Aktywności ligazy i nukleazy są potrzebne

kofaktor atakuje miejsce 5’ i traci PPi z konca 5’

nie potrzeba ATP

kieszeń (zawiera cząsteczki prekursorowego RNA)

kofaktor atakuje miejsce 3’

potrzebny kofaktor GTP, GDP

w operonie ora wpływa na geny struktury

w obecności arabinozy wpływa na geny struktury

po jego związaniu do atenuatora trp może być transkrypcja genów struktury

chroni przez DNAza -87 do -47

chroni miejsca -48 do -5

represor transkrypcji

wiąże z araO1 hamując transkrypcję genu

wiąże araO2 aktywując geny struktury

powoduje wypętlenie, gdy zwiąże się z araO2 i araI

w obecności cAMP-CAP geny struktury operonu i związanie arabinozowego do araO1 i araI

wiąże się specyficznie z DNA w obecności arabinozy

białko cro związane z or1 to hamuje syntezę represora

profag (DNA) jest także lizogenicznej, gdy nie aktywuje zmiany bo represor λ …

białko cro wiąże się do or3 i wtedy hamuje represor (gen c1)

syntetyzuje tylko represor λ w bakterii lizogenicznych

ssDNA = recA oddziałuje z nim także represor λ

zostaje uwolnione z chromosomu bakteryjnego z kompleksu rexDNA

gdy nic nie atakuje, zmienia to w fazie lizogenicznej jest on obecny z uwagi na represor, który ulega autoregulacji

konstutywna synteza białka C

może syntezować arabinozę przy wykorzystaniu białek powstałych z białek struktury

w obecności cAMP-CAP i arabinozy nie da się zapętlić

cAMP-CAP i arabiznoza może przeprowadzać transkrypcje genów struktury, nieznacznie obniżają szybkość

transkrypcja operonu trp kontrolowana atenuatorem

niedobór trp bo brak tryptofanylo-tRNA rybosom zatrzymuje na kodujących trp

koduje krotki peptyd testowy z 2 resztami trp

reszty trp obecne obok siebie

w obrębie genu trpD

rybosom zatrzymuje tak, że transkrypcja poniżej atenuatora

krótki transkrypt liderowy kończy sekwencja poli(U)

zbudowany z helikalnych końców tworzących literę U

zawiera od 70-90 nukleotydów

duża cześć jest sparowana

CCA na końcu 3’

wiele zmodyfikowanych nukleotydów

zawiera ACC, gdzie przyłączone aminokwasy

antykodon i miejsce wiązania aminokwasu na przeciwległym końcu