molekularna egzamin

jest miejscem syntezy i obróbki cząsteczek rRNA

jest miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNA I - polimeraza RNA I jest umieszczona w jąderku no i tworzy transkrypty komórkowe dla rRNA.

jest miejscem obróbki cząsteczek mRNA

jest rusztowaniem chromosomowym zmieniającym swoją strukturę w czasie podziału komórki co prowadzi do kondensacja chromosomów

jest miejscem ekspresji genów kodujących białka

jest miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNAII

może zależeć od szlaku, którego jednym z elementów są cząsteczki RNA o strukturze spinki do włosów, powstające z prekursorowego RNA, syntezowanego przez polimerazę RNA II. chodzi o mikroRNA

może przebiegać, w procesie, w którym następuje usuwanie czapeczki mRNA skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcucha Poli(A), co z kolei prowadzi do braku translacji i szybkiego trawienia eksonukleolitycznego. na odwrót, najpierw łańcuch potem czapeczka

w prawidłowej, niezmienionej komórce skutkuje powstaniem krótkich interferujących RNA o długości 21--28 nukleotydów. na tej podstawie wyciszane są wirusowe RNA

może zależeć od sekwencji znajdujących się w obrębie transkryptu – np. dzięki granicom egzon-intron

powoduje, że eukariotyczne mRNA są cząsteczkami żyjącymi dłużej niż ich odpowiedniki bakteryjne, jednak z typowym okresem półtrwania rzędu 10--20 minut. ssacze mRNA mogą kilka godzin, drożdże 10-20 minut, bakterie max kilka minut

może przebiegać według mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA, który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych.

czynnik elongacyjny Tu(EF-Tu) oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacetylo-tRNA oprócz fMet-tRNAf

fMet-tRNAf zajmuje miejsce P jako jedyn h1-IF1 skierowuje fMet-tRNA od razu do miejsca P podczas inicjacji

poszukiwanie pierwszego kodonu AUG od 5’ końca transkryptu hudrolizującego ATP hydroliza GTP

formylometionylo-tRNAf powstaje w reakcji:

peptydylotRNA może znajdować się zarówno w miejscu P lub A rybosomu, w zależności od fazy cyklu translacyjnego

fMet-tRNAf inicjatorowy wiąże się w przeciwieństwie do...

mRNA policistronowe

czynnik elongacyjny Ts (EFTs) wiąże nukleotyd GTP, przez co w wyniku hydrolizy uwalnia się GDP EF-Ts łączy się z EF-Tu co powoduje odłączenie GDP od EF-Tu

heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w terminacji transkrypcji niektórych genów E.coli (jest dobrze, ponieważ białko RHO ma aktywność ATPazową oraz działa również jak helikaza)

typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA kaseta TATA ma inną sekwencję niż podana, dodatkowo jest promotorem u eukariota a nie e.coli

mRNA policistronowe

sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA

u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki np. operon tryptofanowy - jest tryptofan nie trzeba nic robić, koniec transkrypcji

za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka alfa polimerazy RNA podjednostka sigma

deoksyryboza ma przy węglu 2’ wolną grupę OH (RYBOZA)

dwuniciowe RNA może przyjmować strukturę A DNA.(podobną)

efekt hiperchromowy - efekt podczas topnienia DNA, który powoduje podwyższenie absorbancji przy długości fali 260 nm może być pytanie o efekt hipochromowy - obniżenie absorbancji!!

zasady w superhelisie są wewnątrz helisy

nie pełnią funkcji strukturalnej(?)

eżeli A+G =30% to T może być więcej niż 20%(reguła Chargaffa)

guanina paruje się z cytozyna poprzez 3 wiązania wodorowe

komplementarne pary tworzą się pomiędzy puryna i puryną oraz pirymidyną i pirymidyną puryna z pirymidyną.(NIE)

połączenie zasady z cukrem nosi nazwę nukteozydu, bo nukleotyd to nukleozyd plus gr.fosforanowa.

adenozyna i guanina wiąże się przez N9 z C1 deoksyrybozy wiązaniem N- -glikozydowym , a cytozyna i tymina przez N-1 z C1

temp topnienia jest odwrotnie proporcjonalna do długości łańcucha temp. topnienia rośnie wraz z długością(wprost)

wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie są odcinane po przejściu przez błonę ER

Rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błonę

uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu

Cykl ATPADP... sekwencję sygnałową z SRP i odłącza ją od …

uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu

cząsteczka rozpoznająca sygnał (SRP) jest białkiem składającym się z 7 ahelis/ łańcuchów polipeptydowych

białaczka

wymaga polimerazy DNA i czterech deoksynukleotydów (wymaga termostabilnej DNA i wszystkich 4 dNTP)

potrzebuje dwóch starterów komplementarnych do siebie jak w metodzie dideoksy (potrzebujemy parę starterów, które hybrydyzują z sekwencjami przylegającymi do sekwencji docelowej-każdy starter chyba musi być komplementarny do jednej nici, czyli dwa startery, ale NIE są komplementarne do siebie)

pozwala na wykrycie niewielkich wirusów

3 etapyetap drugià temperatura nie zalezy od długości startera; od długości startera zależy czas trwania drugiego etapu (2 etap- przyłączanie starterów (40-60oC) - w tym kroku startery reakcji przyłączają się do matrycowego DNA, temperatura zależy od temperatury topnienia starterów, a im dłuższy starter tym wyzsza temp topnienia- dlatego ta odp. jest zła)

coś z rearanżacjami chromosomówodp błędna (PCR to metoda powielania łańcuchów DNA polegająca na łańcuchowej reakcji polimerazy DNA w wyniku wielokrotnego podgrzewania i oziębiania próbki- nic nie znalazłam o żadnej rearanżacji chromosomów)

MHC II- cd8(MHC klasy II prezentuje antygeny pomocniczym limfocytom T CD4+, a nie CD8+.)

Opryszczka (układ zgodności tkankowej)

są polimorficzne i odrzucają przeszczepy

układ zawiera 3 grupy MHC I, MHC II, MHC III

kodowane przez HLA

MHC I- cd 4(Fałsz. MHC klasy I prezentuje antygeny cytotoksycznym limfocytom T CD8+, a nie CD4+.)