trzy

To się zmienia mogą być dwa lub jeden

dwa

To się zmienia mogą być trzy albo dwa

jeden

cztery

w splicosomie uczestniczą katalityczne cząsteczki snRna - to było poprawne

gr 1 jest u Procaryota gr 2 u Eucaryota – u prokariota nie ma splicingu bo nie ma intronów!!!

w splicuinu gr 1 następuje atak guaniny lub guanozyny ma na 2’ OH? Na miejsce splicingowe 5’ powinno być (tak, że powstaje wolna gr.3’0h egzonu pierwszego)

splajsing autokatalityczny grupy 1 wymaga guaznozyny lub guanylanu i wiąże się do miejsca splajsingowego 3’

polimeraza DNA zalezna od DNA

odwrotna transkryptaza RNA zależna od DNA

powstaje hybryda DNA – RNA(retrowirusy

organizmy eukariotyczne mogą korzystać z retrowirusa zmieniać metabolizm.

wirusowa czy komórki gospodarza – wirusowa(to jest enzym wprowadzany do komórki gospodarza przez wirus razem z jego materiałem genetycznym)

stępuje etap gdzie o.t. tworzy DNA wirusowego RNA i potem integracja z chromosomem gospodarza

polimeraza DNA zalezna od RNA

Replikaza RNA-polimeraza RNA zalezna od RNA

2-niciowy RNA wbudowuje się do genomu (dwuniciowy DNA)

Zazwyczaj powstają z premRNA

Posiadają na końcu 3’ ogon poliA , nie kodowany przez matryce

Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG( na końcu 5’ jest kap, który nie jest bogaty w ppG)

Translacja jest sprzężona z transkrypcja i zachodzi w tym samym czasie - tylko u prokariotów zachodzi jednocześnie, bo nie ma tam dojrzewania mRNA

Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG lub pppG

który wiąże się z intensywnymi modyfikacjami chemicznymi histonów - (zmiany struktury nukleosomu, poślizg lub przemieszczenie cis, transfer lub przemieszczenie trans)

który jest bezwzględnie konieczny dla rozpoczęcia transkrypcji genu. - nie jest to niezbędny warunek

który zachodzi przy udziale złożonych kompleksów białkowych np. Swi/Snfi i wpływa na ekspresję całego genomu -kompleks swi/snfi nie działa ogólnie na cały genom, ale wpływa na ekspresję tylko ograniczonej liczby genów - krótkie rejony w genomie, ale zachodzi przy udziale kompleksów białkowych Swi/Snfi

które może skutkować tzw. przemieszczeniem cis, skutkujący transportem(?) nukleosomu na inną cząsteczkę DNA - przemieszczenie cis jest fizycznym przesunięciem nukleosomu wzdłuż nici DNA, a transprzeniesienie nukleosomu na inną cząsteczkę DNA lub dalszy fragment tej samej cząsteczki (str.285)

który jest indukowany przez zależny od energii proces osłabiający oddziaływania pomiędzy nukleosomem i związanym z nim DNA - (str. 284)

może przebiegac wg mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA (RNA surveillance), który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych

w prawidłowej, niezmienionej komórce (tzn. niezainfekowanej wirusami i nietransformowanej egzogennym DNA) może być skutkiem wyciszania RNA (interferencji RNA) dwuniciowe genomy wirusowe są wyciszane

może przebiegać w procesie w którym następuje usuwanie czapeczek skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcuchów poliA, co z kolei prowadzi do braku translacji mRNA i szybkiego i szybkiego trawienia eksonukleotydów.

może uczestniczyć w procesie, w którym uczestniczy wielobiałkowy składnik zwany egzosomem, który degraduje mRNA przy udziale spokrewnionych z enzymami bakteryjnego degradosomu.

może zachodzić w kierunku od 5’ do 3’ lub 3’ do 5’ w odróżeniniu od degradacji w komórkach bakteryjnych, która zawsze zachodzi w kierunku od 3’ do 5’ zachodzi w kierunku 5' -> 3'

może zależeć od obecności tzw. elementów niestabilności, znajdujących się w obrębie transkryptu

Rybosom dochodzi do końca sekwencji kodującej, uwalnia właściwie zsyntezowane białko i rozpoczyna syntezę nowego białka począwszy od następnego kodonu inicjacyjnego

Rybosom przeprowadza translację cząsteczki tRNA, która zawiera jeden dodatkowy nukleotyd lub brakuje w niej nukleotydu.

Rybosom kończy translację na kodonie, który koduje aminokwas.

W czasie translacji cząsteczek RNA rybosomu pomija kodon.

Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji przesuwa o jeden kodon do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.

Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji, przesuwa o jeden nukleotyd do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.

Sekwencje intronowe nie są usuwane z transkryptów RNA i podlegają translacji do białek.

Odbywa się pomiędzy eksonami zawartymi w obrębie różnych cząsteczek RNA.

Składanie w układzie trans jest powszechnym zjawiskiem w odniesieniu do transkryptów genów człowieka.

Następuje zastąpienie wybranych eksonów w niektórych transkryptach przez ekson liderowy.

Składanie w układzie trans zachodzi w sposób podobny do składania przebiegającego z wycinaniem intronów GUAG, z tym że zamiast lassa tworzona jest struktura widełek.

eksony z różnych transkryptów RNA są łączone ze sobą

Niektóre RNA uczestniczące w tym procesie zawierają informację z dwóch genów, co skutkuje jednoczesną translacją, prowadzącą do dwóch produktów białkowych.