Podsumowanie: ozi <3

Pytanie 1

Które z następujących twierdzeń jest prawdziwe w odniesieniu do procesu interferencji RNA?

Krótkie interferujące cząsteczki RNA wiążą się z rybosomem, aby zapobiec translacji wirusowych mRNA.

Dwuniciowe interferujące cząsteczki RNA są wytwarzane z prekursorowego RNA kodowanego w genomie komórki.

Antysensowne cząsteczki RNA przyłączają się do nie ulegającego translacji regionu 3’ docelowego RNA

Dwuniciowe cząsteczki RNA wiążą się z białkami, które blokują ich translację.

Dwuniciowe cząsteczki RNA są cięte przez nukleazę na krótkie interferujące cząsteczki RNA.

Interferencja RNA może być przyczyną braku produktu białkowego kodowanego przez transgen.

Pytanie 2

. Izolatory to:

sekwencje o długości 12 kb wyznaczające granice domen, tzw. domen funkcjonalnych charakteryzujących się zwartą strukturą

sekwencje które w swoich normalnych położeniach izolują poszczególne geny danej domeny funkcjonalnej

sekwencje mające zdolność znoszenia efektu pozycyjnego (tak), przejawiającego się w nieobecności izolatorów zamiennością lokalizacji, w której wbudowywany jest rekombinowany gen.

sekwencje które najprawdopodobniej do spełniania swych funkcji wymagają białek wiążących specyficznie zarówno izolatory jak i sieć włókien zbudowanych z RNA i białek przenikających całe jadro.

Sekwencje utrzymujące niezależność domeny funkcjonalnej zapobiegają „wymianie informacji’’ między sąsiednimi domenami.

Sekwencja występująca wyłącznie w genomie Drosophilia melanogaster.

Pytanie 3

. Które z poniższych cech są prawdziwe w odniesieniu do heterochromatyny konstytutywnej?

w jej skład wchodzi DNA nie zawierający żadnych genów.

) w rejonach, w których występuje heterochromatyna konstytutywna można zaobserwować przy pomocy mikroskopu elektronowego pętle zbudowane z włókna chromatynowego

można ją obserwować czasami w pewnych komórkach. – konstytutywna – zawsze zwarta,

jest ona głównym składnikiem ludzkich chromosomów płc

w jej skład wchodzi np DNA centromerów i telomerów.

w jej skład wchodzi DNA nie kodujący żadnych genów

zawiera ona DNA który ma zwartą strukturę

jest jednym z głównych składników chromosomu Y

zawiera ona geny nieaktywne w pewnych komórkach lub na niektórych etapach cyklu komórkowego

Pytanie 4

Która z poniższych modulowanych sekwencji DNA umożliwiają regulację transkrypcji w odpowiedzi na ogólne sygnały z zewnątrz komórki?

Moduły regulatorów rozwoju

Moduły odpowiedzi

Moduły represorów

Moduł w kształcie palca cynkowego

Moduły konstytutywne

Moduły komórkowo specyficzne

Pytanie 5

Inicjacja transkrypcji u Eukaryota to proces, dla którego prawdziwe są następujące stwierdzenia:

Koaktywator, to białko, stymulujące inicjację transkrypcji przez specyficzne bezpośrednie wiązanie DNA.

Inicjacja transkrypcji u Eukaryota różni się od inicjacji transkrypcji jaka ma miejsce w komórkach bakteryjnych, między innymi tym, że podstawowy poziom inicjacji transkrypcji eukariotycznej jest stosunkowo wysoki dla większości promotorów, z wyjątkiem najsłabszych

Powszechną cechą aktywatorów transkrypcji jest ich zdolność do bezpośredniego oddziaływania z kompleksem preinicjacyjnym polimerazy RNAII przez tzw. domenę poliprolinową

Ilość zachodzących inicjacji transkrypcji polimerazy RNAII, zależy od tego, które moduły promotorowe danego genu w danym czasie są związane ze specyficznymi białkami

Aktywatory transkrypcji są istotne dla inicjacji transkrypcji przez polimerazy RNAII i RNAIII, natomiast ich rola w przypadku polimerazy RNAI przeprowadzającej transkrypcję wielokrotnie powtórzonej jednostki transkrypcyjnej zawierającej sekwencję kodującą niektóre z rybosomalnych RNA nie jest dobrze określona

Pytanie 6

Dlaczego reinicjacja transkrypcji z promotora polimerazy RNAII jest dużo szybsza niż pierwsza inicjacja?

Wszystkie podstawowe czynniki transkrypcyjne pozostają związane z promotorem umożliwiając reinicjację

Niektóre podstawowe czynniki transkrypcyjne (TFIID, TFIIA i TFIIH) pozostają związane z promotorem umożliwiając reinicjację

Domena Ckońcowa (CTD) polimerazy jest zaktywowana ze względu na defosforylację jaka miała miejsce w czasie pierwszej inicjacji

Niektóre podstawowe czynniki transkrypcyjne (TFIID, TFIIA, TFIIH) pozostają związane z polimerazą RNA umożliwiając reinicjację.

Wszystkie podstawowe czynniki transkrypcyjne oddysocjowują od promotora ale promotor jest ciągle eksponowany, co umożliwia szybkie ponowne zbudowanie kompleksu inicjującego

Pytanie 7

7. Jaka jest funkcja grupy formylowej przyłączonej do inicjatorowej metioniny w komórce EUKARIOTYCZNEJ?

łączy inicjatorowy tRNA z dużą podjednostką rybosomu w czasie inicjacji translacji

Blokuje grupę aminową Met, dzięki czemu translacja zachodzie w kierunku N>C

Blokuje grupę aminową Met, dzięki czemu translacja zachodzi w kierunku C>N.

Wiąże cząsteczkę GTP potrzebną w procesie formowania kompleksu inicjacyjnego.

) Blokuje łańcuch boczny Met tak, że nie może ona oddziaływać z czynnikiem inicjacyjnym IF3.

żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe.

Pytanie 8

Które z podanych poniżej informacji są PRAWDZIWE dla inicjacji replikacji DNA w komórkach drożdży Saccharomyces cerevisiae?

Identyfikacji sekwencji istotnych dla inicjacji replikacji DNA w tych komórkach dokonano stosując techniki badawcze wcześniej użyte do ustalenia sekwencji oriC bakteryjnego.

Typowa sekwencja ARS jest zwykle dłuższa niż oriC w genomie E.coli

Kompleks ORC działa jako pośrednik pomiędzy miejscem inicjacji replikacji z sygnałami regulacyjnymi odpowiedzialnymi za koordynację inicjacji replikacji z cyklem komórkowym.

Topnienie struktury podwójnej helisy DNA w miejscu inicjacji replikacji zachodzi w obrębie subdomeny B3

Typowa ARS, autonomicznie replikująca sekwencja, składa się z dwóch subdomen A i B1 które razem stanowią sekwencję rozpoznawaną przez białka inicjacyjne kompleksu ORC.

Pytanie 9

Wybierz z podanych poniżej informacji te które są prawdziwe w odniesieniu do przekazywania sygnału biologicznego przez wniknięcie związku sygnalizacyjnego do komórki

rola glukozy, w odpowiedzi diauksycznej operonu laktozowego polega na tym że wywiera ona pośredni wpływ na aktywator kataboliczny (CAP, ang catabolite activator protein) dokonuje tego przez hamowanie aktywności cyklazy adenylowej

bezpośrednie oddziaływanie związku sygnalizującego z białkiem regulacyjnym obecnym w komórce ma miejsce tylko w przypadku komórek eukariotycznyc

laktoferyna, białko znajdowane w mleku ssaków, a w mniejszej ilości w krwioobiegu pełni rolę zewnątrzkomórkowego związku sygnalizującego, który może stymulować transkrypcję specyficznych genów.

związek sygnalizacyjny, który jest białkiem, może działać, na przykład przez oddziaływanie z eksonowymi wzmacniaczami lub wyciszaczami składania RNA

aktywatory transkrypcji, należące do nadrodziny receptorów jądrowych, są głównym celem dla hormonów steroidowych związków sygnalizujących wnikających do komórki i koordynujących szeroki zakres aktywności fizjologicznych u wyższych eukariontów.

Pytanie 10

Która z definicji jest prawdziwym opisem metylacji DNA de novo?

) Metylacja DNA de novo skutkuje przyłączeniem grupy metylowanej do reszty G(guaniny)

Metylacja DNA de novo to u myszy proces metylacji zależny od metylotransferaz DNA kodowanych przez geny Dnmt3a i Dnmt3b.

Metylacja DNA de novo, to przyłączenie grup metylowanych do DNA, w miejscach komplementarnych do miejsc metylowanych w nici rodzicielskiej

Metylacja DNA de novo, to przyłączenie grup metylowanych do promotorów, aktywujące ekspresję genów.

Metylacja DNA de novo, to przyłączenie grup metylowych do DNA w nowym miejscu, prowadzące do zmiany wzoru metylacji genomu.

Pytanie 11

Które z podanych poniżej informacji są prawdziwe w odniesieniu do wycinania intein?

Niektóre z intein są specyficznymi endonukleazami zdolnymi do usuwania specyficznej sekwencji DNA w allelu który nie zawiera sekwencji kodującej inteinę.

po wycięciu inteiny, eksteiny łączone są przez specyficzną ligazę białkową

Większość intein zidentyfikowano w białkach wyższych eukariotów

Inteina to zewnętrzny lub wewnętrzny fragment białka usuwany przez cięcie proteolityczne prowadzące do powstania aktywnego białka

Inteina jest usuwana bezpośrednio po zakończeniu transkrypcji, czemu towarzyszy łączenie zewnętrznych segmentów, t.j ekstein.

Wycinanie intein jest odpowiednikiem wycinania intronów z pre-mRNA

Pytanie 12

Której z wymienionych niżej modyfikacji mogą podlegać histony?

Acetylacja

remodelowanie

sumoilacja (dołączenie białka SUMO)

Metylacja

Przemieszczenie trans

Ubikiwitynacja

Pytanie 13

Co wchodzi w skład promotora u Procaryota?

rejon –35

kaseta CAAT

kaseta Hognessa

sekwencja zawierająca wiele reszt purynowych

kaseta Pribnowa

Pytanie 14

Metody stosowane w inżynierii genetycznej?

Yac-I

RLFP

Southern

Klonowanie DNA

Biblioteki genomowe

Kosmidy

Pytanie 15

Rzęski u eucaryota, budowa, mechanizm:

dyneina przyłącza się do A

ramiona podwłókien A i B przyłączone są do kinezyny

siła powstająca przez mostki poprzeczne między A i B

poszczególne pary mikrotubul są trzymane razem przez łączniki zbudowane z dyneiny

ramiona podwłókien A są zbudowane z dyneiny wykazującej aktywność ATPazową

gł. Składnikiem włókien rzęsek komórek eucaryotycznych są mikrofilamenty tubulinowe, które wchodzą w skład podstawowej wiązki włókien zwanej aksodyskiem

Pytanie 16

Miozyna, meromiozyna lekka (LMM) i meromiozyna ciężka (HMM):

Fragment S1 HMM - jest ATPazą, ale nie jest zbudowana z mikrotubul aktynowych

HMM tworzy filamenty, brak aktywności ATPazy

LMM tworzy filamenty, brak aktywności ATPazy

HMM nie tworzy filamentów

LMM nie tworzy filamentów

Pytanie 17

Replikacja DNA u procaryota:

odp z SSB

topoizomeraza I tnie dwie nici, topoizomeraza II tnie jedną nić

nie potrzebują ATP

Jest semikonserwatywna

gyraza wymaga ATP, odpowiada za superskręty

Pytanie 18

Główny układ zgodności tkankowej

MHC II- cd8

układ zawiera 3 grupy MHC I, MHC II, MHC III

kodowane przez HLA

Opryszczka

MHC I- cd 4

są polimorficzne i odrzucają przeszczepy

Pytanie 19

PCR

3 etapy etap drugià temperatura nie zalezy od długości startera; od długości startera zależy czas trwania drugiego etapu

wymaga polimerazy DNA i czterech deoksynukleotydów

białaczka

pozwala na wykrycie niewielkich wirusów

potrzebuje dwóch starterów komplementarnych do siebie jak w metodzie dideoksy

coś z rearanżacjami chromosomów

Pytanie 20

Przeciwciała wytwarzane przez człowieka:

10^8

Różne ramki odczytu

Różne rodzaje przeciwciał powstają przez ..

V,D,J,C

Pytanie 21

Kierowanie białek które ze stwierdzeń na temat sekwencji sygnałowych są poprawne:

wewnętrzne sekwencje sygnałowe nie są odcinane po przejściu przez błonę ER

SRP zapobiega przedwczesnej elongacji, a przez to fałdowaniu się białka

cząsteczka rozpoznająca sygnał (SRP) jest białkiem składającym się z 7 a helis/ łańcuchów polipeptydowych

Rozfałdowane łańcuchy polipeptydowe są optymalnymi substratami do transportu przez błonę

Cykl ATPADP... sekwencję sygnałową z SRP i odłącza ją od …

uwolnienie SRP z rybosomu powoduje zahamowanie elongacji polipeptydu

Pytanie 22

Które zdania na temat struktury DNA są prawdziwe:

dwuniciowe RNA może przyjmować strukturę A DNA

temp topnienia jest odwrotnie proporcjonalna do długości łańcucha

połączenie zasady z cukrem nosi nazwę nukteozydu

jeżeli A+G =30% to T może być więcej niż 20%

deoksyryboza ma przy węglu 2’ wolną grupę OH

adenozyna i guanina wiąże się przez N9 z C1 deoksyrybozy wiązaniem N--glikozydowym , a cytozyna i tymina przez N-1 z C1

guanina paruje się z cytozyna poprzez 3 wiązania wodorowe

efekt hiperchromowy - efekt podczas topnienia DNA, który powoduje podwyższenie absorbancji przy długości fali 260 nm

zasady w superhelisie są wewnątrz helisy

komplementarne pary tworzą się pomiędzy puryna i puryną oraz pirymidyną i pirymidyną

Pytanie 23

Sygnały rozpoczynające i kończące sygnał:

sygnałem terminacji transkrypcji jest część RNA o strukturze spinki do włosów przed kilkoma resztami UUU

mRNA policistronowe

promotory genów szoku cieplnego różnią się w sposób zasadniczy od typowych promotorów rozpoznawanych przez inne warianty odpowiedniej podjednostki polimerazy RNA

u E.coli wyspecjalizowane sygnały terminacji transkrypcji zwane atenuatorami podlegając regulacji określonych genów dostosowują się do potrzeb pokarmowych komórki

heksametryczne białko RHO jest ATPazą w obecności jednoniciowego RNA i uczestniczy w terminacji transkrypcji niektórych genów E.coli

typowe promotory E.Coli zawierają w obrębie –10 tzw. Kasete tata, o sekwencji zgodnej TATAA

za prawidłowe rozpoznanie miejsca startu transkrypcji odpowiada podjednostka alfa polimerazy RNA

Pytanie 24

Translacja u procaryota

peptydylotRNA może znajdować się zarówno w miejscu P lub A rybosomu, w zależności od fazy cyklu translacyjnego

poszukiwanie pierwszego kodonu AUG od 5’ końca transkryptu hydrolizującego ATP

formylometionylo-tRNAf powstaje w reakcj

czynnik elongacyjny Ts (EFTs) wiąże nukleotyd GTP, przez co w wyniku hydrolizy uwalnia się GDP

fMet-tRNAf zajmuje miejsce P jako jedyne

mRNA policistronowe

czynnik elongacyjny Tu(EFTu) oddziałuje ze wszystkimi cząsteczkami aminoacetylotRNA oprócz fMet-tRNAf

fMet-tRNAf inicjatorowy wiąże się w przeciwieństwie do...

Pytanie 25

Degradacja eukariotycznych RNA:

może zależeć od sekwencji znajdujących się w obrębie transkryptu

powoduje, że eukariotyczne mRNA są cząsteczkami żyjącymi dłużej niż ich odpowiedniki bakteryjne, jednak z typowym okresem półtrwania rzędu 10--20 minut

w prawidłowej, niezmienionej komórce skutkuje powstaniem krótkich interferujących RNA o długości 21--28 nukleotydów

może zależeć od szlaku, którego jednym z elementów są cząsteczki RNA o strukturze spinki do włosów, powstające z prekursorowego RNA, syntezowanego przez polimerazę RNA II.

może przebiegać według mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA, który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych.

może przebiegać, w procesie, w którym następuje usuwanie czapeczki mRNA skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcucha Poli(A), co z kolei prowadzi do braku translacji i szybkiego trawienia eksonukleolitycznego.

Pytanie 26

Jeden/jednym z typowych promotorów E. Coli poddano, wraz z kontrolowanym przez ten promotor genem gruntownym badaniom, korzystając z odpowiednich metod biologii molekularnej. Poniżej przedstawione są wybrane wnioski jakie sformułowano po ich przeprowadzeniu. Wybrać te które są zgodne z AKTUALNYM stanem wiedzy:

w trakcie eksperymentów prowadzonych in vitro nie zaobserwowano powstawania krótszych niż spodziewany, transkryptów.

wzbogacenie sekwencji -10 w pary GC wpływa na proces rozpoznania promotora przez podjednostkę polimerazy RNA

Rozpoczęcie elongacji towarzyszy zmiana konformacyjna holoenzymu polimerazy RNA skutkiem czego pokrywa ona mniejszy odcinek DNA (30--40bp).

w zamkniętym kompleksie promotorowym polimeraza pokrywa ok. 80 pz, rozpoczynając powyżej bloku 35 i kończąc poniżej bloku 10

rdzeń polimerazy RNA rozpoznaje sekwencję promotora i łączy się z nim

zmiana sekwencji bloku/kasety -35 promotora ma bezpośredni wpływ na przekształcenie zamkniętego kompleksu promotorowego w kompleks otwarty

Pytanie 27

Bardzo często polipeptyd uwalniany z rybosomu jest nieaktywny i zanim będzie mógł spełniać swoją funkcję w komórce musi być poddany obróbce potranslacyjnej. Z podanych poniżej wybrać te, które są PRAWDZIWE w odniesieniu do obróbki potranslacyjnej.

nie jest możliwe, aby niewłaściwie sfałdowane białko przyjęło właściwą dla siebie konformację

inteina, to wewnętrzny fragment białka usuwany po translacji z jednoczesnym połączeniem fragmentów go otaczających

niektóre białka syntezowane są jako poliproteiny, długie polipeptydy zawierające kilka białek połączonych ze sobą jedno za drugim, sposobem głowa-ogon; zdarza się, że sekwencje kodujące poszczególne produkty (białka) zachodzą na siebie

białka opiekuńcze decydują o trzeciorzędowej strukturze białek

niektóre z intein posiadają aktywność endonukleazy, która może specyficznie przeciąć gen nie zawierający inteiny, co jest wymagane do ukierunkowanego przemieszczania się sekwencji intronu inteiny

gdyby w komórce proces fałdowania polipeptydu przebiegał, gdy dostępna jest tylko jego część, to mogłoby zmniejszyć prawdopodobieństwo występowania nieprawidłowych odgałęzień ścieżki fałdowania

Pytanie 28

Które z poniższych twierdzeń dotyczących telomerazy ssaków jest PRAWDZIWE?

Telomeraza jest polimerazą DNA zależną od RNA

Terapia powodująca inaktywację telomerazy powinna być stosowana w walce z rakiem tylko wtedy, gdy aktywacja telomerazy jest przyczyną powstawania raka, a nie skutkiem

Aktywność telomerazy jest kontrolowana przez białko TRF1 promujące tworzenie struktury telomerów typu pętli t.

Telomeraza syntezuje tylko jeden z łańcuchów polinukleotydowych telomeru korzystając z matrycy bogatej w reszty G

Telomeraza jest aktywna w wybranych typach komórek,- enzym jest aktywny w komórkach embrionalnych, natomiast po urodzeniu jego aktywność przejawia się w komórkach rozrodczych i macierzystych.

Telomeraza jest aktywna w wybranych typach komórek np. w komórkach hemopoetyczych szpiku kostnego

Żadna z powyższych odpowiedzi nie jest prawdziwa

Pytanie 29

Problem topologiczny dotyczy którego z następujących zagadnień?

Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów dsDNA opisuje grupa plektonemiczna

Synchronizacja replikacji DNA z podziałem komórkowym

Aranżacja DNA zapobiegająca rozdziałowi łańcuchów DNA opisuje grupa toponemiczna

Rozwijanie dsDNA i rotacja cząsteczki DNA

Zablokowanie miejsc replikacji DNA przez nukleosomy

Trudności związane z syntezą DNA na nici opóźnionej

Pytanie 30

Standardowy mechanizm syntezy białka polega na przesuwaniu się rybosomu względem mRNA dokładnie kodon za kodonem. Są znane jednak nietypowe zjawiska zachodzące podczas elongacji. Poniżej podane zostały informacje na ich temat – zaznaczyć prawdziwe

w przypadku kilku mRNA obserwuje się zaprogramowaną zmianę fazy odczytu, zmieniającą fazę odczytu w specyficznym miejscu transkryptu

zaprogramowana zamian fazy odczytu występuje wyłącznie w bakteriach

pominięcie translacyjne zaczyna się i kończy zawsze na dwóch identycznych kodonach.

poślizg rybosomu umożliwia jednemu rybosomowi translację wybranych fragmentów mRNA policistronowego, np. mRNA operonu laktozowego.

wskutek pominięcia translacyjnego z jednego mRNA mogą być syntezowane dwa różne białka

zmiana fazy odczytu polega na tym, iż w czasie translacji mRNA rybosom zatrzymuje się, przesuwa o jeden kodon do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację

Pytanie 31

Które z podanych poniżej informacji są PRAWDZIWE w odniesieniu do domeny C końcowej (CTD) największej podjednostki polimerazy RNA II

CTD jest zaangażowane w oddziaływanie z czynnikami białkowymi biorącymi udział w procesach molekularnych towarzyszących terminacji transkrypcji

Wieloskładnikowy kompleks białkowy, tzw. Czynnik specyficzności cięcia i poliadenylacji (CPSF), pozyskiwany do kompleksu polimerazy jest już na etapie inicjacji transkrypcji i wchodzi w kontakt z CTD. CPSF pozostaje związany z CTD do czasu pojawienia się sekwencji poliA w transkrypcie.

U ssaków CTD zawiera 52 powtórzenia siedmioaminokwasowej sekwencji Tyr--Ser--Pro--Thr--Ser--Pro--Ser. Dwie z reszt Pro w każdym powtórzeniu mogą być modyfikowane przez dodanie grup fosforanowych –

Status jej fosforylacji jest stały podczas trwania procesu transkrypcji – zmienia się na etapie inicjacji, podczas trwania transkrypcji jest taki sam

Jej fosforylacja warunkuje przyłączenie się polimerazy do kompleksu preinicjacyjnego

Kompleks białkowy zwany mediatorem bezpośrednio aktywuje inicjację transkrypcji przez fosforylację CTD

Pytanie 32

Zakończenie transkrypcji bakteryjnej:

Może być skutkiem specjalnego rodzaju kontroli zależnego od sprzężonych ze sobą procesów syntezy transkryptu i biłaka – bakteriofag lambda – syntezowane białka są antyterminatorami dzięki czemu bakteriofag może przejść w kolejną fazę

Poprzedzone jest nieciągłym procesem transkrypcji

Może być zależne od białka Rho, które posiada aktywność helikazy, dzięki czemu może ono aktywnie „rozbijać” pary zasad, w tym przypadku pomiędzy matrycą a ciągiem reszt U struktury spinki do włosów transkryptu

Żadne z powyższych stwierdzeń nie jest prawdziwe

Mniej więcej w połowie przypadków następuje w obrębie sekwencji nici matrycowej DNA, która zawiera sekwencję odwróconego palindromu

Może być kontrolowane przez tzw. Białko antyterminacyjne, którego obecność zapobiega, na przykład, zatrzymaniu się polimerazy przy terminatorze zależnym od białka Rho.

Pytanie 33

Które z podanych poniżej twierdzeń są PRAWDZIWE dla zjawiska replikacji DNA w komórkach eukariotycznych ?

Koniec 5’startera używanego przez polimerazę DNA zawiera resztę 5’ fosforanową , blokuje aktywność enzymatyczną nukleazy oznaczanej skrótem FEN1

Żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe

Chromatydy siostrzane są aż do stadium anafazy dzięki kohezynom, które dołączane są do nowych nici DNA natychmiast po przejściu przez widełki replikacyjne.

Zakończenie syntezy fragmentu Okazaki wymaga usunięcia sekwencji startera odpowiednią polimerazą posiadającą aktywność egzonukleazy

Polimeraza DNA kopiująca nić opóźnioną tworzy kompleksy dimeryczne

Enzymy i pozostałe białka biorące udział w replikacji tworzą duże struktury wewnątrzjądrowe tzw. fabryki replikacyjne, z których każda zawiera odpowiednik bakteryjnego replisomu

Pytanie 34

Jaki stan metylacji wysp CpG charakteryzuje geny metabolizmu podstawowego (housekeeping genes)?

Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów nie są metylowane.

Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów są metylowane w niektórych tkankach, ale nie we wszystkich.

Wyspy CpG nie są metylowane tylko w tych tkankach, w których specyficznej ekspresji ulega sąsiadujący z nią gen metabolizmu

Żadne z powyższych twierdzeń nie jest prawdziwe.

Wyspy CpG położone w sąsiedztwie tych genów charakteryzuje wysoki poziom metylacji.

Te geny z reguły nie są położone w sąsiedztwie wysp CpG

Pytanie 35

Które z poniższych twierdzeń są prawdziwe w odniesieniu do piętnowania genomowego

funkcją piętnowania jest to, że DNA pary alleli (obu jednocześnie) homologicznych podlega metylacji, co skutkuje brakiem ich ekspresji

jeden z pary alleli ulega metylacji w procesie zależnym od tzw. elementów kontrolujących piętnowanie

Skutkiem piętnowania jeden gen z pary alleli ulega ekspresji, drugi jest metylowany i wyciszany.

żadna z odpowiedzi nie jest prawdziwa.

piętnowaniu podlegają tylko geny kodujące białka.

jest to bardzo często występująca cecha genomów ssaków

Pytanie 36

Jeśli komórka diploidalna ma 4 chromosomy X to ile chromosomów X będzie transkrybowanych?

To się zmienia mogą być dwa lub jeden

cztery

jeden

trzy

dwa

To się zmienia mogą być trzy albo dwa

Pytanie 37

Które z poniższych twierdzeń opisują funkcje jąderka

jest miejscem obróbki cząsteczek mRNA

jest miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNA

est miejscem w jądrze komórkowym gdzie biegnie transkrypcja zależna od polimerazy RNAII

jest rusztowaniem chromosomowym zmieniającym swoją strukturę w czasie podziału komórki co prowadzi do kondensacja chromosomów

jest miejscem ekspresji genów kodujących białka

jest miejscem syntezy i obróbki cząsteczek rRNA

Pytanie 38

Które zdanie prawidłowo opisuje składanie RNA w układzie trans ?

Składanie w układzie trans zachodzi w sposób podobny do składania przebiegającego z wycinaniem intronów GUAG, z tym że zamiast lassa tworzona jest struktura widełek.

Składanie w układzie trans jest powszechnym zjawiskiem w odniesieniu do transkryptów genów człowieka.

Odbywa się pomiędzy eksonami zawartymi w obrębie różnych cząsteczek RNA.

Następuje zastąpienie wybranych eksonów w niektórych transkryptach przez ekson liderowy

Niektóre RNA uczestniczące w tym procesie zawierają informację z dwóch genów, co skutkuje jednoczesną translacją, prowadzącą do dwóch produktów białkowych

Sekwencje intronowe nie są usuwane z transkryptów RNA i podlegają translacji do białek.

Pytanie 39

W jaki sposób zachodzi zmiana fazy odczytu w czasie translacji?

Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji przesuwa o jeden kodon do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.

Rybosom dochodzi do końca sekwencji kodującej, uwalnia właściwie zsyntezowane białko i rozpoczyna syntezę nowego białka począwszy od następnego kodonu inicjacyjnego.

Rybosom zatrzymuje się w czasie translacji, przesuwa o jeden nukleotyd do przodu lub do tyłu i potem kontynuuje translację.

Rybosom przeprowadza translację cząsteczki tRNA, która zawiera jeden dodatkowy nukleotyd lub brakuje w niej nukleotydu

W czasie translacji cząsteczek RNA rybosomu pomija kodon.

Rybosom kończy translację na kodonie, który koduje aminokwas.

Pytanie 40

Zakończenie (terminacja) transkrypcji bakteryjnej:

następuje mniej więcej w połowie przypadków w obrębie sekwencji nici matrycowej DNA, która zawiera sekwencje odwróconego palindromu.

może być skutkiem specjalnego rodzaju kontroli, zależnego od sprzężonych ze sobą procesów syntezy transkryptu i białka

Może być kontrolowane przez tzw. białko antyterminacyjne, którego obecność zapobiega, np. zatrzymaniu się polimerazy przy terminatorze zaleznym od białka Rho

może być zależne od białka Rho, które posiada aktywność helikazy, dzięki czemu może ono aktywnie ‘rozbijać’ pary zasad pomiędzy matrycą a ciągiem reszt Ustruktury spinki do włosów transkryptu

Poprzedzone jest nieciągłym procesem transkrypcji , podczas którego polimeraza dokonuje wyboru pomiędzy kontynuowaniem elongacji a terminacją

Pytanie 41

Degradacja drożdżowych mRNA:

może przebiegac wg mechanizmu zwanego kontrolą jakości mRNA (RNA surveillance), który prowadzi do specyficznej degradacji cząsteczek mRNA, w których na skutek nieprecyzyjnego wycięcia intronów dochodzi do powstania nieprawidłowych kodonów terminacyjnych

może zachodzić w kierunku od 5’ do 3’ lub 3’ do 5’ w odróżeniniu od degradacji w komórkach bakteryjnych, która zawsze zachodzi w kierunku od 3’ do 5

może uczestniczyć w procesie, w którym uczestniczy wielobiałkowy składnik zwany egzosomem, który degraduje mRNA przy udziale spokrewnionych z enzymami bakteryjnego degradosomu.

w prawidłowej, niezmienionej komórce (tzn. niezainfekowanej wirusami i nietransformowanej egzogennym DNA) może być skutkiem wyciszania RNA (interferencji RNA)

może przebiegać w procesie w którym następuje usuwanie czapeczek skutkiem czego dochodzi do usunięcia łańcuchów poliA, co z kolei prowadzi do braku translacji mRNA i szybkiego i szybkiego trawienia eksonukleotydów

może zależeć od obecności tzw. elementów niestabilności, znajdujących się w obrębie transkryptu

Pytanie 42

Remodelowanie nukleosomu to jeden ze sposobów/typów modyfikacji struktury chromatyny:

który zachodzi przy udziale złożonych kompleksów białkowych np. Swi/Snfi i wpływa na ekspresję całego genomu

który wiąże się z intensywnymi modyfikacjami chemicznymi histonów

który jest indukowany przez zależny od energii proces osłabiający oddziaływania pomiędzy nukleosomem i związanym z nim DNA

które może skutkować tzw. przemieszczeniem cis, skutkujący transportem(?) nukleosomu na inną cząsteczkę DNA

Żadne nie jest prawdziwe

który jest bezwzględnie konieczny dla rozpoczęcia transkrypcji genu

Pytanie 43

Cechy charakterystyczne mRNA eukariota

Zazwyczaj powstają z premRNA

Posiadają na końcu 3’ ogon poliA , nie kodowany przez matryce

Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG lub pppG

Translacja jest sprzężona z transkrypcja i zachodzi w tym samym czasie

Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG

Pytanie 44

Odwrotna transkryptaza

organizmy eukariotyczne mogą korzystać z retrowirusa zmieniać metabolizm

wirusowa czy komórki gospodarza

2-niciowy RNA wbudowuje się do genomu

Replikaza RNA- - polimeraza RNA zależna od RNA

odwrotna transkryptaza RNA zależna od DNA

powstaje hybryda DNA – RNA

polimeraza DNA zależna od RNA

polimeraza DNA zależna od DNA

Pytanie 45

SPLAJSING

w splicuinu gr 1 następuje atak guaniny lub guanozyny ma na 2’ OH

w splicosomie u wszystkich Eukariotów uczestniczą katalityczne cząsteczki snRna

gr 1 jest u Procaryota gr 2 u Eucaryota – u prokariota nie ma splicingu bo nie ma intronów

splajsing autokatalityczny grupy 1 wymaga guaznozyny lub guanylanu i wiąże się do miejsca splajsingowego 3

Pytanie 46

Histony – modyfikacje potranslacyjne na końcu N’

w euchromatynie acetylacja N-końców

kod histonowy – było coś o tym, że kod histonowy jest informacją czy zbiorem informacji o modyfikacjach czy coś takiego

w heterochromatynie acetylacja N-końców

tylko Lys ulega acetylacji w ogonach hisonowych

regulacje dotyczące histonów noszą nazwę kodu histonowego

wystawienie ogonów na działanie acetylaz

Pytanie 47

Operon laktozowy

gen Y koduje βgalaktozydaze

coś tam że jak się łączy z kompleksem CAP-cAMP w miejscu operatorowym

tworzy się jeszcze permeaza i transacetylaza

tworzy wiązanie 1,6 βglikozydowe w allolaktozie

katalizuje syntezę laktozy z glukozy i galaktozy

IPTG jest induktorem metabolizowanym przez B-galaktozydazę

katalizuje tworzenie glukozy i czegoś tam jeszcze

przyłącza się cAMP

Pytanie 48

Enzymy restrykcyjne pocięto jakiś liniowy odcinek DNA enzymem EcoRV , obraz po elektroforezie uwidoczniono na żelu , Co możesz powiedzieć na podstawie rysunku 17 poniżej , żel wybarwiono bromkiem etydyny , zwróć uwagę na słabo rozdzielone elementy o długościach 433 i 415 pz

Żadna z powyższych nie jest prawdziwa

Metoda ta może być stosowania do produktów ekspresji metody Sangera

Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o dług. 210pz

W żelu znajduje się bromek etydyny

Na tym odcinku DNA znajduje się 5 unikalnych mc restrykcyjnych rozpoznawanych przez enzym

Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o dług. 2220pz

Pytanie 49

Co jest wymagane do przeprowadzenie reakcji Sangera ale chodziło o to że jest obecny zawsze w jednym z odczynników?

jeden z 4 dNTP

matryca

polimeraza DNA (I)

ά-P32-ATP

Pytanie 50

Chcesz syntezować nić DNA co jest do tego NIEZBĘDNE?

matryca komplementarna do startera

matryca 1 lub 2 niciowa

polimeraza DNA

wszystkie 4 dNTP

wszystkie 4 NTP

jon magnezu

starter z 3’-OH

aktywność egzonukleazowa 3’--5

Pytanie 51

represora λ

łączy się z OR3

rożne powinowactwo przez białko lex A

rożne powinowactwo do miejsc OR

cro przyłącza się do OR 1 i hamuje represor lambda

w swoim cyklu lizogennym ma taki okres ze powstaje hybryd DNA-RNA faza lizogenna jest utrzymywana dzięki działaniu represora lambda

wiąże specyficznie do sekwencji DNA rozpoznawanych przez białko cro

koduje represor lambda i cro

koduje represor lambda tylko w fazie lizogennej

przyłącza się do ssDNA –

ma miejsce wiązania ara

wiąże jako monomer

Pytanie 52

Pytanie dotyczące usuwanie deaminowanej Cytozny do uracylu w DNA

mutacje w DNA są widoczne we wszystkich następnych pokoleniach

enzymy usuwające tą mutacje – proces naprawy – glikozydaza uracylowa, potem endonukleaza AP, polimeraza DNA i ligaza na końcu

jest to spontaniczna modyfikacja prowadzi do powstania nowych kodonów

czy da to mutację CG – AT w niciach potomnych

jeżeli jest w mRNA to w znaczący sposób wpływa na ekspresję

tymina jest obecna w RNA, mimo że koszt energetyczny syntezy jest większy niż w uracylu, występującym w RNA

Pytanie 53

Pytanie o kod genetyczny

jest uniwersalny jego uniwersalność jest prawie absolutna

nie ma znaków przecinkowych

jest zdegenerowany, bo w różnych organizmach kodują inny aminokwas

ma 64 kodony kodujące 20 aminokwasów

3 kodony kodujące 1 aminokwas to synonimy

Pytanie 54

Holoenzym polimerazy RNA

wiąże się specyficznie z matrycą

ma po 1 podj. Alfa, beta, gamma i delta 2alfa, 1beta, 1 beta’, 1sigma

łączy się z miejscem promotorowym dopiero po oddysocjowaniu jednej z podjednostek-

bierze udział w inicjacji elongacji i terminacji

Pytanie 55

Redagowanie RNA

zachodzi autokatalitycznie

Zachodzi przy udziale enzymów, np. polimerazy poli(A)

dodatkowa zmiennosc genetyczna

zwiększa różnorodność genomu

Zachodzi już po transkrypcji

Pytanie 56

Represory transkrypcji u Eucaryota

np. deacylacja N-końców histonów

przyłączają się do rejonów cis a same są trans

mają 2 rejony wiążące

mają budowę modułową

Pytanie 57

TOPOIZOMERAZY

zmieniają liczbę opleceń

żadna poprawna

5’-P łaczy się z -OH Ty

5’ P laczy się z ε Lys

przekształcają topoizomery, rozcinają DNA

topoizomerazy 1 rozcina 2 nici, a topoizomerazy 2 jedną nić

wymagają ATP

Pytanie 58

Immunoprecypitacja

ukazane rejony są aktywne transkrypcyjnie

mają więcej etylowanych reszt

dotyczy to euchromatyny

przeciwciało łączy się do Lys na N’ końcu

Pytanie 59

Bakteriofag λ w fazie litycznej

syntetyzuje 3 rożne klasy mRNA, które są wyznaczane poprzez czas po infekcji ich pojawienia

niosą programowaną syntezę białek potrzebnych do replikacji genów i produkcji ich strukturalnych komponentów

N i Q zapobiegają końcu transkrypcji

N powoduje produkcję białka niezbędnego do replikacji DNA faga i rekombinacji

tworzą produkty genów N i Q, które działają jako białka regulacji pozytywnej, prowadzące sekwencyjną λ- kodującego białka

początkowo produkuje dwie cząsteczki jądra, pełni rolę inhibitora syntezy λ represora, a inną gra rolę końca transkrypcji

Q potrzebne, gdy są transkrybowane geny białka główki i ogonka wirusa oraz białka konieczne do lizy komórki gospodarza

Pytanie 60

β-galaktozydaza

jej poziom wzrasta w koordynacji z permeazą galaktozydową i acetylofransferazą tiogalaktozydową

hydrolizuje wiązanie 1,4-β oligosacharydy laktozy i tworzy galaktozę i glukozę

tworzy wiązanie 1,6-β oligosacharydu allolaktozy

jest produkowana z jednostki genu zwanej operonem

obecna w różnych stężeniach zależnie od źródła węgla używanego do wzrostu

est allosterycznie aktywowana przez niemetaboliczny składnik IPTG

Pytanie 61

Które z następujących zdań określa podwójną helisę DNA typu Watson-Crick?

dwa polinukleotydowe łańcuchy są zwinięte wokół wspólnej osi

można zmieniać sekwencje w jednej nici niezależnie od drugiej nic

puryny i pirymidyny znajdują się w wewnętrznej stronie helisy, a szkielet fosfodiestrowy na zewnątrz

skład zasad analizowany z DNA wielu organizmów pokazuje, że ilość A i T jest równe, tak jak ilość G i C

helisa ma pełny obrót o 34 st., bo każda para obraca się o 36 st. względem sąsiedniej pary zasady i oddalonego 3,4 A

tworzy pary A-C i G-T

Pytanie 62

Bardzo długi odcinek DNA z genu Eukariota

może być analizowany przez wędrówkę wzdłuż chromosomu

musi posiadać końce kohezyjne do klonowania

może być pakowany w fag

mogą być odseparowane przez elektroforezę w żelu poliakryloamidowym

może być wydzielana z chromosomów sztucznych drożdży

Pytanie 63

Ligaza DNA

wymagana w replikacji DNA naprawy i rekombinacji

katalizuje reakcje przez mechanizm który wymaga aktywacji fosforanem DNA przez formowanie wiązania fosfobezwodnikowego z AMP

mechanizm katalizowanej reakcji wymaga utworzenia związania kowalencyjnie enzym-adenylan

wymaga kofaktora NAD+ albo ATP zależnie od źródła enzymu, dostarcza energii do tworzenia wiązań fosfodiestrowych

katalizuje tworzenie się wiązania 3’-OH i 5P

Pytanie 64

Kompleks cAMP-CAP

po jego związaniu do atenuatora trp może być transkrypcja genów struktur

chroni miejsca -48 do -5

w obecności arabinozy wpływa na geny struktury

w operonie ora wpływa na geny struktury

represor transkrypcj

chroni przez DNAza -87 do -47

Pytanie 65

Bialko C operonu ara

powoduje wypętlenie, gdy zwiąże się z araO2 i araI

wiąże araO2 aktywując geny struktury

wiąże się specyficznie z DNA w obecności arabinozy

wiąże z araO1 hamując transkrypcję genu

w obecności cAMP-CAP geny struktury operonu i związanie arabinozowego do araO1 i araI

Pytanie 66

Bakteriofag λ

ssDNA = recA oddziałuje z nim także represor λ

białko cro wiąże się do or3 i wtedy hamuje represor (gen c1)

białko cro związane z or1 to hamuje syntezę represora

zostaje uwolnione z chromosomu bakteryjnego z kompleksu rexDNA

syntetyzuje tylko represor λ w bakterii lizogenicznych

gdy nic nie atakuje, zmienia to w fazie lizogenicznej jest on obecny z uwagi na represor, który ulega autoregulacji

profag (DNA) jest także lizogenicznej, gdy nie aktywuje zmiany bo represor λ …

Pytanie 67

Operon arabinozowy

może syntezować arabinozę przy wykorzystaniu białek powstałych z białek struktury

w obecności cAMP-CAP i arabinozy nie da się zapętlić

cAMP-CAP i arabiznoza może przeprowadzać transkrypcje genów struktury, nieznacznie obniżają szybkość

konstutywna synteza białka C

Pytanie 68

tRNA

zawiera ACC, gdzie przyłączone aminokwasy

zawiera od 70-90 nukleotydów

duża cześć jest sparowana

antykodon i miejsce wiązania aminokwasu na przeciwległym końcu

zbudowany z helikalnych końców tworzących literę U

wiele zmodyfikowanych nukleotydów

CCA na końcu 3’

Pytanie 69

Translacja mRNA u Prokaryota

czynniki elongacyjne EF-Ts i EF-Tu

EF-Ts wiąże nukleotyd podlegający hydrolizie

formylometionylo-tRNA powstaje w reakcji

Tu oddziałuje z tRNA oprócz fMet-tRNA

mRNA policistronowe

miejscem translacji jest kodom met AUG za sekwencją bogatą w puryny komplementarną do 16s tRNA

Pytanie 70

Histony

H1 rdzeń nukleosomu

replikacja eukariotycznego chromosomu to kilka widełek

białka aktywatorami transkrypcji podjednostek

sekwencje powtórzeniowe to znaczny % DNA eukariotycznego

histony wiążą się z nicią wiodącą

140 par zasad otacza 8 białek histonowych

białka kodowane przez pojedyncze kopie genów

mRNA histonowe ulega adenylacji

silnie zasadowe białka, ładunek ‘+’

geny kodujące histony wielokrotnie powtórzone

białka histonowe H1, H2A, H2B, H3, H4

histony nie maja intronów

Pytanie 71

Telomerazy

odwrotna transkryptaza 5’🡪3’

wymaga matrycy

syntezuje nic w kierunku 5’🡪3’

nie uzupełniają nici opóźnionej

RNA jest matrycą

mają aktywność polimerazy RNA

syntezuje nić bogatą w G

Twój wynik: ozi <3

Analiza