W przypadku podejrzenia zapalenia opon mózgowo–rdzeniowych, w celu ustalenia etiologii wykonuje się punkcję lędźwiową z pobraniem płynu mózgowo–rdzeniowego do badań biochemicznych i mikrobiologicznych. Dla wirusowego ZOMR charakterystyczna będzie następująca konstelacja parametrów płynu:
Wodojasny, klarowny, podwyższona liczba neutrofili, obniżone stężenie białka, obniżone stężenie glukozy
Żółtawy, mętny, podwyższona liczba neutrofili, podwyższone stężenie białka, obniżone stężenie glukozy
Wodojasny, klarowny, prawidłowa liczba neutrofili, prawidłowa liczba limfocytów, podwyższone stężenie białka i znacznie obniżone stężenie glukozy
Wodojasny, klarowny, prawidłowa lub miernie podwyższona liczba neutrofili, podwyższona liczba limfocytów, prawidłowe lub miernie podwyższone stężenie białka i prawidłowe lub nieco obniżone stężenie glukozy
Wodojasny, klarowny, miernie podwyższona liczba neutrofili, miernie podwyższone stężenie białka, znacznie obniżone stężenie glukozy