Podsumowanie: Oczyszczanie i metody badań makrocząsteczek życia

Pytanie 1

Do metod cytogenetyki klasycznej zaliczamy metodę:

C. FISH

B. cytometrię przepływową

A. ASO

D. HRT

Pytanie 2

Metody cytogenetyki klasycznej to:

c. GTG, RBA

d. RDG, QFQ

b. QRC, CBG

a. FISH, cytometria przepłyowowa

Pytanie 3

Stwierdzenie czy konformacja białka zmienia się pod wpływem dołączanych ligandów UMOŻLIWIA metoda:

C: cytometria przepływowa

D: elektroforeza w żelu agarozowym

A: ekstrakcja fenol-chloroform

B: spektroskopia dichroizmu kołowego (CD)

Pytanie 4

Która z technik NIE jest stosowana w cytogenetyce molekularnej:

B: cytometria przepływowa

D: analiza widmowa kariotypu

C: barwienie odczynnikiem Giemzy

A: fluorescencyjna hybrydyzacja in situ

Pytanie 5

Sonikacja to metoda homogenizacji która polega na:

C. poddaniu ich zawiesiny wysokiemu ciśnieniu

B. rozbiciu komórek dźwiękiem o wysokiej częstotliwości

A. wykorzystaniu materiału rozbijającego w postaci kulek, które umieszczone są w homogenizowanej zawiesinie

Pytanie 6

Typ chromatografii adsorpcyjnej w której wykorzystuje się swoistość wiązania się dwóch substancji to

A. chromatografia powinowactwa

C. chromatografia żelowa

B. chromatografia kolumnowa

Pytanie 7

Elektroforeza jest zjawiskiem polegającym na:

d. Migracji cząsteczek obdarzonych ładunkiem elektrycznym pod wpływem przyłożonego napięcia elektrycznego

a. Oczyszczeniu otrzymanych białek za pomocą żelowych ziaren

c. Rozdziale białek przy użyciu błony półprzepuszczalnej

b. Rozbiciu komórek i tkanek (metoda homogenizacji)

Pytanie 8

Sonikacja to metoda homogenizacji, która polega na

d) Przeciskaniu komórek przez mały otwór pod wysokim ciśnieniem

a) Rozbiciu komórek dźwiękiem o wysokiej częstotliwości

c) Rozdrobnieniu tkanki kulkami metalowymi wstrząsanymi z wysoką częstotliwością

b) Zwiększeniu przepuszczalności błony komórkowej za pomocą łagodnego detergentu

Pytanie 9

Co jest metodą do RNA:

A: Sage

C: RT-PCR

B: homogenizacja

Pytanie 10

Aby uzyskać DNA z ekstraktów w chromatografii jonowymiennej:

b. -dodatnio naładowane złoże jest przepłukiwae 1M roztworem NacL Ph7 w celu wymycia białek

c. -dodatnio naładowane złoże jest przepłukiwae 1M roztworem NacL Ph7 w celu wymycia DNA

a. -ujemnie nałądowane złoże jest przepłukiwane 1M roztworem NaCl o pH 7,0 w celu wymycia białek

d. ujemnie nałądowane złoże jest przepłukiwane 1M roztworem NaCl o pH 7,0 w celu zatrzymania DNA

Pytanie 11

Po wirowaniu przez 10 min z prędkością 800 g, w osadzie znajdują się:

c. rybosomy

a. fragmenty błony komórkowej

d. mitochondria

b. jądra komórkowe i odpady komórkowe

Pytanie 12

W wirowaniu różnicowym, aby otrzymać w osadzie rybosomy należy wirować:

c. 3 h , 150 000 g

a. 15min, 20 000 g

b. 10 min, 800 g

d. 60 min , 100 000 g

Pytanie 13

Permeabilizacja to:

b) Rozdrobnienie tkanki kulkami metalowymi

a) Żadna z powyższych

c) Przedziurawienie błony komórkowej łagodnym detergentem

d) Rozbicie komórek dźwiękiem o wysokiej częstotliwości

Pytanie 14

Pierwszym etapem degradacji Edmana jest:

c. analiza chromatograficzna w celu identyfikacji pierwszego aminokwasu

a. elektroforeza w celu identyfikacji pierwszego aminokwasu

d. usunięcie fenyloizotiocyjanianu z próbki

b. dodanie fenyloizotiocyjanianu do próby

Pytanie 15

W metodzie chromatografii powinowactwa:

D. można oczyścić kwasy nukleinowe oraz białka ze względu na ich masę cząsteczkową

A. można odczytać kwasy nukleinowe ze względu na ich ujemny ładunek

B. Można oczyścić białka ze względu na ich zdolność do łączenia się z substratem połączonym ze złożem chromatograficznym

C. można oczyścić białka ze względu na ich punkt izoelektryczny

Pytanie 16

Które z poniższych stwierdzeń opisuje prawidłowo działanie chromatografii jonowymiennej:

d. na kolumnie anionowej zatrzymują się cząsteczki obojętne i kationy

a. na kolumnie kationowej zatrzymywane są tylko kationy, a cząsteczki obojętne i aniony wypływają z układu wraz z rozpuszczalnikiem

b. na kolumnie kationowej są zatrzymywane aniony, a kationy wypływają z układy wraz z rozpuszczalnikiem

c. na kolumnie anionowej zatrzymywane są tylko kationy, a cząsteczki obojętne i aniony wypływają z układu wraz z rozpuszczalnikiem

Pytanie 17

W przypadku chromatografii jonowymiennej rozdział białek odbywa się według:

c. wartości punktu izoelektrycznego

b. stopnia glikolizacji białka

d. masy białka

a. hydrofobowości białka

Pytanie 18

Płyn wymywający substancje zaabsorbowane na fazie stałej podczas chromatografii:

b. eluat

d. eluent

c. adsorbent

a. adsorbant

Pytanie 19

(...) prawoskrętne i lewoskrętne. Umożliwia to m.in. charakterystykę pofałdowania białka, porównywanie struktury i konformacji białek czy badanie stabilności konformacji białek pod wpływem stresu. Powyższy fragment opisuje:

a. krystalografię rentgenowską

b. chromatografię powinowactwa

c. spektroskopie NMR

d. Spektroskopię dichroizmu kołowego (CD)

Pytanie 20

jak nazywa się odmiana cieczowej chromatografii kolumnowej z użyciem eluentu pod wysokim ciśnieniem?

d. GPC

c. TLC

a. DGGE

b. HPLC

Pytanie 21

Wskaż eluenty stosowane w chromatografii cieczowej:

a. chloroform, aceton

b. aceton, wodór

d. woda, wodór

c. acetonitryl, hel

Pytanie 22

Metodami chromatografii można rozdzielić:

c) Między innymi cukry, lipidy, aminokwasy, białka

d) Wyłącznie białka

b) Wyłącznie cukry

a) Wyłącznie kwasy nukleinowe

Pytanie 23

W przypadku chromatografii żelowej (size exclusion) białko A opuściło kolumnę wcześniej niż białko B, świadczy to o tym, że:

D: białko A jest większe od białka B

C: białko A jest mniejsze od białka B

B: wartość punktu izoelektrycznego dla białka A jest większa niż dla białka B

A: wartość punktu izoelektrycznego dla białka A jest większa niż dla białka B

Pytanie 24

Wirowanie różnicowe NIE polega na:

b. Rozdziale składników na podstawie ich wielkości i gęstości

c. Rozdziale w gradiencie sacharozy

a. Wirowaniu ze stopniowo wzrastającą szybkością

d. Elektrycznym rozdziale cząsteczek obdarzonych różnym ładunkiem

Pytanie 25

Początkowy postęp w zrozumieniu dokładnej struktury rybosomu zawdzięcza się:

B: wszystkim wymienionym

A: technice sekwencjonowania

D: analizie składu rybosomów z zastosowaniem ultrawirowania

C: obserwacjom w mikroskopie

Pytanie 26

Stosując sedymentację szybkościową rozdziela się składniki ze względu na ich:

C. hydrofobowość

A. gęstość

D. wielkość

B. ładunek

Pytanie 27

Związki wykazujące maksimum absorbancji przy długości fali 230 nm:

d. fenol i DNA

a. fenol i białka

b. fenol i EDTA

c. DNA i białka

Pytanie 28

Stosując metodę izolacji DNA z wykorzystaniem metanolu i fenolu na granicy faz:

c. białka

b. RNA i DNA

d. DNA

a. RNA i lipidy

Pytanie 29

Stosując metodę izolacji DNA z wykorzystanie metanolu i fenolu, w fazie organicznej znajdziemy:

a) DNA

d) Białka

c) RNA i lipidy

b) RNA i DNA

Pytanie 30

W jakim celu dodawany jest błękit bromofenolu i glicerol do próbki białka poddawanemu elektroforezie:

C: związki te nie są dodawane do próbek białek poddawanych elektroforezie

D: do redukcji mostków disiarczkowych

A: do zwiększenia gęstości i intensywności zabarwienia próbki

B: do nadania białku ładunku ujemnego

Pytanie 31

Wizualizację produktów na żelu agarozowym po wykonaniu elektroforezy umożliwia:

D. deksametazon

B. agaroza

A. lipofektamina

C. bromek etydyny

Pytanie 32

Tempo migracji cząsteczek w żelu agarozowym:

b. niezależne od wielkości cząsteczki DNA

d. odwrotnie proporcjonalne do wielkości cząsteczki DNA

a. proporcjonalne do wielkości cząsteczki DNA

c. wszystkie NIEPRAWIDŁOWE

Pytanie 33

wskaż zdanie PRAWIDŁOWE:

a. żel poliakrylamidowy ma mniejsze pory niż żele agarozowe co umożliwia dokładny rozdział cząsteczek np. DNA w zakresie wielkości 10-1500bp

b. w elektroforezie w żelu agarozowym stosuje się jedynie żel 5% ponieważ poniżej żel tężeje

d. elektroforezę w żelu poliakrylamidowym stosuje się do rozdziału cząsteczek np DNA z mniejszą dokładnością, gdyż ma mniejszą rozdzielczość niż w żelu agarozowym

c. elektroforeza pozwala na rozdzielenie jedynie cząsteczek DNA

Pytanie 34

Wskaż zdanie BŁĘDNE dot. agarozy

a. w temperaturze pokojowej nieodwracalnie tworzy żel

b. naturalny polisacharyd, zbudowany z pochodnych galaktozy

c. łatwo rozpuszcza się w wodzie

d. izolowana jest ze ścian komórkowych krasnorostów

Pytanie 35

Założywszy, że mutacja wykrywana metodą RFLP wprowadza miejsce restrykcyjne, które pojawia się tylko w amplifikowanym fragmencie DNA to analizowany wzorzec prążków na żelu agarozowym to w przypadku heterozygoty:

a. dwa prążki będące produktem całkowitego cięcia amplifikowanego fragmentu DNA

b. trzy prążki będące odpowiednio niepociętym fragmentem DNA oraz produktami cięcia

d. cztery prążki odpowiadające produktom cięcia fragmentu DNA

c. jeden prążek, o wielkości odpowiadającej niepociętemu fragmentowi DNA

Pytanie 36

Do przeprowadzenia elektroforezy w żelu agarozowym STOSUJE SIĘ bufor

C. TAE

B. otrzymany z mleka w proszku

A. bufor zawierający przeciwciała II rzędowe

D. cyjankowy

Pytanie 37

Do sekwencjonowania DNA można użyć:

d) Żelów poliakrylamidowych

c) Żelów agarozowych

b) Metody Southerna

a) Mikromacierzy

Pytanie 38

Metoda umożliwiająca identyfikację białek na podstawie stosunku masy do ładunku:

d. elektroforeza w żelu agarozowym

b. chromatografia hydrofobowa

a. spektroskopia mas

c. permeabilizacja

Pytanie 39

Które ze zdań jest prawdziwe:

A. polimeryzacją roztworu akryloamidu zapoczątkowuje nadsiarczan amonowy, a katalizuje TEMED

C. elektroforeza w żelu agarozowym umożliwia rozdzielenie jednoniciowych cząsteczek DNA różniących się długością o 1 nukleotyd

B. wielkość porów w żelu poliakrylamidowym zależy od nadsiarczanu amonowego i TEMEDU

D. żele poliakrylamidowe mają większe pory niż żele agarozowe

Pytanie 40

Porządkując białka pod względem wielkości w czasie elektroforezy poliakryloamidowej w pionowym aparacie:

b. małe białka poruszają się szybciej ze względu na mniejszy opór żelu

c. duże białka poruszają się szybciej ze względu na siły grawitacji

a. duże białka poruszają się szybciej ze względu na większy ładunek elektryczny

d. małe białka poruszają się szybciej ze względu na mniejszy ładunek elektryczny

Pytanie 41

SDS i β-merkaptoetanol w elektroforezie w żelu poliakrylamidowym:

d. umożliwia rozdział białek pod względem różnicy ładunków

a. powoduje nadanie dodatniego ładunku cząsteczkom białek i migracji w polu elektrycznym

b. powoduje rozdział wiązań dwusiarczkowych w obrębie białek (lub między nimi) i nadaniu cząsteczkom ujemnego ładunku

c. umożliwia rozdział białek w jednokierunkowej elektroforezie poprzez utworzenie kompleksów białek o tej samej masie cząsteczkowej i ładunku

Pytanie 42

Wskaż zdanie POPRAWNIE opisujące elektroforezę w żelu poliakrylamidowym (białka i kawy nukelinowe)

b. w żelu poliakrylamidowym można rozdzielać wyłącznie białka

a. procentowość żelu poliakrylamidowego dostosowana jest do wielkości rozdzielanych białek

c. żel poliakrylamidowy podczas elektroforezy ułożony jest horyzontalnie

d. w żelu poliakrylamidowym można rozdzielać wyłącznie DNA

Pytanie 43

Wskaż zdanie POPRAWNIE opisujące metodę Western Blot:

D: Transfer białek odbywa się z jednego żelu poliakrylamidowego na drugi

A: Pierwszym etapem tej metody jest rozdzielnie mieszaniny białek w żelu poliakrylamidowym

C: W tej metodzie stosuje się wyłącznie przeciwciała pierwszorzędowe

B: Pozwala na wizualizację fragmentów DNA

Pytanie 44

Metoda diagnostyczna oparta o PCR, która zakłada iż pojedyncze różnice w sekwencji powodują zróżnicowaną migrację i charakterystyczne położenie w żelu poliakrylamidowym to:

A: Hybrydyzacja z allelo-specyficznymi sondami oligonukleotydowymi (ASO ang. allele specific oligonucleotide)

D: Polimorfizm konformacji fragmentów jednoniciowych (SSCP ang. single strand conformation polymorphism)

B:Elektroforeza w żelu z gradientem czynnika denaturującego (DGGE, ang. denaturing gradient gel electrophoresis)

C: Polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych ( RFLP ang. restriction fragment length polymorphism)

Pytanie 45

Metodą służącą do wykrywania określonych sekwencji RNA jest metoda:

C. Southern blot

B. Nothern blot

D. Western blot

A. Elisa

Pytanie 46

Spośród wymienionych poniżej technik badawczych, wskaż tą, w której NIE SĄ wykorzystywane przeciwciała:

C. ELISA

B. southern blot

A. immunoprecypitacja

D. Western blot

Pytanie 47

Do metod analizy białek NIE należy:

b. hybrydyzacja in situ

a. Northern blotting

c. spektroskopia mas

d. Western blotting

Pytanie 48

Która z poniżej wymienionych technika NIE BAZUJE na hybrydyzacji?

D: FISH

B: Western blot

C: Southern blot

A: Northern blot

Pytanie 49

W jakiej metodzie badawczej używany jest fosforan wapnia?

B: w metodzie Western Blot

A: w tranfekcji komórek

C: w elektroforezie

D: w hybrydyzacji DNA

Pytanie 50

Techniką genotypowania, która wykorzystuje endonukleazy restrykcyjne jest technika:

c) Sekwencjonowanie metodą Sangera

d) RFLP

a) PCR

b) Western Blot

Pytanie 51

Modyfikacje elektroforezy która umożliwia rozdział białek w gradiencie PH:

b. western blot

d. cytometria przepływowa

c. elektroforeza w żelu agarozowym

a. ogniskowanie izoelektryczne

Pytanie 52

Która z wymienionych metod służy do sekwencjonowania peptydów?

b. krystalografia rentgenowska

d. degradacja Edmana

c. degradacja Sangera

a. żadna z wymienionych

Pytanie 53

Technika umożliwiająca identyfikację różnej wielkości regionów lub całych chromosomów, dzięki powstawaniu w odpowiednich warunkach kompleksów DNA chromosomowego ze specyficzną sondą molekularną, to:

b. mikromacierze SNP

a. hybrydyzacja in situ

d. technika prążków G

c. pirosekwencjonowanie

Pytanie 54

W pirosekwencjonowaniu używa się:

D. polimerazy DNA, lucyferazy i trifosforanów dideoksynukleotydów

C. lucyferazy, sulfurylazy ATP i fluorochromu

B. hydrazyny, piperydyny i siarczaniu dimetylu

A. polimerazy DNA, lucyferazy i apyrazy

Pytanie 55

W przypadku sekwencjonowania DNA metoda Sanger’a kolejność nukleotydów w badanym DNA ustalamy poprzez:

d. analizę prążków reakcji PCR sekwencyjnego

b. analizę intensywności fluorescencji hybrydyzowanej sondy

a. analizę produktów cięcia enzymami restrykcyjnymi

c. analizę widma absorpcyjnego

Pytanie 56

Wskaż zdanie FAŁSZYWE, metoda terminacji wydłużania łańcucha to?

C. Metoda wykorzystywująca polimerazę DNA, która ma zdolność do syntezy wiernej, komplementarnej kopii jednoniciowego DNA matrycowego

B. Metoda wykorzystująca jako substraty wyłącznie trifosforany deoksyrybonukletydów

D. Inaczej sekwencjonowanie enzymatyczne metodą Sangera

A. Metoda wykorzystująca jako substraty trifosforany deoksyrybonukletydów oraz trifosforany dideoksyrybonukleotydów

Pytanie 57

Wskaż zdanie BŁĘDNIE opisujące pirosekwencjonowanie:

b. metoda ta nie wymaga zastosowania elektroforezy ani innego rozdzielania fragmentów

c. matryca jest kopiowana bez dodawania dideoksyrybonukleotydów do mieszaniny reakcyjnej

d. metoda ta wymaga zastosowania elektroforezy

a. w wyniku dołączenia nowego nukleotydu do końca syntetyzowanej nici zostaje uwolniona cząsteczka pirofosforanu

Pytanie 58

Wskaż odpowiedź FAŁSZYWĄ. Dideoksyrybonukleotydy:

C. stosowane są w sekwencjonowaniu metodą Maxma i Gilberta

D. to nukleotydy nieposiadające grupy hydroksylowej, a jedynie wodór w pozycjach 2’ i 3’ cukru

A. stosowane są w sekwencjonowaniu metodą terminacji łańcucha

B. stosowane są w sekwencjonowaniu metodą Sangera

Pytanie 59

Załączony schemat przedstawia:

D. pirosekwencjonowanie

B. sekwencjonowanie metodą Maxama-Gilberta

C. multipleks PCR

A. sekwencjonowanie metodą Sangera

Pytanie 60

W sekwencjonowaniu metodą Sangera

b. następuje terminacja łańcucha DNA po przyłączeniu dideoksyrybonukleotydu

c. jako materiał wyjściowy stosuje się dsDNA

d. nić DNA jest degradowana chemicznie

a. nie są potrzebne deoksyrybonukleotydy

Pytanie 61

Sekwencjonowanie przez odwracalną terminację:

c. wykorzystanie nukleotydy wyznakowane radioaktywnie

a. sekwencjonowaniu w czasie rzeczywistym SMART (single molekule real time)

b. polega na cyklicznym dodaniu przez polimerazę DNA tylko 1 nukleotydu wyznakowanego fluorescencyjnyjnie, terminacji syntezy, wymyciu niedodanych nukleotydów, obrazowaniu, usunięciu grupy terminującej i powtórzeniu na nowo syntezy 1 nukleotydu

d. wykorzystuje ligazę DNA zamiast polimerazy DNA, dochodzi do łączenia krótkich fragmentów wyznakowanych fluorescencyjnie

Pytanie 62

W której z metod do wizualizacji nie używa się autoradiografii?

d. metoda chemicznej degradacji Maxima-Gilberta

c. pirosekwencjonowanie

a. sekwencjonowanie metodą Sangera

b. Southern Blotting

Pytanie 63

W sekwencjonowaniu cyklicznym materiałem wyjściowym jest zwykle:

b. dwuniciowy RNA

c. jednoniciowy DNA

d. dwuniciowy DNA

a. jednoniciowy cDNA

Pytanie 64

Do metod sekwencjonowania należy:

c. hybrydyzacja FISH

a. Southern-blot

b. Northern-blot

d. Metoda Sangera

Pytanie 65

Wskaż nieprawidłowe stwierdzenie dotyczące sekwencjonowania cyklicznego:

b. do reakcji amplifikacji używany jest jeden starter

a. ze względu na obecność dideoksynuklotydów dochodzi do terminacji łańcucha

c. produkt reakcji przyrasta wykładniczo

d. materiałem wyjściowym jest dwuniciowy DNA

Pytanie 66

Dideoksynukleotydy to:

c. trifisforany dideoksynukleozydów, które są znakowanymi starterami pozwalającymi na specyficzne namnażanie fragmentów PCR do sekwencjonowania

b. trifosforany dideoksynukleozydów, które są analogami nukleotydów uniemożliwiającymi przyłączenie do syntetyzowanego łańcucha DNA następnego nukleotydu

a. zdenaturowane nukleotydy powstające w trakcie oczyszczania produktu PCR przed sekwencjonowaniem

d. nukleotydy podlegające modyfikacji w trakcie reakcji sekwencjonowania

Pytanie 67

Sekwencjonowanie metodą chemicznej degradacji to inna nazwa:

d. metody Maxama-Gilberta

c. metody Sangera

b. pirosekwencjonowania

a. sekwencjonowania cyklicznego

Pytanie 68

“Jest najstarszą metodą sekwencjonowania klasycznego opartą na chemicznej degradacji łańcucha DNA. Składa się z 3 etapów : chemicznej modyfikacji zasady azotowej, usunięciu tej zasady i przecięciu nici DNA w miejscu AP. Matrycę do sekwencjonowania w tej metodzie może stanowić jedno- lub dwuniciowy DNA, wyznakowany radioaktywnie na końcu 5’”. Jaka to metoda:

a. sekwencjonowanie masowe

b. metoda Sangera

d. pirosekwencjonowanie

c. metoda Maxama-Gilberta

Pytanie 69

Jak nazywa się metoda sekwencjonowania peptydów polegająca na kolejnym odrywaniu oznakowanych aminokwasów z N-końca cząsteczki peptydu?

d. degradacja równoległa

b. sekwencjonowanie Sangera

c. degradacja Edmana

a. sekwencjonowanie równoległe

Pytanie 70

Jaką metodę przedstawia poniższa rycina?

b. Metoda Solexa, które należy do NGS

a. Pirosekwencjowanie, które należy do NGS

d. Metoda Sangera, które jest sekwencjonowaniem klasycznym

c. Sekwencjonowanie nanoporowe, które jest sekwencjonowaniem klasycznym

Pytanie 71

W przypadku sekwencjonowania DNA metodą Sanger’a, kolejność nukleotydów w badanym DNA ustalimy poprzez

a. analizę prążków reakcji PCR sekwencyjnego

d. analizę produktów cięcia enzymami restrykcyjnymi

b. analizę widma absorpcyjnego

c. analizę intensywności fluorescencji hybrydyzowanej sondy

Pytanie 72

Poniższe zdjęcie przedstawia wynik otrzymany po:

a. sekwencjonowaniu Sangera

b. Real Time PCR

c. Elektroforezie

d. Hybrydyzacji FISH

Pytanie 73

Na rycinie przedstawiono schemat diagnozowania molekularnego niedokrwistości sierpowatej metodą:

d. PCR-RFLP

b. Sekwencjonowania

a. RT-qPCR

c. hybrydyzacji DNA

Pytanie 74

Fragment Klenowa polimerazy I DNA to enzym używany podczas:

a. Pirosekwencjonowania

b. sekwencjonowania metodą Sangera

d. sekwencjonowania cyklicznego

c. sekwencjonowania metodą Maxama Gilberta

Pytanie 75

Pirosekwencjonowanie polega na:

b. Dodaniu znakowanego fluorochromem nukleotydu, które poprzez lucyferazę powoduje emisję sygnału świetlnego

c. Dodanie niewyznakowanego nukleotydu

d. Odłączaniu nukleotydów przez apirazę i ich degradacja powoduje sygnał świetlny

a. Dodaniu znakowanego fluorochromem nukleotydu i odczyt pików świetlnych

Pytanie 76

Techniką genotypowania, która wykorzystuje endonukleazy restrykcyjne jest technika:

a. PCR

d. RFLP

b. Western Blot

c. Sekwencjonowanie metodą Sangera

Pytanie 77

Na rycinie przedstawiono:

d. Zasadę sekwencjonowania DNA z użyciem znaczników fluorescencyjnych

c. Zasadę techniki PCR w czasie rzeczywistym (qRT-PCR)

a. Zasadę sekwencjonowania metodą Sangera

b. Schemat łańcuchowej syntezy fragmentów DNA

Pytanie 78

Najbardziej precyzyjną metodą poznania struktury DNA jest:

d. Hybrydyzacja

c. RT-PCR

b. Sekwencjonowanie

a. Analiza cytometryczna

Pytanie 79

W jakim celu w jednej z metod sekwencjonowania stosowana jest piperydyna?

c. . Do degradacji ATP i niezwiązanych nukleotydów

d. Do przekształcenia pirofosforanu do ATP

b. Do degradacji wiązań N-glikozydowych i fosfodiestrowych

a. Piperydyna nie jest stosowana w żadnej metodzie sekwencjonowania

Pytanie 80

Jak nazywamy sekwencjonowanie, w którym stosuje się odczynniki przecinające cząsteczki (…) określonych pozycjach nukleotydowych?

c. Sekwencjonowanie metodą Sangera

a. Sekwencjonowanie metodą degradacji chemicznej

d. Pirosekwencjonowanie

b. Sekwencjonowanie losowe

Pytanie 81

Zautomatyzowana metoda minisekwencjonowania oparta na wydłużaniu starterów na matrycy uzyskanej w reakcji PCR, w której pojedyncza nić z podłączonym starterem podlega, w obecności DTP, kaskadzie reakcji enzymatycznych, to:

a. Pirosekwencjonowanie

c. RT-qPCR

d. Sekwencjonowanie enzymatyczne metodą Sangera

b. Porównawcza hybrydyzacja genomowa

Pytanie 82

Jakie byłby konsekwencje zwiększenie stosunku trifosforanów dideuksyrybonukleozydów do trifosforanów deoksyrybonukleozydów w mieszaninie reakcyjnej podczas sekwencjonowania DNA?

c. Zaburzenie stosunku spowodowałby przerwanie reakcji sekwencjonowania

b. Rzadziej następuje terminacja wydłużania DNA, a więc tworzone są dłuższe łańcuchy DNA

d. Stosunek nie ma wpływu na reakcję sekwencjonowania

a. Częściej następuje terminacja wydłużania DNA, a więc tworzone są krótsze łańcuchy DNA

Pytanie 83

Na rycinie przedstawiono dwa układy do elektroforezy w żelu poliakrylamidowym. W układach tych można dokonywać detekcji DNA w metodzie:

a. Sekwencjonowania metodą mikromacierzy CGH

b. Sekwencjonowania metodą pirosekwencjonowania

d. Sekwencjonowania metodą syntezy

c. Sekwencjonowania metodą terminacji łańcucha

Pytanie 84

Metodą sekwencjonowania w czasie rzeczywistym jest:

a. Metoda Sangera

d. Żadna z powyższych

b. Metoda Maxama-Gilberta

c. Pirosekwencjonowanie

Pytanie 85

Rola dideoksynukleotydów:

c. Umożliwiają przyłączenie się polimerazy

a. Hamują replikację DNA

b. Inicjują replikację DNA

Pytanie 86

W sekwencjonowaniu dwufazowym

c. Przeprowadza się tylko analizę masy białka (jedna faza)

b. Nie ma poprawnej odpowiedzi

a. Najpierw przeprowadza się analizę masy białka (faza pierwsza) a następnie analizę izoelektryczną (faza druga)

d. Przeprowadza się najpierw analizę izoelektryczną (pierwsza faza) a następnie masową białka (druga faza)

Pytanie 87

Sulfirylaza ATP w pirosekwencjonowaniu:

c. Uwalnia pirofosforan

a. wspomaga tworzenie ATP

b. bierze udział w wytworzeniu sygnału świetlnego

Pytanie 88

Pierwszym etapem degradacji EDMANA jest:

a. elektroforeza w celu identyfikacji pierwszego aminokwasu

b. dodanie fenyloizotiocyjanianu do próby

d. usunięcie fenyloizotiocyjananu z próbki

c. analiza chromatograficna w celu identyfikacji pierwszego aminokwasu

Pytanie 89

Która z metod umożliwia scharakteryzowanie struktury I-rzędowej białka:

b. spektroskopia dichroizmu kołowego i spektrometria mas

c. spektroskopia dichroizmu kołowego

d. spektroskopia w podczerwieni

a. spektrometria mas

Pytanie 90

Która z metod umożliwia scharakteryzowanie rzeczywistej struktury III-rzędowej białka?

d. Spektroskopia dichroizmu kołowego i spektroskopia mas

a. Spektroskopia w podczerwieni

b. Spektroskopia mas

c. Spektroskopia dichroizmu kołowego

Pytanie 91

Podstawową techniką używaną do wyznaczania struktury przestrzennej białka na poziomie atomowym jest:

d. sekencjonowanie białek

c. spektroskopia mas

b. spektroskopia dichroizmu kołowego

a. krystalografia rentgenowska

Pytanie 92

„_ polega na użyciu 24-kolorowego malowania całych chromosomów umożliwiającego wizualizację każdego chromosomu (osobno) w jednym eksperymencie. Ta metoda oparta jest na zasadach obrazowania spektralnego i spektroskopii Fouriera” opis ten dotyczy:

d. SKY (Spectral Karyotyping)-FISH

a. Fibre FISH

c. Prążkowanie AgNOR

b. Micromacierze CGH

Pytanie 93

Zastosowanie techniki NMR (spektroskopii magnetycznego rezonansu jądrowego) pozwala określić:

a. Sekwencję aminokwasów w białku

c. Nie używa się metody NMR w badaniach molekularnych

b. Strukturę przestrzenną białka

d. Sekwencję nukleotydów w DNA

Pytanie 94

Do czego nie służy spektroskopia mas?

a. Do ustalenia kątów i wiązań między atomami

c. ustalania składu izotopowego analizowanych substancji

b. identyfikacji związków chemicznych i ich mieszanin

Pytanie 95

Metodą Northern-Blot można wykryć:

a. białka

c. sekwencję nukleotydów w RNA

d. strukturę białka

b. DNA

Pytanie 96

Do wykrycia DNA służy metoda

c. Eastern Blot

a. Northern Blot

b. Southern Blot

Pytanie 97

Która z poniżej wymienionych technika NIE BAZUJE na hybrydyzacji?

b. Western blot

d. FISH

a. Northern blot

c. Southern blot

Pytanie 98

Metoda PCR w której używa się dwóch starterów przyłączanych w dwóch różnych reakcjach to:

a. RT-PCR

d. Wewnętrzne PCR

b. qPCR

c. Nie ma poprawnej odpowiedzi

Pytanie 99

Reakcja RT-PCR to:

a. w reakcji PCR, w której używa się równocześnie wielu par specyficznych starterów by namnożyć wiele fragmentów DNA w jednej reakcji

c. reakcja PCR, w której namnażane jest mRNA

b. reakcja PCR, w której mRNA jest przepisywane na cDNA i następnie amplifikowane przy użyciu specyficznych starterów

d. reakcja PCR, w której restryktaza tnie DNA, a następnie pofragmentowane DNA jest namnażane

Pytanie 100

Odmiana PCR, w której wykorzystywanych jest wiele różnych zestawów starterów to:

b. real time PCR

c. multipleks PCR

a. RT-PCR

d. nested PCR

Pytanie 101

Reakcja PCR w której przeprowadzamy amplifikację więcej niż jednego odcinka DNA nazywa się:

a. RT-PCR

c. PCR – RFLP

d. multipleks PCR

b. nested PCR

Pytanie 102

Co jest metodą do RNA?

a. Sage

c. RT-PCR

b. Homogenizacja

Pytanie 103

RT-qPCR to:

c. Inaczej reakcja PCR-Multiplex

a. Reakcja odwrotnej transkrypcji (Reverse Transcription)

d. Jakościowy PCR

b. Reakcja PCR w czasie rzeczywistym (Real Time)

Pytanie 104

Metodę RT-qPCR z wykorzystaniem jakich barwników/sond przedstawia powyższa rycina? Opis do ryciny: 1. polimeryzacja – reporter (R) i wygaszacz (Q) są związane do oligonukleotydowej sondy; 2. przemieszczenie się nici – wygaszacz nadal pochłania sygnał emitowany przez reporter; 3. rozłam – wygaszacz odłącza się od sondy i oddala od reportera – sygnał staje się widoczny; 4. zakończenie polimeryzacji – odłączony reporter nadal emituje sygnał fluorescencji.

b. Sondy o strukturze spinki do włosów

c. Tryptan blue

a. SYBR Green 1

d. Sond TaqMan

Pytanie 105

Mikromacierze RNA dostarczają nam informacji o:

b. zmianach w ilości DNA w jądrze

c. mutacjach punktowych w DNA

a. ilości białek w komórce

d. profilach jakościowej i ilościowej ekspresji genów

Pytanie 106

Wskaż zdanie FAŁSZYWE. Mikromacierze DNA:

c. metoda służąca m.in. do genotypowania

d. metoda, w której stosowane są dwuniciowe sondy w postaci DNA o znanej sekwencji, produktów PCR lub oligonukleotydów

a. inaczej chip DNA

b. zbiór sond molekularnych związanych ze stałym podłożem w ściśle określonym porządku, stanowiący dwuwymiarowy układ mikroskopijnych miejsc z określonymi sekwencjami kwasu nukleinowego

Pytanie 107

Wykrywanie ekspresji genów, przy pomocy mikromacierzy jest możliwe dzięki temu, że:

d. wszystkie z wymienionych

a. Miejsca z większą wydajnością hybrydyzacji mierzonej wielkością sygnału fluorescencji dla genu tkanki chorobowej wystąpią jeśli gen ten uległ nadekspresji u chorego

b. cDNA pochodzi z mRNA znanych genów unieruchomionych na podłożu, a próbka zawiera geny, zarówno prawidłowych jak i chorych tkanek

c. wzór ekspresji genu jest porównywany ze wzorem ekspresji genu odpowiedzialnego za chorobe

Pytanie 108

Mikromacierze DNA to technologia, która umożliwia badanie i rozwiązywanie problemów biomedycznych. Które były kiedyś uważane za nierozwiązywalne dlatego że:

a. Badanie na jednej płytce DNA dostarcza jednoczesnej informacji o tysiącach genów

b. Umożliwiają równoległą analizę ekspresji genów i ich identyfikacji

c. Są używane do wykrywania wiązania na zasadzie komplementarności cząsteczek w mieszaninie o nieznanym składzie

d. Wszystkie z wymienionych

Pytanie 109

W metodzie mikromacierzy:

d. do badanego niewyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond

a. do sond umieszczonych na stałym podłożu dodaje się wyznakowany DNA badany b. do sond umieszczonych na stałym podłożu dodaje się niewyznakowany DNA badany c. do badanego wyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond d. do badanego niewyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond

b. do sond umieszczonych na stałym podłożu dodaje się niewyznakowany DNA badany

c. do badanego wyznakowanego DNA umieszczonego na stałym podłożu dodaje się wiele sond

Pytanie 110

Wskaż zdanie FAŁSZYWE dotyczące mikromacierzy:

b. Niska specyficzność wobec genów

a. Dłuższe sondy zwiększają ryzyko nieswoistej hybrydyzacji

d. Krótkie sondy

c. Odczyt fluorescencji ma charakter porównawczy

Pytanie 111

Mikromacierze SNP są ‘lepsze” od porównawczej hybrydyzacji genomowej, gdyż:

b. używają sond oligonukloetydowych

d. pozwalają na wykrywanie zmian ilościowych i jakościowych

a. nie używa się znakowania sond

c. nie można porównać tych dwóch technik, gdyż mikromacierze SNP służą do analizy pojedynczych genów/nukleotydów, a porównawcza hybrydyzacja genomowa do analizy całych genomów

Pytanie 112

Metoda, w której stosuję sie sondę oligonukleotydową do ustalenia, która z dwóch alternatywnych sekwencji występuje w danej cząsteczce to:

c. Hybrydyzacja allelospecyficzna

b. Fluorescencyjna hybrydyzacja in situ

d. Hybrydyzacja fluorescencyjna

a. Metoda SSCP

Pytanie 113

Technika FISH:

a. Jest metodą uzupełniającą analizę prążkową chromosomów - do rozstrzygania problemów diagnostycznych zaistniałych w badaniach konwencjonalnych

c. Umożliwia identyfikacje aberracji chromosomowych tylko w jądrach interfazowych

b. Umożliwia identyfikację aberracji chromosomowych tylko w chromosomach metafazowych

d. Stanowi modyfikację metody hybrydyzacji in situ

Pytanie 114

Podaj nazwę techniki, w której izolowany DNA z jądra komórkowego rozciąga się i utrwala na szkiełku podstawowym:

c. Fiber FISH

d. Southern blot

a. CGH

b. Hybrydyzacja in-situ

Pytanie 115

Metoda biologii molekularnej wykorzystująca różnicę w ilości i rodzaju miejsc restrykcyjnych w badanym fragmencie materiały genetycznego to technika:

c. DGGE

b. RFLP

a. ASO

d. SSCP

Pytanie 116

Rolą enzymów restrykcyjnych w klonowaniu DNA jest:

d. otrzymaniu polimorfizmu długości fragmentów restrykcyjnych (RFLP)

b. wytworzenie lepkich końców wokół genu do sklonowania i w plazmidzie, w celu wstawienia genu do plazmidu

a. pocięcie otrzymanego DNA na mniejsze losowe fragmenty

c. strawienie bakteryjnych plazmidów

Pytanie 117

W reakcja hybrydyzacji z DNA sonda molekularna:

c. jest przyłączana do polimerazy DNA w celu umożliwienia precyzyjnej hybrydyzacji DNA

d. nie pozwala na identyfikację DNA z preparatów cytologicznych

a. powinna być wyznakowana w celu zidentyfikowania powstałych dwuniciowych kompleksów

b. pozwala na wykrywanie enzymów restrykcyjnych zawartych w mieszaninie reakcyjnej

Pytanie 118

Lepkie końce powstają w wyniku cięcia nici DNA:

c. Enzymem restrykcyjnym

d. Sekwencjonazą DNA

a. Polimerazą DNA 30

b. Ligazą

Pytanie 119

Enzym restrykcyjny:

d. rozpoznaje i przecina tylko określone sekwencje nukleotydowe w cząsteczce DNA

c. jest używany w trakcie replikacji hybrydyzacji Southern Blot

b. potrafi replikować dwuniciowa cząsteczka DNA

a. ułatwia łączenie fragmentów DNA

Pytanie 120

Hybrydyzacja Southern Blot:

c. Wykrywa duże mutacje

b. Wykrywa mutacje punktowe

d. Zakłada, że mutacja zmienia wzór restrykcyjny

a. Ma na celu wyszukanie sekwencji RNA spośród mieszaniny fragmentów otrzymanych po trawieniu enzymami restrykcyjnymi

Pytanie 121

Paleontolodzy odkryli fragment tkanki na liczącej 400 lat zakonserwowanej skórze wymarłego ptaka dodo. Genetycy chcieli porównać specyficzny region DNA z tej próbki z DNA pochodzącym od ptaków żyjących obecnie. Która z poniższych metod byłaby najbardziej przydatna do zwiększenia dostępnych ilości DNA ptaka dodo?

c. łańcuchowa reakcja polimerazy (PCR)

d. analiza RFLP

a. hybrydyzacja metodą Southerna

b. elektoroforeza żelowa

Pytanie 122

W celu precyzyjnego zidentyfikowania dwuniciowych kompleksów powstałych w wyniku reakcji Southern Blot należy:

a. Doprowadzić do denaturacji sondy molekularnej w celu odłączenia jej od kompleksu hybrydyzacyjnego

c. Wyznakować chemiluminescencyjnie wszystkie fragmenty DNA genomowe po cięciu restryktazami

d. Wyznakować radioaktywnie sondę molekularną

b. Wyznakować radioaktywne DNA genomowe

Pytanie 123

W metodzie Southern:

d. fragmenty RNA intubowane z RNA

b. fragmenty DNA intubowane z RNA

a. fragmenty DNA intubowane na membranie z DNA

c. fragmenty DNA intubowane z przeciwciałami

Pytanie 124

W metodzie hybrydyzacji Southerna:

d. DNA na membranie nylonowej jest indukowany ze swoistymi przeciwciałami

b. RNA na membranie nylonowej jest hybrydyzowany z sondą RNA

a. RNA na membranie nylonowej jest inkubowany ze swoistymi przeciwciałami

c. DNA na membranie nylonowej jest hybrydyzowany z sondą DNA

Pytanie 125

W metodzie nested PCR

b. Występuje wyłącznie faza annealingu

c. Występpuje wyłącznie faza denaturacji

a. Stosowane są startery zewnętrzne i wewnętrzne

d. Występuje wyłącznie faza elongacji

Pytanie 126

Wskaż BŁĘDNE zdanie dotyczące łańcuchowej reakcji polimerazy PCR

c. Jest to technika służąca do namnożenia (amplifikacji) specyficznego fragmentu/ów DNA

b. Jest jedną z metod izolacji białek

a. Naśladuje replikację DNA in vivo

d. Wykorzystuje urządzenie zwane termocyklerem umożliwiającym liczne cykliczne reakcje syntezy nici DNA

Pytanie 127

Prawidłowy skład mieszaniny reakcyjnej Real-Time qPCR to:

d. matryca, startery, dNTPs, polimeraza DNA, SYBR Green, środowisko reakcji

b. matryca, startery, dNTPs. Polimeraza DNA, środowisko reakcji

a. matryca, startery, dNTPs, polimeraza DNA

c. matryca, startery, dNTPs, polimeraza DNA, SYBR Green

Pytanie 128

W metodzie Real-Time qPCR, poziom ekspresji badanego genu określa

c. Produktów niespecyficznych

b. Drugiego genu badanego

a. Sam gen badany wystarczy do określenia poziomu jego ekspresji

d. Genu referencyjnego

Pytanie 129

Do mieszaniny reakcyjnej reakcji PCR NIE NALEŻY:

c. APS

a. DNA matrycowe

d. Startery

b. termostabilna polimeraza DNA

Pytanie 130

Na żelu jednokierunkowym nie można dobrze rozdzielić:

a. Fragmentów DNA po reakcji multipleks PCR

c. fragmentów DNA po reakcji restrykcji

b. oczyszczonego białka albuminy

d. złożonej mieszaniny białek

Pytanie 131

W metodzie PCR NIE JEST wymagana obecność:

b. Starterów

c. Polimerazy DNA

a. Jonów magnezowych

d. Dideoksynukleotydy

Pytanie 132

Wskaż zdanie POPRAWNIE opisujące metodę PCR-DGGE:

a. dsDNA ulega denaturacji przy różnych stężeniach związków denaturujących w zależności od składu zasad i sekwencji nukleotydowej

c. dsDNA ulega denaturacji przy takich samych stężeniach związków denaturujących

d. dsDNA ulega denaturacji przy tych samych stężeniach związków denaturujących bez względu na skład zasad i sekwencji nukleotydowej

b. dsDNA ulega denaturacji przy różnych stężeniach związków denaturujących bez względu na skład zasad i sekwencji nukleotydowej

Pytanie 133

Na poniższym rysunku przedstawiono program temperaturowy reakcji PCR, etap C jest to:

a. Gorący start

b. Wydłużanie produktu

d. Renaturacja

c. Denaturacja

Pytanie 134

Metoda PCR w której używa się dwóch starterów przyłączanych w dwóch różnych reakcjach to:

d. Wewnętrzne PCR

b. qPCR 95

a. RT-PCR

c. Nie ma poprawnej odpowiedzi

Pytanie 135

W jakiej temperaturze następuje przyłączenie starterów podczas PCR:

d. W takiej jak temperatura topnienia starterów

c. O 5* niższej od ich temperatury topnienia

a. O 20* wyższej od ich temperatury topnienia

b. O 15* niższej od ich temperatury topnienia

Pytanie 136

Ktore jony musza byc w PCR w mieszaninie

c. Magnezu

b. Sodu

a. Baru

Twój wynik: Oczyszczanie i metody badań makrocząsteczek życia

Analiza