biomolo kolo 2moje

Długość życia mRNA zależy w pewnym stopniu od szybkości degradacji ogona poli(A)

Za syntezę ogona poli(A) odpowiedzialna jest polimeraza poli(A

Inhibitorem reakcji poliadenylacji jest 3’-deoksyadenozyna.

mRNA pozbawiony ogona poli(A) może nie ulegać wydajnej translacji.

Poliadenylacja zwiększa stabilność cząsteczki mRNA.

Pierwotne transkrypty eukariontów są rozcinane przez specyficzną nukleazę kompleksu rozpoznającego sekwencję AAUAAA.

większość syntetazy ma walsciwosci korekcyjne

potrzebne ATP

aminoacylo-tRNA wiaze się do miejsca P

IF2 zdolny do hydrolizy GTP dzieki czemu dostarcza energii do translacji

aminokwasy aktywowane przez przyłączenia do tRNA

rozpoczęcie na kodonie przez specyficzne pre tRNA i kodonu

wiązanie peptydowe aminoacylo-tRNA miejsce A a reszta peptydylowa miejsca P

antykodon i miejsce wiazania aminokwasu na przeciwległym koncu

zawiera od 70-90 nukleotydow

duza czesc jest sparowana

CCA na koncu 3’

wiele zmodyfikowanych nukleotydow

wiaze z araO1 hamujac transkrypcje genu

powoduje wypetlenie gdy zwiaze się z araO2 i araI

wiaze się specyficznie z DNA w obecności arabinozy

hydroliza GTP przez czynnik elongacyjny EF-Tu umożliwia… uwolnienie

Puromycyna powoduje przedwczesną terminację łańcucha działając jako analog aminoacyloTrna

Element wchodzący w sklad chromosomow

upakowane DNA

rdzen ma 4 rodzaje histonow

dla każdego aminokwasu istnieje inny enzym katalizujący tworzenie odpowiedniego

rodzaj aminokwasu przylaczanego do tRNA zalezy od rodzaju syntetazy……….. jest substratem

niektóre syntetay aminoacylo-tRNA posiadają aktywność korekcyjna……….. niewłaściwym tRNA

zawiera antykodon

może być polaczony z aminokwasem wiazaniem estrowym,

oddzialywuje z mRNA na drodze translacji,

może posiadac rozna ilość licznych roznych sekwencji

sluzy jako polaczenie miedzy mRNA a pojedynczym aminokwasem

aktywacja aminokwasu zachodzi poprzez przyłączenie do tRNA

czy przy tworzeniu aminoacylo-tRNA, powstaje produkt pośredni aminoacyloAMP

za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka sigma polimerazy RNA

typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA

promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA zależy jak interpretowac zasadniczy

sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy (...) niektórych genów E.coli (

u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki

mogą wykazywac rozna wydajność transkrypcji

dla wkiekszosci genow zawiera rozne zgodne sekwencje

okresla strone startu dla transkrypcji na matrycy DNA

te które maja sekwencje prawie zgodne z sekwencjami zgodnymi i sa separowane przez 17 par zasad sa bardzo wydajne

czasteczka elongacyjna Tu oddzialuje ze wszystkimi czasteczkami aminiacetyl-tRNA oprocz fMet-RNAf

peptydylo-tRNA może zajmowac miejsce P lub A zalezne od tego, w którym cyklu komorkowym się znajduje

fMet-tRNA zajmuje miejsce P(jako jedyne)

produktem może być policistronowy mRNA

aza elongacji podczas transkrypcji jest przeprowadzana przez rdzen polimerazy

alternatywny splicing pre-mRNA dzięki któremu powstają różne cząsteczki transkryptu

ozluźnienie struktury spakowanego DNA poprzez modyfikacje białek histonowych

selektywna degradacja cząsteczek mRNA

regulacja tworzenia się kompleksu inicjującego translację

selektywne skladanie aktywnych kompleksów transkrypcyjnych na ….

aktywatory i represory działają poprzez zmiane szybkości tworzenia się kompleksu transkrypcyjnego

Miejsce splicingowe 5’ jest ustawione w odpowiedniej pozycji dzięki parowaniu się zasad rejonu bogatego w pirymidyny, występującego w eksonie poprzedzającym intron i sekwencji przewodnika bogatej w puryny, która występuje w intronie

Pre-rRNA zawiera specjalną „kieszeń” wiążącą kofaktor

Kofaktor atakuje miejsce splicingowe 5’ i tworzy wiązanie fosfodiestrowe z końcem 5’ intronu

Grupa 3’-OH eksonu 1 atakuje miejsce splicingowe 3’

Związanie TBP wywołuje w DNA duże zmiany konformacyjne prowadzące m.in. do poszerzania małego rowka DNA

Białko TBP jest składnikiem czynnika transkrypcyjnego TFIID, który rozpoczyna proces inicjacji transkrypcji

Podjednostka σ oddysocjowuje od holoenzymu na wczesnym etapie elongacji transkryptu

Rdzeń polimerazy RNA silnie wiąże się z matrycą DNA bez względu na jej sekwencję

Podjednostka σ nadaje rdzeniowi enzymu zdolność inicjacji transkrypcji w miejscach promotorowych

Przejście od kompleksu promotorowego zamkniętego do kompleksu promotorowego otwartego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji.

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza σ54

Odpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza σ32

w przybliżeniu 17 nukleozydow nici kodującej DNA w formie pojedynczej

Przejście od kompleksu promotorowego zamkniętego do kompleksu promotorowego otwartego jest kluczowym punktem inicjacji transkrypcji.

Odpowiedzią E. coli na niedobór azotu jest synteza σ54

dpowiedzią E. coli na podwyższoną temperaturę jest synteza σ32