
b) gdyby w komórce proces fałdowania polipeptydu przebiegał, gdy dostępna jest tylko jego część, to mogłoby zmniejszyć prawdopodobieństwo występowania nieprawidłowych odgałęzień ścieżki 8 fałdowania
c) inteina, to wewnętrzny fragment białka usuwany po translacji z jednoczesnym połączeniem fragmentów go otaczających
a) nie jest możliwe, aby niewłaściwie sfałdowane białko przyjęło właściwą dla siebie konformację.
e) niektóre białka syntezowane są jako poliproteiny, długie polipeptydy zawierające kilka białek połączonych ze sobą jedno za drugim, sposobem głowaogon; zdarza się, że sekwencje kodujące poszczególne produkty (białka) zachodzą na siebie.
c) inteina, to wewnętrzny fragment białka usuwany po translacji z jednoczesnym połączeniem fragmentów go otaczających
Problem topologiczny dotyczy którego z następujących zagadnień?
c) Rozwijanie dsDNA i rotacja cząsteczki DNA
d) Synchronizacja replikacji DNA z podziałem komórkowym
b) Trudności związane z syntezą DNA na nici opóźnionej
a) Zablokowanie miejsc replikacji DNA przez nukleosomy
e) Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów ds. DNA opisuje grupa plektonemiczna
f) Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów DNA opisuje grupa toponemiczna
c) Rozwijanie dsDNA i rotacja cząsteczki DNA
e) Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów ds. DNA opisuje grupa plektonemiczna
Standardowy mechanizm syntezy białka polega na przesuwaniu się rybosomu względem mRNA
dokładnie kodon za kodonem. Są znane jednak nietypowe zjawiska zachodzące podczas elongacji.
Poniżej podane zostały informacje na ich temat – zaznaczyć prawdziwe.
a) w przypadku kilku mRNA obserwuję się zaprogramowaną zmianę fazy odczytu, zmieniającą fazę odczytu w specyficznym miejscu transkryptu.
c) zmiana fazy odczytu polega na tym, iż w czasie translacji mRNA rybosom zatrzymuje się, przesuwa o jeden kodon do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.
e) pominięcie translacyjne zaczyna się i kończy zawsze na dwóch identycznych kodonach.
f) wskutek pominięcia translacyjnego z jednego mRNA mogą być syntezowane dwa różne białka.
d) poślizg rybosomy umożliwia jednemu rybosomowi translację wybranych fragmentów mRNA policistronowego, np. mRNA operonu laktozowego.
b) zaprogramowana zamian fazy odczytu występuje wyłącznie w bakteriach
a) w przypadku kilku mRNA obserwuję się zaprogramowaną zmianę fazy odczytu, zmieniającą fazę odczytu w specyficznym miejscu transkryptu.
f) wskutek pominięcia translacyjnego z jednego mRNA mogą być syntezowane dwa różne białka.
d) poślizg rybosomy umożliwia jednemu rybosomowi translację wybranych fragmentów mRNA policistronowego, np. mRNA operonu laktozowego.
Które z podanych poniżej informacji są PRAWDZIWE w odniesieniu do domeny Ckońcowej
(CTD) największej podjednostki polimerazy RNA II
b) Kompleks białkowy zwany mediatorem bezpośrednio aktywuje inicjację transkrypcji przez fosforylację CTD
a) Jej fosforylacja warunkuje przyłączenie się polimerazy do kompleksu preinicjacyjnego
c) CTD jest zaangażowane w oddziaływanie z czynnikami białkowymi biorącymi udział w procesach molekularnych towarzyszących terminacji transkrypcji
d) Status jej fosforylacji jest stały podczas trwania procesu transkrypcji – zmienia się na etapie inicjacji, podczas trwania transkrypcji jest taki sam
e) U ssaków CTD zawiera 52 powtórzenia siedmioaminokwasowej sekwencji TyrSerProThrSerProSer. Dwie z reszt Pro w każdym powtórzeniu mogą być modyfikowane przez dodanie grup fosforanowych
f) Wieloskładnikowy kompleks białkowy, tzw. Czynnik specyficzności cięcia i poliadenylacji (CPSF), pozyskiwany do kompleksu polimerazy jest już na etapie inicjacji transkrypcji i wchodzi w kontakt z CTD. CPSF pozostaje związany z CTD do czasu pojawienia się sekwencji poliA w transkrypcie.
f) Wieloskładnikowy kompleks białkowy, tzw. Czynnik specyficzności cięcia i poliadenylacji (CPSF), pozyskiwany do kompleksu polimerazy jest już na etapie inicjacji transkrypcji i wchodzi w kontakt z CTD. CPSF pozostaje związany z CTD do czasu pojawienia się sekwencji poliA w transkrypcie.
Które z podanych poniżej twierdzeń są PRAWDZIWE dla zjawiska replikacji DNA w komórkach eukariotycznych
c) Koniec 5’startera używanego przez polimerazę DNA zawiera resztę 5’ fosforanową , blokuje aktywność enzymatyczną nukleazy oznaczanej skrótem FEN1
d) Enzymy i pozostałe białka biorące udział w replikacji tworzą duże struktury wewnątrzjądrowe tzw. fabryki replikacyjne, z których każda zawiera odpowiednik bakteryjnego replisomu
b) Zakończenie syntezy fragmentu Okazaki wymaga usunięcia sekwencji startera odpowiednią polimerazą posiadającą aktywność egzonukleazy
a) Polimeraza DNA kopiująca nić opóźnioną tworzy kompleksy dimeryczne
e) Chromatydy siostrzane są związane razem aż do stadium anafazy dzięki kohezynom, które dołączone są do nowych nici DNA natychmiast po przejściu przez widełki replikacyjne
f) Żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe
e) Chromatydy siostrzane są związane razem aż do stadium anafazy dzięki kohezynom, które dołączone są do nowych nici DNA natychmiast po przejściu przez widełki replikacyjne