Test: Biologia molekularna

Pytanie 25

Kierowanie białek które ze stwierdzen na temat sekwencji sygnałowych są poprawne:

e) Rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błone

c) uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu

a) wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie sa odcinane po przejściu przez błonę ER

b) cząsteczka rozpoznająca sygnał (SRP) jest białkiem składającym się z 7 ahelis

d) SRP zapobiega przedwczesnej elongacji, a przez to fałdowaniu się białka

Pytanie 26

Sygnały rozpoczynające i kończące sygnał:

c) promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA

f) u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki

d) sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

h) mRNA policistronowe

a) za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka alfa polimerazy RNA

b) typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA

e) heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w terminacji transkrypcji niektórych genów E.coli

Pytanie 27

Translacja u procaryota

a) poszukiwanie pierwszego kodonu AUG od 5’ końca transkryptu hudrolizującego ATP

e) fMettRNA f zajmuje miejsce P jako jedyne

c) czynnik elongacyjny Tu(EFTu) oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacetylotRNA oprócz fMettRNA f

d) peptydylotRNA może znajdować się zarówno w miejscu P lub A rybosomu, w zależności od fazy cyklu translacyjnego

b) czynnik elongacyjny Ts (EFTs) wiąże nukleotyd GTP, przez co w wyniku hydrolizy uwalnia się GDP

Pytanie 28

Degradacja eukariotycznych RNA:

e) w prawidłowej, niezmienionej komórce skutkuje powstaniem krótkich interferujących RNA o długości 2128 nukleotydów

c) może przebiegać według mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA, który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych

d) może zależeć od szlaku, którego jednym z elementów są cząsteczki RNA o strukturze spinki do włosów, powstające z prekursorowego RNA, syntezowanego przez polimerazę RNA II.

b) może przebiegać, w procesie, w którym następuje usuwanie czapeczki mRNA skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcucha Poli(A), co z kolei prowadzi do braku translacji i szybkiego trawienia eksonukleolitycznego.

f) może zależeć od sekwencji znajdujących się w obrębie transkryptu

a) powoduje, że eukariotyczne mRNA są cząsteczkami żyjącymi dłużej niż ich odpowiedniki bakteryjne, jednak z typowym okresem półtrwania rzędu 10-20 minut

Pytanie 29

Jeden z typowych promotorów E.Coli poddano, wraz z kontrolowanym przez ten promotor genem gruntownym badaniom, korzystając z odpowiednich metod biologii molekularnej. Poniżej przedstawione są wybrane wnioski jakie sformułowano po ich przeprowadzeniu. Wybrać te które są zgodne z AKTUALNYM stanem wiedzy:

a) rdzeń polimerazy RNA rozpoznaje sekwencję promotora i łączy się z nim

e) w trakcie eksperymentów prowadzonych in vitro nie zaobserwowano powstawania krótszych niż spodziewany, transkryptów

b) zmiana sekwencji bloku/kasety 35 promotora ma bezpośredni wpływ na przekształcenie zamkniętego kompleksu promotorowego w kompleks otwarty.

f) Rozpoczęcie elongacji towarzyszy zmiana konformacyjna holoenzymu polimerazy RNA skutkiem czego pokrywa ona mniejszy odcinek DNA (3040bp).

d) wzbogacenie sekwencji 10 w pary GC wpływa na proces rozpoznania promotora przez podjednostkę polimerazy RNA

c) w zamkniętym kompleksie promotorowym polimeraza pokrywa ok. 80pz, rozpoczynając powyżej bloku 35 i kończąc poniżej bloku 10

Pytanie 30

Bardzo często polipeptyd uwalniany z rybosomu jest nieaktywny i zanim będzie mógł spełniać swoją funkcję w komórce musi być poddany obróbce postranslacyjnej. Z podanych poniżej wybrać te, które są PRAWDZIWE w odniesieniu do obróbki potranslacyjnej.

c) inteina, to wewnętrzny fragment białka usuwany po translacji z jednoczesnym połączeniem fragmentów go otaczających

a) nie jest możliwe, aby niewłaściwie sfałdowane białko przyjęło właściwą dla siebie konformację.

d) niektóre z intein posiadają aktywność endonukleazy, która może specyficznie przeciąć gen nie zawierający inteiny, co jest wymagane do ukierunkowanego przemieszczania się sekwencji intronu inteiny

f) białka opiekuńcze decydują o trzeciorzędowej strukturze białek

b) gdyby w komórce proces fałdowania polipeptydu przebiegał, gdy dostępna jest tylko jego część, to mogłoby zmniejszyć prawdopodobieństwo występowania nieprawidłowych odgałęzień ścieżki 8 fałdowania

e) niektóre białka syntezowane są jako poliproteiny, długie polipeptydy zawierające kilka białek połączonych ze sobą jedno za drugim, sposobem głowaogon; zdarza się, że sekwencje kodujące poszczególne produkty (białka) zachodzą na siebie.

Pytanie 31

Problem topologiczny dotyczy którego z następujących zagadnień?

b) Trudności związane z syntezą DNA na nici opóźnionej

c) Rozwijanie dsDNA i rotacja cząsteczki DNA

f) Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów DNA opisuje grupa toponemiczna

a) Zablokowanie miejsc replikacji DNA przez nukleosomy

e) Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów ds. DNA opisuje grupa plektonemiczna

d) Synchronizacja replikacji DNA z podziałem komórkowym

Pytanie 32

Standardowy mechanizm syntezy białka polega na przesuwaniu się rybosomu względem mRNA dokładnie kodon za kodonem. Są znane jednak nietypowe zjawiska zachodzące podczas elongacji. Poniżej podane zostały informacje na ich temat – zaznaczyć prawdziwe.

e) pominięcie translacyjne zaczyna się i kończy zawsze na dwóch identycznych kodonach.

f) wskutek pominięcia translacyjnego z jednego mRNA mogą być syntezowane dwa różne białka.

b) zaprogramowana zamian fazy odczytu występuje wyłącznie w bakteriach

c) zmiana fazy odczytu polega na tym, iż w czasie translacji mRNA rybosom zatrzymuje się, przesuwa o jeden kodon do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.

d) poślizg rybosomy umożliwia jednemu rybosomowi translację wybranych fragmentów mRNA policistronowego, np. mRNA operonu laktozowego.

a) w przypadku kilku mRNA obserwuję się zaprogramowaną zmianę fazy odczytu, zmieniającą fazę odczytu w specyficznym miejscu transkryptu.

Pytanie 33

Które z podanych poniżej informacji są PRAWDZIWE w odniesieniu do domeny Ckońcowej (CTD) największej podjednostki polimerazy RNA II

f) Wieloskładnikowy kompleks białkowy, tzw. Czynnik specyficzności cięcia i poliadenylacji (CPSF), pozyskiwany do kompleksu polimerazy jest już na etapie inicjacji transkrypcji i wchodzi w kontakt z CTD. CPSF pozostaje związany z CTD do czasu pojawienia się sekwencji poliA w transkrypcie.

b) Kompleks białkowy zwany mediatorem bezpośrednio aktywuje inicjację transkrypcji przez fosforylację CTD

a) Jej fosforylacja warunkuje przyłączenie się polimerazy do kompleksu preinicjacyjnego

e) U ssaków CTD zawiera 52 powtórzenia siedmioaminokwasowej sekwencji TyrSerProThrSerProSer. Dwie z reszt Pro w każdym powtórzeniu mogą być modyfikowane przez dodanie grup fosforanowych

d) Status jej fosforylacji jest stały podczas trwania procesu transkrypcji – zmienia się na etapie inicjacji, podczas trwania transkrypcji jest taki sam

c) CTD jest zaangażowane w oddziaływanie z czynnikami białkowymi biorącymi udział w procesach molekularnych towarzyszących terminacji transkrypcji

Pytanie 34

Które z podanych poniżej twierdzeń są PRAWDZIWE dla zjawiska replikacji DNA w komórkach eukariotycznych

d) Enzymy i pozostałe białka biorące udział w replikacji tworzą duże struktury wewnątrzjądrowe tzw. fabryki replikacyjne, z których każda zawiera odpowiednik bakteryjnego replisomu

e) Chromatydy siostrzane są związane razem aż do stadium anafazy dzięki kohezynom, które dołączone są do nowych nici DNA natychmiast po przejściu przez widełki replikacyjne

c) Koniec 5’startera używanego przez polimerazę DNA zawiera resztę 5’ fosforanową , blokuje aktywność enzymatyczną nukleazy oznaczanej skrótem FEN1

b) Zakończenie syntezy fragmentu Okazaki wymaga usunięcia sekwencji startera odpowiednią polimerazą posiadającą aktywność egzonukleazy

a) Polimeraza DNA kopiująca nić opóźnioną tworzy kompleksy dimeryczne

f) Żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe

Strona 4

Biologia molekularna