jest miejscem obróbki cząsteczek mRNA

jest miejscem ekspresji genów kodujących białka

jest miejscem syntezy i obróbki cząsteczek rRNA

jest rusztowaniem chromosomowym zmieniającym swoją strukturę w czasie podziału komórki co prowadzi do kondensacja chromosomów

jest miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNA I - polimeraza RNA I jest umieszczona w jąderku no i tworzy transkrypty komórkowe dla rRNA.

jest miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNAII

powoduje, że eukariotyczne mRNA są cząsteczkami żyjącymi dłużej niż ich odpowiedniki bakteryjne, jednak z typowym okresem półtrwania rzędu 10--20 minut. ssacze mRNA mogą kilka godzin, drożdże 10-20 minut, bakterie max kilka minut

może przebiegać według mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA, który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych.

może zależeć od szlaku, którego jednym z elementów są cząsteczki RNA o strukturze spinki do włosów, powstające z prekursorowego RNA, syntezowanego przez polimerazę RNA II. chodzi o mikroRNA

może przebiegać, w procesie, w którym następuje usuwanie czapeczki mRNA skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcucha Poli(A), co z kolei prowadzi do braku translacji i szybkiego trawienia eksonukleolitycznego. na odwrót, najpierw łańcuch potem czapeczka

może zależeć od sekwencji znajdujących się w obrębie transkryptu – np. dzięki granicom egzon-intron

w prawidłowej, niezmienionej komórce skutkuje powstaniem krótkich interferujących RNA o długości 21--28 nukleotydów. na tej podstawie wyciszane są wirusowe RNA

peptydylotRNA może znajdować się zarówno w miejscu P lub A rybosomu, w zależności od fazy cyklu translacyjnego

fMet-tRNAf inicjatorowy wiąże się w przeciwieństwie do...

poszukiwanie pierwszego kodonu AUG od 5’ końca transkryptu hudrolizującego ATP hydroliza GTP

czynnik elongacyjny Tu(EF-Tu) oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacetylo-tRNA oprócz fMet-tRNAf

czynnik elongacyjny Ts (EFTs) wiąże nukleotyd GTP, przez co w wyniku hydrolizy uwalnia się GDP EF-Ts łączy się z EF-Tu co powoduje odłączenie GDP od EF-Tu

formylometionylo-tRNAf powstaje w reakcji:

fMet-tRNAf zajmuje miejsce P jako jedyn h1-IF1 skierowuje fMet-tRNA od razu do miejsca P podczas inicjacji

mRNA policistronowe

mRNA policistronowe

sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka alfa polimerazy RNA podjednostka sigma

u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki np. operon tryptofanowy - jest tryptofan nie trzeba nic robić, koniec transkrypcji

promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA

heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w terminacji transkrypcji niektórych genów E.coli (jest dobrze, ponieważ białko RHO ma aktywność ATPazową oraz działa również jak helikaza)

typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA kaseta TATA ma inną sekwencję niż podana, dodatkowo jest promotorem u eukariota a nie e.coli

adenozyna i guanina wiąże się przez N9 z C1 deoksyrybozy wiązaniem N- -glikozydowym , a cytozyna i tymina przez N-1 z C1

połączenie zasady z cukrem nosi nazwę nukteozydu, bo nukleotyd to nukleozyd plus gr.fosforanowa.

nie pełnią funkcji strukturalnej(?)

efekt hiperchromowy - efekt podczas topnienia DNA, który powoduje podwyższenie absorbancji przy długości fali 260 nm może być pytanie o efekt hipochromowy - obniżenie absorbancji!!

komplementarne pary tworzą się pomiędzy puryna i puryną oraz pirymidyną i pirymidyną puryna z pirymidyną.(NIE)

eżeli A+G =30% to T może być więcej niż 20%(reguła Chargaffa)

temp topnienia jest odwrotnie proporcjonalna do długości łańcucha temp. topnienia rośnie wraz z długością(wprost)

guanina paruje się z cytozyna poprzez 3 wiązania wodorowe

deoksyryboza ma przy węglu 2’ wolną grupę OH (RYBOZA)

dwuniciowe RNA może przyjmować strukturę A DNA.(podobną)

zasady w superhelisie są wewnątrz helisy

uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu

Cykl ATPADP... sekwencję sygnałową z SRP i odłącza ją od …

cząsteczka rozpoznająca sygnał (SRP) jest białkiem składającym się z 7 ahelis/ łańcuchów polipeptydowych

wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie są odcinane po przejściu przez błonę ER

Rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błonę

uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu

3 etapyetap drugià temperatura nie zalezy od długości startera; od długości startera zależy czas trwania drugiego etapu (2 etap- przyłączanie starterów (40-60oC) - w tym kroku startery reakcji przyłączają się do matrycowego DNA, temperatura zależy od temperatury topnienia starterów, a im dłuższy starter tym wyzsza temp topnienia- dlatego ta odp. jest zła)

coś z rearanżacjami chromosomówodp błędna (PCR to metoda powielania łańcuchów DNA polegająca na łańcuchowej reakcji polimerazy DNA w wyniku wielokrotnego podgrzewania i oziębiania próbki- nic nie znalazłam o żadnej rearanżacji chromosomów)

pozwala na wykrycie niewielkich wirusów

białaczka

potrzebuje dwóch starterów komplementarnych do siebie jak w metodzie dideoksy (potrzebujemy parę starterów, które hybrydyzują z sekwencjami przylegającymi do sekwencji docelowej-każdy starter chyba musi być komplementarny do jednej nici, czyli dwa startery, ale NIE są komplementarne do siebie)

wymaga polimerazy DNA i czterech deoksynukleotydów (wymaga termostabilnej DNA i wszystkich 4 dNTP)

Opryszczka (układ zgodności tkankowej)

MHC II- cd8(MHC klasy II prezentuje antygeny pomocniczym limfocytom T CD4+, a nie CD8+.)

są polimorficzne i odrzucają przeszczepy

kodowane przez HLA

MHC I- cd 4(Fałsz. MHC klasy I prezentuje antygeny cytotoksycznym limfocytom T CD8+, a nie CD4+.)

układ zawiera 3 grupy MHC I, MHC II, MHC III