Strona 3
JUMPJET 1.1
Pytanie 17
Enzymy restrykcyjne: pocięto jakiś liniowy odcinek DNA enzymem EcoRV, obraz po elektroforezie uwidoczniono na żelu. Co możesz powiedzieć na podstawie rysunku poniżej; żel wybarwiono bromkiem etydyny; zwróć uwagę na słabo rozdzielone elementy o długościach 433 i 415 par zasad.
W żelu znajduje się bromek etydyny
Żadna z powyższych nie jest prawdziwa
Na tym odcinku DNA znajduje się 5 unikalnych miejsc restrykcyjnych rozpoznawanych przez enzym
Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o długości 2220 pz
Najszybciej migrującym fragmentem jest fragment o długości 210 pz
Metoda ta może być stosowania do produktów ekspresji metody Sangera
Długość cząsteczki DNA wynosi 2220
Pytanie 18
Co jest wymagane do przeprowadzenia reakcji Sangera, ale chodziło o to, że jest obecny zawsze w jednym z odczynników?
2’,5’-dideoksy analog jednego z 4 dNTP
Matryca
Polimeraza DNA
γ-P32-ATP
α-P32-ATP
Wszystkie 4 dNTP
Jeden z 4 dNTP
Pytanie 19
Chcesz syntezować nić DNA - co jest do tego niezbędne?
Matryca komplementarna do startera
Wszystkie 4 dNTP
Starter z 3’-OH
Aktywność egzonukleazowa 3---5’
Polimeraza DNA
Magnez
Wszystkie 4 NTP
Matryca 1 lub 2 niciowa
Pytanie 20
Pytanie dotyczące usuwania deaminowanej cytozny do uracylu w DNA
Mutacje w DNA są widoczne we wszystkich następnych pokoleniach
Jeżeli jest w mRNA to w znaczący sposób wpływa na ekspresję
Jest to spontaniczna modyfikacja, prowadzi do powstania nowych kodonów
Coś z tyminą, że jest obecna w RNA, mimo że koszt energetyczny syntezy jest większy niż w uracylu, występującym w RNA
Enzymy usuwające tę mutację – proces naprawy – glikozydaza uracylowa, potem endonukleaza AP, polimeraza DNA i ligaza na końcu
Czy da to mutację CG – AT w niciach potomnych
Pytanie 21
Pytanie o kod genetyczny
Ma 64 kodony kodujące 20 aminokwasów
Sekwencja zasad jest odczytywana kolejno, poczynając od określonego miejsca startowego.
3 kodony kodujące 1 aminokwas to synonimy
Jest zdegenerowany, bo w różnych organizmach różne kodony kodują inny aminokwas
Nie ma znaków przecinkowych
Jest uniwersalny, jego uniwersalność jest prawie absolutna
Pytanie 22
Redagowanie RNA
Zachodzi przy udziale enzymów, np. polimerazy poli(A)
Zwiększa różnorodność genomu
Zachodzi już po transkrypcji
Dodatkowa zmienność genetyczna
Zachodzi autokatalitycznie
Pytanie 23
Topoizomeraza
Przerywają i powodują relaksacje wiązań fosfodiestrowych
Wymagają ATP
5’-P łączy się z ε-Lys
Topoizomeraza I rozcina dwie nici, a topoizomeraza II jedną
Tworzy kowalencyjny intermediat z substratem DNA
Przekształcają topoizomery, rozcinają DNA
Mogą w szczególnym przypadku używać ATP do tworzenia ujemnej suprhelikalnego DNA z formy rozluźnionej
Zmieniają liczbę opleceń
Zmieniają liczbę miejsc wiążących topoizomeraz
5’-P łączy się z -OH Tyr
Wymagają NAD+ jako kofaktora do dostarczenia energii kolistych cząsteczek w formy zrelaksowane
Pytanie 24
Podobienstwa w budowie polimerazy DNA i RNA
Obie wymagają odcinka starterowego
Polimeraza RNA podobnie jak polimeraza DNA ma właściwości nukleazy
Polimeraza RNA podobnie jak i DNA katalizuje reakcję poprzez atak nukleofilowy na grupę fosforanową