Mutacje można podzielić na spontaniczne i indukowane. Mutacje spontaniczne odbywają się samorzutnie, najczęściej przez błędy podczas replikacji. Natomiast mutacje indukowane zachodzą przez wpływ czynników mutagennych, do których zaliczamy:
promieniowanie jonizujące
promieniowanie ultrafioletowe
wysoką temperaturę
amoniak
iperyt
benzopiren
kolchicynę