Podsumowanie: ozi <3

Pytanie 1

Które z następujących twierdzeń jest prawdziwe w odniesieniu do procesu interferencji RNA?

Interferencja RNA może być przyczyną braku produktu białkowego kodowanego przez transgen.

Dwuniciowe cząsteczki RNA wiążą się z białkami, które blokują ich translację.

Krótkie interferujące cząsteczki RNA wiążą się z rybosomem, aby zapobiec translacji wirusowych mRNA.

Dwuniciowe interferujące cząsteczki RNA są wytwarzane z prekursorowego RNA kodowanego w genomie komórki.

Dwuniciowe cząsteczki RNA są cięte przez nukleazę na krótkie interferujące cząsteczki RNA.

Antysensowne cząsteczki RNA przyłączają się do nie ulegającego translacji regionu 3’ docelowego RNA

Pytanie 2

. Izolatory to:

Sekwencja występująca wyłącznie w genomie Drosophilia melanogaster.

sekwencje o długości 12 kb wyznaczające granice domen, tzw. domen funkcjonalnych charakteryzujących się zwartą strukturą

sekwencje które w swoich normalnych położeniach izolują poszczególne geny danej domeny funkcjonalnej

Sekwencje utrzymujące niezależność domeny funkcjonalnej zapobiegają „wymianie informacji’’ między sąsiednimi domenami.

sekwencje które najprawdopodobniej do spełniania swych funkcji wymagają białek wiążących specyficznie zarówno izolatory jak i sieć włókien zbudowanych z RNA i białek przenikających całe jadro.

sekwencje mające zdolność znoszenia efektu pozycyjnego (tak), przejawiającego się w nieobecności izolatorów zamiennością lokalizacji, w której wbudowywany jest rekombinowany gen.

Pytanie 3

. Które z poniższych cech są prawdziwe w odniesieniu do heterochromatyny konstytutywnej?

w jej skład wchodzi DNA nie kodujący żadnych genów

jest jednym z głównych składników chromosomu Y

w jej skład wchodzi np DNA centromerów i telomerów.

zawiera ona geny nieaktywne w pewnych komórkach lub na niektórych etapach cyklu komórkowego

można ją obserwować czasami w pewnych komórkach. – konstytutywna – zawsze zwarta,

zawiera ona DNA który ma zwartą strukturę

jest ona głównym składnikiem ludzkich chromosomów płc

) w rejonach, w których występuje heterochromatyna konstytutywna można zaobserwować przy pomocy mikroskopu elektronowego pętle zbudowane z włókna chromatynowego

w jej skład wchodzi DNA nie zawierający żadnych genów.

Pytanie 4

Która z poniższych modulowanych sekwencji DNA umożliwiają regulację transkrypcji w odpowiedzi na ogólne sygnały z zewnątrz komórki?

Moduły komórkowo specyficzne

Moduły odpowiedzi

Moduły represorów

Moduł w kształcie palca cynkowego

Moduły konstytutywne

Moduły regulatorów rozwoju

Pytanie 5

Inicjacja transkrypcji u Eukaryota to proces, dla którego prawdziwe są następujące stwierdzenia:

Aktywatory transkrypcji są istotne dla inicjacji transkrypcji przez polimerazy RNAII i RNAIII, natomiast ich rola w przypadku polimerazy RNAI przeprowadzającej transkrypcję wielokrotnie powtórzonej jednostki transkrypcyjnej zawierającej sekwencję kodującą niektóre z rybosomalnych RNA nie jest dobrze określona

Ilość zachodzących inicjacji transkrypcji polimerazy RNAII, zależy od tego, które moduły promotorowe danego genu w danym czasie są związane ze specyficznymi białkami

Koaktywator, to białko, stymulujące inicjację transkrypcji przez specyficzne bezpośrednie wiązanie DNA.

Inicjacja transkrypcji u Eukaryota różni się od inicjacji transkrypcji jaka ma miejsce w komórkach bakteryjnych, między innymi tym, że podstawowy poziom inicjacji transkrypcji eukariotycznej jest stosunkowo wysoki dla większości promotorów, z wyjątkiem najsłabszych

Powszechną cechą aktywatorów transkrypcji jest ich zdolność do bezpośredniego oddziaływania z kompleksem preinicjacyjnym polimerazy RNAII przez tzw. domenę poliprolinową

Pytanie 6

Dlaczego reinicjacja transkrypcji z promotora polimerazy RNAII jest dużo szybsza niż pierwsza inicjacja?

Wszystkie podstawowe czynniki transkrypcyjne oddysocjowują od promotora ale promotor jest ciągle eksponowany, co umożliwia szybkie ponowne zbudowanie kompleksu inicjującego

Wszystkie podstawowe czynniki transkrypcyjne pozostają związane z promotorem umożliwiając reinicjację

Niektóre podstawowe czynniki transkrypcyjne (TFIID, TFIIA i TFIIH) pozostają związane z promotorem umożliwiając reinicjację

Niektóre podstawowe czynniki transkrypcyjne (TFIID, TFIIA, TFIIH) pozostają związane z polimerazą RNA umożliwiając reinicjację.

Domena Ckońcowa (CTD) polimerazy jest zaktywowana ze względu na defosforylację jaka miała miejsce w czasie pierwszej inicjacji

Pytanie 7

7. Jaka jest funkcja grupy formylowej przyłączonej do inicjatorowej metioniny w komórce EUKARIOTYCZNEJ?

Wiąże cząsteczkę GTP potrzebną w procesie formowania kompleksu inicjacyjnego.

żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe.

łączy inicjatorowy tRNA z dużą podjednostką rybosomu w czasie inicjacji translacji

) Blokuje łańcuch boczny Met tak, że nie może ona oddziaływać z czynnikiem inicjacyjnym IF3.

Blokuje grupę aminową Met, dzięki czemu translacja zachodzie w kierunku N>C

Blokuje grupę aminową Met, dzięki czemu translacja zachodzi w kierunku C>N.

Pytanie 8

Które z podanych poniżej informacji są PRAWDZIWE dla inicjacji replikacji DNA w komórkach drożdży Saccharomyces cerevisiae?

Typowa sekwencja ARS jest zwykle dłuższa niż oriC w genomie E.coli

Kompleks ORC działa jako pośrednik pomiędzy miejscem inicjacji replikacji z sygnałami regulacyjnymi odpowiedzialnymi za koordynację inicjacji replikacji z cyklem komórkowym.

Typowa ARS, autonomicznie replikująca sekwencja, składa się z dwóch subdomen A i B1 które razem stanowią sekwencję rozpoznawaną przez białka inicjacyjne kompleksu ORC.

Identyfikacji sekwencji istotnych dla inicjacji replikacji DNA w tych komórkach dokonano stosując techniki badawcze wcześniej użyte do ustalenia sekwencji oriC bakteryjnego.

Topnienie struktury podwójnej helisy DNA w miejscu inicjacji replikacji zachodzi w obrębie subdomeny B3

Pytanie 9

Wybierz z podanych poniżej informacji te które są prawdziwe w odniesieniu do przekazywania sygnału biologicznego przez wniknięcie związku sygnalizacyjnego do komórki

rola glukozy, w odpowiedzi diauksycznej operonu laktozowego polega na tym że wywiera ona pośredni wpływ na aktywator kataboliczny (CAP, ang catabolite activator protein) dokonuje tego przez hamowanie aktywności cyklazy adenylowej

aktywatory transkrypcji, należące do nadrodziny receptorów jądrowych, są głównym celem dla hormonów steroidowych związków sygnalizujących wnikających do komórki i koordynujących szeroki zakres aktywności fizjologicznych u wyższych eukariontów.

laktoferyna, białko znajdowane w mleku ssaków, a w mniejszej ilości w krwioobiegu pełni rolę zewnątrzkomórkowego związku sygnalizującego, który może stymulować transkrypcję specyficznych genów.

bezpośrednie oddziaływanie związku sygnalizującego z białkiem regulacyjnym obecnym w komórce ma miejsce tylko w przypadku komórek eukariotycznyc

związek sygnalizacyjny, który jest białkiem, może działać, na przykład przez oddziaływanie z eksonowymi wzmacniaczami lub wyciszaczami składania RNA

Pytanie 10

Która z definicji jest prawdziwym opisem metylacji DNA de novo?

Metylacja DNA de novo, to przyłączenie grup metylowych do DNA w nowym miejscu, prowadzące do zmiany wzoru metylacji genomu.

Metylacja DNA de novo, to przyłączenie grup metylowanych do promotorów, aktywujące ekspresję genów.

Metylacja DNA de novo, to przyłączenie grup metylowanych do DNA, w miejscach komplementarnych do miejsc metylowanych w nici rodzicielskiej

Metylacja DNA de novo to u myszy proces metylacji zależny od metylotransferaz DNA kodowanych przez geny Dnmt3a i Dnmt3b.

) Metylacja DNA de novo skutkuje przyłączeniem grupy metylowanej do reszty G(guaniny)

Pytanie 11

Które z podanych poniżej informacji są prawdziwe w odniesieniu do wycinania intein?

Niektóre z intein są specyficznymi endonukleazami zdolnymi do usuwania specyficznej sekwencji DNA w allelu który nie zawiera sekwencji kodującej inteinę.

Inteina jest usuwana bezpośrednio po zakończeniu transkrypcji, czemu towarzyszy łączenie zewnętrznych segmentów, t.j ekstein.

Wycinanie intein jest odpowiednikiem wycinania intronów z pre-mRNA

Inteina to zewnętrzny lub wewnętrzny fragment białka usuwany przez cięcie proteolityczne prowadzące do powstania aktywnego białka

Większość intein zidentyfikowano w białkach wyższych eukariotów

po wycięciu inteiny, eksteiny łączone są przez specyficzną ligazę białkową

Pytanie 12

Której z wymienionych niżej modyfikacji mogą podlegać histony?

Acetylacja

Przemieszczenie trans

remodelowanie

Metylacja

Ubikiwitynacja

sumoilacja (dołączenie białka SUMO)

Pytanie 13

Co wchodzi w skład promotora u Procaryota?

kaseta Pribnowa

kaseta CAAT

sekwencja zawierająca wiele reszt purynowych

rejon –35

kaseta Hognessa

Pytanie 14

Metody stosowane w inżynierii genetycznej?

RLFP

Kosmidy

Klonowanie DNA

Biblioteki genomowe

Yac-I

Southern

Pytanie 15

Rzęski u eucaryota, budowa, mechanizm:

ramiona podwłókien A są zbudowane z dyneiny wykazującej aktywność ATPazową

poszczególne pary mikrotubul są trzymane razem przez łączniki zbudowane z dyneiny

siła powstająca przez mostki poprzeczne między A i B

dyneina przyłącza się do A

ramiona podwłókien A i B przyłączone są do kinezyny

gł. Składnikiem włókien rzęsek komórek eucaryotycznych są mikrofilamenty tubulinowe, które wchodzą w skład podstawowej wiązki włókien zwanej aksodyskiem

Pytanie 16

Miozyna, meromiozyna lekka (LMM) i meromiozyna ciężka (HMM):

HMM tworzy filamenty, brak aktywności ATPazy

LMM nie tworzy filamentów

HMM nie tworzy filamentów

LMM tworzy filamenty, brak aktywności ATPazy

Fragment S1 HMM - jest ATPazą, ale nie jest zbudowana z mikrotubul aktynowych

Pytanie 17

Replikacja DNA u procaryota:

nie potrzebują ATP

gyraza wymaga ATP, odpowiada za superskręty

Jest semikonserwatywna

odp z SSB

topoizomeraza I tnie dwie nici, topoizomeraza II tnie jedną nić

Pytanie 18

Główny układ zgodności tkankowej

kodowane przez HLA

MHC II- cd8

MHC I- cd 4

układ zawiera 3 grupy MHC I, MHC II, MHC III

są polimorficzne i odrzucają przeszczepy

Opryszczka

Pytanie 19

PCR

białaczka

potrzebuje dwóch starterów komplementarnych do siebie jak w metodzie dideoksy

pozwala na wykrycie niewielkich wirusów

3 etapy etap drugià temperatura nie zalezy od długości startera; od długości startera zależy czas trwania drugiego etapu

coś z rearanżacjami chromosomów

wymaga polimerazy DNA i czterech deoksynukleotydów

Pytanie 20

Przeciwciała wytwarzane przez człowieka:

Różne rodzaje przeciwciał powstają przez ..

V,D,J,C

Różne ramki odczytu

10^8

Pytanie 21

Kierowanie białek które ze stwierdzeń na temat sekwencji sygnałowych są poprawne:

cząsteczka rozpoznająca sygnał (SRP) jest białkiem składającym się z 7 a helis/ łańcuchów polipeptydowych

Cykl ATPADP... sekwencję sygnałową z SRP i odłącza ją od …

uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu

Rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błonę

SRP zapobiega przedwczesnej elongacji, a przez to fałdowaniu się białka

wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie są odcinane po przejściu przez błonę ER

Pytanie 22

Które zdania na temat struktury DNA są prawdziwe:

temp topnienia jest odwrotnie proporcjonalna do długości łańcucha

guanina paruje się z cytozyna poprzez 3 wiązania wodorowe

deoksyryboza ma przy węglu 2’ wolną grupę OH

dwuniciowe RNA może przyjmować strukturę A DNA

jeżeli A+G =30% to T może być więcej niż 20%

komplementarne pary tworzą się pomiędzy puryna i puryną oraz pirymidyną i pirymidyną

zasady w superhelisie są wewnątrz helisy

połączenie zasady z cukrem nosi nazwę nukteozydu

efekt hiperchromowy - efekt podczas topnienia DNA, który powoduje podwyższenie absorbancji przy długości fali 260 nm

adenozyna i guanina wiąże się przez N9 z C1 deoksyrybozy wiązaniem N--glikozydowym , a cytozyna i tymina przez N-1 z C1

Pytanie 23

Sygnały rozpoczynające i kończące sygnał:

heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w terminacji transkrypcji niektórych genów E.coli

u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki

sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka alfa polimerazy RNA

typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA

mRNA policistronowe

promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA

Pytanie 24

Translacja u procaryota

czynnik elongacyjny Ts (EFTs) wiąże nukleotyd GTP, przez co w wyniku hydrolizy uwalnia się GDP

fMet-tRNAf zajmuje miejsce P jako jedyne

formylometionylo-tRNAf powstaje w reakcj

peptydylotRNA może znajdować się zarówno w miejscu P lub A rybosomu, w zależności od fazy cyklu translacyjnego

mRNA policistronowe

poszukiwanie pierwszego kodonu AUG od 5’ końca transkryptu hydrolizującego ATP

czynnik elongacyjny Tu(EFTu) oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacetylotRNA oprócz fMet-tRNAf

fMet-tRNAf inicjatorowy wiąże się w przeciwieństwie do...

Pytanie 25

Degradacja eukariotycznych RNA:

może zależeć od sekwencji znajdujących się w obrębie transkryptu

może przebiegać według mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA, który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych.

może przebiegać, w procesie, w którym następuje usuwanie czapeczki mRNA skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcucha Poli(A), co z kolei prowadzi do braku translacji i szybkiego trawienia eksonukleolitycznego.

powoduje, że eukariotyczne mRNA są cząsteczkami żyjącymi dłużej niż ich odpowiedniki bakteryjne, jednak z typowym okresem półtrwania rzędu 10--20 minut

w prawidłowej, niezmienionej komórce skutkuje powstaniem krótkich interferujących RNA o długości 21--28 nukleotydów

może zależeć od szlaku, którego jednym z elementów są cząsteczki RNA o strukturze spinki do włosów, powstające z prekursorowego RNA, syntezowanego przez polimerazę RNA II.

Pytanie 26

Jeden/jednym z typowych promotorów E. Coli poddano, wraz z kontrolowanym przez ten promotor genem gruntownym badaniom, korzystając z odpowiednich metod biologii molekularnej. Poniżej przedstawione są wybrane wnioski jakie sformułowano po ich przeprowadzeniu. Wybrać te które są zgodne z AKTUALNYM stanem wiedzy:

rdzeń polimerazy RNA rozpoznaje sekwencję promotora i łączy się z nim

wzbogacenie sekwencji -10 w pary GC wpływa na proces rozpoznania promotora przez podjednostkę polimerazy RNA

w zamkniętym kompleksie promotorowym polimeraza pokrywa ok. 80 pz, rozpoczynając powyżej bloku 35 i kończąc poniżej bloku 10

zmiana sekwencji bloku/kasety -35 promotora ma bezpośredni wpływ na przekształcenie zamkniętego kompleksu promotorowego w kompleks otwarty

w trakcie eksperymentów prowadzonych in vitro nie zaobserwowano powstawania krótszych niż spodziewany, transkryptów.

Rozpoczęcie elongacji towarzyszy zmiana konformacyjna holoenzymu polimerazy RNA skutkiem czego pokrywa ona mniejszy odcinek DNA (30--40bp).

Pytanie 27

Bardzo często polipeptyd uwalniany z rybosomu jest nieaktywny i zanim będzie mógł spełniać swoją funkcję w komórce musi być poddany obróbce potranslacyjnej. Z podanych poniżej wybrać te, które są PRAWDZIWE w odniesieniu do obróbki potranslacyjnej.

białka opiekuńcze decydują o trzeciorzędowej strukturze białek

niektóre białka syntezowane są jako poliproteiny, długie polipeptydy zawierające kilka białek połączonych ze sobą jedno za drugim, sposobem głowa-ogon; zdarza się, że sekwencje kodujące poszczególne produkty (białka) zachodzą na siebie

nie jest możliwe, aby niewłaściwie sfałdowane białko przyjęło właściwą dla siebie konformację

niektóre z intein posiadają aktywność endonukleazy, która może specyficznie przeciąć gen nie zawierający inteiny, co jest wymagane do ukierunkowanego przemieszczania się sekwencji intronu inteiny

gdyby w komórce proces fałdowania polipeptydu przebiegał, gdy dostępna jest tylko jego część, to mogłoby zmniejszyć prawdopodobieństwo występowania nieprawidłowych odgałęzień ścieżki fałdowania

inteina, to wewnętrzny fragment białka usuwany po translacji z jednoczesnym połączeniem fragmentów go otaczających

Pytanie 28

Które z poniższych twierdzeń dotyczących telomerazy ssaków jest PRAWDZIWE?

Żadna z powyższych odpowiedzi nie jest prawdziwa

Terapia powodująca inaktywację telomerazy powinna być stosowana w walce z rakiem tylko wtedy, gdy aktywacja telomerazy jest przyczyną powstawania raka, a nie skutkiem

Telomeraza syntezuje tylko jeden z łańcuchów polinukleotydowych telomeru korzystając z matrycy bogatej w reszty G

Aktywność telomerazy jest kontrolowana przez białko TRF1 promujące tworzenie struktury telomerów typu pętli t.

Telomeraza jest polimerazą DNA zależną od RNA

Telomeraza jest aktywna w wybranych typach komórek,- enzym jest aktywny w komórkach embrionalnych, natomiast po urodzeniu jego aktywność przejawia się w komórkach rozrodczych i macierzystych.

Telomeraza jest aktywna w wybranych typach komórek np. w komórkach hemopoetyczych szpiku kostnego

Pytanie 29

Problem topologiczny dotyczy którego z następujących zagadnień?

Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów DNA opisuje grupa toponemiczna

Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów dsDNA opisuje grupa plektonemiczna

Rozwijanie dsDNA i rotacja cząsteczki DNA

Zablokowanie miejsc replikacji DNA przez nukleosomy

Trudności związane z syntezą DNA na nici opóźnionej

Synchronizacja replikacji DNA z podziałem komórkowym

Pytanie 30

Standardowy mechanizm syntezy białka polega na przesuwaniu się rybosomu względem mRNA dokładnie kodon za kodonem. Są znane jednak nietypowe zjawiska zachodzące podczas elongacji. Poniżej podane zostały informacje na ich temat – zaznaczyć prawdziwe

pominięcie translacyjne zaczyna się i kończy zawsze na dwóch identycznych kodonach.

wskutek pominięcia translacyjnego z jednego mRNA mogą być syntezowane dwa różne białka

zmiana fazy odczytu polega na tym, iż w czasie translacji mRNA rybosom zatrzymuje się, przesuwa o jeden kodon do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację

poślizg rybosomu umożliwia jednemu rybosomowi translację wybranych fragmentów mRNA policistronowego, np. mRNA operonu laktozowego.

zaprogramowana zamian fazy odczytu występuje wyłącznie w bakteriach

w przypadku kilku mRNA obserwuje się zaprogramowaną zmianę fazy odczytu, zmieniającą fazę odczytu w specyficznym miejscu transkryptu

Pytanie 31

Które z podanych poniżej informacji są PRAWDZIWE w odniesieniu do domeny C końcowej (CTD) największej podjednostki polimerazy RNA II

U ssaków CTD zawiera 52 powtórzenia siedmioaminokwasowej sekwencji Tyr--Ser--Pro--Thr--Ser--Pro--Ser. Dwie z reszt Pro w każdym powtórzeniu mogą być modyfikowane przez dodanie grup fosforanowych –

Kompleks białkowy zwany mediatorem bezpośrednio aktywuje inicjację transkrypcji przez fosforylację CTD

Jej fosforylacja warunkuje przyłączenie się polimerazy do kompleksu preinicjacyjnego

CTD jest zaangażowane w oddziaływanie z czynnikami białkowymi biorącymi udział w procesach molekularnych towarzyszących terminacji transkrypcji

Wieloskładnikowy kompleks białkowy, tzw. Czynnik specyficzności cięcia i poliadenylacji (CPSF), pozyskiwany do kompleksu polimerazy jest już na etapie inicjacji transkrypcji i wchodzi w kontakt z CTD. CPSF pozostaje związany z CTD do czasu pojawienia się sekwencji poliA w transkrypcie.

Status jej fosforylacji jest stały podczas trwania procesu transkrypcji – zmienia się na etapie inicjacji, podczas trwania transkrypcji jest taki sam

Pytanie 32

Zakończenie transkrypcji bakteryjnej:

Żadne z powyższych stwierdzeń nie jest prawdziwe

Może być zależne od białka Rho, które posiada aktywność helikazy, dzięki czemu może ono aktywnie „rozbijać” pary zasad, w tym przypadku pomiędzy matrycą a ciągiem reszt U struktury spinki do włosów transkryptu

Mniej więcej w połowie przypadków następuje w obrębie sekwencji nici matrycowej DNA, która zawiera sekwencję odwróconego palindromu

Poprzedzone jest nieciągłym procesem transkrypcji

Może być skutkiem specjalnego rodzaju kontroli zależnego od sprzężonych ze sobą procesów syntezy transkryptu i biłaka – bakteriofag lambda – syntezowane białka są antyterminatorami dzięki czemu bakteriofag może przejść w kolejną fazę

Może być kontrolowane przez tzw. Białko antyterminacyjne, którego obecność zapobiega, na przykład, zatrzymaniu się polimerazy przy terminatorze zależnym od białka Rho.

Pytanie 33

Które z podanych poniżej twierdzeń są PRAWDZIWE dla zjawiska replikacji DNA w komórkach eukariotycznych ?

Żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe

Zakończenie syntezy fragmentu Okazaki wymaga usunięcia sekwencji startera odpowiednią polimerazą posiadającą aktywność egzonukleazy

Enzymy i pozostałe białka biorące udział w replikacji tworzą duże struktury wewnątrzjądrowe tzw. fabryki replikacyjne, z których każda zawiera odpowiednik bakteryjnego replisomu

Chromatydy siostrzane są aż do stadium anafazy dzięki kohezynom, które dołączane są do nowych nici DNA natychmiast po przejściu przez widełki replikacyjne.

Polimeraza DNA kopiująca nić opóźnioną tworzy kompleksy dimeryczne

Koniec 5’startera używanego przez polimerazę DNA zawiera resztę 5’ fosforanową , blokuje aktywność enzymatyczną nukleazy oznaczanej skrótem FEN1

Pytanie 34

Jaki stan metylacji wysp CpG charakteryzuje geny metabolizmu podstawowego (housekeeping genes)?

Żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe.

Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów nie są metylowane.

Te geny z reguły nie są położone w sąsiedztwie wysp CpG

Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów charakteryzuje wysoki poziom metylacji.

Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów są metylowane w niektórych tkankach, ale nie we wszystkich.

Wyspy CpG nie są metylowane tylko w tych tkankach, w których specyficznej ekspresji ulega sąsiadujący z nią gen metabolizmu

Pytanie 35

Które z poniższych twierdzeń są prawdziwe w odniesieniu do piętnowania genomowego

piętnowaniu podlegają tylko geny kodujące białka.

funkcją piętnowania jest to, że DNA pary alleli (obu jednocześnie) homologicznych podlega metylacji, co skutkuje brakiem ich ekspresji

jest to bardzo często występująca cecha genomów ssaków

Skutkiem piętnowania jeden gen z pary alleli ulega ekspresji, drugi jest metylowany i wyciszany.

jeden z pary alleli ulega metylacji w procesie zależnym od tzw. elementów kontrolujących piętnowanie

żadna z odpowiedzi nie jest prawdziwa.

Pytanie 36

Jeśli komórka diploidalna ma 4 chromosomy X to ile chromosomów X będzie transkrybowanych?

dwa

jeden

To się zmienia mogą być dwa lub jeden

To się zmienia mogą być trzy albo dwa

cztery

trzy

Pytanie 37

Które z poniższych twierdzeń opisują funkcje jąderka

jest miejscem obróbki cząsteczek mRNA

jest rusztowaniem chromosomowym zmieniającym swoją strukturę w czasie podziału komórki co prowadzi do kondensacja chromosomów

jest miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNA

jest miejscem ekspresji genów kodujących białka

jest miejscem syntezy i obróbki cząsteczek rRNA

est miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNAII

Pytanie 38

Które zdanie prawidłowo opisuje składanie RNA w układzie trans ?

Składanie w układzie trans jest powszechnym zjawiskiem w odniesieniu do transkryptów genów człowieka.

Odbywa się pomiędzy eksonami zawartymi w obrębie różnych cząsteczek RNA.

Składanie w układzie trans zachodzi w sposób podobny do składania przebiegającego z wycinaniem intronów GUAG, z tym że zamiast lassa tworzona jest struktura widełek.

Niektóre RNA uczestniczące w tym procesie zawierają informację z dwóch genów, co skutkuje jednoczesną translacją, prowadzącą do dwóch produktów białkowych

Sekwencje intronowe nie są usuwane z transkryptów RNA i podlegają translacji do białek.

Następuje zastąpienie wybranych eksonów w niektórych transkryptach przez ekson liderowy

Pytanie 39

W jaki sposób zachodzi zmiana fazy odczytu w czasie translacji?

Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji przesuwa o jeden kodon do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.

Rybosom kończy translację na kodonie, który koduje aminokwas.

Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji, przesuwa o jeden nukleotyd do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.

W czasie translacji cząsteczek RNA rybosomu pomija kodon.

Rybosom dochodzi do końca sekwencji kodującej, uwalnia właściwie zsyntezowane białko i rozpoczyna syntezę nowego białka począwszy od następnego kodonu inicjacyjnego.

Rybosom przeprowadza translację cząsteczki tRNA, która zawiera jeden dodatkowy nukleotyd lub brakuje w niej nukleotydu

Pytanie 40

Zakończenie (terminacja) transkrypcji bakteryjnej:

może być zależne od białka Rho, które posiada aktywność helikazy, dzięki czemu może ono aktywnie ‘rozbijać’ pary zasad pomiędzy matrycą a ciągiem reszt Ustruktury spinki do włosów transkryptu

może być skutkiem specjalnego rodzaju kontroli, zależnego od sprzężonych ze sobą procesów syntezy transkryptu i białka

następuje mniej więcej w połowie przypadków w obrębie sekwencji nici matrycowej DNA, która zawiera sekwencje odwróconego palindromu.

Poprzedzone jest nieciągłym procesem transkrypcji , podczas którego polimeraza dokonuje wyboru pomiędzy kontynuowaniem elongacji a terminacją

Może być kontrolowane przez tzw. białko antyterminacyjne, którego obecność zapobiega, np. zatrzymaniu się polimerazy przy terminatorze zaleznym od białka Rho

Pytanie 41

Degradacja drożdżowych mRNA:

może przebiegać w procesie w którym następuje usuwanie czapeczek skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcuchów poliA, co z kolei prowadzi do braku translacji mRNA i szybkiego i szybkiego trawienia eksonukleotydów

może przebiegac wg mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA (RNA surveillance), który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych

może zachodzić w kierunku od 5’ do 3’ lub 3’ do 5’ w odróżeniniu od degradacji w komórkach bakteryjnych, która zawsze zachodzi w kierunku od 3’ do 5

w prawidłowej, niezmienionej komórce (tzn. niezainfekowanej wirusami i nietransformowanej egzogennym DNA) może być skutkiem wyciszania RNA (interferencji RNA)

może uczestniczyć w procesie, w którym uczestniczy wielobiałkowy składnik zwany egzosomem, który degraduje mRNA przy udziale spokrewnionych z enzymami bakteryjnego degradosomu.

może zależeć od obecności tzw. elementów niestabilności, znajdujących się w obrębie transkryptu

Pytanie 42

Remodelowanie nukleosomu to jeden ze sposobów/typów modyfikacji struktury chromatyny:

które może skutkować tzw. przemieszczeniem cis, skutkujący transportem(?) nukleosomu na inną cząsteczkę DNA

który jest bezwzględnie konieczny dla rozpoczęcia transkrypcji genu

który jest indukowany przez zależny od energii proces osłabiający oddziaływania pomiędzy nukleosomem i związanym z nim DNA

który wiąże się z intensywnymi modyfikacjami chemicznymi histonów

który zachodzi przy udziale złożonych kompleksów białkowych np. Swi/Snfi i wpływa na ekspresję całego genomu

Żadne nie jest prawdziwe

Pytanie 43

Cechy charakterystyczne mRNA eukariota

Posiadają na końcu 3’ ogon poliA , nie kodowany przez matryce

Translacja jest sprzężona z transkrypcja i zachodzi w tym samym czasie

Zazwyczaj powstają z premRNA

Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG

Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG lub pppG

Pytanie 44

Odwrotna transkryptaza

polimeraza DNA zależna od RNA

odwrotna transkryptaza RNA zależna od DNA

Replikaza RNA- - polimeraza RNA zależna od RNA

polimeraza DNA zależna od DNA

2-niciowy RNA wbudowuje się do genomu

wirusowa czy komórki gospodarza

organizmy eukariotyczne mogą korzystać z retrowirusa zmieniać metabolizm

powstaje hybryda DNA – RNA

Pytanie 45

SPLAJSING

gr 1 jest u Procaryota gr 2 u Eucaryota – u prokariota nie ma splicingu bo nie ma intronów

w splicuinu gr 1 następuje atak guaniny lub guanozyny ma na 2’ OH

splajsing autokatalityczny grupy 1 wymaga guaznozyny lub guanylanu i wiąże się do miejsca splajsingowego 3

w splicosomie u wszystkich Eukariotów uczestniczą katalityczne cząsteczki snRna

Pytanie 46

Histony – modyfikacje potranslacyjne na końcu N’

tylko Lys ulega acetylacji w ogonach hisonowych

wystawienie ogonów na działanie acetylaz

regulacje dotyczące histonów noszą nazwę kodu histonowego

kod histonowy – było coś o tym, że kod histonowy jest informacją czy zbiorem informacji o modyfikacjach czy coś takiego

w heterochromatynie acetylacja N-końców

w euchromatynie acetylacja N-końców

Pytanie 47

Operon laktozowy

gen Y koduje βgalaktozydaze

katalizuje syntezę laktozy z glukozy i galaktozy

coś tam że jak się łączy z kompleksem CAP-cAMP w miejscu operatorowym

tworzy się jeszcze permeaza i transacetylaza

IPTG jest induktorem metabolizowanym przez B-galaktozydazę

tworzy wiązanie 1,6 βglikozydowe w allolaktozie

przyłącza się cAMP

katalizuje tworzenie glukozy i czegoś tam jeszcze

Pytanie 48

Enzymy restrykcyjne pocięto jakiś liniowy odcinek DNA enzymem EcoRV , obraz po elektroforezie uwidoczniono na żelu , Co możesz powiedzieć na podstawie rysunku 17 poniżej , żel wybarwiono bromkiem etydyny , zwróć uwagę na słabo rozdzielone elementy o długościach 433 i 415 pz

Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o dług. 2220pz

Na tym odcinku DNA znajduje się 5 unikalnych mc restrykcyjnych rozpoznawanych przez enzym

Metoda ta może być stosowania do produktów ekspresji metody Sangera

Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o dług. 210pz

Żadna z powyższych nie jest prawdziwa

W żelu znajduje się bromek etydyny

Pytanie 49

Co jest wymagane do przeprowadzenie reakcji Sangera ale chodziło o to że jest obecny zawsze w jednym z odczynników?

polimeraza DNA (I)

ά-P32-ATP

matryca

jeden z 4 dNTP

Pytanie 50

Chcesz syntezować nić DNA co jest do tego NIEZBĘDNE?

jon magnezu

aktywność egzonukleazowa 3’--5

wszystkie 4 dNTP

matryca komplementarna do startera

matryca 1 lub 2 niciowa

starter z 3’-OH

wszystkie 4 NTP

polimeraza DNA

Pytanie 51

represora λ

wiąże specyficznie do sekwencji DNA rozpoznawanych przez białko cro

koduje represor lambda i cro

przyłącza się do ssDNA –

koduje represor lambda tylko w fazie lizogennej

rożne powinowactwo do miejsc OR

łączy się z OR3

rożne powinowactwo przez białko lex A

wiąże jako monomer

w swoim cyklu lizogennym ma taki okres ze powstaje hybryd DNA-RNA faza lizogenna jest utrzymywana dzięki działaniu represora lambda

ma miejsce wiązania ara

cro przyłącza się do OR 1 i hamuje represor lambda

Pytanie 52

Pytanie dotyczące usuwanie deaminowanej Cytozny do uracylu w DNA

czy da to mutację CG – AT w niciach potomnych

jeżeli jest w mRNA to w znaczący sposób wpływa na ekspresję

enzymy usuwające tą mutacje – proces naprawy – glikozydaza uracylowa, potem endonukleaza AP, polimeraza DNA i ligaza na końcu

mutacje w DNA są widoczne we wszystkich następnych pokoleniach

tymina jest obecna w RNA, mimo że koszt energetyczny syntezy jest większy niż w uracylu, występującym w RNA

jest to spontaniczna modyfikacja prowadzi do powstania nowych kodonów

Pytanie 53

Pytanie o kod genetyczny

nie ma znaków przecinkowych

jest uniwersalny jego uniwersalność jest prawie absolutna

ma 64 kodony kodujące 20 aminokwasów

jest zdegenerowany, bo w różnych organizmach kodują inny aminokwas

3 kodony kodujące 1 aminokwas to synonimy

Pytanie 54

Holoenzym polimerazy RNA

ma po 1 podj. Alfa, beta, gamma i delta 2alfa, 1beta, 1 beta’, 1sigma

bierze udział w inicjacji elongacji i terminacji

wiąże się specyficznie z matrycą

łączy się z miejscem promotorowym dopiero po oddysocjowaniu jednej z podjednostek-

Pytanie 55

Redagowanie RNA

Zachodzi przy udziale enzymów, np. polimerazy poli(A)

dodatkowa zmiennosc genetyczna

zachodzi autokatalitycznie

zwiększa różnorodność genomu

Zachodzi już po transkrypcji

Pytanie 56

Represory transkrypcji u Eucaryota

przyłączają się do rejonów cis a same są trans

mają budowę modułową

mają 2 rejony wiążące

np. deacylacja N-końców histonów

Pytanie 57

TOPOIZOMERAZY

wymagają ATP

topoizomerazy 1 rozcina 2 nici, a topoizomerazy 2 jedną nić

żadna poprawna

5’ P laczy się z ε Lys

zmieniają liczbę opleceń

5’-P łaczy się z -OH Ty

przekształcają topoizomery, rozcinają DNA

Pytanie 58

Immunoprecypitacja

przeciwciało łączy się do Lys na N’ końcu

mają więcej etylowanych reszt

ukazane rejony są aktywne transkrypcyjnie

dotyczy to euchromatyny

Pytanie 59

Bakteriofag λ w fazie litycznej

N powoduje produkcję białka niezbędnego do replikacji DNA faga i rekombinacji

tworzą produkty genów N i Q, które działają jako białka regulacji pozytywnej, prowadzące sekwencyjną λ- kodującego białka

niosą programowaną syntezę białek potrzebnych do replikacji genów i produkcji ich strukturalnych komponentów

Q potrzebne, gdy są transkrybowane geny białka główki i ogonka wirusa oraz białka konieczne do lizy komórki gospodarza

syntetyzuje 3 rożne klasy mRNA, które są wyznaczane poprzez czas po infekcji ich pojawienia

N i Q zapobiegają końcu transkrypcji

początkowo produkuje dwie cząsteczki jądra, pełni rolę inhibitora syntezy λ represora, a inną gra rolę końca transkrypcji

Pytanie 60

β-galaktozydaza

tworzy wiązanie 1,6-β oligosacharydu allolaktozy

jej poziom wzrasta w koordynacji z permeazą galaktozydową i acetylofransferazą tiogalaktozydową

est allosterycznie aktywowana przez niemetaboliczny składnik IPTG

obecna w różnych stężeniach zależnie od źródła węgla używanego do wzrostu

jest produkowana z jednostki genu zwanej operonem

hydrolizuje wiązanie 1,4-β oligosacharydy laktozy i tworzy galaktozę i glukozę

Pytanie 61

Które z następujących zdań określa podwójną helisę DNA typu Watson-Crick?

skład zasad analizowany z DNA wielu organizmów pokazuje, że ilość A i T jest równe, tak jak ilość G i C

helisa ma pełny obrót o 34 st., bo każda para obraca się o 36 st. względem sąsiedniej pary zasady i oddalonego 3,4 A

dwa polinukleotydowe łańcuchy są zwinięte wokół wspólnej osi

można zmieniać sekwencje w jednej nici niezależnie od drugiej nic

tworzy pary A-C i G-T

puryny i pirymidyny znajdują się w wewnętrznej stronie helisy, a szkielet fosfodiestrowy na zewnątrz

Pytanie 62

Bardzo długi odcinek DNA z genu Eukariota

może być wydzielana z chromosomów sztucznych drożdży

musi posiadać końce kohezyjne do klonowania

może być analizowany przez wędrówkę wzdłuż chromosomu

może być pakowany w fag

mogą być odseparowane przez elektroforezę w żelu poliakryloamidowym

Pytanie 63

Ligaza DNA

mechanizm katalizowanej reakcji wymaga utworzenia związania kowalencyjnie enzym-adenylan

katalizuje reakcje przez mechanizm który wymaga aktywacji fosforanem DNA przez formowanie wiązania fosfobezwodnikowego z AMP

wymagana w replikacji DNA naprawy i rekombinacji

katalizuje tworzenie się wiązania 3’-OH i 5P

wymaga kofaktora NAD+ albo ATP zależnie od źródła enzymu, dostarcza energii do tworzenia wiązań fosfodiestrowych

Pytanie 64

Kompleks cAMP-CAP

w operonie ora wpływa na geny struktury

chroni przez DNAza -87 do -47

chroni miejsca -48 do -5

po jego związaniu do atenuatora trp może być transkrypcja genów struktur

represor transkrypcj

w obecności arabinozy wpływa na geny struktury

Pytanie 65

Bialko C operonu ara

wiąże się specyficznie z DNA w obecności arabinozy

wiąże araO2 aktywując geny struktury

powoduje wypętlenie, gdy zwiąże się z araO2 i araI

wiąże z araO1 hamując transkrypcję genu

w obecności cAMP-CAP geny struktury operonu i związanie arabinozowego do araO1 i araI

Pytanie 66

Bakteriofag λ

zostaje uwolnione z chromosomu bakteryjnego z kompleksu rexDNA

gdy nic nie atakuje, zmienia to w fazie lizogenicznej jest on obecny z uwagi na represor, który ulega autoregulacji

ssDNA = recA oddziałuje z nim także represor λ

profag (DNA) jest także lizogenicznej, gdy nie aktywuje zmiany bo represor λ …

białko cro wiąże się do or3 i wtedy hamuje represor (gen c1)

syntetyzuje tylko represor λ w bakterii lizogenicznych

białko cro związane z or1 to hamuje syntezę represora

Pytanie 67

Operon arabinozowy

może syntezować arabinozę przy wykorzystaniu białek powstałych z białek struktury

cAMP-CAP i arabiznoza może przeprowadzać transkrypcje genów struktury, nieznacznie obniżają szybkość

w obecności cAMP-CAP i arabinozy nie da się zapętlić

konstutywna synteza białka C

Pytanie 68

tRNA

zbudowany z helikalnych końców tworzących literę U

zawiera ACC, gdzie przyłączone aminokwasy

wiele zmodyfikowanych nukleotydów

duża cześć jest sparowana

CCA na końcu 3’

antykodon i miejsce wiązania aminokwasu na przeciwległym końcu

zawiera od 70-90 nukleotydów

Pytanie 69

Translacja mRNA u Prokaryota

EF-Ts wiąże nukleotyd podlegający hydrolizie

mRNA policistronowe

czynniki elongacyjne EF-Ts i EF-Tu

miejscem translacji jest kodom met AUG za sekwencją bogatą w puryny komplementarną do 16s tRNA

formylometionylo-tRNA powstaje w reakcji

Tu oddziałuje z tRNA oprócz fMet-tRNA

Pytanie 70

Histony

mRNA histonowe ulega adenylacji

białka kodowane przez pojedyncze kopie genów

H1 rdzeń nukleosomu

histony wiążą się z nicią wiodącą

140 par zasad otacza 8 białek histonowych

sekwencje powtórzeniowe to znaczny % DNA eukariotycznego

białka aktywatorami transkrypcji podjednostek

replikacja eukariotycznego chromosomu to kilka widełek

geny kodujące histony wielokrotnie powtórzone

białka histonowe H1, H2A, H2B, H3, H4

histony nie maja intronów

silnie zasadowe białka, ładunek ‘+’

Pytanie 71

Telomerazy

RNA jest matrycą

odwrotna transkryptaza 5’🡪3’

mają aktywność polimerazy RNA

nie uzupełniają nici opóźnionej

wymaga matrycy

syntezuje nić bogatą w G

syntezuje nic w kierunku 5’🡪3’

Twój wynik: ozi <3

Twój wynik