Podsumowanie: Oczyszczanie i metody badań makrocząsteczek życia

Pytanie 1

Do metod cytogenetyki klasycznej zaliczamy metodę:

B. cytometrię przepływową

D. HRT

C. FISH

A. ASO

Pytanie 2

Metody cytogenetyki klasycznej to:

a. FISH, cytometria przepłyowowa

d. RDG, QFQ

c. GTG, RBA

b. QRC, CBG

Pytanie 3

Stwierdzenie czy konformacja białka zmienia się pod wpływem dołączanych ligandów UMOŻLIWIA metoda:

C: cytometria przepływowa

D: elektroforeza w żelu agarozowym

B: spektroskopia dichroizmu kołowego (CD)

A: ekstrakcja fenol-chloroform

Pytanie 4

Która z technik NIE jest stosowana w cytogenetyce molekularnej:

C: barwienie odczynnikiem Giemzy

D: analiza widmowa kariotypu

B: cytometria przepływowa

A: fluorescencyjna hybrydyzacja in situ

Pytanie 5

Sonikacja to metoda homogenizacji która polega na:

C. poddaniu ich zawiesiny wysokiemu ciśnieniu

A. wykorzystaniu materiału rozbijającego w postaci kulek, które umieszczone są w homogenizowanej zawiesinie

B. rozbiciu komórek dźwiękiem o wysokiej częstotliwości

Pytanie 6

Typ chromatografii adsorpcyjnej w której wykorzystuje się swoistość wiązania się dwóch substancji to

B. chromatografia kolumnowa

C. chromatografia żelowa

A. chromatografia powinowactwa

Pytanie 7

Elektroforeza jest zjawiskiem polegającym na:

a. Oczyszczeniu otrzymanych białek za pomocą żelowych ziaren

c. Rozdziale białek przy użyciu błony półprzepuszczalnej

d. Migracji cząsteczek obdarzonych ładunkiem elektrycznym pod wpływem przyłożonego napięcia elektrycznego

b. Rozbiciu komórek i tkanek (metoda homogenizacji)

Pytanie 8

Sonikacja to metoda homogenizacji, która polega na

a) Rozbiciu komórek dźwiękiem o wysokiej częstotliwości

b) Zwiększeniu przepuszczalności błony komórkowej za pomocą łagodnego detergentu

d) Przeciskaniu komórek przez mały otwór pod wysokim ciśnieniem

c) Rozdrobnieniu tkanki kulkami metalowymi wstrząsanymi z wysoką częstotliwością

Pytanie 9

Co jest metodą do RNA:

C: RT-PCR

A: Sage

B: homogenizacja

Pytanie 10

Aby uzyskać DNA z ekstraktów w chromatografii jonowymiennej:

d. ujemnie nałądowane złoże jest przepłukiwane 1M roztworem NaCl o pH 7,0 w celu zatrzymania DNA

c. -dodatnio naładowane złoże jest przepłukiwae 1M roztworem NacL Ph7 w celu wymycia DNA

a. -ujemnie nałądowane złoże jest przepłukiwane 1M roztworem NaCl o pH 7,0 w celu wymycia białek

b. -dodatnio naładowane złoże jest przepłukiwae 1M roztworem NacL Ph7 w celu wymycia białek

Pytanie 11

Po wirowaniu przez 10 min z prędkością 800 g, w osadzie znajdują się:

c. rybosomy

d. mitochondria

a. fragmenty błony komórkowej

b. jądra komórkowe i odpady komórkowe

Pytanie 12

W wirowaniu różnicowym, aby otrzymać w osadzie rybosomy należy wirować:

a. 15min, 20 000 g

d. 60 min , 100 000 g

b. 10 min, 800 g

c. 3 h , 150 000 g

Pytanie 13

Permeabilizacja to:

c) Przedziurawienie błony komórkowej łagodnym detergentem

b) Rozdrobnienie tkanki kulkami metalowymi

d) Rozbicie komórek dźwiękiem o wysokiej częstotliwości

a) Żadna z powyższych

Pytanie 14

Pierwszym etapem degradacji Edmana jest:

d. usunięcie fenyloizotiocyjanianu z próbki

a. elektroforeza w celu identyfikacji pierwszego aminokwasu

c. analiza chromatograficzna w celu identyfikacji pierwszego aminokwasu

b. dodanie fenyloizotiocyjanianu do próby

Pytanie 15

W metodzie chromatografii powinowactwa:

B. Można oczyścić białka ze względu na ich zdolność do łączenia się z substratem połączonym ze złożem chromatograficznym

D. można oczyścić kwasy nukleinowe oraz białka ze względu na ich masę cząsteczkową

A. można odczytać kwasy nukleinowe ze względu na ich ujemny ładunek

C. można oczyścić białka ze względu na ich punkt izoelektryczny

Pytanie 16

Które z poniższych stwierdzeń opisuje prawidłowo działanie chromatografii jonowymiennej:

d. na kolumnie anionowej zatrzymują się cząsteczki obojętne i kationy

c. na kolumnie anionowej zatrzymywane są tylko kationy, a cząsteczki obojętne i aniony wypływają z układu wraz z rozpuszczalnikiem

b. na kolumnie kationowej są zatrzymywane aniony, a kationy wypływają z układy wraz z rozpuszczalnikiem

a. na kolumnie kationowej zatrzymywane są tylko kationy, a cząsteczki obojętne i aniony wypływają z układu wraz z rozpuszczalnikiem

Pytanie 17

W przypadku chromatografii jonowymiennej rozdział białek odbywa się według:

b. stopnia glikolizacji białka

a. hydrofobowości białka

d. masy białka

c. wartości punktu izoelektrycznego

Pytanie 18

Płyn wymywający substancje zaabsorbowane na fazie stałej podczas chromatografii:

c. adsorbent

b. eluat

a. adsorbant

d. eluent

Pytanie 19

(...) prawoskrętne i lewoskrętne. Umożliwia to m.in. charakterystykę pofałdowania białka, porównywanie struktury i konformacji białek czy badanie stabilności konformacji białek pod wpływem stresu. Powyższy fragment opisuje:

c. spektroskopie NMR

a. krystalografię rentgenowską

d. Spektroskopię dichroizmu kołowego (CD)

b. chromatografię powinowactwa

Pytanie 20

jak nazywa się odmiana cieczowej chromatografii kolumnowej z użyciem eluentu pod wysokim ciśnieniem?

b. HPLC

d. GPC

c. TLC

a. DGGE

Pytanie 21

Wskaż eluenty stosowane w chromatografii cieczowej:

a. chloroform, aceton

c. acetonitryl, hel

d. woda, wodór

b. aceton, wodór

Pytanie 22

Metodami chromatografii można rozdzielić:

d) Wyłącznie białka

b) Wyłącznie cukry

c) Między innymi cukry, lipidy, aminokwasy, białka

a) Wyłącznie kwasy nukleinowe

Pytanie 23

W przypadku chromatografii żelowej (size exclusion) białko A opuściło kolumnę wcześniej niż białko B, świadczy to o tym, że:

B: wartość punktu izoelektrycznego dla białka A jest większa niż dla białka B

A: wartość punktu izoelektrycznego dla białka A jest większa niż dla białka B

D: białko A jest większe od białka B

C: białko A jest mniejsze od białka B

Pytanie 24

Wirowanie różnicowe NIE polega na:

b. Rozdziale składników na podstawie ich wielkości i gęstości

d. Elektrycznym rozdziale cząsteczek obdarzonych różnym ładunkiem

a. Wirowaniu ze stopniowo wzrastającą szybkością

c. Rozdziale w gradiencie sacharozy

Pytanie 25

Początkowy postęp w zrozumieniu dokładnej struktury rybosomu zawdzięcza się:

C: obserwacjom w mikroskopie

D: analizie składu rybosomów z zastosowaniem ultrawirowania

A: technice sekwencjonowania

B: wszystkim wymienionym

Pytanie 26

Stosując sedymentację szybkościową rozdziela się składniki ze względu na ich:

D. wielkość

C. hydrofobowość

B. ładunek

A. gęstość

Pytanie 27

Związki wykazujące maksimum absorbancji przy długości fali 230 nm:

a. fenol i białka

c. DNA i białka

b. fenol i EDTA

d. fenol i DNA

Pytanie 28

Stosując metodę izolacji DNA z wykorzystaniem metanolu i fenolu na granicy faz:

d. DNA

a. RNA i lipidy

b. RNA i DNA

c. białka

Pytanie 29

Stosując metodę izolacji DNA z wykorzystanie metanolu i fenolu, w fazie organicznej znajdziemy:

a) DNA

c) RNA i lipidy

d) Białka

b) RNA i DNA

Pytanie 30

W jakim celu dodawany jest błękit bromofenolu i glicerol do próbki białka poddawanemu elektroforezie:

B: do nadania białku ładunku ujemnego

D: do redukcji mostków disiarczkowych

A: do zwiększenia gęstości i intensywności zabarwienia próbki

C: związki te nie są dodawane do próbek białek poddawanych elektroforezie

Pytanie 31

Wizualizację produktów na żelu agarozowym po wykonaniu elektroforezy umożliwia:

A. lipofektamina

D. deksametazon

B. agaroza

C. bromek etydyny

Pytanie 32

Tempo migracji cząsteczek w żelu agarozowym:

d. odwrotnie proporcjonalne do wielkości cząsteczki DNA

c. wszystkie NIEPRAWIDŁOWE

a. proporcjonalne do wielkości cząsteczki DNA

b. niezależne od wielkości cząsteczki DNA

Pytanie 33

wskaż zdanie PRAWIDŁOWE:

d. elektroforezę w żelu poliakrylamidowym stosuje się do rozdziału cząsteczek np DNA z mniejszą dokładnością, gdyż ma mniejszą rozdzielczość niż w żelu agarozowym

a. żel poliakrylamidowy ma mniejsze pory niż żele agarozowe co umożliwia dokładny rozdział cząsteczek np. DNA w zakresie wielkości 10-1500bp

b. w elektroforezie w żelu agarozowym stosuje się jedynie żel 5% ponieważ poniżej żel tężeje

c. elektroforeza pozwala na rozdzielenie jedynie cząsteczek DNA

Pytanie 34

Wskaż zdanie BŁĘDNE dot. agarozy

a. w temperaturze pokojowej nieodwracalnie tworzy żel

d. izolowana jest ze ścian komórkowych krasnorostów

b. naturalny polisacharyd, zbudowany z pochodnych galaktozy

c. łatwo rozpuszcza się w wodzie

Pytanie 35

Założywszy, że mutacja wykrywana metodą RFLP wprowadza miejsce restrykcyjne, które pojawia się tylko w amplifikowanym fragmencie DNA to analizowany wzorzec prążków na żelu agarozowym to w przypadku heterozygoty:

c. jeden prążek, o wielkości odpowiadającej niepociętemu fragmentowi DNA

a. dwa prążki będące produktem całkowitego cięcia amplifikowanego fragmentu DNA

b. trzy prążki będące odpowiednio niepociętym fragmentem DNA oraz produktami cięcia

d. cztery prążki odpowiadające produktom cięcia fragmentu DNA

Pytanie 36

Do przeprowadzenia elektroforezy w żelu agarozowym STOSUJE SIĘ bufor

C. TAE

B. otrzymany z mleka w proszku

D. cyjankowy

A. bufor zawierający przeciwciała II rzędowe

Pytanie 37

Do sekwencjonowania DNA można użyć:

d) Żelów poliakrylamidowych

c) Żelów agarozowych

b) Metody Southerna

a) Mikromacierzy

Pytanie 38

Metoda umożliwiająca identyfikację białek na podstawie stosunku masy do ładunku:

a. spektroskopia mas

d. elektroforeza w żelu agarozowym

b. chromatografia hydrofobowa

c. permeabilizacja

Pytanie 39

Które ze zdań jest prawdziwe:

B. wielkość porów w żelu poliakrylamidowym zależy od nadsiarczanu amonowego i TEMEDU

D. żele poliakrylamidowe mają większe pory niż żele agarozowe

C. elektroforeza w żelu agarozowym umożliwia rozdzielenie jednoniciowych cząsteczek DNA różniących się długością o 1 nukleotyd

A. polimeryzacją roztworu akryloamidu zapoczątkowuje nadsiarczan amonowy, a katalizuje TEMED

Pytanie 40

Porządkując białka pod względem wielkości w czasie elektroforezy poliakryloamidowej w pionowym aparacie:

c. duże białka poruszają się szybciej ze względu na siły grawitacji

b. małe białka poruszają się szybciej ze względu na mniejszy opór żelu

a. duże białka poruszają się szybciej ze względu na większy ładunek elektryczny

d. małe białka poruszają się szybciej ze względu na mniejszy ładunek elektryczny

Pytanie 41

SDS i β-merkaptoetanol w elektroforezie w żelu poliakrylamidowym:

c. umożliwia rozdział białek w jednokierunkowej elektroforezie poprzez utworzenie kompleksów białek o tej samej masie cząsteczkowej i ładunku

a. powoduje nadanie dodatniego ładunku cząsteczkom białek i migracji w polu elektrycznym

b. powoduje rozdział wiązań dwusiarczkowych w obrębie białek (lub między nimi) i nadaniu cząsteczkom ujemnego ładunku

d. umożliwia rozdział białek pod względem różnicy ładunków

Pytanie 42

Wskaż zdanie POPRAWNIE opisujące elektroforezę w żelu poliakrylamidowym (białka i kawy nukelinowe)

c. żel poliakrylamidowy podczas elektroforezy ułożony jest horyzontalnie

b. w żelu poliakrylamidowym można rozdzielać wyłącznie białka

a. procentowość żelu poliakrylamidowego dostosowana jest do wielkości rozdzielanych białek

d. w żelu poliakrylamidowym można rozdzielać wyłącznie DNA

Pytanie 43

Wskaż zdanie POPRAWNIE opisujące metodę Western Blot:

C: W tej metodzie stosuje się wyłącznie przeciwciała pierwszorzędowe

D: Transfer białek odbywa się z jednego żelu poliakrylamidowego na drugi

A: Pierwszym etapem tej metody jest rozdzielnie mieszaniny białek w żelu poliakrylamidowym

B: Pozwala na wizualizację fragmentów DNA

Pytanie 44

Metoda diagnostyczna oparta o PCR, która zakłada iż pojedyncze różnice w sekwencji powodują zróżnicowaną migrację i charakterystyczne położenie w żelu poliakrylamidowym to:

C: Polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych ( RFLP ang. restriction fragment length polymorphism)

A: Hybrydyzacja z allelo-specyficznymi sondami oligonukleotydowymi (ASO ang. allele specific oligonucleotide)

B:Elektroforeza w żelu z gradientem czynnika denaturującego (DGGE, ang. denaturing gradient gel electrophoresis)

D: Polimorfizm konformacji fragmentów jednoniciowych (SSCP ang. single strand conformation polymorphism)

Pytanie 45

Metodą służącą do wykrywania określonych sekwencji RNA jest metoda:

D. Western blot

B. Nothern blot

C. Southern blot

A. Elisa

Pytanie 46

Spośród wymienionych poniżej technik badawczych, wskaż tą, w której NIE SĄ wykorzystywane przeciwciała:

C. ELISA

B. southern blot

A. immunoprecypitacja

D. Western blot

Pytanie 47

Do metod analizy białek NIE należy:

c. spektroskopia mas

b. hybrydyzacja in situ

a. Northern blotting

d. Western blotting

Pytanie 48

Która z poniżej wymienionych technika NIE BAZUJE na hybrydyzacji?

B: Western blot

C: Southern blot

D: FISH

A: Northern blot

Pytanie 49

W jakiej metodzie badawczej używany jest fosforan wapnia?

D: w hybrydyzacji DNA

A: w tranfekcji komórek

C: w elektroforezie

B: w metodzie Western Blot

Pytanie 50

Techniką genotypowania, która wykorzystuje endonukleazy restrykcyjne jest technika:

a) PCR

c) Sekwencjonowanie metodą Sangera

b) Western Blot

d) RFLP

Pytanie 51

Modyfikacje elektroforezy która umożliwia rozdział białek w gradiencie PH:

b. western blot

a. ogniskowanie izoelektryczne

c. elektroforeza w żelu agarozowym

d. cytometria przepływowa

Pytanie 52

Która z wymienionych metod służy do sekwencjonowania peptydów?

b. krystalografia rentgenowska

a. żadna z wymienionych

c. degradacja Sangera

d. degradacja Edmana

Pytanie 53

Technika umożliwiająca identyfikację różnej wielkości regionów lub całych chromosomów, dzięki powstawaniu w odpowiednich warunkach kompleksów DNA chromosomowego ze specyficzną sondą molekularną, to:

c. pirosekwencjonowanie

d. technika prążków G

a. hybrydyzacja in situ

b. mikromacierze SNP

Pytanie 54

W pirosekwencjonowaniu używa się:

A. polimerazy DNA, lucyferazy i apyrazy

C. lucyferazy, sulfurylazy ATP i fluorochromu

D. polimerazy DNA, lucyferazy i trifosforanów dideoksynukleotydów

B. hydrazyny, piperydyny i siarczaniu dimetylu

Pytanie 55

W przypadku sekwencjonowania DNA metoda Sanger’a kolejność nukleotydów w badanym DNA ustalamy poprzez:

b. analizę intensywności fluorescencji hybrydyzowanej sondy

d. analizę prążków reakcji PCR sekwencyjnego

a. analizę produktów cięcia enzymami restrykcyjnymi

c. analizę widma absorpcyjnego

Pytanie 56

Wskaż zdanie FAŁSZYWE, metoda terminacji wydłużania łańcucha to?

B. Metoda wykorzystująca jako substraty wyłącznie trifosforany deoksyrybonukletydów

C. Metoda wykorzystywująca polimerazę DNA, która ma zdolność do syntezy wiernej, komplementarnej kopii jednoniciowego DNA matrycowego

A. Metoda wykorzystująca jako substraty trifosforany deoksyrybonukletydów oraz trifosforany dideoksyrybonukleotydów

D. Inaczej sekwencjonowanie enzymatyczne metodą Sangera

Pytanie 57

Wskaż zdanie BŁĘDNIE opisujące pirosekwencjonowanie:

b. metoda ta nie wymaga zastosowania elektroforezy ani innego rozdzielania fragmentów

c. matryca jest kopiowana bez dodawania dideoksyrybonukleotydów do mieszaniny reakcyjnej

a. w wyniku dołączenia nowego nukleotydu do końca syntetyzowanej nici zostaje uwolniona cząsteczka pirofosforanu

d. metoda ta wymaga zastosowania elektroforezy

Pytanie 58

Wskaż odpowiedź FAŁSZYWĄ. Dideoksyrybonukleotydy:

C. stosowane są w sekwencjonowaniu metodą Maxma i Gilberta

A. stosowane są w sekwencjonowaniu metodą terminacji łańcucha

D. to nukleotydy nieposiadające grupy hydroksylowej, a jedynie wodór w pozycjach 2’ i 3’ cukru

B. stosowane są w sekwencjonowaniu metodą Sangera

Pytanie 59

Załączony schemat przedstawia:

A. sekwencjonowanie metodą Sangera

D. pirosekwencjonowanie

B. sekwencjonowanie metodą Maxama-Gilberta

C. multipleks PCR

Pytanie 60

W sekwencjonowaniu metodą Sangera

b. następuje terminacja łańcucha DNA po przyłączeniu dideoksyrybonukleotydu

d. nić DNA jest degradowana chemicznie

c. jako materiał wyjściowy stosuje się dsDNA

a. nie są potrzebne deoksyrybonukleotydy

Pytanie 61

Sekwencjonowanie przez odwracalną terminację:

b. polega na cyklicznym dodaniu przez polimerazę DNA tylko 1 nukleotydu wyznakowanego fluorescencyjnyjnie, terminacji syntezy, wymyciu niedodanych nukleotydów, obrazowaniu, usunięciu grupy terminującej i powtórzeniu na nowo syntezy 1 nukleotydu

d. wykorzystuje ligazę DNA zamiast polimerazy DNA, dochodzi do łączenia krótkich fragmentów wyznakowanych fluorescencyjnie

a. sekwencjonowaniu w czasie rzeczywistym SMART (single molekule real time)

c. wykorzystanie nukleotydy wyznakowane radioaktywnie

Pytanie 62

W której z metod do wizualizacji nie używa się autoradiografii?

a. sekwencjonowanie metodą Sangera

b. Southern Blotting

c. pirosekwencjonowanie

d. metoda chemicznej degradacji Maxima-Gilberta

Pytanie 63

W sekwencjonowaniu cyklicznym materiałem wyjściowym jest zwykle:

d. dwuniciowy DNA

c. jednoniciowy DNA

a. jednoniciowy cDNA

b. dwuniciowy RNA

Pytanie 64

Do metod sekwencjonowania należy:

d. Metoda Sangera

b. Northern-blot

c. hybrydyzacja FISH

a. Southern-blot

Pytanie 65

Wskaż nieprawidłowe stwierdzenie dotyczące sekwencjonowania cyklicznego:

a. ze względu na obecność dideoksynuklotydów dochodzi do terminacji łańcucha

b. do reakcji amplifikacji używany jest jeden starter

d. materiałem wyjściowym jest dwuniciowy DNA

c. produkt reakcji przyrasta wykładniczo

Pytanie 66

Dideoksynukleotydy to:

c. trifisforany dideoksynukleozydów, które są znakowanymi starterami pozwalającymi na specyficzne namnażanie fragmentów PCR do sekwencjonowania

a. zdenaturowane nukleotydy powstające w trakcie oczyszczania produktu PCR przed sekwencjonowaniem

b. trifosforany dideoksynukleozydów, które są analogami nukleotydów uniemożliwiającymi przyłączenie do syntetyzowanego łańcucha DNA następnego nukleotydu

d. nukleotydy podlegające modyfikacji w trakcie reakcji sekwencjonowania

Pytanie 67

Sekwencjonowanie metodą chemicznej degradacji to inna nazwa:

b. pirosekwencjonowania

d. metody Maxama-Gilberta

c. metody Sangera

a. sekwencjonowania cyklicznego

Pytanie 68

“Jest najstarszą metodą sekwencjonowania klasycznego opartą na chemicznej degradacji łańcucha DNA. Składa się z 3 etapów : chemicznej modyfikacji zasady azotowej, usunięciu tej zasady i przecięciu nici DNA w miejscu AP. Matrycę do sekwencjonowania w tej metodzie może stanowić jedno- lub dwuniciowy DNA, wyznakowany radioaktywnie na końcu 5’”. Jaka to metoda:

c. metoda Maxama-Gilberta

a. sekwencjonowanie masowe

d. pirosekwencjonowanie

b. metoda Sangera

Pytanie 69

Jak nazywa się metoda sekwencjonowania peptydów polegająca na kolejnym odrywaniu oznakowanych aminokwasów z N-końca cząsteczki peptydu?

c. degradacja Edmana

b. sekwencjonowanie Sangera

d. degradacja równoległa

a. sekwencjonowanie równoległe

Pytanie 70

Jaką metodę przedstawia poniższa rycina?

d. Metoda Sangera, które jest sekwencjonowaniem klasycznym

a. Pirosekwencjowanie, które należy do NGS

b. Metoda Solexa, które należy do NGS

c. Sekwencjonowanie nanoporowe, które jest sekwencjonowaniem klasycznym

Pytanie 71

W przypadku sekwencjonowania DNA metodą Sanger’a, kolejność nukleotydów w badanym DNA ustalimy poprzez

d. analizę produktów cięcia enzymami restrykcyjnymi

c. analizę intensywności fluorescencji hybrydyzowanej sondy

a. analizę prążków reakcji PCR sekwencyjnego

b. analizę widma absorpcyjnego

Pytanie 72

Poniższe zdjęcie przedstawia wynik otrzymany po:

c. Elektroforezie

b. Real Time PCR

d. Hybrydyzacji FISH

a. sekwencjonowaniu Sangera

Pytanie 73

Na rycinie przedstawiono schemat diagnozowania molekularnego niedokrwistości sierpowatej metodą:

a. RT-qPCR

d. PCR-RFLP

c. hybrydyzacji DNA

b. Sekwencjonowania

Pytanie 74

Fragment Klenowa polimerazy I DNA to enzym używany podczas:

b. sekwencjonowania metodą Sangera

a. Pirosekwencjonowania

d. sekwencjonowania cyklicznego

c. sekwencjonowania metodą Maxama Gilberta

Pytanie 75

Pirosekwencjonowanie polega na:

a. Dodaniu znakowanego fluorochromem nukleotydu i odczyt pików świetlnych

b. Dodaniu znakowanego fluorochromem nukleotydu, które poprzez lucyferazę powoduje emisję sygnału świetlnego

d. Odłączaniu nukleotydów przez apirazę i ich degradacja powoduje sygnał świetlny

c. Dodanie niewyznakowanego nukleotydu

Pytanie 76

Techniką genotypowania, która wykorzystuje endonukleazy restrykcyjne jest technika:

d. RFLP

c. Sekwencjonowanie metodą Sangera

b. Western Blot

a. PCR

Pytanie 77

Na rycinie przedstawiono:

b. Schemat łańcuchowej syntezy fragmentów DNA

d. Zasadę sekwencjonowania DNA z użyciem znaczników fluorescencyjnych

a. Zasadę sekwencjonowania metodą Sangera

c. Zasadę techniki PCR w czasie rzeczywistym (qRT-PCR)

Pytanie 78

Najbardziej precyzyjną metodą poznania struktury DNA jest:

c. RT-PCR

d. Hybrydyzacja

b. Sekwencjonowanie

a. Analiza cytometryczna

Pytanie 79

W jakim celu w jednej z metod sekwencjonowania stosowana jest piperydyna?

a. Piperydyna nie jest stosowana w żadnej metodzie sekwencjonowania

c. . Do degradacji ATP i niezwiązanych nukleotydów

d. Do przekształcenia pirofosforanu do ATP

b. Do degradacji wiązań N-glikozydowych i fosfodiestrowych

Pytanie 80

Jak nazywamy sekwencjonowanie, w którym stosuje się odczynniki przecinające cząsteczki (…) określonych pozycjach nukleotydowych?

b. Sekwencjonowanie losowe

c. Sekwencjonowanie metodą Sangera

a. Sekwencjonowanie metodą degradacji chemicznej

d. Pirosekwencjonowanie

Pytanie 81

Zautomatyzowana metoda minisekwencjonowania oparta na wydłużaniu starterów na matrycy uzyskanej w reakcji PCR, w której pojedyncza nić z podłączonym starterem podlega, w obecności DTP, kaskadzie reakcji enzymatycznych, to:

d. Sekwencjonowanie enzymatyczne metodą Sangera

a. Pirosekwencjonowanie

b. Porównawcza hybrydyzacja genomowa

c. RT-qPCR

Pytanie 82

Jakie byłby konsekwencje zwiększenie stosunku trifosforanów dideuksyrybonukleozydów do trifosforanów deoksyrybonukleozydów w mieszaninie reakcyjnej podczas sekwencjonowania DNA?

c. Zaburzenie stosunku spowodowałby przerwanie reakcji sekwencjonowania

d. Stosunek nie ma wpływu na reakcję sekwencjonowania

a. Częściej następuje terminacja wydłużania DNA, a więc tworzone są krótsze łańcuchy DNA

b. Rzadziej następuje terminacja wydłużania DNA, a więc tworzone są dłuższe łańcuchy DNA

Pytanie 83

Na rycinie przedstawiono dwa układy do elektroforezy w żelu poliakrylamidowym. W układach tych można dokonywać detekcji DNA w metodzie:

c. Sekwencjonowania metodą terminacji łańcucha

a. Sekwencjonowania metodą mikromacierzy CGH

d. Sekwencjonowania metodą syntezy

b. Sekwencjonowania metodą pirosekwencjonowania

Pytanie 84

Metodą sekwencjonowania w czasie rzeczywistym jest:

a. Metoda Sangera

d. Żadna z powyższych

b. Metoda Maxama-Gilberta

c. Pirosekwencjonowanie

Pytanie 85

Rola dideoksynukleotydów:

a. Hamują replikację DNA

c. Umożliwiają przyłączenie się polimerazy

b. Inicjują replikację DNA

Pytanie 86

W sekwencjonowaniu dwufazowym

d. Przeprowadza się najpierw analizę izoelektryczną (pierwsza faza) a następnie masową białka (druga faza)

b. Nie ma poprawnej odpowiedzi

a. Najpierw przeprowadza się analizę masy białka (faza pierwsza) a następnie analizę izoelektryczną (faza druga)

c. Przeprowadza się tylko analizę masy białka (jedna faza)

Pytanie 87

Sulfirylaza ATP w pirosekwencjonowaniu:

c. Uwalnia pirofosforan

a. wspomaga tworzenie ATP

b. bierze udział w wytworzeniu sygnału świetlnego

Pytanie 88

Pierwszym etapem degradacji EDMANA jest:

d. usunięcie fenyloizotiocyjananu z próbki

b. dodanie fenyloizotiocyjanianu do próby

c. analiza chromatograficna w celu identyfikacji pierwszego aminokwasu

a. elektroforeza w celu identyfikacji pierwszego aminokwasu

Pytanie 89

Która z metod umożliwia scharakteryzowanie struktury I-rzędowej białka:

b. spektroskopia dichroizmu kołowego i spektrometria mas

a. spektrometria mas

c. spektroskopia dichroizmu kołowego

d. spektroskopia w podczerwieni

Pytanie 90

Która z metod umożliwia scharakteryzowanie rzeczywistej struktury III-rzędowej białka?

b. Spektroskopia mas

a. Spektroskopia w podczerwieni

c. Spektroskopia dichroizmu kołowego

d. Spektroskopia dichroizmu kołowego i spektroskopia mas

Pytanie 91

Podstawową techniką używaną do wyznaczania struktury przestrzennej białka na poziomie atomowym jest:

c. spektroskopia mas

a. krystalografia rentgenowska

d. sekencjonowanie białek

b. spektroskopia dichroizmu kołowego

Pytanie 92

„_ polega na użyciu 24-kolorowego malowania całych chromosomów umożliwiającego wizualizację każdego chromosomu (osobno) w jednym eksperymencie. Ta metoda oparta jest na zasadach obrazowania spektralnego i spektroskopii Fouriera” opis ten dotyczy:

d. SKY (Spectral Karyotyping)-FISH

c. Prążkowanie AgNOR

a. Fibre FISH

b. Micromacierze CGH

Pytanie 93

Zastosowanie techniki NMR (spektroskopii magnetycznego rezonansu jądrowego) pozwala określić:

a. Sekwencję aminokwasów w białku

b. Strukturę przestrzenną białka

d. Sekwencję nukleotydów w DNA

c. Nie używa się metody NMR w badaniach molekularnych

Pytanie 94

Do czego nie służy spektroskopia mas?

a. Do ustalenia kątów i wiązań między atomami

c. ustalania składu izotopowego analizowanych substancji

b. identyfikacji związków chemicznych i ich mieszanin

Pytanie 95

Metodą Northern-Blot można wykryć:

d. strukturę białka

b. DNA

c. sekwencję nukleotydów w RNA

a. białka

Pytanie 96

Do wykrycia DNA służy metoda

a. Northern Blot

b. Southern Blot

c. Eastern Blot

Pytanie 97

Która z poniżej wymienionych technika NIE BAZUJE na hybrydyzacji?

c. Southern blot

d. FISH

b. Western blot

a. Northern blot

Pytanie 98

Metoda PCR w której używa się dwóch starterów przyłączanych w dwóch różnych reakcjach to:

b. qPCR

a. RT-PCR

d. Wewnętrzne PCR

c. Nie ma poprawnej odpowiedzi

Pytanie 99

Reakcja RT-PCR to:

c. reakcja PCR, w której namnażane jest mRNA

a. w reakcji PCR, w której używa się równocześnie wielu par specyficznych starterów by namnożyć wiele fragmentów DNA w jednej reakcji

b. reakcja PCR, w której mRNA jest przepisywane na cDNA i następnie amplifikowane przy użyciu specyficznych starterów

d. reakcja PCR, w której restryktaza tnie DNA, a następnie pofragmentowane DNA jest namnażane

Pytanie 100

Odmiana PCR, w której wykorzystywanych jest wiele różnych zestawów starterów to:

a. RT-PCR

d. nested PCR

c. multipleks PCR

b. real time PCR

Pytanie 101

Reakcja PCR w której przeprowadzamy amplifikację więcej niż jednego odcinka DNA nazywa się:

b. nested PCR

d. multipleks PCR

a. RT-PCR

c. PCR – RFLP

Pytanie 102

Co jest metodą do RNA?

c. RT-PCR

a. Sage

b. Homogenizacja

Pytanie 103

RT-qPCR to:

c. Inaczej reakcja PCR-Multiplex

d. Jakościowy PCR

b. Reakcja PCR w czasie rzeczywistym (Real Time)

a. Reakcja odwrotnej transkrypcji (Reverse Transcription)

Pytanie 104

Metodę RT-qPCR z wykorzystaniem jakich barwników/sond przedstawia powyższa rycina? Opis do ryciny: 1. polimeryzacja – reporter (R) i wygaszacz (Q) są związane do oligonukleotydowej sondy; 2. przemieszczenie się nici – wygaszacz nadal pochłania sygnał emitowany przez reporter; 3. rozłam – wygaszacz odłącza się od sondy i oddala od reportera – sygnał staje się widoczny; 4. zakończenie polimeryzacji – odłączony reporter nadal emituje sygnał fluorescencji.

a. SYBR Green 1

d. Sond TaqMan

b. Sondy o strukturze spinki do włosów

c. Tryptan blue

Pytanie 105

Mikromacierze RNA dostarczają nam informacji o:

c. mutacjach punktowych w DNA

d. profilach jakościowej i ilościowej ekspresji genów

a. ilości białek w komórce

b. zmianach w ilości DNA w jądrze

Pytanie 106

Wskaż zdanie FAŁSZYWE. Mikromacierze DNA:

b. zbiór sond molekularnych związanych ze stałym podłożem w ściśle określonym porządku, stanowiący dwuwymiarowy układ mikroskopijnych miejsc z określonymi sekwencjami kwasu nukleinowego

a. inaczej chip DNA

c. metoda służąca m.in. do genotypowania

d. metoda, w której stosowane są dwuniciowe sondy w postaci DNA o znanej sekwencji, produktów PCR lub oligonukleotydów

Pytanie 107

Wykrywanie ekspresji genów, przy pomocy mikromacierzy jest możliwe dzięki temu, że:

c. wzór ekspresji genu jest porównywany ze wzorem ekspresji genu odpowiedzialnego za chorobe

d. wszystkie z wymienionych

b. cDNA pochodzi z mRNA znanych genów unieruchomionych na podłożu, a próbka zawiera geny, zarówno prawidłowych jak i chorych tkanek

a. Miejsca z większą wydajnością hybrydyzacji mierzonej wielkością sygnału fluorescencji dla genu tkanki chorobowej wystąpią jeśli gen ten uległ nadekspresji u chorego

Pytanie 108

Mikromacierze DNA to technologia, która umożliwia badanie i rozwiązywanie problemów biomedycznych. Które były kiedyś uważane za nierozwiązywalne dlatego że:

d. Wszystkie z wymienionych

a. Badanie na jednej płytce DNA dostarcza jednoczesnej informacji o tysiącach genów

c. Są używane do wykrywania wiązania na zasadzie komplementarności cząsteczek w mieszaninie o nieznanym składzie

b. Umożliwiają równoległą analizę ekspresji genów i ich identyfikacji

Pytanie 109

W metodzie mikromacierzy:

b. do sond umieszczonych na stałym podłożu dodaje się niewyznakowany DNA badany

c. do badanego wyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond

a. do sond umieszczonych na stałym podłożu dodaje się wyznakowany DNA badany b. do sond umieszczonych na stałym podłożu dodaje się niewyznakowany DNA badany c. do badanego wyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond d. do badanego niewyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond

d. do badanego niewyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond

Pytanie 110

Wskaż zdanie FAŁSZYWE dotyczące mikromacierzy:

c. Odczyt fluorescencji ma charakter porównawczy

d. Krótkie sondy

a. Dłuższe sondy zwiększają ryzyko nieswoistej hybrydyzacji

b. Niska specyficzność wobec genów

Pytanie 111

Mikromacierze SNP są ‘lepsze” od porównawczej hybrydyzacji genomowej, gdyż:

c. nie można porównać tych dwóch technik, gdyż mikromacierze SNP służą do analizy pojedynczych genów/nukleotydów, a porównawcza hybrydyzacja genomowa do analizy całych genomów

d. pozwalają na wykrywanie zmian ilościowych i jakościowych

b. używają sond oligonukloetydowych

a. nie używa się znakowania sond

Pytanie 112

Metoda, w której stosuję sie sondę oligonukleotydową do ustalenia, która z dwóch alternatywnych sekwencji występuje w danej cząsteczce to:

b. Fluorescencyjna hybrydyzacja in situ

d. Hybrydyzacja fluorescencyjna

c. Hybrydyzacja allelospecyficzna

a. Metoda SSCP

Pytanie 113

Technika FISH:

c. Umożliwia identyfikacje aberracji chromosomowych tylko w jądrach interfazowych

d. Stanowi modyfikację metody hybrydyzacji in situ

b. Umożliwia identyfikację aberracji chromosomowych tylko w chromosomach metafazowych

a. Jest metodą uzupełniającą analizę prążkową chromosomów - do rozstrzygania problemów diagnostycznych zaistniałych w badaniach konwencjonalnych

Pytanie 114

Podaj nazwę techniki, w której izolowany DNA z jądra komórkowego rozciąga się i utrwala na szkiełku podstawowym:

a. CGH

d. Southern blot

b. Hybrydyzacja in-situ

c. Fiber FISH

Pytanie 115

Metoda biologii molekularnej wykorzystująca różnicę w ilości i rodzaju miejsc restrykcyjnych w badanym fragmencie materiały genetycznego to technika:

c. DGGE

a. ASO

d. SSCP

b. RFLP

Pytanie 116

Rolą enzymów restrykcyjnych w klonowaniu DNA jest:

a. pocięcie otrzymanego DNA na mniejsze losowe fragmenty

b. wytworzenie lepkich końców wokół genu do sklonowania i w plazmidzie, w celu wstawienia genu do plazmidu

d. otrzymaniu polimorfizmu długości fragmentów restrykcyjnych (RFLP)

c. strawienie bakteryjnych plazmidów

Pytanie 117

W reakcja hybrydyzacji z DNA sonda molekularna:

c. jest przyłączana do polimerazy DNA w celu umożliwienia precyzyjnej hybrydyzacji DNA

a. powinna być wyznakowana w celu zidentyfikowania powstałych dwuniciowych kompleksów

b. pozwala na wykrywanie enzymów restrykcyjnych zawartych w mieszaninie reakcyjnej

d. nie pozwala na identyfikację DNA z preparatów cytologicznych

Pytanie 118

Lepkie końce powstają w wyniku cięcia nici DNA:

a. Polimerazą DNA 30

c. Enzymem restrykcyjnym

d. Sekwencjonazą DNA

b. Ligazą

Pytanie 119

Enzym restrykcyjny:

c. jest używany w trakcie replikacji hybrydyzacji Southern Blot

b. potrafi replikować dwuniciowa cząsteczka DNA

a. ułatwia łączenie fragmentów DNA

d. rozpoznaje i przecina tylko określone sekwencje nukleotydowe w cząsteczce DNA

Pytanie 120

Hybrydyzacja Southern Blot:

a. Ma na celu wyszukanie sekwencji RNA spośród mieszaniny fragmentów otrzymanych po trawieniu enzymami restrykcyjnymi

d. Zakłada, że mutacja zmienia wzór restrykcyjny

b. Wykrywa mutacje punktowe

c. Wykrywa duże mutacje

Pytanie 121

Paleontolodzy odkryli fragment tkanki na liczącej 400 lat zakonserwowanej skórze wymarłego ptaka dodo. Genetycy chcieli porównać specyficzny region DNA z tej próbki z DNA pochodzącym od ptaków żyjących obecnie. Która z poniższych metod byłaby najbardziej przydatna do zwiększenia dostępnych ilości DNA ptaka dodo?

a. hybrydyzacja metodą Southerna

b. elektoroforeza żelowa

c. łańcuchowa reakcja polimerazy (PCR)

d. analiza RFLP

Pytanie 122

W celu precyzyjnego zidentyfikowania dwuniciowych kompleksów powstałych w wyniku reakcji Southern Blot należy:

b. Wyznakować radioaktywne DNA genomowe

c. Wyznakować chemiluminescencyjnie wszystkie fragmenty DNA genomowe po cięciu restryktazami

a. Doprowadzić do denaturacji sondy molekularnej w celu odłączenia jej od kompleksu hybrydyzacyjnego

d. Wyznakować radioaktywnie sondę molekularną

Pytanie 123

W metodzie Southern:

a. fragmenty DNA intubowane na membranie z DNA

c. fragmenty DNA intubowane z przeciwciałami

d. fragmenty RNA intubowane z RNA

b. fragmenty DNA intubowane z RNA

Pytanie 124

W metodzie hybrydyzacji Southerna:

c. DNA na membranie nylonowej jest hybrydyzowany z sondą DNA

a. RNA na membranie nylonowej jest inkubowany ze swoistymi przeciwciałami

b. RNA na membranie nylonowej jest hybrydyzowany z sondą RNA

d. DNA na membranie nylonowej jest indukowany ze swoistymi przeciwciałami

Pytanie 125

W metodzie nested PCR

d. Występuje wyłącznie faza elongacji

c. Występpuje wyłącznie faza denaturacji

b. Występuje wyłącznie faza annealingu

a. Stosowane są startery zewnętrzne i wewnętrzne

Pytanie 126

Wskaż BŁĘDNE zdanie dotyczące łańcuchowej reakcji polimerazy PCR

a. Naśladuje replikację DNA in vivo

b. Jest jedną z metod izolacji białek

d. Wykorzystuje urządzenie zwane termocyklerem umożliwiającym liczne cykliczne reakcje syntezy nici DNA

c. Jest to technika służąca do namnożenia (amplifikacji) specyficznego fragmentu/ów DNA

Pytanie 127

Prawidłowy skład mieszaniny reakcyjnej Real-Time qPCR to:

c. matryca, startery, dNTPs, polimeraza DNA, SYBR Green

b. matryca, startery, dNTPs. Polimeraza DNA, środowisko reakcji

d. matryca, startery, dNTPs, polimeraza DNA, SYBR Green, środowisko reakcji

a. matryca, startery, dNTPs, polimeraza DNA

Pytanie 128

W metodzie Real-Time qPCR, poziom ekspresji badanego genu określa

a. Sam gen badany wystarczy do określenia poziomu jego ekspresji

c. Produktów niespecyficznych

d. Genu referencyjnego

b. Drugiego genu badanego

Pytanie 129

Do mieszaniny reakcyjnej reakcji PCR NIE NALEŻY:

a. DNA matrycowe

c. APS

b. termostabilna polimeraza DNA

d. Startery

Pytanie 130

Na żelu jednokierunkowym nie można dobrze rozdzielić:

b. oczyszczonego białka albuminy

a. Fragmentów DNA po reakcji multipleks PCR

d. złożonej mieszaniny białek

c. fragmentów DNA po reakcji restrykcji

Pytanie 131

W metodzie PCR NIE JEST wymagana obecność:

c. Polimerazy DNA

b. Starterów

d. Dideoksynukleotydy

a. Jonów magnezowych

Pytanie 132

Wskaż zdanie POPRAWNIE opisujące metodę PCR-DGGE:

d. dsDNA ulega denaturacji przy tych samych stężeniach związków denaturujących bez względu na skład zasad i sekwencji nukleotydowej

b. dsDNA ulega denaturacji przy różnych stężeniach związków denaturujących bez względu na skład zasad i sekwencji nukleotydowej

c. dsDNA ulega denaturacji przy takich samych stężeniach związków denaturujących

a. dsDNA ulega denaturacji przy różnych stężeniach związków denaturujących w zależności od składu zasad i sekwencji nukleotydowej

Pytanie 133

Na poniższym rysunku przedstawiono program temperaturowy reakcji PCR, etap C jest to:

a. Gorący start

b. Wydłużanie produktu

d. Renaturacja

c. Denaturacja

Pytanie 134

Metoda PCR w której używa się dwóch starterów przyłączanych w dwóch różnych reakcjach to:

a. RT-PCR

c. Nie ma poprawnej odpowiedzi

b. qPCR 95

d. Wewnętrzne PCR

Pytanie 135

W jakiej temperaturze następuje przyłączenie starterów podczas PCR:

b. O 15* niższej od ich temperatury topnienia

d. W takiej jak temperatura topnienia starterów

c. O 5* niższej od ich temperatury topnienia

a. O 20* wyższej od ich temperatury topnienia

Pytanie 136

Ktore jony musza byc w PCR w mieszaninie

b. Sodu

c. Magnezu

a. Baru

Twój wynik: Oczyszczanie i metody badań makrocząsteczek życia

Twój wynik