Twój wynik: JUMPJET 1.1
Analiza
Wszystkie ({{dataStorage.userResults.answersTotal}})
Prawidłowe ({{dataStorage.userResults.answersGood}})
Do powtórki ({{dataStorage.userResults.answersRepeat}})
Błędne ({{dataStorage.userResults.answersBad}})
Pytanie 1
Kwasy nukleinowe
Jednoniciowy RNA może tworzyć helisę z komplementarnym jednoniciowym DNA
Deoksyryboza nie zawiera grupy hydroksylowej 2’
Podczas rozplatania dwuniciowej helisy DNA pod wpływem wzrostu temperatury następuje spadek absorbancji przy długości fali 260 nm
W DNA obok standardowych wiązań fosfodiestrowych 3’-5’ występują także przejściowo 2’-5’. fosfodiestrowe
Temperatura topnienia DNA zależy od długości cząsteczki DNA w sposób odwrotnie proporcjonalny
Ryboza nie zawiera grupy hydroksylowej 3’
Pytanie 2
Mutacja genów
Zamiana zasady purynowej na purynę jest przykładem transwersji
Głównym efektem działania światła ultrafioletowego jest powstanie wiązań kowalencyjnych łączących komplementarne zasady pirymidynowe w jednej nici DNA TAK
Puste miejsca powstałe w wyniku wycięcia uszkodzonego DNA wypełnia polimeraza DNA III
Guanina ulega deaminacji oksydacyjnej do ksantyny
Transwersja jest jednym z rodzajów delecji
Produkt utlenienia guaniny, 8 - oksyguanina, tworzy wiązania wodorowe z adeniną
Insercja polega na wstawieniu jednej lub większej liczby zasad do danej cząsteczki DNA
Głównym efektem działania światła ultrafioletowego jest powstanie wiązań kowalencyjnych łączących komplementarne zasady pirymidynowe w jednej nici DNA
Spontaniczne pojawienie się uracylu w DNA podlega naprawie polegającej na jego metylacji w odpowiedniej pozycji z utworzeniem tyminy
Psoralen i jego chemiczne pochodne mogą połączyć kowalencyjnie dwie nici DNA
Metylacja cytozyny w pozycji C5 może skutkować zwiększonym poziomem mutacji z powodu zachodzącej spontanicznie jej deaminacji
Za usuwanie dimerów pirymidynowych w komórkach jest odpowiedzialne białko FGIR będące fotoligazą
Hipoksantyna tworzy parę z cytozyną
Wprowadzenie do DNA 5-bromouracylu zwiększa częstość pojawiania się insercji
Pytanie 3
Spośród poniższych składników wybierz te, które są wymagane dla aktywności polimerazy DNA zależnej od DNA do przeprowadzenia reakcji syntezy nowego łańcucha (DNA):
Odcinek starterowy posiadający wolną grupę hydroksylową 5’
Jony Mg2+
Wszystkie 4 aktywowane prekursory dATP, dCTP, dGTP, dTTP
Wszystkie 4 aktywowane prekursory 5’-trifosforany deoksyrybonukleozydów
NAD+, który dostarcza energii do syntezy
Jednoniciowa lub dwuniciowa matryca DNA
Wszystkie 4 aktywowane prekursory ATP, CTP, GTP, TTP
Pytanie 4
Ligazy DNA
Wymagają końców DNA z wolną grupą 3’-OH oraz ufosforylowaną grupą hydroksylową 5’
Mechanizm katalizowanej reakcji wymaga utworzenia związania kowalencyjnie enzym-adenylan
Źródłem energii dla danej ligazy może być ATP jak i NAD+
Katalizuje tworzenie się wiązania 3OH i 5P
Katalizują tworzenie wiązań fosfatydylowych w miejscach zerwania łańcucha DNA
Wymagana w replikacji DNA do naprawy i rekombinacji
Katalizuje reakcje przez mechanizm, który wymaga aktywacji fosforanem DNA przez formowanie wiązania fosfobezwodnikowego z AMP
Mogą łączyć końce jednoniciowego DNA w formę kolistą
Jednym z etapów reakcji jest przeniesienie reszty AMP na ufosforylowany koniec 5’ DNA z utworzeniem wiązania bezwodnikowego
Wymaga kofaktora NAD+ albo ATP zależnie od źródła enzymu, dostarcza energii do tworzenia wiązań fosfodiestrowych
Ligaza T4 bierze udział w przyłączeniu białka regulatorowego do sekwencji promotorowej
Pytanie 5
Topologia DNA:
Do zmiany konformacji cząsteczki DNA wystarczy jej rozplecenie i ponowne splecenie do nowej postaci bez przecinania którejkolwiek z nici, podczas gdy do zmiany topologii konieczne jej rozcięcie przynajmniej jednej z nici
Lk-liczba opleceń mówi, ile razy jedna nić DNA oplata prawoskrętnie drugą nić DNA i dlatego jest zawsze dodatnia dla DNA- B
Prokariotyczne izomerazy typu II katalizują
Liczba opleceń (Lk) naturalnie występująca u cząsteczek DNA, jest cechą dotyczącą wyłącznie DNA kolistego
liczba opleceń mówi ile razy jedna nić DNA oplata prawoskrętnie drugą nić DNA i dlatego jest zawsze dodatnią helisą typu B
Lk-liczba opleceń- jest topologiczną właściwością DNA
Tw-liczba skrętów- móri nam ile razy jedna nić oplata się wokół osi dupleksu w DNA
Lk=Tw+Wr
Liczba zwojów (Wr) jest cechą topologiczną
DNA chromosomów człowieka jest superskręcone negatywnie/ujemnie, dzięki toroidalnemu nawinięciu DNA na szkielet
Lk naturalnie występujących cząsteczek DNA nie jest cechą dotyczącą wyłącznie kolistego DNA
Wr-Liczba zwojów- mówi nam ile razy oś helisy DNA oplata prawoskrętnie samą siebie
Wr-Liczba zwojów-liczba zwrotów, które oś dupleksu DNA wykonuje wokół osi superhelisy
Pytanie 6
Wskaż zdania dotyczące dwuniciowej DNA, które są prawdziwe
Połączenie puryny z rybozą i pirymidyny z deoksyrybozą nosi nazwę nukleozydu
Jest jednokierunkowa
Deoksyryboza ma przy 3’ wolna grupę OH
Guanina paruje z cytozyną poprzez 3 wiązania wodorowe
Zasady w superhelisie znajdują się wewnątrz helisy prostopadle do osi helisy
Komplementarne pary tworzą się między pirymidyna a pirymidyna, puryna a puryną
Pytanie 7
Mamy oligonukleotyd, który ma tępe końce. Jakich odczynników musimy dodać, aby powstał peptyd o końcach lepkich:
ATP
Endonukleaza EcoRI
Pi
Kinaza polinukleotydowa
Ligaza z faga T-4
Pytanie 8
Które zdania są prawdziwe o DNA
Jeżeli na jednej nici A+G wynosi 30%, to możliwe jest by na drugiej T stanowiło 20%
Zawsze jest dwuniciowa
Ze wzrostem ilości nukleotydów temperatura topnienia wzrasta
Hiperchromizm jest to efekt podczas topnienia DNA, który powoduje obniżenie absorbancji przy promieniu 260 nm
Paruje 5 zasad
Pytanie 9
Które z poniższych zdań są cechami kodu genetycznego?
Każdy aminokwas może być kodowany przez więcej niż jeden kodon, przy czym skład pierwszej i drugiej zasady dla danego aminokwasu jest taki sam
Sekwencja jest odczytywana kolejno, od określonego miejsca startowego
61 trojek koduje aminokwasy
Mutacja w sekwencji końca 5' cząsteczki tRNA może sprawić, że dany kodon STOP w mRNA będzie rozpoznawany jako kodon kodujący aminokwas.
Znakami przestankowymi w kodzie genetycznym są zwykle cytozyny metylowane przy C-5
Kodony, które określają ten sam aminokwas są nazywane akronimami.
W różnych organizmach ten sam kodon może kodować inny aminokwas, co jest nazywane degeneracją kodu genetycznego
Jest zdegenerowany
Jest całkowicie zdegradowany
Kod genetyczny jest w pełni uniwersalny, co oznacza, że wszystkie systemy translacyjne organizmów żywych używają tego samego kodonu, lub tej samej grupy kodonów, dla tych samych aminokwasów.
Mutacja w pętli antykodonu cząsteczki tRNA może sprawić, że dany kodon STOP w mRNA będzie rozpoznawany jako kodon kodujący aminokwas
Pytanie 10
Gen
W genie prokariota występuje współliniowa zależność pomiędzy genem i kodowanym przez niego białkiem.
Introny kodują łączniki pomiędzy białkami
Eukariota mają introny, a większość prokariota nie ma
Egzony mogą kodować całe domeny białek
Splicing autokatalityczny jest jedną z metod do otrzymania białka o innnych właściwościach
Pytanie 11
Czym się różni polimeraza RNA od polimerazy DNA
Syntezę RNA ułatwia nukleofilowy atak na gr 2’
Wydłuża rosnący łańcuch w kierunku 5’->3’
Jako startera wymaga RNA zamiast DNA
Katalizuje tworzenie wiązań fosfodiestrowych tylko wtedy, gdy zasada przyłączonego nukleotydu jest komplementarna do zasady w łańcuchu stanowiącym matrycę
Umożliwia syntezę łańcucha DNA poprzez ułatwienie ataku nukleofilowego grupy hydroksylowej 3’ rosnącego łańcucha na atom fosforu w pozycji alfa odpowiedniego bifosforanu deoksyrybonukleotydu
Umożliwia syntezę łańcucha DNA poprzez atak nukleofilowy grupy hydroksylowej 3’ rosnącego łańcucha na atom fosforu w pozycji α odpowiedniego dNTP
Nie ma właściwości nukleazowej
Wymaga jonu 2-wartościowego
Wymaga dUTP zamiast dTTP
Jako matryce wykorzystuje RNA zamiast DNA
Pytanie 12
PCR
Ma ważne zastosowanie w mutagenezie ukierunkowanej sterowanej oligonukleotydem
Metodą tą możemy skutecznie poddać amplifikacji także ten fragment cząsteczki DNA, którego sekwencji nie znamy, pod warunkiem, że znamy sekwencje go oskrzydlające (otaczające)
Służy do wykrywania śladowych ilości wirusów i bakterii
Wykorzystywana do wykrywania białaczki (spowodowane rearanżacją chromosomów)
Klasyczny PCR może być wykorzystany do amplifikacji dwuniciowych matryc DNA
DNA jest syntezowany w sposób geometryczny
Typowym enzymem wykorzystywanym w tej metodzie jest termostabilna polimeraza DNA z Thermus aquaticus, nazywana polimerazą Taq
Wymaga polimerazy DNA
Składają się na niego 3 etapy: denaturacja w 90℃, hybrydyzacja w 72℃, elongacja, dla której temp jest zależna od długości startera
Wymaga użycia dwóch komplementarnych do siebie oligonukleotydów jako starterów
Pytanie 13
Która z odpowiedzi dotyczącej łańcuchowej polimeryzacji jest nieprawdziwa:
Służy do wykrywania rzadkich rodzajów białek
Można wykrywać śladowe ilości białek i cukrów
W PCR: 3 etapy: denaturacja w 90℃, hybrydyzacja w 72℃, elongacja , dla której temp jest zależna od długości startera
W reakcji PCR DNA jest wydłużane w sposób geometryczny
Produkty PCR są wykrywane przy pomocy western blotting
Potrzebne są: 2 odcinki startera, trifosforany 4 nukleozydów, polimeraza RNA
Pytanie 14
Jakie wiązanie występuje między nukleozydami?
Fosfodiestrowe
Kowalencyjne
Beta-laktamowe
Glikozydowe
Pytanie 15
Cechy charakterystyczne mRNA eukariota
Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG
Zazwyczaj powstają z pre-mRNA
Posiadają na końcu 3’ ogon poliA, niekodowany przez matryce
Translacja jest sprzężona z transkrypcją i zachodzi w tym samym czasie
Posiadają na końcu 5’ rejon bogaty w ppG lub pppG
Pytanie 16
Odwrotna transkryptaza
Wirusowa czy komórki gospodarza
Dwuniciowy RNA wbudowuje się do genomu
Powstaje hybryda DNA-RNA
Polimeraza DNA zależna od DNA
Odwrotna transkryptaza RNA zależna od DNA
Polimeraza DNA zależna od RNA
Organizmy eukariotyczne mogą korzystać z retrowirusa zmieniać metabolizm
Replikaza RNA-polimeraza RNA zależna od RNA
Pytanie 17
Enzymy restrykcyjne: pocięto jakiś liniowy odcinek DNA enzymem EcoRV, obraz po elektroforezie uwidoczniono na żelu. Co możesz powiedzieć na podstawie rysunku poniżej; żel wybarwiono bromkiem etydyny; zwróć uwagę na słabo rozdzielone elementy o długościach 433 i 415 par zasad.
Metoda ta może być stosowania do produktów ekspresji metody Sangera
Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o długości 2220 pz
Długość cząsteczki DNA wynosi 2220
Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o długości 210 pz
Żadna z powyższych nie jest prawdziwa
Na tym odcinku DNA znajduje się 5 unikalnych miejsc restrykcyjnych rozpoznawanych przez enzym
W żelu znajduje się bromek etydyny
Pytanie 18
Co jest wymagane do przeprowadzenia reakcji Sangera, ale chodziło o to, że jest obecny zawsze w jednym z odczynników?
Polimeraza DNA
γ-P32-ATP
α-P32-ATP
Wszystkie 4 dNTP
2’,5’-dideoksy analog jednego z 4 dNTP
Jeden z 4 dNTP
Matryca
Pytanie 19
Chcesz syntezować nić DNA - co jest do tego niezbędne?
Matryca 1 lub 2 niciowa
Magnez
Aktywność egzonukleazowa 3---5’
Matryca komplementarna do startera
Wszystkie 4 NTP
Polimeraza DNA
Wszystkie 4 dNTP
Starter z 3’-OH
Pytanie 20
Pytanie dotyczące usuwania deaminowanej cytozny do uracylu w DNA
Czy da to mutację CG – AT w niciach potomnych
Enzymy usuwające tę mutację – proces naprawy – glikozydaza uracylowa, potem endonukleaza AP, polimeraza DNA i ligaza na końcu
Jest to spontaniczna modyfikacja, prowadzi do powstania nowych kodonów
Jeżeli jest w mRNA to w znaczący sposób wpływa na ekspresję
Coś z tyminą, że jest obecna w RNA, mimo że koszt energetyczny syntezy jest większy niż w uracylu, występującym w RNA
Mutacje w DNA są widoczne we wszystkich następnych pokoleniach
Pytanie 21
Pytanie o kod genetyczny
Jest zdegenerowany, bo w różnych organizmach różne kodony kodują inny aminokwas
3 kodony kodujące 1 aminokwas to synonimy
Nie ma znaków przecinkowych
Sekwencja zasad jest odczytywana kolejno, poczynając od określonego miejsca startowego.
Jest uniwersalny, jego uniwersalność jest prawie absolutna
Ma 64 kodony kodujące 20 aminokwasów
Pytanie 22
Redagowanie RNA
Zachodzi już po transkrypcji
Zachodzi przy udziale enzymów, np. polimerazy poli(A)
Dodatkowa zmienność genetyczna
Zachodzi autokatalitycznie
Zwiększa różnorodność genomu
Pytanie 23
Topoizomeraza
Wymagają NAD+ jako kofaktora do dostarczenia energii kolistych cząsteczek w formy zrelaksowane
Zmieniają liczbę opleceń
Tworzy kowalencyjny intermediat z substratem DNA
Przerywają i powodują relaksacje wiązań fosfodiestrowych
Wymagają ATP
Przekształcają topoizomery, rozcinają DNA
5’-P łączy się z ε-Lys
Zmieniają liczbę miejsc wiążących topoizomeraz
Mogą w szczególnym przypadku używać ATP do tworzenia ujemnej suprhelikalnego DNA z formy rozluźnionej
5’-P łączy się z -OH Tyr
Topoizomeraza I rozcina dwie nici, a topoizomeraza II jedną
Pytanie 24
Podobienstwa w budowie polimerazy DNA i RNA
Polimeraza RNA podobnie jak i DNA katalizuje reakcję poprzez atak nukleofilowy na grupę fosforanową
Polimeraza RNA podobnie jak polimeraza DNA ma właściwości nukleazy
Obie wymagają odcinka starterowego
Pytanie 25
Wybierz prawdziwe dokończenie następującego zdania. Polimeraza DNA I różni się od polimerazy RNA z E.coli tym, że:
Wydłuża rosnący łańcuch w kierunku 5’ -> 3’
Zamiast UTP wymaga dTTP
Wykorzystuje jako matryce cząsteczkę DNA zamiast RNA
Umożliwia syntezę łańcucha DNA poprzez atak nukleofilowy grupy hydroksylowej 3’ rosnącego łańcucha na atom fosforu w pozycji α odpowiedniego dNTP
Nie wymaga startera
Katalizuje tworzenie wiązań fosfodiestrowych tylko wtedy, gdy zasada przyłączanego nukleotydu jest komplementarna do zasady w łańcuchu stanowiącym matryce
Pytanie 26
Oligonukleotydy
Służą jako sondy do hybrydyzacji
W metodzie dideoksy Sangera
Do mutagenezy ukierunkowanej
W reakcji PCR używane
Pytanie 27
Które z następujących stwierdzeń na temat sekwencjonowania jednoniciowej cząsteczki DNA metodą Sangera są prawdziwe?
Znakowanie produktów przeprowadza się zwykle już po zakończeniu reakcji sekwencjonowania
Żadne z powyższych stwierdzeń nie jest prawdziwe
Wymaga użycia analogów dideoksyrybonukleotydów
Wymaga użycia dwóch starterów, jednego komplementarnego do początkowego, a drugiego do końcowego regionu cząsteczki
Wymaga znakowania zsekwencjonowanej cząsteczki DNA np. za pomocą kinazy polinukleotydowej
Do znakowania powstających cząsteczek DNA może być wykorzystany zarowno [p-20y]ATP, jak i [u-12y]dATP
Pytanie 28
Przykładami przedtranslacyjnej kontroli ekspresji genów u Eukaryota są:
Alternatywny splicing pre-mRNA dzięki któremu powstają różne cząsteczki transkryptu
Glikozylacja i fosforylacja polipeptydów, aby mogły się stać funkcjonalnymi białkami
Regulacja tworzenia się kompleksu inicjującego translację
Selektywne składanie aktywnych kompleksów transkrypcyjnych
Rozluźnienie struktury spakowanego DNA poprzez modyfikacje białek histonowych
Selektywna degradacja cząsteczek mRNA
Pytanie 29
Które z następujących zdań określa podwójną Helis DNA typu WC?
Dwa polinukleotydowe łańcuchy są zwinięte wokół wspólnej osi
Skład zasad analizowany z DNA wielu organizmów pokazuje, że ilość A i T jest równa, tak jak ilość G i C
Puryny i pirymidyny znajdują się w wewnętrznej stronie helisy, a szkielet fosfodiestrowy na zewnątrz
Tworzy pary A-T i G-C
Tworzy pary A-C i G-T
Można zmieniać sekwencje w jednej nici niezależnie od drugiej nici
Helisa ma pełny obrót o 34 stopni, bo każda para obraca się o 36 stopni względem sąsiedniej pary zasady i oddalonej o 3,4 A
Pytanie 30
Bardzo długi odcinek DNA z genu Eukariota (> 100 kb)
Może być analizowany przez wędrówkę wzdłuż chromosomu
Musi posiadać końce kohezyjne do klonowania
Może być wydzielana z chromosomów sztucznych drożdży
Może być wyseparowany przez elektroforezę w żelu poliakryloamidowym
Może być pakowany w fag
Pytanie 31
Miejsca promotorowe E. coli
Dla większości genów zawierają różne zgodne sekwencje
Mogą wykazywać rożną wydajność transkrypcji
Te, które maja sekwencje prawie zgodne z sekwencjami zgodnymi i są separowane przez 17 par zasad, są bardzo wydajne
Mają identyczne i określone sekwencje
Są aktywne, kiedy G lub C są zamienione w ich -10 rejon w czasie mutacji
Określa stronę startu dla transkrypcji na matrycy DNA
Pytanie 32
Mamy gen w pojedynczej kopii. Chcąc go wykryć użyto sondy o odpowiednio do niego (tego genu) komplementarnej sekwencji. Była to metoda fluorescencyjna FISH, a eksperyment przeprowadzono na chromosomach w trakcie profazy. Co zaobserwowano: wyobraź sobie, że dysponujesz klonem (tzn. sekwencją) jakiegoś genu, który możesz przypuszczać na podstawie analiz genetycznych, jest zlokalizowany w odległości nie większej niż 200kb od genu odpowiedzialnego za powstawanie jakieś choroby. Spośród podanych poniżej czynności proszę wybrać TYLKO NIEKTÓRE składające się w odpowiedniej sekwencji na eksperyment (technikę), które pozwolą na odczytanie sekwencji w tym obszarze 200kb.
Izolacja ludzkiego genomowego DNA
Otrzymanie biblioteki w fagu lambda
Całkowite (wyczerpujące) trawienie DNA enzymem EcoRI
Izolacja genomowego DNA z E.coli
Przeszukiwanie biblioteki przy pomocy sondy przygotowanej w oparciu o sekwencje genu A w etapie pierwszym, potem izolacja klonu hybrydowanego z sonda
Częściowe trawienie DNA enzymem BamHI w celu otrzymania zachodzących na siebie (względem sekwencji) fragmentów o dl ok. 20 kb
Powtarzanie czynności opisanych w poprzednich dwóch etapach do momentu otrzymania odpowiedniej ilości klonów
Northern-blotting sondą otrzymana przy wykorzystaniu genu A
Subklonowanie fragmentu z końca nowo izolowanego klonu w celu otrzymania nowej sondy do ponownego przeszukiwania biblioteki i identyfikacji nowego klonu hybrydyzowanego z sond
Pytanie 33
Jak można uwidocznić rozcięte fragmenty restrykcyjne
Coś z podłożem mokrym
Bromek etydyny
Metoda dideoksy
Metoda Southern
Pytanie 34
Naprawa DNA uszkodzonego światłem ultrafioletowym (uszeregować)
Pytanie 35
Które dotyczące transkrypcji genów u E. coli są prawdziwe
rRNA (tzw. odwrotny RNA) jest syntetyzowany w kierunku odwrotnym do typowego 5’---3’ stąd jego nazwa
Produktem może być policistronowy mRNA
Faza elongacji podczas transkrypcji jest przeprowadzana przez rdzeń polimerazy
Polimeraza RNA wykazuje aktywność egzonukleazowa, która umożliwia jej korekcję błędów
Pre-mRNA podlega procesowi składania (slipingu) jeszcze zanim zajdzie translacja
Ekspresja genów jest kontrolowana głównie na poziomie transkrypcji
Pytanie 36
Które są wspólne dla ligazy bakteriofaga (wirus) i zwierząt
Mogą łączyć wyłącznie cząsteczki posiadające „lepkie końce”
Do utworzenia wiązania fosfodiestrowego ligaza zużywa 2 wysokoenergetyczne wiązania
Źródłem energii jest ATP
Do utworzenia wiązania fosfodiestrowego ligaza zużywa 1 wysokoenergetyczne wiązanie
Enzym katalizuje tworzenie wiązania estrowego między grupą 3’-fosforanowa a grupą 5’-OH
Biorą udział w replikacji DNA, naprawie uszkodzonego DNA, leczeniu jednoniciowego DNA w formę kolista
Biorą udział w naprawie uszkodzonego DNA
Źródłem energii jest NAD+
Enzym katalizuje tworzenie wiązania estrowego między grupą 5’-P a grupą 3’-OH
Podczas ligacji powstaje kompleks enzym-adenylan, adenylan-DNA
Pytanie 37
Które z poniższych sekwencji mogą występować w Z DNA
GAATTTAAAG
TAGAGGTAGA
GAGAGAGAGA
TTGGAATTAA
CGTACGTACG
GCGCGCGCGC
Pytanie 38
41. Które z poniższych stwierdzeń dotyczących zasad występujących w DNA są z godne z modelem Watsona-Cricka?
Zmienną częścią DNA jest sekwencja czterech rodzajów zasad
Dwa helikalne łańcuchy oplatają wspólną oś i biegną w przeciwnym kierunku
Adenina paruje z guaniną poprzez 2 wiązania wodorowe
G paruje z C poprzez 3 wiązania wodorowe
Kolejność zasad w cząsteczkach DNA stanowi informację genetyczną
Adenina paruje z tyminą poprzez 2 wiązania wodorowe
Nukleozyd to nukleotyd połączony wiązaniem estrowym z jedną lub większą liczbą grup fosforanowych
W dsDNA zasada purynowa zawsze tworzy parę z zasada pirymidynową
Związek zasady purynowej z deoksyryboza jest nukleozydem
Zasady purynowe i pirymidynowe znajdują się wewnątrz helisy i ich płaszczyzny są w przybliżeniu prostopadłe do jej osi
Pytanie 39
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących eksperymentu klonowania insertu (kolor pomarańczowy), ograniczonego miejscami restrykcyjnymi Pst, do wektora plazmidowego pBR322, zobrazowanego schematycznie na rysunku, są prawdziwe? Zwróć uwagę, że wektor pBR322 zawiera geny (kolor niebieski i czerwony) nadające bakteriom oporność na 2 antybiotyki – ampicylinę (AmpR) i tetracyklinę (TetR):
Aby za pomocą genów markerowych AmpR i TetR wyselekcjonować komórki, które zawierają wektor z włączonym insertem konieczne jest wykonanie replik z podłoża zawierającego tetracyklinę na podłoże zawierające oba antybiotyki
Na podłożu z tetracykliną zginą wszystkie komórki, które nie pobrały wektora
Na podłożu zawierającym oba antybiotyki zginą tylko te komórki, które pobrały wektor zawierający insert oraz te, które nie uległy transformacji (nie pobrały wektora)
Na podłożu z ampicyliną zginą tylko te komórki, które pobrały pusty wektor
Na podłożu z tetracyklina zginą wszystkie komórki, które pobrały wektor
Na podłożu z ampicylina zgina tylko te komórki, które pobrały wektor zawierający insert oraz te, które nie uległy transformacji
Gdyby insert ograniczony był miejscami EcoRI, to do poprawnego wykonania eksperymentu należałoby przeciąć wektor enzymem EcoRI, zamiast PstI
Na podłożu zawierającym oba antybiotyki zgina tylko te komórki, które pobrały wektor zawierający insert
Włączenie insertu do wektora w miejsce PstI nie ma sensu, ponieważ przerywa ciągłość genu AmpR, niezbędnego do przeżycia komórek na podłożu z ampicyliną
Pytanie 40
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących retrowirusów są prawdziwe?
Odwrotna transkryptaza retrowirusow wykazuje aktywność polimerazy DNA zależnej od RNA
Odwrotna transkryptaza syntezuje DNA i jako matryce wykorzystuje wirusowe RNA
Retrowirusy wykorzystują odwrotna transkryptaza występująca w komórkach eukariotycznych do zmiany metabolizmu zainfekowanej komórki
W pewnej fazie infekcji komórki przez retrowirusa powstaje etap, w którym tworzona jest hybryda RNA-DNA
W przepływie informacji genetycznej u retrowirusów istnieje etap, w którym tworzone jest dwuniciowa helisa DNA, która zostaje włączona w strukturę chromosomu gospodarza
Odwrotna transkryptaza retrowirusow wykazuje aktywność replikazy RNA
Pytanie 41
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących liczb opisujących właściwości konformacyjne i topologiczne DNA są prawdziwe?
Tw to liczba opleceń DNA
Liczba oplecen mówi, ile razy jedna nić oplata prawoskrętnie oś DNA
Liczba Wr mówi, ile razy os helisy DNA oplata prawoskrętnie sama siebie
Wr to liczba skrętów DNA
Liczba opleceń jest topologiczną właściwością DNA
Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe
Pytanie 42
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących trzech enzymów A, B oraz C, których aktywności przedstawiono schematycznie na rysunku, są prawdziwe?
Istnieje co najmniej 1 grupa enzymów, które wykazują zarówno aktywność A, jak i akt B
Niektóre enzymy wykazujące aktywność A są stosowane w metodzie Sangera
Enzym A wykazuje aktywność polimerazy RNA zależnej od DNA.
Niektóre enzymy wykazujące aktywność A są stosowane w metodzie PCR
Niektóre enzymy wykazujące aktywność B są stosowane w metodzie Sangera
Enzymy wykazujące aktywność A są stosowane do znakowania DNA radioaktywnym izotopem fosforu
Kinaza polinukleotydowa wykorzystywana jest do przeprowadzana reakcji C
Fosfataza wykazuje aktywność enzymatyczną przedstawioną na schemacie B
Enzym B wykazuje aktywność polimerazy RNA zależnej od DNA
Pytanie 43
Które z poniższych stwierdzeń na temat plazmidów używanych do transformacji komórek E. coli są prawdziwe?
Plazmidy są cząsteczkami kolistymi, które poddaje się linearyzacji w obrębie sekwencji oznaczonych na rysunku jako MCS w celu włączenia innego DNA
ORI jest to element genetyczny unikalny dla każdego wektora pozwalający odróżnić od siebie komórki, które uległy transformacji rożnymi wektorami
Plazmidy nie mogą być mniejsze niż ok. 100kpz, ponieważ tylko bardzo duże cząsteczki DNA są zdolne do wnikania do komórki bakteryjnej
Plazmidy pelnia funkcje wektorow dla cząsteczek DNA
Plazmidy mają zdolność autonomicznej replikacji w komórce gospodarza dzięki sekwencji zaznaczonej na rysunku jako ORI
Pytanie 44
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących elektroforezy fragmentów restrykcyjnych są prawdziwe?
e) Żele agarozowe bardziej nadają się do rozdziału bardzo długich fragmentów restrykcyjnych niż żele poliakrylamidowe
d) Elektroforeza w pulsującym polu elektrycznym (PFGE) nadaje się szczególnie do rozdziału bardzo długich cząsteczek DNA
b) Ruchliwość elektroforetyczna fragmentu DNA jest do pewnych granic odwrotnie proporcjonalna do logarytmu długości tego fragmentu, wyrażonej liczbą par zasad
b) Ruchliwość elektroforetyczna fragmentu DNA jest do pewnych granic wprost proporcjonalna do logarytmu długości tego fragmentu, wyrażonej liczbą par zasad
c) Wysoka zdolność rozdzielcza żeli poliakrylamidowych pozwala rozdzielać fragmenty restrykcyjne, których długość różni się tylko jednym nukleotydem na kilkaset wchodzących w ich skład
a) Elektroforeza żelowa może być wykorzystana także do rozdziału cząsteczek o długości milionów par zasad, w tym - chromosomów
Pytanie 45
Eksperymentator wyizolował DNA genomowe oraz mRNA z mózgu, nerki oraz mięśni szkieletowych szczura wędrownego. Następnie przygotował odpowiednie biblioteki genomowe oraz biblioteki cDNA z każdego z tych narządów w tym samym plazmidzie. Które z poniższych stwierdzeń na temat uzyskanych bibliotek są prawdziwe?
Szansa odnalezienia klonu sekwencji kodującej białko występujące tylko w nerce jest wyższa w bibliotece cDNA nerki niż w bibliotece genomowej z tego organu, z powodu znacznie mniejszej liczby różnych klonów zawartych w tej pierwszej
Każda z uzyskanych bibliotek genomowych powinna zawierać bardzo zbliżoną liczbę różnych klonów DNA
To, jakie różne sekwencje DNA zawarte są w każdej z uzyskanych bibliotek zależy np. od wieku, trybu życia, diety oraz temperatury chowu zwierzęcia – komórki produkują różne białka w zależności od potrzeb i dzięki temu biblioteki są zróżnicowane
Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe
Każda z uzyskanych bibliotek cDNA powinna zawierać większą liczbę różnych klonów DNA niż każda z bibliotek genomowych
Szansa odnalezienia klonu sekwencji kodującej białko występujące tylko w mózgu jest wyższa w bibliotece cDNA mózgu niż w bibliotece genomowej z tego organu z powodu znacznie mniejszej liczby różnych klonów zawartych w tej pierwszej
Szansa odnalezienia klonu cDNA kodującego dowolnie wybrane białko szczurze jest identyczne w przypadku każdej z otrzymanych bibliotek cDNA
Pytanie 46
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących telomerów i telomerazy są prawdziwe?
Telomeraza jest polimerazą DNA zależną od RNA i wykorzystuje jako matryce wewnętrzne odcinki RNA chromosomów
Telomerowy DNA zawiera setki tandemowo ułożonych powtórzeń sześcionukleotydowej sekwencji (TTAGGG) oraz jest związany z wieloma białkami tworząc wyspecjalizowane struktury nukleo…(jakieś)
Telomeraza jest polimerazą DNA zależną od RNA i wykorzystuje jako matryce zewnętrzne odcinki RNA chromosomów
Wysoka aktywność telomerazy jest zachowana w komórkach rozrodczych, macierzystych oraz w niektórych typach komórek nowotworowych.
Telomeraza wykazuje aktywność odwrotnej transkryptazy
Telomeraza rozwiązuje problem replikacji końców liniowych chromosomów dzięki swej nietypowej aktywności polimerazowej w kierunku 3’ -> 5’
Po usunięciu startera nic opóźniona ma niekompletny koniec 5’ i każda następna runda transkrypcji skraca chromosom
Telomeraza jest enzymem rybonukleoproteinowym, w którego skład wchodzi cząsteczka RNA
Sekwencje telomerów bogate są w nukleotydy zawierające guaninę
Pytanie 47
50. Które z poniższych stwierdzeń dotyczących enzymów restrykcyjnych są prawdziwe?
Mogą być użyte w metodzie nothern blotting
Służą do degradowania własnego DNA uszkodzonego w wyniku działania czynnika mutagennego
Służą komórce do rekombinacji własnego DNA zwiększając w ten sposób zmienność genetyczną komórki
Niektóre enzymy przecinają jednoniciowe, a inne dwuniciowe cząsteczki DNA
Przecinając cząsteczki DNA enzymy te zawsze tworzą końce kohezyjne (lepkie), dzięki czemu mogą być stosowane w technikach rekombinacji DNA
Większość z nich wiąże się z sekwencjami palindromowymi na DNA
Mogą być użyte do stworzenia charakterystycznego wzoru nazywanego „odciskiem palca” (tzw. fingerprint) cząsteczki DNA
Są charakterystyczne dla GMO i nie występują w komórkach żywych
Są bardzo rozpowszechnione zarówno w komórkach prokariotycznych, jak i eukariotycznych
Większość produktów trawienia DNA z wykorzystaniem enzymów restrykcyjnych posiada ufosforylowany koniec 5’ i wolne końce 3’OH, dlatego te produkty stanowią bezpośrednie struktury do ligazy DNA
Mogą służyć komórce do degradowania wirusowego DNA
Pytanie 48
Które z poniższych stwierdzeń na temat przepływu informacji genetycznej są prawdziwe?
Białka rybosomalne powstaja w wyniku translacji rRNA
Najbardziej oszczędnym energetycznie sposobem regulacji ekspresji informacji genetycznej jest regulacja transkrypcji genów
Białka rybosomalne powstaja w wyniku translacji mRNA
Szczególnie wysoka wierność transkrypcji osiągana jest dzięki polimerazom RNA, ponieważ posiadają one aktywność egzonukleazowa 5’ -> 3’
Odwrotna replikaza RNA prowadzi syntezę RNA na matrycy RNA
Synteza nici RNA na matrycy RNA retrowirusowego jest przykładem procesu odwrotnej transkrypcji
Żadne z podanych stwierdzeń nie jest prawdziwe
Pytanie 49
Eksperymentator przeprowadził sekwencjonowanie jednoniciowej cząsteczki DNA metodą Sangera i otrzymał wynik w postaci autoradiogramu przedstawionego poniżej. W każdym z 4 śladów rozdziałowi poddano mieszaninę reakcyjną zawierającą odpowiedni analog ddNTP. Strzałka przedstawia kierunek elektroforezy. Która z podanych sekwencji odpowiada matrycowej nici DNA poddanej sekwencjonowaniu?
Żadna z podanych sekwencji nie odpowiada szukanej nici DNA
GCGCTCAA
CGCGAGTT
AACCCTGG
AACTCGCG
TTGAGCGC
Pytanie 50
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących zjawiska homologii genów kodujących białka są prawdziwe? Wybierz co najmniej jedną odpowiedź
Jeśli dwa geny są względem siebie paralogami to są swoimi homologami
Jeśli dwa geny wykazują ponad 90% identyczności sekwencji nukleotydowej to najprawdopodobniej powstały na drodze ewolucji konwergentnej
Dwa homologiczne względem siebie geny występujące u tego samego gatunku są najprawdopodobniej swoimi paralogami
Dowolne dwa geny występujące u tego samego gatunku nazywamy homologami.
Jeśli dwa geny są względem siebie ortologami to oba pochodzą od wspólnego przodka genowego
W biologii ewolucyjnej ewolucja zbieżna konwergentna jest procesem, w którym organizmy niezwiązane blisko, niezależnie rozwijają podobne cechy w wyniku przystosowania się do podobnych środowisk lub nisz ekologicznych.
Pytanie 51
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących naprawy DNA są prawdziwe?
Ostatnim etapem naprawy DNA jest połączenie odpowiednich końców DNA przez ligazę DNA
MutH jest bardzo słabą endonukleazą, która jest aktywowana po związaniu z MutL
Za usuwanie dimerów tymin w komórkach E. coli jest odpowiedzialne białko uvrABC będące fotoligazą
Puste miejsca powstałe w wyniku wycięcia uszkodzonego DNA wypełnia w komórkach E. coli polimeraza DNA I
Spontaniczne pojawienie się uracylu w DNA może podlegać naprawie polegającej na jego metylacji w odpowiedniej pozycji z utworzeniem tyminy
Koniec 5’-OH uszkodzonej nici jest starterem syntezy brakującego fragmentu DNA
Błędnie sparowane nukleotydy u E. coli rozpoznaje białko MutS
Pytanie 52
Które z następujących stwierdzeń dotyczących bibliotek DNA są prawdziwe?
Każda z uzyskanych bibliotek cDNA pochodzących z różnych organów danego organizmu powinna zawierać pewną liczbę klonów DNA odpowiadających tym samym genom
Biblioteka cDNA jest zdecydowanie mniejsza od biblioteki genomowej danego organizmu.
Biblioteka genomowa zawiera fragmenty DNA powstałe po trawieniu genomowego DNA odpowiednim zestawem endonukleaz restrykcyjnych.
Biblioteka genomowa zawiera fragmenty DNA powstałe na matrycy mRNA
Hybrydyzacja DNA oraz przesiew (screen) immunologiczny są metodami służącymi do przeszukiwania bibliotek cDNA
Biblioteka genomowa zawiera zarówno kodujące, jak i niekodujące sekwencje kompletnego genomu danego organizmu.
Pytanie 53
Bakterie hodowano ze źródłem azotu 15N i następnie przeniesiono do środowiska z 14N, a po jednym pokoleniu znowu do 15N. Jakiego DNA można się spodziewać?
III 50% średnie, a 50% ciężkie
I 100% ciężkie
II 100% średnie
Pytanie 54
Wprowadzenie genu w środek wektora, który zawiera odporność na antybiotyk:
Powoduje czułość komórki na antybiotyk
Jest nazywane inaktywacja insercyjna
Jest metodą niszczenia patogenicznych bakterii
Prowadzi do przeniesienia odporności leków
Może być używany do identyfikacji bakterii zawierających wektor z fragmentem DNA
Pytanie 55
Ktore z ponizszych stwierdzeń dotyczacych poznawania ewolucji są prawdziwe?
Macierz substytucji Blenum-62 przyznaje najwyższą liczbę punktów sekwencjom wprowadzającym najmniej zachowawcze zmiany aminokwasowe w białku
W trakcie ewolucji nowe białka mogły powstawać w wyniku mutacji zachodzących w zduplikowanym genie
Ortologi powstają na drodze ewolucji konwergentnej
Enzymy pochodzące z różnych organizmów są odpowiedzialne za katalizowanie podobnych reakcji muszą mieć podobne sekwencje na całej długości łańcucha białka
Paralogi powstają w wyniku specjacji (różnicowania się gatunków)
Ortologi powstają w wyniku specjacji (różnicowania się gatunków)
Paralogi powstają w wyniku duplikacji genów
Jeśli białko A jest ontologiem białka B, a białko B jest paralogiem białka C, to białko A i C są homologami
Pytanie 56
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących replikacji DNA u E. coli są prawdziwe?
Żadne z powyższych stwierdzeń nie jest prawdziwe
Nić wiodąca syntezowana jest w sposób nieciągły przez polimerazę DNA III
Energia potrzebna do rozplecenia DNA przez prymazę pochodzi z hydrolizy DNA III
Podczas replikacji rolę starterów dla nici opóźnionej pełnią krótkie odcinki RNA nazwane fragmentami Okazaki
Nić opóźniona powstaje w kierunku 3’ --> 5’ na poziomie nukleotydowym
Ilość widełek replikacyjnych powstających podczas replikacji danej cząsteczki u E.coli i Eukariota jest podobna
Pytanie 57
Które z poniższych twierdzeń dotyczących telomerazy ssaków jest prawdziwe?
Aktywność telomerazy jest kontrolowana przez białko TRF1, promujące tworzenie struktury telomerów typu pętli t
Telomeraza syntezuje tylko jeden z łańcuchów polinukleotydowych telomeru, korzystając z matrycy bogatej w reszty G
Telomeraza jest aktywna w wybranych typach komórek np. w komórkach homopoetyczych szpiku kostnego
Terapia powodująca inaktywację telomerazy powinna być stosowana w walce z rakiem tylko wtedy, gdy aktywacja telomerazy jest przyczyną powstawania raka, a nie skutkiem
Żadna z powyższych odpowiedzi nie jest prawdziwa
Telomeraza jest polimerazą DNA zależną od RNA
Pytanie 58
Które z poniższych stwierdzeń dotyczących struktury kwasów nukleinowych są prawdziwe?
Dwuniciowe rejony RNA przybierają formę struktury typu A
Nici w helisie typu A i B biegną w przeciwnych kierunkach, a w helisie typu Z w tym samym kierunku
Występujące w DNA kilkukrotnie powtórzone sekwencje GCATACGT prowadzi do utworzenia w tym rejonie struktury typu A
DNA typu B i Z to dwuniciowe helisy prawoskrętne
Nazwa struktury typu Z pochodzi od jej specyficznego szkieletu
Tylko na powierzchni helisy typu B wyróżnić można duży i mały rowek